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LOGs for ID: 210317093515117032

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210317093515117032.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210317093515117032.atom to be opened. Openam> File opened: 210317093515117032.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1468 First residue number = 1 Last residue number = 1468 Number of atoms found = 11488 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.256200 +/- 56.850894 From: -101.097000 To: 90.504000 = 14.543780 +/- 60.911413 From: -106.430000 To: 114.147000 = -6.599690 +/- 51.394554 From: -112.860000 To: 81.081000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6762 % Filled. Pdbmat> 4015939 non-zero elements. Pdbmat> 438624 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.36 +/- 21.87 Maximum number = 132 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 8.772480E+06 Pdbmat> Larger element = 504.992 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1468 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210317093515117032.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210317093515117032.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210317093515117032.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11488 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1468 residues. Blocpdb> 61 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 55 atoms in block 2 Block first atom: 62 Blocpdb> 56 atoms in block 3 Block first atom: 117 Blocpdb> 68 atoms in block 4 Block first atom: 173 Blocpdb> 66 atoms in block 5 Block first atom: 241 Blocpdb> 65 atoms in block 6 Block first atom: 307 Blocpdb> 62 atoms in block 7 Block first atom: 372 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 434 Blocpdb> 70 atoms in block 9 Block first atom: 505 Blocpdb> 63 atoms in block 10 Block first atom: 575 Blocpdb> 60 atoms in block 11 Block first atom: 638 Blocpdb> 70 atoms in block 12 Block first atom: 698 Blocpdb> 66 atoms in block 13 Block first atom: 768 Blocpdb> 57 atoms in block 14 Block first atom: 834 Blocpdb> 58 atoms in block 15 Block first atom: 891 Blocpdb> 70 atoms in block 16 Block first atom: 949 Blocpdb> 66 atoms in block 17 Block first atom: 1019 Blocpdb> 59 atoms in block 18 Block first atom: 1085 Blocpdb> 68 atoms in block 19 Block first atom: 1144 Blocpdb> 65 atoms in block 20 Block first atom: 1212 Blocpdb> 58 atoms in block 21 Block first atom: 1277 Blocpdb> 60 atoms in block 22 Block first atom: 1335 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1395 Blocpdb> 66 atoms in block 24 Block first atom: 1461 Blocpdb> 67 atoms in block 25 Block first atom: 1527 Blocpdb> 56 atoms in block 26 Block first atom: 1594 Blocpdb> 55 atoms in block 27 Block first atom: 1650 Blocpdb> 58 atoms in block 28 Block first atom: 1705 Blocpdb> 59 atoms in block 29 Block first atom: 1763 Blocpdb> 66 atoms in block 30 Block first atom: 1822 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1888 Blocpdb> 62 atoms in block 32 Block first atom: 1946 Blocpdb> 63 atoms in block 33 Block first atom: 2008 Blocpdb> 57 atoms in block 34 Block first atom: 2071 Blocpdb> 55 atoms in block 35 Block first atom: 2128 Blocpdb> 63 atoms in block 36 Block first atom: 2183 Blocpdb> 60 atoms in block 37 Block first atom: 2246 Blocpdb> 65 atoms in block 38 Block first atom: 2306 Blocpdb> 50 atoms in block 39 Block first atom: 2371 Blocpdb> 70 atoms in block 40 Block first atom: 2421 Blocpdb> 63 atoms in block 41 Block first atom: 2491 Blocpdb> 65 atoms in block 42 Block first atom: 2554 Blocpdb> 62 atoms in block 43 Block first atom: 2619 Blocpdb> 53 atoms in block 44 Block first atom: 2681 Blocpdb> 69 atoms in block 45 Block first atom: 2734 Blocpdb> 58 atoms in block 46 Block first atom: 2803 Blocpdb> 67 atoms in block 47 Block first atom: 2861 Blocpdb> 67 atoms in block 48 Block first atom: 2928 Blocpdb> 68 atoms in block 49 Block first atom: 2995 Blocpdb> 61 atoms in block 50 Block first atom: 3063 Blocpdb> 53 atoms in block 51 Block first atom: 3124 Blocpdb> 63 atoms in block 52 Block first atom: 3177 Blocpdb> 61 atoms in block 53 Block first atom: 3240 Blocpdb> 58 atoms in block 54 Block first atom: 3301 Blocpdb> 60 atoms in block 55 Block first atom: 3359 Blocpdb> 64 atoms in block 56 Block first atom: 3419 Blocpdb> 57 atoms in block 57 Block first atom: 3483 Blocpdb> 69 atoms in block 58 Block first atom: 3540 Blocpdb> 77 atoms in block 59 Block first atom: 3609 Blocpdb> 63 atoms in block 60 Block first atom: 3686 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 3749 Blocpdb> 67 atoms in block 62 Block first atom: 3819 Blocpdb> 58 atoms in block 63 