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***  PlanNO.2model1-TLR4-MD2-model1  ***

CA distance fluctuations for 2401150634111121472

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
PRO 171 0.11 PRO 1 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.12 CYS 2 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.12 ILE 3 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.12 GLU 4 -0.08 VAL 155
PRO 171 0.13 VAL 5 -0.08 VAL 155
LYS 173 0.13 VAL 6 -0.08 VAL 155
LYS 173 0.13 PRO 7 -0.08 VAL 155
LYS 173 0.13 ASN 8 -0.07 VAL 155
LYS 173 0.14 ILE 9 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.14 THR 10 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.13 TYR 11 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.13 GLN 12 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.13 CYS 13 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.13 MET 14 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.12 ASP 15 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.12 GLN 16 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.12 LYS 17 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.12 LEU 18 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.12 SER 19 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.13 LYS 20 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.13 VAL 21 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.13 PRO 22 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.13 ASP 23 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.12 ASP 24 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.13 ILE 25 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.13 PRO 26 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.14 SER 27 -0.07 GLY 156
LYS 173 0.14 SER 28 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.14 THR 29 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 LYS 30 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 ASN 31 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 ILE 32 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 ASP 33 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 LEU 34 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 SER 35 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.13 PHE 36 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.13 ASN 37 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.13 PRO 38 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 LEU 39 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 LYS 40 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 ILE 41 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 LEU 42 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.14 LYS 43 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 SER 44 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.15 TYR 45 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.14 SER 46 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 PHE 47 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 SER 48 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.14 ASN 49 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.15 PHE 50 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 SER 51 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.16 GLU 52 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 LEU 53 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 GLN 54 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 TRP 55 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 LEU 56 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.16 ASP 57 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 LEU 58 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 SER 59 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.15 ARG 60 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.14 CYS 61 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.14 GLU 62 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 ILE 63 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 GLU 64 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 THR 65 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 ILE 66 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.15 GLU 67 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 ASP 68 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.16 LYS 69 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.16 ALA 70 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 TRP 71 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 HIS 72 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.16 GLY 73 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.16 LEU 74 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 HIS 75 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 HIS 76 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 LEU 77 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.18 SER 78 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.18 ASN 79 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.18 LEU 80 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 ILE 81 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.17 LEU 82 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.17 THR 83 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.16 GLY 84 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 ASN 85 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.15 PRO 86 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.16 ILE 87 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.16 GLN 88 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 SER 89 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 PHE 90 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.17 SER 91 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.18 PRO 92 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 GLY 93 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 SER 94 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.18 PHE 95 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.18 SER 96 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.17 GLY 97 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.18 LEU 98 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.18 THR 99 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.19 SER 100 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.19 LEU 101 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 GLU 102 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.20 ASN 103 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.19 LEU 104 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.19 VAL 105 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 ALA 106 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 VAL 107 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.17 GLU 108 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.17 THR 109 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.17 LYS 110 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 LEU 111 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.18 ALA 112 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.19 SER 113 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 LEU 114 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 GLU 115 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.19 SER 116 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.19 PHE 117 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.19 PRO 118 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 ILE 119 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 GLY 120 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 GLN 121 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.20 LEU 122 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.21 ILE 123 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.21 THR 124 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.21 LEU 125 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.22 LYS 126 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.22 LYS 127 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 LEU 128 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.20 ASN 129 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.20 VAL 130 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.19 ALA 131 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 HIS 132 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 ASN 133 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.18 PHE 134 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.19 ILE 135 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.20 HIS 136 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 SER 137 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.22 CYS 138 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.23 LYS 139 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.23 LEU 140 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.22 PRO 141 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.22 ALA 142 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.22 TYR 143 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.23 PHE 144 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.23 SER 145 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.22 ASN 146 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.22 LEU 147 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.23 THR 148 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.23 ASN 149 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.23 LEU 150 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.24 VAL 151 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.24 HIS 152 