CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  EXP_4XFX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000  ***

CA distance fluctuations for 24021912421241012

---  normal mode 15  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLU 119 0.65 MET 1 -0.64 GLY 85
GLU 36 0.70 VAL 2 -0.53 PRO 84
GLY 37 0.83 HIS 3 -0.43 GLN 103
GLU 36 0.77 GLN 4 -0.32 PRO 84
GLU 36 0.28 ALA 5 -0.28 GLN 170
LEU 34 0.19 ILE 6 -0.38 GLN 170
THR 98 0.19 SER 7 -0.50 GLN 170
THR 45 0.34 PRO 8 -0.45 GLN 170
THR 49 0.23 ARG 9 -0.57 GLN 170
GLN 4 0.15 THR 10 -0.57 GLN 170
ARG 9 0.21 LEU 11 -0.44 GLN 170
GLY 51 0.24 ASN 12 -0.46 GLN 170
VAL 2 0.17 ALA 13 -0.52 GLN 170
VAL 2 0.16 TRP 14 -0.48 GLN 170
GLY 52 0.20 VAL 15 -0.37 GLN 170
GLY 52 0.17 LYS 16 -0.40 GLN 170
MET 1 0.22 VAL 17 -0.42 GLN 170
MET 1 0.17 VAL 18 -0.32 GLN 170
GLY 52 0.17 GLU 19 -0.27 GLN 170
MET 1 0.18 GLU 20 -0.30 GLN 170
MET 1 0.25 LYS 21 -0.29 GLN 170
MET 1 0.20 ALA 22 -0.22 GLN 170
MET 1 0.25 PHE 23 -0.20 GLN 170
MET 1 0.31 SER 24 -0.24 GLN 170
MET 1 0.38 PRO 25 -0.29 GLN 170
MET 1 0.38 GLU 26 -0.45 GLN 170
MET 1 0.35 VAL 27 -0.45 GLN 170
MET 1 0.46 ILE 28 -0.53 GLN 170
MET 1 0.55 PRO 29 -0.79 GLN 170
MET 1 0.44 MET 30 -0.66 GLN 170
MET 1 0.40 PHE 31 -0.57 GLN 170
MET 1 0.58 SER 32 -0.68 GLN 170
VAL 2 0.59 ALA 33 -0.76 GLN 170
GLN 4 0.51 LEU 34 -0.62 GLN 170
GLN 4 0.54 SER 35 -0.53 GLN 170
GLN 4 0.77 GLU 36 -0.54 GLN 170
HIS 3 0.83 GLY 37 -0.43 SER 7
HIS 3 0.54 ALA 38 -0.39 SER 169
HIS 3 0.29 THR 39 -0.33 SER 169
MET 1 0.15 PRO 40 -0.33 SER 169
PRO 8 0.21 GLN 41 -0.31 SER 169
PRO 8 0.16 ASP 42 -0.33 SER 169
MET 1 0.17 LEU 43 -0.36 SER 169
PRO 8 0.28 ASN 44 -0.30 SER 169
PRO 8 0.34 THR 45 -0.31 GLN 170
PRO 8 0.23 MET 46 -0.36 GLN 170
PRO 8 0.22 LEU 47 -0.30 GLN 170
PRO 8 0.32 ASN 48 -0.26 GLN 170
PRO 8 0.28 THR 49 -0.29 GLN 170
LYS 61 0.21 VAL 50 -0.26 GLN 170
ASN 12 0.24 GLY 51 -0.20 GLN 170
ASN 12 0.22 GLY 52 -0.19 LEU 102
ASN 12 0.14 HIS 53 -0.20 GLN 41
PRO 8 0.15 GLN 54 -0.24 LEU 102
PRO 8 0.13 ALA 55 -0.22 THR 98
MET 1 0.14 ALA 56 -0.20 THR 98
VAL 50 0.18 MET 57 -0.24 THR 98
PRO 8 0.16 GLN 58 -0.28 THR 98
MET 1 0.18 MET 59 -0.22 THR 98
MET 1 0.20 LEU 60 -0.23 THR 98
VAL 50 0.21 LYS 61 -0.31 THR 98
MET 1 0.17 GLU 62 -0.24 THR 98
MET 1 0.27 THR 63 -0.16 THR 98
MET 1 0.24 ILE 64 -0.20 SER 169
ASN 48 0.21 ASN 65 -0.18 THR 98
MET 1 0.24 GLU 66 -0.14 PRO 198
