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***  PlanNO.2model1-TLR4-MD2-model1  ***

CA distance fluctuations for 2401150634111121472

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
LYS 168 0.08 PRO 1 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 CYS 2 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 ILE 3 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 GLU 4 -0.05 GLY 240
LYS 168 0.09 VAL 5 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 VAL 6 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.08 PRO 7 -0.05 GLY 240
LYS 168 0.07 ASN 8 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 9 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.08 THR 10 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 TYR 11 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.09 GLN 12 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 CYS 13 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.09 MET 14 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 ASP 15 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 GLN 16 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 LYS 17 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 LEU 18 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.08 SER 19 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LYS 20 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 VAL 21 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 PRO 22 -0.06 GLY 240
LYS 168 0.07 ASP 23 -0.05 GLY 240
LYS 168 0.07 ASP 24 -0.05 GLY 240
LYS 168 0.07 ILE 25 -0.05 GLY 240
LYS 168 0.07 PRO 26 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 27 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 28 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 THR 29 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.08 LYS 30 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.08 ASN 31 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 32 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.09 ASP 33 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 34 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.09 SER 35 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 PHE 36 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ASN 37 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 PRO 38 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 39 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LYS 40 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 ILE 41 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 42 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LYS 43 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 44 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 TYR 45 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 46 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 PHE 47 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 48 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 ASN 49 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 PHE 50 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 51 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 GLU 52 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 53 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 GLN 54 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 TRP 55 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 56 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.09 ASP 57 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 58 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 SER 59 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 ARG 60 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 CYS 61 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 GLU 62 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 63 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 GLU 64 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 THR 65 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 ILE 66 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 GLU 67 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 ASP 68 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 LYS 69 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 ALA 70 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 TRP 71 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 HIS 72 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 GLY 73 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 74 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 HIS 75 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 HIS 76 -0.05 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 77 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 78 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 ASN 79 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 80 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 81 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 82 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 THR 83 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 GLY 84 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ASN 85 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 PRO 86 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 87 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 GLN 88 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 89 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 PHE 90 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 91 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 PRO 92 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 GLY 93 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 94 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 PHE 95 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 96 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 GLY 97 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 98 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 THR 99 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 100 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 101 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 GLU 102 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 ASN 103 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 104 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 VAL 105 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ALA 106 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 VAL 107 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.09 GLU 108 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 THR 109 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LYS 110 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 111 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 ALA 112 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 113 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 114 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 GLU 115 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 116 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 PHE 117 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 PRO 118 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 ILE 119 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 GLY 120 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 GLN 121 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 LEU 122 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 ILE 123 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 THR 124 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 125 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LYS 126 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.08 LYS 127 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 LEU 128 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 ASN 129 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 VAL 130 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 ALA 131 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.09 HIS 132 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.09 ASN 133 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 PHE 134 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 135 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 HIS 136 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.07 SER 137 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 CYS 138 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.07 LYS 139 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.07 LEU 140 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 PRO 141 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 ALA 142 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 TYR 143 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 PHE 144 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.06 SER 145 -0.06 VAL 155