Block first atom: 3886 Blocpdb> 59 atoms in block 64 Block first atom: 3944 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4003 Blocpdb> 60 atoms in block 66 Block first atom: 4062 Blocpdb> 61 atoms in block 67 Block first atom: 4122 Blocpdb> 69 atoms in block 68 Block first atom: 4183 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4252 Blocpdb> 72 atoms in block 70 Block first atom: 4318 Blocpdb> 65 atoms in block 71 Block first atom: 4390 Blocpdb> 58 atoms in block 72 Block first atom: 4455 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 4513 Blocpdb> 73 atoms in block 74 Block first atom: 4576 Blocpdb> 61 atoms in block 75 Block first atom: 4649 Blocpdb> 65 atoms in block 76 Block first atom: 4710 Blocpdb> 64 atoms in block 77 Block first atom: 4775 Blocpdb> 64 atoms in block 78 Block first atom: 4839 Blocpdb> 59 atoms in block 79 Block first atom: 4903 Blocpdb> 63 atoms in block 80 Block first atom: 4962 Blocpdb> 58 atoms in block 81 Block first atom: 5025 Blocpdb> 67 atoms in block 82 Block first atom: 5083 Blocpdb> 68 atoms in block 83 Block first atom: 5150 Blocpdb> 61 atoms in block 84 Block first atom: 5218 Blocpdb> 66 atoms in block 85 Block first atom: 5279 Blocpdb> 65 atoms in block 86 Block first atom: 5345 Blocpdb> 65 atoms in block 87 Block first atom: 5410 Blocpdb> 53 atoms in block 88 Block first atom: 5475 Blocpdb> 65 atoms in block 89 Block first atom: 5528 Blocpdb> 52 atoms in block 90 Block first atom: 5593 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 5645 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 5684 Blocpdb> 61 atoms in block 93 Block first atom: 5745 Blocpdb> 55 atoms in block 94 Block first atom: 5806 Blocpdb> 56 atoms in block 95 Block first atom: 5861 Blocpdb> 68 atoms in block 96 Block first atom: 5917 Blocpdb> 66 atoms in block 97 Block first atom: 5985 Blocpdb> 65 atoms in block 98 Block first atom: 6051 Blocpdb> 62 atoms in block 99 Block first atom: 6116 Blocpdb> 71 atoms in block 100 Block first atom: 6178 Blocpdb> 70 atoms in block 101 Block first atom: 6249 Blocpdb> 63 atoms in block 102 Block first atom: 6319 Blocpdb> 60 atoms in block 103 Block first atom: 6382 Blocpdb> 70 atoms in block 104 Block first atom: 6442 Blocpdb> 66 atoms in block 105 Block first atom: 6512 Blocpdb> 57 atoms in block 106 Block first atom: 6578 Blocpdb> 58 atoms in block 107 Block first atom: 6635 Blocpdb> 70 atoms in block 108 Block first atom: 6693 Blocpdb> 66 atoms in block 109 Block first atom: 6763 Blocpdb> 59 atoms in block 110 Block first atom: 6829 Blocpdb> 68 atoms in block 111 Block first atom: 6888 Blocpdb> 65 atoms in block 112 Block first atom: 6956 Blocpdb> 58 atoms in block 113 Block first atom: 7021 Blocpdb> 60 atoms in block 114 Block first atom: 7079 Blocpdb> 66 atoms in block 115 Block first atom: 7139 Blocpdb> 66 atoms in block 116 Block first atom: 7205 Blocpdb> 67 atoms in block 117 Block first atom: 7271 Blocpdb> 56 atoms in block 118 Block first atom: 7338 Blocpdb> 55 atoms in block 119 Block first atom: 7394 Blocpdb> 58 atoms in block 120 Block first atom: 7449 Blocpdb> 59 atoms in block 121 Block first atom: 7507 Blocpdb> 66 atoms in block 122 Block first atom: 7566 Blocpdb> 58 atoms in block 123 Block first atom: 7632 Blocpdb> 62 atoms in block 124 Block first atom: 7690 Blocpdb> 63 atoms in block 125 Block first atom: 7752 Blocpdb> 57 atoms in block 126 Block first atom: 7815 Blocpdb> 55 atoms in block 127 Block first atom: 7872 Blocpdb> 63 atoms in block 128 Block first atom: 7927 Blocpdb> 60 atoms in block 129 Block first atom: 7990 Blocpdb> 65 atoms in block 130 Block first atom: 8050 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 8115 Blocpdb> 70 atoms in block 132 Block first atom: 8165 Blocpdb> 63 atoms in block 133 Block first atom: 8235 Blocpdb> 65 atoms in block 134 Block first atom: 8298 Blocpdb> 62 atoms in block 135 Block first atom: 8363 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 8425 Blocpdb> 69 atoms in block 137 Block first atom: 8478 Blocpdb> 58 atoms in block 138 Block first atom: 8547 Blocpdb> 67 atoms in block 139 Block first atom: 8605 Blocpdb> 67 atoms in block 140 Block first atom: 8672 Blocpdb> 68 atoms in block 141 Block first atom: 8739 Blocpdb> 61 atoms in block 142 Block first atom: 8807 Blocpdb> 53 atoms in block 143 Block first atom: 8868 Blocpdb> 63 atoms in block 144 Block first atom: 8921 Blocpdb> 61 atoms in block 145 Block first atom: 8984 Blocpdb> 58 atoms in block 146 Block first atom: 9045 Blocpdb> 60 atoms in block 147 Block first atom: 9103 Blocpdb> 64 atoms in block 148 Block first atom: 9163 Blocpdb> 57 atoms in block 149 Block first atom: 9227 Blocpdb> 