*** EXP_5T5S_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_5_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912430841891.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912430841891.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912430841891.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 207
First residue number = 1
Last residue number = 207
Number of atoms found = 1566
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.054133 +/- 18.277824 From: -28.781000 To: 47.344000
= -0.142322 +/- 6.117615 From: -16.594000 To: 15.539000
= -2.321722 +/- 14.367239 From: -28.625000 To: 25.500000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.8523 % Filled.
Pdbmat> 535592 non-zero elements.
Pdbmat> 58536 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 74.76 +/- 21.37
Maximum number = 127
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.170720E+06
Pdbmat> Larger element = 491.307
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
207 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912430841891.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912430841891.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912430841891.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1566 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 207 residues.
Blocpdb> 14 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 15
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 19 atoms in block 4
Block first atom: 43
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 62
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 76
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 91
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 108
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 123
Blocpdb> 15 atoms in block 10
Block first atom: 137
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 152
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 166
Blocpdb> 14 atoms in block 13
Block first atom: 182
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 196
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 212
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 224
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 241
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 256
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 276
Blocpdb> 13 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 306
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 318
Blocpdb> 13 atoms in block 23
Block first atom: 332
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 345
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 357
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 372
Blocpdb> 23 atoms in block 27
Block first atom: 388
Blocpdb> 17 atoms in block 28
Block first atom: 411
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 428
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 445
Blocpdb> 15 atoms in block 31
Block first atom: 465
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 480
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 495
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 512
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 528
Blocpdb> 16 atoms in block 36
Block first atom: 544
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 560
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 579
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 590
Blocpdb> 15 atoms in block 40
Block first atom: 604
Blocpdb> 18 atoms in block 41
Block first atom: 619
Blocpdb> 18 atoms in block 42
Block first atom: 637
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 655
Blocpdb> 16 atoms in block 44
Block first atom: 672
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 688
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 706
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 725
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 739
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 754
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 771
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 786
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 801
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 818
Blocpdb> 10 atoms in block 54
Block first atom: 835
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 845
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 857
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 871
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 884
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 901
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 914
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 931
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 951
Blocpdb> 13 atoms in block 63
Block first atom: 969
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 982
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 998
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 1009
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1025
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1043
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1058
Blocpdb> 9 atoms in block 70
Block first atom: 1075
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1084
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1101
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1114
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1128
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1144
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1160
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1173
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1186
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1201
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1218
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1229
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1252
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1268
Blocpdb> 10 atoms in block 84
Block first atom: 1284
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1294
Blocpdb> 12 atoms in block 86
Block first atom: 1310
Blocpdb> 13 atoms in block 87
Block first atom: 1322
Blocpdb> 8 atoms in block 88
Block first atom: 1335
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1343
Blocpdb> 13 atoms in block 90
Block first atom: 1360
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1373
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1387
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1399
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1412
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 1427
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1437
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1454
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1468
Blocpdb> 13 atoms in block 99
Block first atom: 1485
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1498
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1511
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1527
Blocpdb> 19 atoms in block 103
Block first atom: 1544
Blocpdb> 4 atoms in block 104
Block first atom: 1562
Blocpdb> 104 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 535696 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4698
Prepmat> Matrix trace = 1170720.0000
Prepmat> Last element read: 4698 4698 77.4878
Prepmat> 5461 lines saved.
