***  PlanNO.2model1-TLR4-MD2-model1  ***

CA distance fluctuations for 2401150634111121472

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner). The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations. [HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase			ref	largest decrease
ALA 16		0.02	PRO 1	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	CYS 2	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ILE 3	-0.00		SER 228
ALA 16		0.03	GLU 4	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	VAL 5	-0.00		SER 228
ALA 16		0.03	VAL 6	-0.00		SER 228
ALA 16		0.03	PRO 7	-0.00		SER 228
ALA 16		0.03	ASN 8	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ILE 9	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	THR 10	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	TYR 11	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	GLN 12	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	CYS 13	-0.00		SER 228
ASN 34		0.02	MET 14	-0.01		SER 228
ASN 34		0.02	ASP 15	-0.01		SER 228
ASN 34		0.02	GLN 16	-0.00		SER 228
ASN 34		0.02	LYS 17	-0.00		SER 228
ASN 34		0.02	LEU 18	-0.00		SER 228
ASN 34		0.02	SER 19	-0.00		SER 228
ASN 34		0.02	LYS 20	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	VAL 21	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	PRO 22	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ASP 23	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ASP 24	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ILE 25	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	PRO 26	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	SER 27	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	SER 28	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	THR 29	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	LYS 30	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	ASN 31	-0.00		SER 228
LEU 23		0.02	ILE 32	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	ASP 33	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 34	-0.01		SER 228
PRO 160		0.02	SER 35	-0.01		SER 228
PRO 160		0.02	PHE 36	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	ASN 37	-0.01		SER 228
PRO 334		0.01	PRO 38	-0.01		SER 228
PRO 334		0.01	LEU 39	-0.00		SER 228
PRO 334		0.01	LYS 40	-0.01		SER 228
PRO 334		0.01	ILE 41	-0.00		SER 228
GLY 333		0.01	LEU 42	-0.00		SER 228
PRO 334		0.01	LYS 43	-0.00		SER 228
PRO 334		0.01	SER 44	-0.00		SER 228
GLU 30		0.01	TYR 45	-0.00		SER 228
GLU 30		0.01	SER 46	-0.00		SER 228
LEU 23		0.01	PHE 47	-0.00		SER 228
LEU 23		0.01	SER 48	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	ASN 49	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	PHE 50	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	SER 51	-0.00		SER 228
ALA 16		0.02	GLU 52	-0.00		SER 228
LEU 23		0.01	LEU 53	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	GLN 54	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	TRP 55	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 56	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	ASP 57	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 58	-0.01		SER 228
PRO 160		0.02	SER 59	-0.01		SER 228
PRO 160		0.02	ARG 60	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	CYS 61	-0.01		SER 228
PRO 334		0.01	GLU 62	-0.01		SER 228
GLY 333		0.01	ILE 63	-0.01		SER 228
PRO 334		0.01	GLU 64	-0.01		GLU 3
PRO 334		0.01	THR 65	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	ILE 66	-0.01		GLU 3
PRO 334		0.01	GLU 67	-0.00		SER 228
GLY 333		0.01	ASP 68	-0.00		SER 228
GLY 333		0.01	LYS 69	-0.00		SER 228
GLY 333		0.01	ALA 70	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	TRP 71	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	HIS 72	-0.00		SER 228
LEU 23		0.01	GLY 73	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 74	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	HIS 75	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	HIS 76	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 77	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	SER 78	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	ASN 79	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 80	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	ILE 81	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 82	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.02	THR 83	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.02	GLY 84	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	ASN 85	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.02	PRO 86	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	ILE 87	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	GLN 88	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 89	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 90	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 91	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	PRO 92	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	GLY 93	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 94	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 95	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 96	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	GLY 97	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 98	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	THR 99	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	SER 100	-0.00		SER 228
PRO 160		0.01	LEU 101	-0.01		SER 228
PRO 160		0.01	GLU 102	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	ASN 103	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LEU 104	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	VAL 105	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	ALA 106	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.02	VAL 107	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	GLU 108	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.02	THR 109	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.02	LYS 110	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.02	LEU 111	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.02	ALA 112	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 113	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	LEU 114	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	GLU 115	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 116	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 117	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	PRO 118	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	ILE 119	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	GLY 120	-0.01		GLU 3
GLY 333		0.01	GLN 121	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LEU 122	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	ILE 123	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	THR 124	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LEU 125	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LYS 126	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LYS 127	-0.01		GLU 3