MET 1 0.31 GLU 67 -0.18 SER 169
MET 1 0.23 ALA 68 -0.18 SER 169
MET 1 0.19 ALA 69 -0.14 PRO 198
MET 1 0.26 GLU 70 -0.13 PRO 198
MET 1 0.27 TRP 71 -0.15 SER 169
PRO 113 0.19 ASP 72 -0.12 PRO 198
PRO 81 0.22 ARG 73 -0.11 PRO 198
MET 1 0.26 LEU 74 -0.12 GLN 86
PRO 113 0.26 HIS 75 -0.14 GLN 86
PRO 81 0.28 PRO 76 -0.10 GLN 86
ILE 82 0.27 VAL 77 -0.13 THR 101
PRO 113 0.31 HIS 78 -0.35 ARG 88
PRO 113 0.27 ALA 79 -0.34 ARG 88
PRO 113 0.26 GLY 80 -0.39 THR 101
PRO 76 0.28 PRO 81 -0.42 VAL 2
VAL 77 0.27 ILE 82 -0.42 VAL 2
ALA 69 0.04 ALA 83 -0.39 MET 1
THR 99 0.25 PRO 84 -0.63 MET 1
THR 99 0.31 GLY 85 -0.67 ASN 112
THR 99 0.18 GLN 86 -0.39 HIS 111
GLN 86 0.15 MET 87 -0.31 GLY 80
PRO 84 0.17 ARG 88 -0.35 HIS 78
PRO 113 0.26 GLU 89 -0.19 SER 169
PRO 113 0.16 PRO 90 -0.22 SER 169
PRO 84 0.17 ARG 91 -0.19 SER 169
MET 1 0.16 GLY 92 -0.20 SER 169
PRO 8 0.19 SER 93 -0.21 SER 169
PRO 8 0.15 ASP 94 -0.23 SER 169
MET 1 0.18 ILE 95 -0.27 SER 169
PRO 8 0.18 ALA 96 -0.27 SER 169
PRO 8 0.22 GLY 97 -0.27 SER 169
PRO 8 0.29 THR 98 -0.31 LYS 61
GLY 85 0.31 THR 99 -0.32 GLY 80
GLY 85 0.24 SER 100 -0.34 GLY 80
PRO 8 0.21 THR 101 -0.39 GLY 80
PRO 8 0.13 LEU 102 -0.32 GLY 80
GLY 107 0.09 GLN 103 -0.44 VAL 2
GLY 107 0.09 GLU 104 -0.36 GLY 80
GLN 103 0.08 GLN 105 -0.27 SER 169
GLU 119 0.14 ILE 106 -0.26 GLY 85
GLU 104 0.09 GLY 107 -0.31 GLY 85
PRO 113 0.06 TRP 108 -0.30 GLY 85
MET 1 0.28 MET 109 -0.36 GLY 85
VAL 2 0.19 THR 110 -0.55 GLY 85
GLU 89 0.09 HIS 111 -0.60 GLY 85
HIS 78 0.19 ASN 112 -0.67 GLY 85
HIS 78 0.31 PRO 113 -0.51 GLY 85
MET 1 0.30 PRO 114 -0.45 GLY 85
MET 1 0.35 ILE 115 -0.35 GLY 85
MET 1 0.55 PRO 116 -0.34 SER 169
MET 1 0.37 VAL 117 -0.32 SER 169
MET 1 0.45 GLY 118 -0.38 SER 169
MET 1 0.65 GLU 119 -0.45 SER 169
MET 1 0.52 ILE 120 -0.39 SER 169
MET 1 0.39 TYR 121 -0.36 SER 169
MET 1 0.48 LYS 122 -0.47 SER 169
MET 1 0.54 ARG 123 -0.49 SER 169
MET 1 0.41 TRP 124 -0.36 SER 169
MET 1 0.36 ILE 125 -0.35 SER 169
MET 1 0.46 ILE 126 -0.46 SER 169
MET 1 0.44 LEU 127 -0.32 SER 169
MET 1 0.33 GLY 128 -0.19 SER 169
MET 1 0.34 LEU 129 -0.23 SER 169
MET 1 0.40 ASN 130 -0.22 SER 140
MET 1 0.34 LYS 131 -0.19 SER 140
MET 1 0.28 ILE 132 -0.15 THR 98
MET 1 0.31 VAL 133 -0.19 SER 140
MET 1 0.31 ARG 134 -0.25 SER 140
MET 1 0.26 MET 135 -0.13 THR 98
MET 1 0.24 TYR 136 -0.13 THR 98
MET 1 0.27 SER 137 -0.17 THR 139
MET 1 0.25 PRO 138 -0.12 PRO 187
MET 1 0.24 THR 139 -0.20 PRO 25
