*** 1F0N_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220091526165245.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220091526165245.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220091526165245.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.327679 +/- 11.008309 From: -25.297000 To: 25.641000
= -0.774994 +/- 8.983875 From: -23.969000 To: 20.375000
= -0.575573 +/- 9.938465 From: -29.047000 To: 21.469000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.0836 % Filled.
Pdbmat> 851948 non-zero elements.
Pdbmat> 93310 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.68 +/- 23.35
Maximum number = 134
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.866200E+06
Pdbmat> Larger element = 512.642
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
284 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220091526165245.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220091526165245.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220091526165245.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2153 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 284 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 96
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 109
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 122
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 134
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 153
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 186
Blocpdb> 10 atoms in block 14
Block first atom: 206
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 216
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 228
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 242
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 273
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 289
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 301
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 320
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 334
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 350
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 370
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 388
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 404
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 419
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 431
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 451
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 522
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 537
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 563
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 576
Blocpdb> 23 atoms in block 39
Block first atom: 588
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 611
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 625
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 651
Blocpdb> 11 atoms in block 43
Block first atom: 664
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 675
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 688
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 712
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 731
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 754
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 770
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 789
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 802
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 819
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 835
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 868
Blocpdb> 12 atoms in block 57
Block first atom: 887
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 899
Blocpdb> 11 atoms in block 59
Block first atom: 915
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 926
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 937
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 950
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 962
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 976
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 985
Blocpdb> 13 atoms in block 66
Block first atom: 997
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1010
Blocpdb> 10 atoms in block 68
Block first atom: 1026
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1036
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1058
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1074
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1094
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 1114
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1123
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1137
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 12 atoms in block 79
Block first atom: 1194
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1206
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1217
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1231
Blocpdb> 13 atoms in block 83
Block first atom: 1243
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1256
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1268
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 1281
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 1289
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1310
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1320
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1336
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1354
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1367
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1381
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 1393
Blocpdb> 19 atoms in block 95
Block first atom: 1416
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1435
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1450
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1466
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1483
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1499
Blocpdb> 13 atoms in block 101
Block first atom: 1514
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1527
Blocpdb> 19 atoms in block 103
Block first atom: 1542
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 1561
Blocpdb> 18 atoms in block 105
Block first atom: 1582
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1600
Blocpdb> 11 atoms in block 107
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 108
Block first atom: 1623
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1638
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 1655
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1663
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1676
Blocpdb> 14 atoms in block 113
Block first atom: 1691
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1705
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1724
Blocpdb> 18 atoms in block 116
Block first atom: 1741