69 atoms in block 150 Block first atom: 9284 Blocpdb> 77 atoms in block 151 Block first atom: 9353 Blocpdb> 63 atoms in block 152 Block first atom: 9430 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 9493 Blocpdb> 67 atoms in block 154 Block first atom: 9563 Blocpdb> 58 atoms in block 155 Block first atom: 9630 Blocpdb> 59 atoms in block 156 Block first atom: 9688 Blocpdb> 59 atoms in block 157 Block first atom: 9747 Blocpdb> 60 atoms in block 158 Block first atom: 9806 Blocpdb> 61 atoms in block 159 Block first atom: 9866 Blocpdb> 69 atoms in block 160 Block first atom: 9927 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 9996 Blocpdb> 72 atoms in block 162 Block first atom: 10062 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 10134 Blocpdb> 58 atoms in block 164 Block first atom: 10199 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 10257 Blocpdb> 73 atoms in block 166 Block first atom: 10320 Blocpdb> 61 atoms in block 167 Block first atom: 10393 Blocpdb> 65 atoms in block 168 Block first atom: 10454 Blocpdb> 64 atoms in block 169 Block first atom: 10519 Blocpdb> 64 atoms in block 170 Block first atom: 10583 Blocpdb> 59 atoms in block 171 Block first atom: 10647 Blocpdb> 63 atoms in block 172 Block first atom: 10706 Blocpdb> 58 atoms in block 173 Block first atom: 10769 Blocpdb> 67 atoms in block 174 Block first atom: 10827 Blocpdb> 68 atoms in block 175 Block first atom: 10894 Blocpdb> 61 atoms in block 176 Block first atom: 10962 Blocpdb> 66 atoms in block 177 Block first atom: 11023 Blocpdb> 65 atoms in block 178 Block first atom: 11089 Blocpdb> 65 atoms in block 179 Block first atom: 11154 Blocpdb> 53 atoms in block 180 Block first atom: 11219 Blocpdb> 65 atoms in block 181 Block first atom: 11272 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 11337 Blocpdb> 39 atoms in block 183 Block first atom: 11389 Blocpdb> 61 atoms in block 184 Block first atom: 11427 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 77 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 39 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4016123 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 34464 Prepmat> Matrix trace = 8772480.0000 Prepmat> Last element read: 34464 34464 128.4939 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15777 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11488 RTB> Total mass = 11488.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11488 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 176257.7678 RTB> 41988 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 41988 Diagstd> Projected matrix trace = 176257.7678 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 176257.7678 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0009884 0.0020099 0.0049465 0.0079561 0.0134377 0.0244524 0.0328049 0.0348515 0.0448657 0.0921522 0.1293085 0.1531925 0.2230919 0.2653121 0.3165605 0.3529915 0.4715707 0.4868535 0.6196808 0.6881567 0.7715051 0.9631482 0.9755777 1.1493997 1.2590185 1.3941494 1.5313965 1.8601377 1.9690464 2.0779566 2.2103031 2.4502526 2.5548713 2.6426203 2.9298668 3.0505513 3.3045559 3.4880664 3.7158308 3.9836459 4.4249843 4.5331107 5.1658618 5.5360181 5.5902848 5.7772028 5.9690853 6.3759383 6.4867598 6.9349867 7.1379510 7.4356305 7.6677136 7.7078929 7.8413596 8.0602666 8.4565166 8.7530874 9.0756329 9.4856253 9.8120126 9.8551935 10.2231660 10.3073781 10.3628681 10.8276705 11.3159091 11.5217921 11.8038702 12.1740721 12.7598582 13.0855745 13.1878004 13.2286575 13.7723990 14.2626534 14.7712158 14.7990399 15.3211682 15.3969893 16.5916407 16.9712996 17.5003484 17.5735948 17.8217239 17.9939768 18.7184852 18.8530924 19.3917667 19.8892443 20.6874516 21.1534001 21.2711037 21.5144642 21.6539285 21.9734839 22.1814125 22.4501902 22.5548267 22.8672329 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034339 0.0034342 0.0034345 0.0034349 0.0034356 3.4139852 4.8684030 7.6373544 9.6859923 12.5880416 16.9807056 19.6681941 20.2724351 23.0013124 32.9646334 39.0488971 42.5024586 51.2905267 55.9337297 61.0975241 64.5174808 74.5707826 75.7695038 85.4829108 90.0821923 95.3816201 106.5716855 107.2571417 116.4208621 121.8460188 128.2182769 134.3813808 148.1043550 152.3783450 156.5357405 161.4437369 169.9811288 173.5720517 176.5276175 185.8742462 189.6638006 197.4021299 202.8091996 209.3260334 216.7382908 228.4289518 231.2029885 246.8122277 255.5018390 256.7510610 261.0081607 265.3072830 274.1999259 276.5726230 285.9684345 290.1229344 296.1107538 300.6963956 301.4831999 304.0821761 308.2974871 315.7846623 321.2742458 327.1400683 334.4477382 340.1530184 340.9006735 347.2066121 348.6337144 349.5708946 357.3245010 365.2918694 368.5999716 