VAL 172 0.28 SER 140 -0.26 PRO 29
MET 1 0.26 ILE 141 -0.31 PRO 29
VAL 172 0.32 LEU 142 -0.28 PRO 29
VAL 172 0.25 ASP 143 -0.24 PRO 29
MET 1 0.24 ILE 144 -0.24 PRO 29
MET 1 0.22 ARG 145 -0.23 ARG 9
MET 1 0.23 GLN 146 -0.23 ARG 9
MET 1 0.19 GLY 147 -0.22 ARG 9
MET 1 0.19 PRO 148 -0.20 ARG 9
MET 1 0.19 LYS 149 -0.20 ARG 9
MET 1 0.20 GLU 150 -0.22 ARG 9
MET 1 0.23 PRO 151 -0.23 ARG 9
MET 1 0.26 PHE 152 -0.25 ARG 9
MET 1 0.27 ARG 153 -0.27 ARG 9
MET 1 0.24 ASP 154 -0.27 ARG 9
MET 1 0.25 TYR 155 -0.26 ARG 9
MET 1 0.28 VAL 156 -0.30 ARG 9
MET 1 0.28 ASP 157 -0.31 ARG 9
MET 1 0.25 ARG 158 -0.28 ARG 9
MET 1 0.28 PHE 159 -0.29 ARG 9
MET 1 0.31 TYR 160 -0.35 ARG 9
MET 1 0.31 LYS 161 -0.31 ALA 13
MET 1 0.29 THR 162 -0.29 PRO 29
MET 1 0.33 LEU 163 -0.37 PRO 29
MET 1 0.36 ARG 164 -0.47 PRO 29
MET 1 0.35 ALA 165 -0.29 PRO 29
MET 1 0.33 GLU 166 -0.39 PRO 29
MET 1 0.36 GLN 167 -0.38 PRO 29
MET 1 0.31 ALA 168 -0.47 PRO 29
SER 140 0.21 SER 169 -0.72 PRO 29
MET 1 0.25 GLN 170 -0.79 PRO 29
MET 1 0.21 GLU 171 -0.64 ALA 33
LEU 142 0.32 VAL 172 -0.51 PRO 29
MET 1 0.30 LYS 173 -0.53 PRO 29
MET 1 0.30 ASN 174 -0.49 PRO 29
MET 1 0.28 TRP 175 -0.40 PRO 29
MET 1 0.29 MET 176 -0.38 PRO 29
MET 1 0.33 THR 177 -0.35 ARG 9
MET 1 0.32 GLU 178 -0.33 PRO 198
MET 1 0.28 THR 179 -0.53 PRO 198
MET 1 0.26 LEU 180 -0.38 PRO 198
MET 1 0.28 LEU 181 -0.29 ARG 9
MET 1 0.28 VAL 182 -0.29 PRO 198
MET 1 0.25 GLN 183 -0.35 PRO 198
MET 1 0.24 ASN 184 -0.25 PRO 198
MET 1 0.25 ALA 185 -0.24 ARG 9
MET 1 0.22 ASN 186 -0.22 ARG 9
MET 1 0.23 PRO 187 -0.21 ARG 9
MET 1 0.24 ASP 188 -0.20 ARG 9
MET 1 0.26 CYS 189 -0.22 ARG 9
MET 1 0.26 LYS 190 -0.22 ARG 9
MET 1 0.27 THR 191 -0.20 ARG 9
MET 1 0.29 ILE 192 -0.20 ARG 9
MET 1 0.31 LEU 193 -0.22 ARG 9
MET 1 0.30 LYS 194 -0.21 ARG 9
MET 1 0.31 ALA 195 -0.20 ARG 9
MET 1 0.33 LEU 196 -0.21 ARG 9
MET 1 0.34 GLY 197 -0.31 THR 179
MET 1 0.34 PRO 198 -0.53 THR 179
MET 1 0.40 GLY 199 -0.24 ARG 9
MET 1 0.39 ALA 200 -0.24 ARG 9
MET 1 0.40 THR 201 -0.34 GLU 171
MET 1 0.37 LEU 202 -0.34 ASN 174
MET 1 0.38 GLU 203 -0.29 GLU 171
MET 1 0.37 GLU 204 -0.24 GLU 171
MET 1 0.33 MET 205 -0.24 ARG 9
MET 1 0.32 MET 206 -0.24 ARG 9
MET 1 0.33 THR 207 -0.21 ARG 9
MET 1 0.31 ALA 208 -0.20 ARG 9
MET 1 0.28 CYS 209 -0.21 ARG 9
MET 1 0.28 GLN 210 -0.20 ARG 9
MET 1 0.24 GLY 211 -0.19 ARG 9
MET 1 0.24 VAL 212 -0.20 ARG 9

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.