CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR 29-OCT-17 5YOK  ***

LOGs for ID: 21062218281741693

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21062218281741693.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21062218281741693.atom to be opened. Openam> File opened: 21062218281741693.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 3597 Mean number per residue = 18.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 14.206439 +/- 7.350960 From: -3.903000 To: 33.097000 = 25.667559 +/- 10.080429 From: -2.656000 To: 47.353000 = 19.535976 +/- 12.013132 From: -6.872000 To: 45.758000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.1708 % Filled. Pdbmat> 3010842 non-zero elements. Pdbmat> 332195 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 184.71 +/- 61.88 Maximum number = 336 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 6.643900E+06 Pdbmat> Larger element = 1456.94 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 198 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21062218281741693.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21062218281741693.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21062218281741693.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3597 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 198 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 51 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 65 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 84 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 108 Blocpdb> 36 atoms in block 8 Block first atom: 143 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 179 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 193 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 212 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 228 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 242 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 261 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 283 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 302 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 309 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 316 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 333 Blocpdb> 22 atoms in block 20 Block first atom: 352 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 374 Blocpdb> 10 atoms in block 22 Block first atom: 389 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 399 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 418 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 437 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 452 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 466 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 473 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 483 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 495 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 515 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 529 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 545 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 564 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 579 Blocpdb> 17 atoms in block 36 Block first atom: 594 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 611 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 629 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 648 Blocpdb> 7 atoms in block 40 Block first atom: 662 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 669 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 717 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 739 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 753 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 775 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 814 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 833 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 847 Blocpdb> 38 atoms in block 50 Block first atom: 861 Blocpdb> 14 atoms in block 51 Block first atom: 899 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 913 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 920 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 940 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 959 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 988 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 1004 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 1040 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1057 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 1078 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1090 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 1112 Blocpdb> 38 atoms in block 63 Block first atom: 1131 Blocpdb> 38 atoms in block 64 Block first atom: 1169 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1207 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1222 Blocpdb> 10 atoms in block 67 Block first atom: 1241 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 1251 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1258 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1275 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1297 Blocpdb> 19 atoms in block 72 Block first atom: 1317 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 1336 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1343 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1357 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1373 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1392 Blocpdb> 7 atoms in block 78 Block first atom: 1408 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1415 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1429 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1443 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1457 Blocpdb> 14 atoms in block 83 Block first atom: 1473 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1487 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1506 Blocpdb> 7 atoms in block 86 Block first atom: 1525 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 1532 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1556 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1570 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1589 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1608 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1622 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1639 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 1658 Blocpdb> 10 atoms in block 95 Block first atom: 1665 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1675 Blocpdb> 32 atoms in block 97 Block first atom: 1689 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1721 Blocpdb> 21 atoms in block 99 Block first atom: 1735 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1756 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1770 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1787 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1806 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1820 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 1839 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 1863 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1889 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1913 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1927 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1946 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1962 