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.23 VAL 153 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.22 ASP 154 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 LEU 155 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 SER 156 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.19 TYR 157 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.19 ASN 158 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.20 TYR 159 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 ILE 160 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.21 GLN 161 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.23 THR 162 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.24 ILE 163 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.24 THR 164 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.25 VAL 165 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.24 ASN 166 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.24 ASP 167 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.25 LEU 168 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.25 GLN 169 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.25 PHE 170 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.27 LEU 171 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.27 ARG 172 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.26 GLU 173 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.27 ASN 174 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.29 PRO 175 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.28 GLN 176 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.27 VAL 177 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.27 ASN 178 -0.05 GLY 156
PRO 171 0.26 LEU 179 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.26 SER 180 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.25 LEU 181 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.24 ASP 182 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.23 MET 183 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.22 SER 184 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.20 LEU 185 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.21 ASN 186 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.20 PRO 187 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.22 ILE 188 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.22 ASP 189 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.23 PHE 190 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.25 ILE 191 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.25 GLN 192 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.27 ASP 193 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.28 GLN 194 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.27 ALA 195 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.29 PHE 196 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.30 GLN 197 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.30 GLY 198 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.29 ILE 199 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.30 LYS 200 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.29 LEU 201 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.29 HIS 202 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.28 GLU 203 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.27 LEU 204 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.25 THR 205 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.25 LEU 206 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.23 ARG 207 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.21 GLY 208 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.22 ASN 209 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.22 PHE 210 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.20 ASN 211 -0.08 GLY 156
LYS 168 0.21 SER 212 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.24 SER 213 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.23 ASN 214 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.23 ILE 215 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.25 MET 216 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.27 LYS 217 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.26 THR 218 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.26 CYS 219 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.28 LEU 220 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.30 GLN 221 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.29 ASN 222 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.30 LEU 223 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.32 ALA 224 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.32 GLY 225 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.32 LEU 226 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.33 HIS 227 -0.05 PRO 295
PRO 171 0.32 VAL 228 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.32 HIS 229 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.31 ARG 230 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.30 LEU 231 -0.06 GLY 156
PRO 171 0.27 ILE 232 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.26 LEU 233 -0.07 GLY 156
PRO 171 0.24 GLY 234 -0.08 GLY 156
PRO 171 0.22 GLU 235 -0.09 GLY 156
PRO 171 0.19 PHE 236 -0.10 GLY 156
LYS 168 0.18 LYS 237 -0.11 GLY 156
LYS 168 0.16 ASP 238 -0.11 GLY 156
PRO 171 0.18 GLU 239 -0.10 GLY 156
PRO 171 0.18 ARG 240 -0.09 GLY 156
LYS 168 0.19 ASN 241 -0.09 GLY 156
LYS 168 0.21 LEU 242 -0.08 GLY 156
LYS 168 0.20 GLU 243 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.22 ILE 244 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.25 PHE 245 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.28 GLU 246 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.32 PRO 247 -0.08 PRO 295
LYS 168 0.31 SER 248 -0.07 PRO 295
LYS 168 0.29 ILE 249 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.31 MET 250 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.33 GLU 251 -0.07 PRO 295
PRO 171 0.33 GLY 252 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.34 LEU 253 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.37 CYS 254 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.36 ASP 255 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.34 VAL 256 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.36 THR 257 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.36 ILE 258 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.36 ASP 259 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.34 GLU 260 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.32 PHE 261 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.29 ARG 262 -0.07 ILE 157
PRO 171 0.27 LEU 263 -0.08 ILE 157
ALA 169 0.24 THR 264 -0.09 ILE 157
LYS 168 0.22 TYR 265 -0.10 ILE 157
LYS 168 0.23 THR 266 -0.10 ILE 157
LYS 168 0.20 ASN 267 -0.10 GLY 156
LYS 168 0.22 ASP 268 -0.09 GLY 156
LYS 168 0.25 PHE 269 -0.09 ILE 157
LYS 168 0.28 SER 270 -0.09 GLY 296
LYS 168 0.31 ASP 271 -0.08 GLY 296
LYS 168 0.36 ASP 272 -0.08 GLY 296
LYS 168 0.34 ILE 273 -0.08 GLY 296
LYS 168 0.35 VAL 274 -0.07 GLY 296
LYS 168 0.41 LYS 275 -0.07 GLY 296
LYS 168 0.40 PHE 276 -0.07 GLY 296
LYS 168 0.42 HIS 277 -0.07 GLY 296
PRO 171 0.39 CYS 278 -0.06 PRO 295
PRO 171 0.39 LEU 279 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.45 ALA 280 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.45 ASN 281 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.41 VAL 282 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.40 SER 283 -0.06 GLY 296
PRO 171 0.36 ALA 284 -0.06 GLY 296
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GLY 254 0.10 ASN 4 -0.18 LYS 174
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GLY 254 0.11 ILE 7 -0.19 LYS 174
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LYS 290 0.11 ILE 10 -0.20 LYS 174
GLY 254 0.13 LYS 11 -0.19 LYS 174
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PRO 255 0.12 PRO 13 -0.19 LYS 174
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PRO 255 0.15 GLY 19 -0.17 LYS 174
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PRO 255 0.17 ASP 22 -0.17 SER 228
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PRO 255 0.14 ALA 26 -0.17 SER 228
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ASN 285 0.12 VAL 28 -0.16 PRO 336
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ASP 229 0.02 ARG 56 -0.18 LEU 154
SER 365 0.01 LEU 57 -0.21 LEU 154
ASP 229 0.01 THR 58 -0.20 LEU 154
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ASP 229 0.02 GLY 86 -0.15 VAL 155
ASP 229 0.02 TYR 87 -0.16 ALA 151
ARG 38 0.01 LEU 88 -0.13 ALA 151
ASP 229 0.02 GLU 89 -0.12 ALA 151
ASP 229 0.02 ALA 90 -0.13 ALA 151
ARG 38 0.02 ALA 91 -0.13 GLY 148
ARG 38 0.02 THR 92 -0.10 GLY 148
ASP 229 0.02 SER 93 -0.10 ALA 151
ARG 38 0.02 ARG 94 -0.11 THR 144
ARG 38 0.02 TYR 95 -0.12 ALA 176
ASN 34 0.02 ASN 96 -0.12 ALA 176
ARG 38 0.02 GLU 97 -0.12 ALA 176
ASN 34 0.02 LEU 98 -0.14 ALA 176
ASN 34 0.02 VAL 99 -0.14 ALA 176
TRP 251 0.02 GLU 100 -0.13 ALA 176
TRP 251 0.02 ARG 101 -0.14 ALA 176
PRO 253 0.02 GLY 102 -0.16 ALA 176
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PRO 253 0.04 SER 111 -0.16 LYS 174
PRO 253 0.04 GLN 112 -0.17 LYS 174
GLY 254 0.04 GLN 113 -0.18 LYS 174
PRO 253 0.04 SER 114 -0.18 LYS 174
GLY 254 0.05 PHE 115 -0.18 LYS 174
GLY 254 0.04 GLU 116 -0.20 LYS 174
GLY 254 0.05 GLU 117 -0.20 LYS 174
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GLY 254 0.03 ALA 120 -0.24 LYS 174
ALA 12 0.05 PRO 121 -0.24 LYS 174
ALA 12 0.04 ALA 122 -0.25 LYS 174
ALA 12 0.05 GLU 123 -0.27 LYS 174
PRO 13 0.09 GLY 124 -0.27 LYS 174
PRO 13 0.08 TYR 125 -0.25 LYS 174
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