PRO 160		0.01	LEU 128	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	ASN 129	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	VAL 130	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	ALA 131	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	HIS 132	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 133	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.02	PHE 134	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 135	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	HIS 136	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	SER 137	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	CYS 138	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	LYS 139	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	LEU 140	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	PRO 141	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	ALA 142	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	TYR 143	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 144	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	SER 145	-0.02		GLU 3
GLY 333		0.01	ASN 146	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	LEU 147	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	THR 148	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	ASN 149	-0.01		GLU 3
ALA 163		0.01	LEU 150	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	VAL 151	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	HIS 152	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	VAL 153	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	ASP 154	-0.02		GLU 3
PRO 160		0.02	LEU 155	-0.03		GLU 3
PRO 160		0.02	SER 156	-0.03		GLU 3
PRO 160		0.02	TYR 157	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 158	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	TYR 159	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 160	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	GLN 161	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.02	THR 162	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 163	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	THR 164	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	VAL 165	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	ASN 166	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	ASP 167	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	LEU 168	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	GLN 169	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 170	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	LEU 171	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	ARG 172	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	GLU 173	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.01	ASN 174	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.01	PRO 175	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.01	GLN 176	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.01	VAL 177	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	ASN 178	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	LEU 179	-0.02		GLU 3
ALA 163		0.01	SER 180	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	LEU 181	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	ASP 182	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	MET 183	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	SER 184	-0.03		GLU 3
PRO 160		0.02	LEU 185	-0.03		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 186	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.02	PRO 187	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 188	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.02	ASP 189	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	PHE 190	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 191	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	GLN 192	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	ASP 193	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	GLN 194	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	ALA 195	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	PHE 196	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	GLN 197	-0.04		GLU 3
GLY 333		0.01	GLY 198	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.01	ILE 199	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.01	LYS 200	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.01	LEU 201	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.01	HIS 202	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	GLU 203	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	LEU 204	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	THR 205	-0.03		GLU 3
ALA 163		0.02	LEU 206	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	ARG 207	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	GLY 208	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	ASN 209	-0.04		GLU 3
ARG 331		0.02	PHE 210	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 211	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	SER 212	-0.05		GLU 3
ARG 331		0.02	SER 213	-0.06		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 214	-0.06		GLU 3
GLY 333		0.02	ILE 215	-0.05		GLU 3
ARG 331		0.02	MET 216	-0.05		GLU 3
ARG 331		0.02	LYS 217	-0.06		GLU 3
GLY 333		0.02	THR 218	-0.06		GLU 3
GLY 333		0.02	CYS 219	-0.05		GLU 3
ALA 163		0.02	LEU 220	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	GLN 221	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.02	ASN 222	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	LEU 223	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	ALA 224	-0.05		GLU 3
GLY 333		0.01	GLY 225	-0.05		GLU 3
ALA 163		0.01	LEU 226	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.01	HIS 227	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.01	VAL 228	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.01	HIS 229	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	ARG 230	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	LEU 231	-0.04		GLU 3
ALA 163		0.02	ILE 232	-0.04		ASN 6
ALA 163		0.02	LEU 233	-0.04		ASN 6
ALA 163		0.02	GLY 234	-0.04		ASN 6
ALA 163		0.02	GLU 235	-0.04		ASN 6
PRO 160		0.02	PHE 236	-0.04		ASN 6
PRO 160		0.03	LYS 237	-0.04		ASN 6
PRO 160		0.02	ASP 238	-0.04		ASN 6
PRO 160		0.02	GLU 239	-0.04		ASN 6
ARG 331		0.02	ARG 240	-0.04		GLU 3
PRO 160		0.02	ASN 241	-0.05		ASN 6
ALA 163		0.02	LEU 242	-0.05		ASN 6
ARG 331		0.03	GLU 243	-0.06		ASN 6
ALA 163		0.03	ILE 244	-0.06		ASN 6
ALA 163		0.03	PHE 245	-0.06		ASN 6
ALA 163		0.03	GLU 246	-0.07		ASN 6
ALA 163		0.02	PRO 247	-0.07		ASN 6
ALA 163		0.02	SER 248	-0.07		ASN 6
ALA 163		0.02	ILE 249	-0.06		ASN 6
ALA 163		0.02	MET 250	-0.06		ASN 6
PRO 165		0.02	GLU 251	-0.06		GLU 3
PRO 165		0.02	GLY 252	-0.06		GLU 3
PRO 165		0.02	LEU 253	-0.05		GLU 3
PRO 165		0.02	CYS 254	-0.06		GLU 3
PRO 165		0.01	ASP 255	-0.05		GLU 3
PRO 165		0.01	VAL 256	-0.05		GLU 3
PRO 165		0.01	THR 257	-0.05		GLU 3
PRO 165		0.02	ILE 258	-0.04		GLU 3
PRO 165		0.02	ASP 259	-0.04		ASN 6
PRO 165		0.02	GLU 260	-0.04		ASN 6
ALA 163		0.02	PHE 261	-0.04		ASN 6
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ALA 163		0.02	LEU 263	-0.04		ASN 6
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