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***  LYASE/RNA 29-JUN-11 3SNP  ***

CA distance fluctuations for 22100319494474332

---  normal mode 8  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ASP 866 0.04 SER 2 -0.14 LYS 889
ASP 866 0.04 ASN 3 -0.11 LYS 889
PRO 820 0.04 PRO 4 -0.10 LYS 889
PRO 820 0.04 PHE 5 -0.09 LYS 889
PRO 820 0.03 ALA 6 -0.10 LYS 889
PRO 820 0.04 TYR 7 -0.09 LYS 889
PRO 820 0.04 LEU 8 -0.08 LYS 113
PRO 820 0.03 ALA 9 -0.08 LYS 113
GLN 602 0.03 GLU 10 -0.08 LYS 113
GLY 486 0.03 PRO 11 -0.07 LYS 113
GLN 602 0.03 LEU 12 -0.06 ARG 165
GLY 486 0.04 ASP 13 -0.06 ARG 165
GLY 486 0.04 PRO 14 -0.06 GLU 112
GLY 486 0.04 ALA 15 -0.07 LYS 632
GLY 486 0.04 GLN 16 -0.07 LYS 632
GLY 486 0.03 PRO 17 -0.08 GLU 112
GLY 486 0.03 GLY 18 -0.09 GLU 112
GLY 486 0.03 LYS 19 -0.08 ARG 165
GLN 602 0.03 LYS 20 -0.08 ARG 165
GLN 602 0.03 PHE 21 -0.07 LYS 113
GLY 777 0.03 PHE 22 -0.07 LYS 113
GLY 777 0.03 ASN 23 -0.07 LYS 113
GLY 777 0.04 LEU 24 -0.06 LYS 113
GLY 777 0.04 ASN 25 -0.05 LYS 113
GLY 777 0.04 LYS 26 -0.06 LYS 889
GLY 777 0.05 LEU 27 -0.06 LYS 889
GLY 777 0.05 ASP 28 -0.06 LYS 889
GLY 777 0.05 TYR 29 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.06 SER 30 -0.05 GLN 377
GLY 777 0.06 ARG 31 -0.05 GLN 377
GLY 777 0.06 TYR 32 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.05 GLY 33 -0.05 GLN 377
GLY 777 0.06 ARG 34 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.06 LEU 35 -0.05 GLN 377
SER 778 0.07 PRO 36 -0.05 GLN 377
SER 778 0.05 PHE 37 -0.04 GLN 377
SER 778 0.06 SER 38 -0.04 GLN 377
SER 778 0.07 ILE 39 -0.04 GLN 377
SER 778 0.05 ARG 40 -0.04 LYS 113
SER 778 0.05 VAL 41 -0.04 LYS 113
SER 778 0.06 LEU 42 -0.04 LYS 113
GLY 777 0.06 LEU 43 -0.05 LYS 113
GLY 777 0.04 GLU 44 -0.06 LYS 113
GLY 777 0.04 ALA 45 -0.06 LYS 113
GLY 777 0.05 ALA 46 -0.06 LYS 113
GLY 777 0.04 VAL 47 -0.07 LYS 113
GLY 777 0.03 ARG 48 -0.08 LYS 113
GLY 777 0.03 ASN 49 -0.08 LYS 113
GLY 777 0.04 CYS 50 -0.08 MET 887
ASP 866 0.04 ASP 51 -0.10 LYS 886
ASP 866 0.05 LYS 52 -0.08 LYS 889
ASP 866 0.05 PHE 53 -0.07 LYS 886
GLY 777 0.03 LEU 54 -0.05 LYS 886
GLY 777 0.05 VAL 55 -0.06 LYS 886
ASP 866 0.06 LYS 56 -0.06 LYS 889
GLU 801 0.06 LYS 57 -0.07 LYS 889
GLU 801 0.07 GLU 58 -0.06 LYS 889
GLU 801 0.07 ASP 59 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.06 ILE 60 -0.06 LYS 889
GLY 777 0.07 GLU 61 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.08 ASN 62 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.07 ILE 63 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.07 LEU 64 -0.05 LYS 889
GLY 777 0.08 ASN 65 -0.05 GLN 377
GLY 777 0.08 TRP 66 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.08 ASN 67 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.09 VAL 68 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.10 THR 69 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.10 GLN 70 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.11 HIS 71 -0.07 GLN 377
GLY 777 0.11 MET 72 -0.06 GLN 377
GLY 777 0.13 ASN 73 -0.06 GLN 377
GLU 801 0.11 ILE 74 -0.06 ASP 868
GLY 777 0.10 GLU 75 -0.07 THR 867
GLY 777 0.08 VAL 76 -0.06 ASP 868
