*** EXP_4XFX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912421241012.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912421241012.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912421241012.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 212
First residue number = 1
Last residue number = 212
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.057644 +/- 15.131803 From: -33.031000 To: 37.375000
= -0.197530 +/- 8.727476 From: -24.578000 To: 18.172000
= -0.833500 +/- 13.768716 From: -22.359000 To: 31.062000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.5896 % Filled.
Pdbmat> 566500 non-zero elements.
Pdbmat> 61911 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 74.77 +/- 23.98
Maximum number = 134
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 1.238220E+06
Pdbmat> Larger element = 489.068
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
212 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912421241012.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912421241012.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912421241012.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1656 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 212 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 13 atoms in block 3
Block first atom: 35
Blocpdb> 13 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 18 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 130
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 144
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 162
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 176
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 193
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 209
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 224
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 239
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 256
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 269
Blocpdb> 9 atoms in block 19
Block first atom: 284
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 307
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 324
Blocpdb> 15 atoms in block 23
Block first atom: 340
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 355
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 371
Blocpdb> 8 atoms in block 26
Block first atom: 385
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 393
Blocpdb> 10 atoms in block 28
Block first atom: 412
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 422
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 439
Blocpdb> 18 atoms in block 31
Block first atom: 455
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 473
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 488
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 505
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 519
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 533
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 555
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 574
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 591
Blocpdb> 9 atoms in block 40
Block first atom: 608
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 617
Blocpdb> 12 atoms in block 42
Block first atom: 632
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 644
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 657
Blocpdb> 16 atoms in block 45
Block first atom: 676
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 692
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 707
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 721
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 734
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 745
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 758
Blocpdb> 18 atoms in block 52
Block first atom: 773
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 791
Blocpdb> 18 atoms in block 54
Block first atom: 808
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 826
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 841
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 859
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 873
Blocpdb> 11 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 899
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 916
Blocpdb> 25 atoms in block 62
Block first atom: 937
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 962
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 978
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 990
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 1006
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1023
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1041
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1061
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1074
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1087
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1103
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 74
Block first atom: 1139
Blocpdb> 18 atoms in block 75
Block first atom: 1150
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1168
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1186
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1205
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1224
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1243
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1266
Blocpdb> 19 atoms in block 82
Block first atom: 1282
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1301
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1315
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1329
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1344
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1360
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 1377
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1399
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1415
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1430
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1445
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1462
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1475
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1490
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1505
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1520
Blocpdb> 13 atoms in block 98
Block first atom: 1537
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 1550
Blocpdb> 9 atoms in block 100
Block first atom: 1561
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1570
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1585
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1603
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1619
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1631
Blocpdb> 11 atoms in block 106
Block first atom: 1645
Blocpdb> 106 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 566606 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4968
Prepmat> Matrix trace = 1238220.0000
Prepmat> Last element read: 4968 4968 159.8357
Prepmat> 5672 lines saved.
Prepmat> 4697 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1656
RTB> Total mass = 1656.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1656
RTB> Number of blocks = 106
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 129221.6374
RTB> 33474 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 636
Diagstd> Nb of non-zero elements: 33474
Diagstd> Projected matrix trace = 129221.6374
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 636 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 129221.6374
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3257866 0.5098484 0.6711677 2.2640936
2.4130306 3.3070410 3.4881086 5.0035303 5.1904506
6.6889782 7.4447092 8.2807919 8.3894452 10.0735379
10.5583271 11.0346559 11.7400940 12.4718688 12.9643797
14.0427249 15.1366803 15.7345081 16.7270168 17.0246953
17.7931375 18.9569536 21.2128875 22.8104303 23.0473753
24.5644283 24.9299202 25.7911271 26.5586886 27.6565223
27.9142335 28.1530071 30.5629416 31.6990766 31.7759954
32.6038772 33.7858287 33.8690963 34.7163202 35.5667763
36.0341170 36.4801571 37.6949094 38.5423463 39.0164183
39.3551837 40.7554807 41.5190339 42.1981175 43.3687041
44.0809378 44.3827208 45.9461916 46.4757303 47.4682657
48.1025311 48.8074446 49.7268522 49.9175856 50.5400459
51.3151805 51.7728068 52.3337338 53.1799970 54.1839892
54.4978356 54.8587130 55.0821010 56.0330131 56.2926998
57.2546608 57.9312194 58.9708711 59.3892681 59.6221641
60.1106934 60.8433018 62.3945642 62.5398980 63.4463464
64.4158998 65.5739182 66.3334718 66.5469069 68.0309799
68.4410069 69.2794814 69.8899102 70.2365459 70.4688078
71.4255096 72.0387046 73.8604849 74.3335631 74.9662011
75.0392889
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034331 0.0034333 0.0034334 0.0034339
0.0034345 61.9814745 77.5382208 88.9632838 163.3963947
168.6850874 197.4763392 202.8104265 242.9033730 247.3989276
280.8504791 296.2914698 312.4864674 314.5298743 344.6563574
352.8522053 360.7237000 372.0754940 383.4961847 390.9949529
406.9311868 422.4843238 430.7466072 444.1242907 448.0587413
458.0591334 472.8022707 500.1441287 518.6352355 521.3219576
538.2060939 542.1952696 551.4808564 559.6269154 571.0762040
573.7307589 576.1793309 600.3338839 611.3903589 612.1316885
620.0545585 631.1935732 631.9709053 639.8263523 647.6159430
651.8568334 655.8788558 666.7094830 674.1621332 678.2955684
681.2339015 693.2474653 699.7113202 705.4103362 715.1275390
720.9758085 723.4395397 736.0715633 740.3010952 748.1642680
753.1461233 758.6445026 765.7566280 767.2237989 771.9925265
777.8900396 781.3509339 785.5722627 791.8983438 799.3385679
801.6502042 804.3000353 805.9359506 812.8628367 814.7442782
821.6761913 826.5166663 833.9001498 836.8531725 838.4924336
841.9206255 847.0356070 857.7656653 858.7640677 864.9651093
871.5490202 879.3481362 884.4262912 885.8480175 895.6712693
898.3663481 903.8525637 907.8258012 910.0743061 911.5778046
917.7448454 921.6758912 933.2572179 936.2412152 940.2168544
940.6750714
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1656
Rtb_to_modes> Number of blocs = 106
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5098
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6712
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.413
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.307
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.488
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.004
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.689
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.445
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.281
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.04
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 636 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001
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1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
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1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998
1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
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0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
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0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
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0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 29808 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
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1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004
0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998
1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
0.99997 0.99996 1.00003 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00004
0.99998 0.99999 0.99997 0.99998 0.99997
0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912421241012.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912421241012.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912421241012.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912421241012.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 212
First residue number = 1
Last residue number = 212
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5098
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.413
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.307
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.004
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.689
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.445
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.281
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.04
Bfactors> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.325800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.611 for 212 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.103 +/- 0.10
Bfactors> = 93.859 +/- 5.17
Bfactors> Shiftng-fct= 93.756
Bfactors> Scaling-fct= 51.090
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912421241012 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912421241012.eigenfacs
24021912421241012.atom
24021912421241012.10.pdb
24021912421241012.11.pdb
24021912421241012.12.pdb
24021912421241012.13.pdb
24021912421241012.14.pdb
24021912421241012.15.pdb
24021912421241012.16.pdb
24021912421241012.7.pdb
24021912421241012.8.pdb
24021912421241012.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m4.938s
user 0m4.910s
sys 0m0.016s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912421241012.Chkmod.res: No such file or directory
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