373.0847453 378.8900622 387.8985934 392.8182693 394.3496533 394.9600474 402.9953901 410.1053593 417.3528668 417.7457603 425.0511750 426.1016186 442.3234326 447.3555502 454.2747809 455.2244548 458.4269442 460.6370416 469.8190590 471.5053000 478.1938313 484.2887960 493.9110900 499.4423573 500.8299504 503.6867746 505.3166750 509.0315960 511.4343328 514.5235914 515.7212507 519.2805875 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11488 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8840E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0099E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9465E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9561E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3438E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4452E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2805E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4851E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4866E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2152E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2231 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6197 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.860 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.555 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.488 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.841 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.076 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.855 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00006 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 206784 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00006 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210317093515117032.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210317093515117032.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210317093515117032.atom Openam> file on opening on unit 11: 210317093515117032.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1468 First residue number = 1 Last residue number = 1468 Number of atoms found = 11488 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8840E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0099E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9465E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9561E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3438E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4452E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2805E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4851E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4866E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2152E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2231 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6197 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.860 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.555 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.777 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.841 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.076 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Bfactors> 106 vectors, 34464 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000988 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.094 for 1468 C-alpha atoms. Bfactors> = 2.797 +/- 1.32 Bfactors> = 82.941 +/- 41.95 Bfactors> Shiftng-fct= 80.144 Bfactors> Scaling-fct= 31.884 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210317093515117032.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210317093515117032.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.868 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.9 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Chkmod> That is: 11488 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 88 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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calculating perturbed structure for DQ=-120 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=120 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=160 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=200 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=240 210317093515117032.eigenfacs 210317093515117032.atom calculating perturbed structure for DQ=280 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MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 210317093515117032.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 210317093515117032.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210317093515117032 8 -1000 1000 40 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed 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