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1759
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1776
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1790
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 1807
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1827
Blocpdb> 20 atoms in block 122
Block first atom: 1840
Blocpdb> 10 atoms in block 123
Block first atom: 1860
Blocpdb> 8 atoms in block 124
Block first atom: 1870
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 1878
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 1896
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 1908
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 1927
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 1945
Blocpdb> 11 atoms in block 130
Block first atom: 1960
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1971
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 1987
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 2010
Blocpdb> 9 atoms in block 134
Block first atom: 2036
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 2045
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2062
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2075
Blocpdb> 12 atoms in block 138
Block first atom: 2092
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2104
Blocpdb> 12 atoms in block 140
Block first atom: 2121
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2133
Blocpdb> 9 atoms in block 142
Block first atom: 2144
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 852090 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6459
Prepmat> Matrix trace = 1866200.0000
Prepmat> Last element read: 6459 6459 11.0506
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8511 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2153
RTB> Total mass = 2153.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2153
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 210962.2426
RTB> 56971 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56971
Diagstd> Projected matrix trace = 210962.2426
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 210962.2426
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 5.2368037 6.6205591 9.3368156 9.6026271
11.0830475 13.2726034 13.5398265 15.8738882 16.5574648
18.7701609 18.9700793 19.8271143 20.0324000 23.1225747
24.1919876 24.8830865 25.4396314 25.6609402 26.9999564
27.7789375 28.3894406 29.4819705 30.0874379 31.5776903
31.8866588 33.6941787 34.2863190 34.6578364 35.4721954
35.9786233 36.5996492 37.4427669 39.7895211 40.8945491
41.2983507 42.9048231 43.7553563 44.9843503 45.9399525
46.2862584 47.1438303 47.6392688 48.7460128 49.5710998
49.8657902 50.3563698 51.3207183 52.8856844 53.7143499
54.7934274 55.3747779 56.6202449 57.2275805 59.2181095
60.6803443 61.0498274 61.8036088 61.9917233 63.4712606
64.4419464 64.9732507 65.5776628 66.5528933 67.0087208
67.3350361 67.7887126 69.5090350 69.5367161 70.8373578
71.3022394 71.3778921 72.8253227 74.0848994 74.8019671
75.6772033 76.4657389 76.9847593 77.6626320 78.1341047
78.7142319 79.6057225 80.6979627 81.9049836 82.8974036
83.2922132 84.2756376 85.4580132 85.8565097 86.1387869
87.0572584 87.6757331 88.1730858 88.2216610 89.3347338
90.4045405 91.1662409 91.9096081 93.2002067 93.3097444
96.0855074
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034328 0.0034330 0.0034337 0.0034344
0.0034355 248.5011641 279.4104298 331.8139741 336.5040622
361.5137983 395.6155361 399.5782404 432.6502297 441.8676432
470.4671215 472.9659259 483.5317930 486.0285396 522.1717540
534.1104261 541.6857431 547.7100221 550.0872294 564.2568129
572.3386779 578.5936959 589.6218026 595.6455260 610.2186278
613.1966696 630.3368800 635.8515158 639.2871922 646.7542844
651.3546993 656.9521554 664.4759207 684.9827522 694.4292287
697.8492790 711.2926776 718.3083131 728.3263231 736.0215857
738.7905271 745.6031135 749.5106768 758.1669160 764.5564514
766.8256531 770.5884356 777.9320125 789.7040127 795.8668989
803.8213070 808.0742704 817.1111785 821.4818503 835.6464060
845.9005323 848.4719718 853.6939382 854.9921647 865.1349206
871.7252082 875.3113865 879.3732440 885.8878608 888.9164515
891.0782205 894.0750449 905.3487571 905.5290111 913.9584597
916.9525555 917.4388768 926.6942945 934.6739268 939.1863883
944.6649835 949.5738038 952.7910267 956.9766311 959.8770330
963.4338726 968.8742737 975.4984095 982.7667265 988.7027551
991.0543711 996.8878520 1003.8565944 1006.1943977 1007.8471125
1013.2060475 1016.7987023 1019.6785895 1019.9594249 1026.3735557
1032.5008118 1036.8413386 1041.0599452 1048.3437685 1048.9596440
1064.4474456
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2153
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.09
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
0.99996 0.99994 1.00001 1.00003 0.99999
0.99998 0.99997 1.00003 1.00002 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
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1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00004
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0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 38754 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
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0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00004 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996
0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00004
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220091526165245.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220091526165245.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220091526165245.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220091526165245.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.621
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.337
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.603
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.09
Bfactors> 106 vectors, 6459 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.237000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.498 for 284 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.019 +/- 0.02
Bfactors> = 95.630 +/- 6.24
Bfactors> Shiftng-fct= 95.612
Bfactors> Scaling-fct= 305.585
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091526165245 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091526165245.eigenfacs
240220091526165245.atom
240220091526165245.10.pdb
240220091526165245.11.pdb
240220091526165245.12.pdb
240220091526165245.13.pdb
240220091526165245.14.pdb
240220091526165245.15.pdb
240220091526165245.16.pdb
240220091526165245.7.pdb
240220091526165245.8.pdb
240220091526165245.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m10.288s
user 0m10.222s
sys 0m0.040s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220091526165245.Chkmod.res: No such file or directory
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