Prepmat> 4467 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1566
RTB> Total mass = 1566.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1566
RTB> Number of blocks = 104
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 128681.6302
RTB> 34188 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 624
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34188
Diagstd> Projected matrix trace = 128681.6302
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 624 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 128681.6302
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1057281 0.3008427 0.4829354 1.8206869
2.0996799 3.1353499 4.4625005 5.0242784 6.6928865
8.8256543 10.1700666 10.7842907 12.7699730 13.8626637
14.7781513 15.3061551 16.5338803 18.7686946 20.1185300
21.3336206 22.1514494 22.3743069 23.6676855 24.2526184
25.1261628 25.8650358 26.6668398 29.0671654 29.5890137
30.3599278 31.8198096 31.8653102 33.3662467 35.2226043
35.4482100 36.4046708 36.9160861 37.7938730 38.7761452
40.0045848 40.9184872 41.6820924 42.3575330 44.2052677
45.3999385 46.0374579 46.7701263 47.6670177 48.4563330
49.9748184 50.5884980 51.4150049 51.9919878 52.5638247
53.4937529 53.5811597 54.3644696 55.1137637 55.5565219
56.4875122 57.7564894 58.8499275 59.6678240 59.7988392
60.6617140 61.7214693 62.8032637 63.2090370 64.0820468
65.4043347 65.5506706 66.9728833 67.4567304 68.1660072
68.2863518 69.6726941 70.1221214 71.0288833 71.3253503
72.5756320 73.6077960 74.3185481 75.1463182 75.2096244
76.4939902 77.7603272 79.2119715 79.9311024 80.7492015
81.6194442 82.1678313 82.7675726 83.6491168 83.8008309
84.4851544 85.7367249 86.3124030 86.7600300 86.9508821
87.0824748
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034333 0.0034336 0.0034338 0.0034339
0.0034340 35.3094057 59.5614160 75.4639998 146.5253990
157.3518411 192.2818475 229.3952494 243.4064750 280.9325174
322.6032482 346.3037374 356.6079928 388.0523064 404.3138553
417.4508360 424.8428706 441.5528325 470.4487453 487.0722670
501.5653941 511.0887886 513.6532922 528.2909554 534.7793108
544.3251044 552.2704697 560.7652027 585.4591813 590.6912329
598.3367082 612.5535603 612.9913635 627.2619714 644.4749061
646.5355882 655.1999179 659.7860146 667.5840934 676.2037843
686.8314353 694.6324453 701.0839683 706.7415249 721.9918463
731.6829118 736.8022571 742.6420762 749.7289326 755.9108043
767.6635016 772.3624877 778.6462944 783.0031174 787.2972954
794.2309627 794.8795701 800.6687124 806.1675542 809.3992631
816.1528549 825.2692706 833.0445862 838.8134398 839.7338439
845.7706673 853.1264527 860.5703662 863.3459725 869.2875663
878.2103407 879.1922472 888.6787151 891.8830777 896.5596894
897.3507618 906.4139534 909.3326891 915.1931770 917.1011478
925.1042868 931.6594370 936.1466525 941.3456800 941.7421096
949.7492041 957.5783531 966.4751490 970.8523398 975.8080542
981.0521566 984.3424003 987.9282164 993.1754145 994.0756656
998.1262593 1005.4922444 1008.8622789 1011.4749395 1012.5868341
1013.3527760
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1566
Rtb_to_modes> Number of blocs = 104
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1057
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3008
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4829
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.821
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.100
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.135
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.463
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.024
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.693
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.08
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 624 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 28188 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
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1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00003
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1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
0.99995 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00004 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00003 0.99997 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912430841891.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912430841891.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912430841891.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912430841891.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 207
First residue number = 1
Last residue number = 207
Number of atoms found = 1566
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3008
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4829
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.135
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.463
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.024
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.693
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.08
Bfactors> 106 vectors, 4698 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.105700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.835 for 207 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.173 +/- 0.14
Bfactors> = 96.189 +/- 3.47
Bfactors> Shiftng-fct= 96.016
Bfactors> Scaling-fct= 25.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912430841891 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912430841891.eigenfacs
24021912430841891.atom
24021912430841891.10.pdb
24021912430841891.11.pdb
24021912430841891.12.pdb
24021912430841891.13.pdb
24021912430841891.14.pdb
24021912430841891.15.pdb
24021912430841891.16.pdb
24021912430841891.7.pdb
24021912430841891.8.pdb
24021912430841891.9.pdb
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real 0m4.812s
user 0m4.792s
sys 0m0.020s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912430841891.Chkmod.res: No such file or directory
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