LYS 168 0.06 ASN 146 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 LEU 147 -0.06 ASP 271
LYS 168 0.06 THR 148 -0.06 VAL 155
LYS 168 0.07 ASN 149 -0.06 VAL 155
LYS 168 0.07 LEU 150 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.08 VAL 151 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.08 HIS 152 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.08 VAL 153 -0.07 ASP 271
LYS 168 0.09 ASP 154 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.09 LEU 155 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.10 SER 156 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.10 TYR 157 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.09 ASN 158 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.09 TYR 159 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 ILE 160 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 GLN 161 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.08 THR 162 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.07 ILE 163 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.06 THR 164 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.06 VAL 165 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.06 ASN 166 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.06 ASP 167 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.06 LEU 168 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.05 GLN 169 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.06 PHE 170 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.06 LEU 171 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.05 ARG 172 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.05 GLU 173 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.05 ASN 174 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.05 PRO 175 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.05 GLN 176 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.06 VAL 177 -0.07 VAL 155
LYS 168 0.07 ASN 178 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.08 LEU 179 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.09 SER 180 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.09 LEU 181 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.10 ASP 182 -0.08 VAL 155
LYS 168 0.10 MET 183 -0.08 ASP 271
LYS 168 0.11 SER 184 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.11 LEU 185 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.10 ASN 186 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.10 PRO 187 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.09 ILE 188 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.09 ASP 189 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.08 PHE 190 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.07 ILE 191 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 GLN 192 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 ASP 193 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 GLN 194 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 ALA 195 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.07 PHE 196 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 GLN 197 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.05 GLY 198 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.06 ILE 199 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.07 LYS 200 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.08 LEU 201 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.08 HIS 202 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.09 GLU 203 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.10 LEU 204 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.11 THR 205 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.11 LEU 206 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.12 ARG 207 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.12 GLY 208 -0.09 ASP 271
LYS 168 0.11 ASN 209 -0.09 VAL 155
LYS 168 0.11 PHE 210 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.11 ASN 211 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.11 SER 212 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.12 SER 213 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.10 ASN 214 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.10 ILE 215 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.10 MET 216 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.10 LYS 217 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.09 THR 218 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.09 CYS 219 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.09 LEU 220 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.08 GLN 221 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.07 ASN 222 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.08 LEU 223 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.07 ALA 224 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.06 GLY 225 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.07 LEU 226 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.07 HIS 227 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.08 VAL 228 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.09 HIS 229 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.10 ARG 230 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.11 LEU 231 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.12 ILE 232 -0.10 VAL 155
LYS 168 0.13 LEU 233 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.14 GLY 234 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.13 GLU 235 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.13 PHE 236 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.14 LYS 237 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.13 ASP 238 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.12 GLU 239 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.12 ARG 240 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.13 ASN 241 -0.10 ASP 271
LYS 168 0.13 LEU 242 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.14 GLU 243 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.14 ILE 244 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.15 PHE 245 -0.14 VAL 155
LYS 168 0.14 GLU 246 -0.14 VAL 155
LYS 168 0.15 PRO 247 -0.15 VAL 155
LYS 168 0.12 SER 248 -0.14 VAL 155
LYS 168 0.12 ILE 249 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.12 MET 250 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.10 GLU 251 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.08 GLY 252 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.09 LEU 253 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.08 CYS 254 -0.12 ILE 157
LYS 168 0.07 ASP 255 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.08 VAL 256 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.08 THR 257 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.09 ILE 258 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.10 ASP 259 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.11 GLU 260 -0.11 VAL 155
LYS 168 0.12 PHE 261 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.13 ARG 262 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.15 LEU 263 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.15 THR 264 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.16 TYR 265 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.16 THR 266 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.16 ASN 267 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.17 ASP 268 -0.14 VAL 155
LYS 168 0.18 PHE 269 -0.16 VAL 155
LYS 168 0.20 SER 270 -0.17 VAL 155
LYS 168 0.22 ASP 271 -0.18 ILE 157
LYS 168 0.20 ASP 272 -0.18 ILE 157
LYS 168 0.17 ILE 273 -0.16 ILE 157
LYS 168 0.18 VAL 274 -0.15 ILE 157
LYS 168 0.18 LYS 275 -0.17 ILE 157
LYS 168 0.15 PHE 276 -0.15 ILE 157
LYS 168 0.12 HIS 277 -0.15 ILE 157
LYS 168 0.11 CYS 278 -0.13 ILE 157
LYS 168 0.12 LEU 279 -0.13 ILE 157
LYS 168 0.11 ALA 280 -0.14 ILE 157
LYS 168 0.09 ASN 281 -0.13 ILE 157
LYS 168 0.11 VAL 282 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.11 SER 283 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.12 ALA 284 -0.12 VAL 155
LYS 168 0.14 MET 285 -0.13 VAL 155
LYS 168 0.15 SER 286 -0.12 VAL 155
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LYS 168 0.16 ALA 288 -0.12 VAL 155
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GLU 123 0.09 ALA 381 -0.04 GLY 222

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