Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* 4XFX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 *

LOGs for ID: 240220091228160354

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 240220091228160354.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 240220091228160354.atom to be opened.

 Openam> File opened: 240220091228160354.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    216
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    216
            Number of atoms found    =   1687
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.133093 +/-    16.234006 From:   -33.062000 To:    37.125000
 =    -0.171800 +/-     8.257040 From:   -20.062000 To:    19.234000
 =    -0.135554 +/-    13.104801 From:   -25.375000 To:    29.453000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.4525 % Filled.
 Pdbmat>       570344  non-zero elements.
 Pdbmat>        62328 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     73.89 +/-     24.25
         Maximum number =    132
         Minimum number =     11

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.246560E+06
 Pdbmat> Larger element =  515.147    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
216 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 240220091228160354.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 240220091228160354.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 240220091228160354.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1687 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   216 residues.
 Blocpdb>    15 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     16
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    19 atoms in block      4
 Block first atom:     47
 Blocpdb>    13 atoms in block      5
 Block first atom:     66
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     79
 Blocpdb>    18 atoms in block      7
 Block first atom:     92
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    19 atoms in block      9
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    145
 Blocpdb>    14 atoms in block     11
 Block first atom:    161
 Blocpdb>    18 atoms in block     12
 Block first atom:    175
 Blocpdb>    14 atoms in block     13
 Block first atom:    193
 Blocpdb>    17 atoms in block     14
 Block first atom:    207
 Blocpdb>    16 atoms in block     15
 Block first atom:    224
 Blocpdb>    15 atoms in block     16
 Block first atom:    240
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    255
 Blocpdb>    17 atoms in block     18
 Block first atom:    270
 Blocpdb>    13 atoms in block     19
 Block first atom:    287
 Blocpdb>    15 atoms in block     20
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     9 atoms in block     21
 Block first atom:    315
 Blocpdb>    14 atoms in block     22
 Block first atom:    324
 Blocpdb>    17 atoms in block     23
 Block first atom:    338
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    15 atoms in block     25
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    386
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    402
 Blocpdb>     8 atoms in block     28
 Block first atom:    416
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    424
 Blocpdb>    10 atoms in block     30
 Block first atom:    443
 Blocpdb>    17 atoms in block     31
 Block first atom:    453
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    470
 Blocpdb>    18 atoms in block     33
 Block first atom:    486
 Blocpdb>    15 atoms in block     34
 Block first atom:    504
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    519
 Blocpdb>    14 atoms in block     36
 Block first atom:    536
 Blocpdb>    14 atoms in block     37
 Block first atom:    550
 Blocpdb>    22 atoms in block     38
 Block first atom:    564
 Blocpdb>    19 atoms in block     39
 Block first atom:    586
 Blocpdb>    17 atoms in block     40
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    17 atoms in block     41
 Block first atom:    622
 Blocpdb>     9 atoms in block     42
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    648
 Blocpdb>    12 atoms in block     44
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    13 atoms in block     45
 Block first atom:    675
 Blocpdb>    19 atoms in block     46
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    707
 Blocpdb>    15 atoms in block     48
 Block first atom:    723
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    738
 Blocpdb>    13 atoms in block     50
 Block first atom:    752
 Blocpdb>    11 atoms in block     51
 Block first atom:    765
 Blocpdb>    13 atoms in block     52
 Block first atom:    776
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    18 atoms in block     54
 Block first atom:    804
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    822
 Blocpdb>    18 atoms in block     56
 Block first atom:    839
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    857
 Blocpdb>    18 atoms in block     58
 Block first atom:    872
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    15 atoms in block     60
 Block first atom:    904
 Blocpdb>    11 atoms in block     61
 Block first atom:    919
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    930
 Blocpdb>    21 atoms in block     63
 Block first atom:    947
 Blocpdb>    25 atoms in block     64
 Block first atom:    968
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:    993
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1009
 Blocpdb>    16 atoms in block     67
 Block first atom:   1021
 Blocpdb>    17 atoms in block     68
 Block first atom:   1037
 Blocpdb>    18 atoms in block     69
 Block first atom:   1054
 Blocpdb>    20 atoms in block     70
 Block first atom:   1072
 Blocpdb>    13 atoms in block     71
 Block first atom:   1092
 Blocpdb>    13 atoms in block     72
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    16 atoms in block     73
 Block first atom:   1118
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1134
 Blocpdb>    20 atoms in block     75
 Block first atom:   1150
 Blocpdb>    11 atoms in block     76
 Block first atom:   1170
 Blocpdb>    18 atoms in block     77
 Block first atom:   1181
 Blocpdb>    18 atoms in block     78
 Block first atom:   1199
 Blocpdb>    19 atoms in block     79
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    19 atoms in block     80
 Block first atom:   1236
 Blocpdb>    19 atoms in block     81
 Block first atom:   1255
 Blocpdb>    23 atoms in block     82
 Block first atom:   1274
 Blocpdb>    16 atoms in block     83
 Block first atom:   1297
 Blocpdb>    19 atoms in block     84
 Block first atom:   1313
 Blocpdb>    14 atoms in block     85
 Block first atom:   1332
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1346
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1360
 Blocpdb>    16 atoms in block     88
 Block first atom:   1375
 Blocpdb>    17 atoms in block     89
 Block first atom:   1391
 Blocpdb>    22 atoms in block     90
 Block first atom:   1408
 Blocpdb>    16 atoms in block     91
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    15 atoms in block     93
 Block first atom:   1461
 Blocpdb>    17 atoms in block     94
 Block first atom:   1476
 Blocpdb>    13 atoms in block     95
 Block first atom:   1493
 Blocpdb>    15 atoms in block     96
 Block first atom:   1506
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1521
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1536
 Blocpdb>    17 atoms in block     99
 Block first atom:   1551
 Blocpdb>    13 atoms in block    100
 Block first atom:   1568
 Blocpdb>    11 atoms in block    101
 Block first atom:   1581
 Blocpdb>     9 atoms in block    102
 Block first atom:   1592
 Blocpdb>    15 atoms in block    103
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1616
 Blocpdb>    16 atoms in block    105
 Block first atom:   1634
 Blocpdb>    12 atoms in block    106
 Block first atom:   1650
 Blocpdb>    15 atoms in block    107
 Block first atom:   1662
 Blocpdb>    11 atoms in block    108
 Block first atom:   1676