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1976 Blocpdb> 29 atoms in block 113 Block first atom: 1995 Blocpdb> 38 atoms in block 114 Block first atom: 2024 Blocpdb> 7 atoms in block 115 Block first atom: 2062 Blocpdb> 7 atoms in block 116 Block first atom: 2069 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2076 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 2093 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 2112 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 2134 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 2153 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 2163 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2182 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 2201 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2216 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 2230 Blocpdb> 10 atoms in block 127 Block first atom: 2237 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 2247 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2259 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2283 Blocpdb> 32 atoms in block 131 Block first atom: 2297 Blocpdb> 30 atoms in block 132 Block first atom: 2329 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 2359 Blocpdb> 30 atoms in block 134 Block first atom: 2389 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2419 Blocpdb> 13 atoms in block 136 Block first atom: 2436 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2449 Blocpdb> 14 atoms in block 138 Block first atom: 2468 Blocpdb> 7 atoms in block 139 Block first atom: 2482 Blocpdb> 24 atoms in block 140 Block first atom: 2489 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 2513 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 2537 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2572 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 2586 Blocpdb> 25 atoms in block 145 Block first atom: 2630 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2655 Blocpdb> 14 atoms in block 147 Block first atom: 2674 Blocpdb> 14 atoms in block 148 Block first atom: 2688 Blocpdb> 38 atoms in block 149 Block first atom: 2702 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2740 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 2754 Blocpdb> 20 atoms in block 152 Block first atom: 2761 Blocpdb> 19 atoms in block 153 Block first atom: 2781 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 2800 Blocpdb> 16 atoms in block 155 Block first atom: 2822 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 2838 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2862 Blocpdb> 21 atoms in block 158 Block first atom: 2879 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2900 Blocpdb> 25 atoms in block 160 Block first atom: 2912 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 2937 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2956 Blocpdb> 19 atoms in block 163 Block first atom: 2975 Blocpdb> 21 atoms in block 164 Block first atom: 2994 Blocpdb> 23 atoms in block 165 Block first atom: 3015 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 3038 Blocpdb> 7 atoms in block 167 Block first atom: 3048 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 3055 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 3072 Blocpdb> 10 atoms in block 170 Block first atom: 3094 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 3104 Blocpdb> 7 atoms in block 172 Block first atom: 3123 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 3130 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 3144 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3160 Blocpdb> 16 atoms in block 176 Block first atom: 3179 Blocpdb> 7 atoms in block 177 Block first atom: 3195 Blocpdb> 28 atoms in block 178 Block first atom: 3202 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 3230 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 3258 Blocpdb> 32 atoms in block 181 Block first atom: 3286 Blocpdb> 14 atoms in block 182 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 3332 Blocpdb> 19 atoms in block 184 Block first atom: 3351 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 3370 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 3377 Blocpdb> 14 atoms in block 187 Block first atom: 3401 Blocpdb> 19 atoms in block 188 Block first atom: 3415 Blocpdb> 19 atoms in block 189 Block first atom: 3434 Blocpdb> 14 atoms in block 190 Block first atom: 3453 Blocpdb> 17 atoms in block 191 Block first atom: 3467 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 3484 Blocpdb> 7 atoms in block 193 Block first atom: 3503 Blocpdb> 10 atoms in block 194 Block first atom: 3510 Blocpdb> 14 atoms in block 195 Block first atom: 3520 Blocpdb> 29 atoms in block 196 Block first atom: 3534 Blocpdb> 14 atoms in block 197 Block first atom: 3563 Blocpdb> 21 atoms in block 198 Block first atom: 3576 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 44 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3011040 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10791 Prepmat> Matrix trace = 6643900.0000 Prepmat> Last element read: 10791 10791 755.3816 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 16660 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3597 RTB> Total mass = 3597.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3597 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 667129.9400 RTB> 106506 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 106506 Diagstd> Projected matrix trace = 667129.9400 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 667129.9400 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 6.6107492 7.5878084 10.2616619 14.2280246 17.4966909 20.2869072 22.4734368 25.3786144 26.6390896 30.1027704 32.4009739 35.5144532 36.6865990 39.7354943 41.2213047 44.1747406 45.5802797 49.3419723 50.7653521 51.6547202 55.2929606 60.0028269 60.9148751 64.1204174 66.2827371 69.8903731 70.1989054 71.1782686 73.0148093 74.4403910 76.1244335 76.9678654 81.4046359 82.2705083 85.9018110 87.2163198 88.9622877 92.2339543 93.1192029 96.4857072 99.7421845 100.6859111 103.3916751 103.8377495 107.0556553 108.0814874 109.0178261 111.1839124 113.4309779 114.3427718 115.8813196 117.1012505 117.5715519 118.6676275 120.6679697 122.3725080 123.6851709 125.3863255 126.8241003 127.6202170 128.7484503 131.0420165 132.3411160 133.8454208 134.5172388 135.3495232 138.4515854 138.9396028 141.9217681 142.1002569 145.6098519 147.2029514 150.1346418 151.6633370 152.5713702 155.5649035 156.3349818 158.8228706 160.0368577 160.2695435 161.3540329 163.3703177 163.7802448 164.6452638 169.0894310 170.5158666 171.1200190 172.1191667 176.4307249 178.0000457 179.5895298 181.1484364 182.4364543 184.7795088 185.3437924 186.3754411 188.8337484 190.6648121 191.9225253 193.7887897 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034330 0.0034334 0.0034335 0.0034345 0.0034347 279.2033480 299.1255142 347.8597099 409.6072024 454.2273074 489.1062374 514.7899109 547.0527852 560.4733535 595.7972765 618.1221586 647.1394069 657.7320525 684.5175546 697.1980236 721.7425081 733.1346962 762.7874390 773.7113745 780.4593485 807.4770776 841.1648881 847.5336675 869.5477801 884.0880030 907.8288074 909.8304142 916.1550716 927.8991095 936.9137291 947.4522190 952.6864789 979.7603262 984.9572258 1006.4598165 1014.1312344 1024.2317905 1042.8952619 1047.8880920 1066.6618746 1084.5128899 1089.6314566 1104.1753972 1106.5547681 1123.5698773 1128.9401967 1133.8198061 1145.0283941 1156.5412266 1161.1802439 1168.9663141 1175.1033021 1177.4606595 1182.9364395 1192.8649644 1201.2605387 1207.6861815 1215.9630220 1222.9147279 1226.7470425 1232.1576715 1243.0842501 1249.2307809 1256.3106428 1259.4596326 1263.3498858 1277.7451669 1279.9950988 1293.6589185 1294.4721517 1310.3600997 1317.5088436 1330.5639004 1337.3207524 1341.3181572 1354.4129333 1357.7611063 1368.5220550 1373.7423534 1374.7406677 1379.3840269 1387.9756819 1389.7159380 1393.3810552 1412.0611732 1418.0047267 1420.5145623 1424.6556265 1442.3889597 1448.7896581 1455.2438983 1461.5462910 1466.7330963 1476.1217669 1478.3739548 1482.4826605 1492.2276651 1499.4450512 1504.3824384 1511.6790886 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3597 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9848E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 161.