 Blocpdb>   108 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       570452 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5061

 Prepmat> Matrix trace    =    1246560.0000
 Prepmat> Last element read:    5061   5061       186.9229
 Prepmat>         5887 lines saved.
 Prepmat>         4898 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1687
 RTB> Total mass =        1687.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1687
 RTB> Number of blocks =   108
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  129776.6428
 RTB>     33948 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      648
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    33948
 Diagstd> Projected matrix trace =  129776.6428

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    648 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 129776.6428
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.3116896      0.5046335      0.5510155      0.9137267
      1.4849831      2.2875376      2.4326076      3.3877455      3.8118851
      4.9595664      4.9962426      5.9151133      6.6368299      7.7195318
      8.2439824      8.8374539     10.3489960     11.0273337     11.9013990
     12.0835584     12.1914014     13.7379199     14.5826960     15.0217514
     15.6823052     16.2496670     17.2319423     17.8670553     18.3697947
     19.3517412     20.0009594     21.0137275     22.3279652     23.4060325
     24.5150121     24.9304374     25.9415729     26.7879450     26.8039736
     27.2551631     28.3221720     29.0036111     30.6835714     31.0366389
     31.8756233     33.3779045     34.2994250     34.6177924     34.8336734
     35.9600167     36.4828591     36.7980074     37.4951796     38.5477353
     39.1923511     39.9796476     41.0382256     41.9286928     41.9955158
     43.1571169     43.9986214     45.7062305     46.6171693     46.8869304
     47.1081493     48.3289264     48.6354479     48.8851416     48.9877751
     49.9307937     51.0186266     51.6580998     52.7031729     53.7439482
     54.4412158     54.8739227     55.7681809     56.2895783     56.8615251
     57.4381905     57.8720274     58.2496777     59.2236441     59.7492858
     59.9202215     60.0936670     61.8995971     62.1440708     63.2664238
     63.8701105     64.5824714     65.1867735     65.7067186     66.8381516
     67.9953345     68.3407373     68.8866416     69.3110193     70.2122621
     71.6583653

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034318      0.0034327      0.0034332      0.0034341      0.0034344
      0.0034350     60.6256505     77.1406558     80.6078191    103.8014553
    132.3293081    164.2401774    169.3679815    199.8714059    212.0143134
    241.8338758    242.7264134    264.1051167    279.7535611    301.7107327
    311.7911676    322.8188305    349.3368415    360.6039996    374.6228716
    377.4789200    379.1596345    402.4906259    414.6810515    420.8773611
    430.0314629    437.7412897    450.7776712    459.0096022    465.4225607
    477.7000687    485.6469824    497.7907570    513.1210764    525.3626352
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    566.9172513    577.9078027    584.8187885    601.5174544    604.9683053
    613.0905517    627.3715408    635.9730315    638.9177662    640.9068572
    651.1862518    655.9031452    658.7299830    664.9408272    674.2092623
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    919.2396072

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1687
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    108

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9877E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9925E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3117    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5046    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5510    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9137    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.485    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.288    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.433    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.388    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.812    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.915    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.02    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.25    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.23    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.87    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.52    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.30    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.04    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.87    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.75    

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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.34    

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 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.66    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    648 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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 0.99997

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    30366 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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 1.00001 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000
 0.99997

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 240220091228160354.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 240220091228160354.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 240220091228160354.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 240220091228160354.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    216
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    216
            Number of atoms found    =   1687
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9877E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9925E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3117    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5046    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5510    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9137    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.485    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.288    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.433    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.388    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.812    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.960    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.996    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.915    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.637    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.720    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.244    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.837    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.66    

 Bfactors>  106 vectors,   5061 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.311700
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.776 for    216 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.121 +/-   0.21
 Bfactors> =     92.729 +/-   8.51
 Bfactors> Shiftng-fct=     92.608
 Bfactors> Scaling-fct=     41.456

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091228160354 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091228160354 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091228160354 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091228160354.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 10
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generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=100
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 14
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 15
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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generate a series of perturbations for mode 16
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calculating perturbed structure for DQ=20
240220091228160354.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
240220091228160354.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
240220091228160354.eigenfacs
240220091228160354.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091228160354.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
240220091228160354.eigenfacs
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240220091228160354.11.pdb
240220091228160354.12.pdb
240220091228160354.13.pdb
240220091228160354.14.pdb
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240220091228160354.16.pdb
240220091228160354.7.pdb
240220091228160354.8.pdb
240220091228160354.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m5.148s
user	0m5.136s
sys	0m0.012s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220091228160354.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
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*** 4XFX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 ***

LOGs for ID: 240220091228160354

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

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