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 171.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 181.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 190.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 191.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 193.8 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00004 1.00003 1.00001 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99995 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 64746 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00004 1.00003 1.00001 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99995 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21062218281741693.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21062218281741693.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21062218281741693.atom Openam> file on opening on unit 11: 21062218281741693.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 3597 Mean number per residue = 18.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9848E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 191.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.8 Bfactors> 106 vectors, 10791 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 6.611000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.628 for 221 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.005 +/- 0.00 Bfactors> = 7.862 +/- 2.71 Bfactors> Shiftng-fct= 7.857 Bfactors> Scaling-fct= 608.433 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21062218281741693.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21062218281741693.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1129. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1134. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1208. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1263. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1278. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1280. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1330. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1337. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1358. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1368. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1374. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1380. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1388. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1390. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1393. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1412. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1418. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1420. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1442. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1449. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1455. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1461. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1467. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1476. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1478. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1483. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1492. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1500. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1504. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1512. Chkmod> 106 vectors, 10791 coordinates in file. Chkmod> That is: 3597 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7508 0.0034 0.9211 0.0034 0.8590 0.0034 0.7686 0.0034 0.9281 0.0034 0.6799 279.1967 0.2998 299.1164 0.4190 347.8166 0.0634 409.6181 0.3200 454.2508 0.1989 489.1225 0.0887 514.7284 0.3238 547.0442 0.5314 560.4589 0.5108 595.7443 0.3856 618.0863 0.4207 647.0711 0.1565 657.7343 0.1706 684.5270 0.1132 697.1571 0.0897 721.6728 0.3233 733.1010 0.4251 762.7394 0.2715 773.7136 0.5894 780.3902 0.3668 807.4208 0.4483 841.1090 0.3819 847.4634 0.3845 869.5076 0.4227 884.0318 0.3709 907.7874 0.1922 909.7985 0.3782 916.1269 0.1399 927.8287 0.5002 936.8710 0.2108 947.3840 0.3294 952.6588 0.1017 979.6904 0.3739 984.9119 0.2993 1006.4060 0.4009 1014.1091 0.3812 1024.1747 0.3370 1042.8281 0.2077 1047.8476 0.4552 1066.6398 0.2708 1084.4545 0.5011 1089.6609 0.2694 1104.1724 0.4903 1106.3061 0.3617 1123.7543 0.2377 1128.9884 0.4957 1133.6784 0.3314 1145.0621 0.3624 1156.3336 0.3908 1160.9132 0.3687 1169.0103 0.3019 1175.0466 0.3713 1177.5526 0.4040 1183.0470 0.4163 1192.9721 0.3575 1201.3439 0.4086 1207.7067 0.3231 1215.9771 0.2775 1222.7460 0.3744 1226.5972 0.1813 1231.8729 0.3166 1242.8316 0.2458 1248.9831 0.3300 1256.0435 0.3026 1259.3249 0.3253 1263.0645 0.4218 1277.9137 0.4480 1279.7577 0.1813 1293.5042 0.3794 1294.4154 0.3161 1310.2595 0.4159 1317.4391 0.4365 1330.3533 0.2958 1337.4250 0.2267 1341.3864 0.2377 1354.5076 0.3552 1357.5509 0.4539 1368.3648 0.3517 1373.5252 0.4009 1374.8123 0.4597 1379.5213 0.3268 1388.0422 0.4389 1389.7401 0.4013 1393.1297 0.3510 1412.0447 0.2597 1417.8779 0.3899 1420.3705 0.3013 1424.5151 0.4040 1442.2014 0.4604 1448.7273 0.3541 1455.2238 0.3820 1461.2881 0.4777 1466.5236 0.3757 1476.1402 0.3230 1478.1358 0.3886 1482.5167 0.3631 1492.0303 0.2519 1499.5190 0.2661 1504.2296 0.3491 1511.6579 0.2162 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21062218281741693 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom making animated gifs 11 models are in 21062218281741693.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21062218281741693 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom making animated gifs 11 models are in 21062218281741693.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21062218281741693 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom making animated gifs 11 models are in 21062218281741693.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21062218281741693 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom making animated gifs 11 models are in 21062218281741693.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21062218281741693 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062218281741693.eigenfacs 21062218281741693.atom making animated gifs 11 models are in 21062218281741693.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062218281741693.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21062218281741693.10.pdb 21062218281741693.11.pdb 21062218281741693.7.pdb 21062218281741693.8.pdb 21062218281741693.9.pdb STDERR: real 0m24.296s user 0m24.176s sys 0m0.112s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.