GLY 777 0.06 PRO 77 -0.04 VAL 869
SER 778 0.06 PHE 78 -0.03 LYS 113
SER 778 0.04 LYS 79 -0.04 LYS 113
GLY 684 0.03 PRO 80 -0.03 ARG 165
THR 610 0.02 ALA 81 -0.04 ARG 165
SER 436 0.02 ARG 82 -0.03 ARG 165
PRO 301 0.03 VAL 83 -0.03 ILE 803
PRO 301 0.04 ILE 84 -0.04 GLY 223
PRO 301 0.06 LEU 85 -0.05 GLY 223
PRO 301 0.07 GLN 86 -0.07 SER 779
ASN 537 0.10 ASP 87 -0.06 SER 778
ASN 537 0.09 PHE 88 -0.05 SER 779
PRO 301 0.09 THR 89 -0.06 ARG 780
PRO 301 0.07 GLY 90 -0.03 ASP 193
ASN 537 0.07 VAL 91 -0.04 ASP 193
PRO 301 0.07 PRO 92 -0.03 ASP 193
PRO 301 0.05 SER 93 -0.04 ASP 193
ASN 537 0.06 VAL 94 -0.05 ASP 193
ASN 537 0.06 VAL 95 -0.05 ASP 193
ASN 537 0.05 ASP 96 -0.04 ASP 193
ASN 537 0.05 PHE 97 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.06 ALA 98 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.05 ALA 99 -0.05 SER 2
ASN 537 0.04 MET 100 -0.06 SER 2
GLY 540 0.05 ARG 101 -0.07 SER 2
GLY 540 0.05 ASP 102 -0.07 SER 2
GLY 540 0.04 ALA 103 -0.07 SER 2
GLY 540 0.04 VAL 104 -0.09 SER 2
GLY 540 0.05 LYS 105 -0.08 SER 2
GLY 540 0.04 LYS 106 -0.07 SER 2
GLY 540 0.04 LEU 107 -0.09 SER 2
GLY 540 0.04 GLY 108 -0.09 SER 2
GLY 540 0.04 GLY 109 -0.10 SER 2
GLY 540 0.04 ASP 110 -0.10 SER 2
GLY 540 0.05 PRO 111 -0.09 SER 2
GLY 540 0.05 GLU 112 -0.10 ASP 193
GLU 617 0.04 LYS 113 -0.11 SER 2
GLY 540 0.04 ILE 114 -0.09 SER 2
GLY 540 0.04 ASN 115 -0.08 ASP 193
GLY 540 0.03 PRO 116 -0.06 ASP 193
GLU 617 0.02 ILE 117 -0.06 ASN 49
TYR 613 0.02 CYS 118 -0.04 ALA 81
SER 436 0.03 PRO 119 -0.05 GLN 192
ARG 536 0.04 VAL 120 -0.03 ASP 193
ARG 536 0.05 ASP 121 -0.03 SER 779
ASN 537 0.07 LEU 122 -0.04 SER 779
THR 438 0.08 VAL 123 -0.05 SER 778
ASN 537 0.10 ILE 124 -0.06 SER 778
THR 438 0.12 ASP 125 -0.06 SER 778
THR 438 0.15 HIS 126 -0.08 SER 778
ARG 536 0.18 SER 127 -0.08 SER 778
ASN 537 0.21 GLU 146 -0.05 VAL 619
ASN 537 0.20 PHE 147 -0.06 VAL 619
ASN 537 0.18 GLU 148 -0.06 VAL 619
ASN 537 0.17 ARG 149 -0.05 VAL 619
ASN 537 0.15 ASN 150 -0.05 VAL 619
ASN 537 0.15 ARG 151 -0.05 VAL 619
ASN 537 0.13 GLU 152 -0.05 ASP 193
ASN 537 0.11 ARG 153 -0.04 ASP 193
ASN 537 0.12 PHE 154 -0.05 ASP 193
ASN 537 0.11 GLU 155 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.10 PHE 156 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.09 LEU 157 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.10 LYS 158 -0.06 ASP 193
ASN 537 0.09 TRP 159 -0.07 ASP 193
ASN 537 0.07 GLY 160 -0.08 ASP 193
ASN 537 0.07 SER 161 -0.08 ASP 193
GLY 540 0.07 LYS 162 -0.09 ASP 193
GLY 540 0.07 ALA 163 -0.09 ASP 193
GLY 540 0.06 PHE 164 -0.10 ASP 193
GLU 617 0.05 ARG 165 -0.13 ASP 193
GLY 540 0.04 ASN 166 -0.09 GLN 192
ASN 537 0.05 MET 167 -0.07 ASP 193
ASN 537 0.06 ARG 168 -0.05 GLN 192
ASN 537 0.08 ILE 169 -0.04 ASP 193
ARG 536 0.09 ILE 170 -0.04 SER 778
ASN 537 0.11 PRO 171 -0.05 SER 778
ASN 537 0.13 PRO 172 -0.06 SER 778
SER 475 0.15 GLY 173 -0.06 SER 778
SER 475 0.14 SER 174 -0.05 SER 778
SER 475 0.13 GLY 175 -0.06 SER 778
SER 475 0.12 ILE 176 -0.07 SER 778
THR 438 0.11 ILE 177 -0.06 SER 778
THR 438 0.10 HIS 178 -0.06 SER 778
THR 440 0.07 GLN 179 -0.05 SER 778
SER 436 0.06 VAL 180 -0.04 SER 778
THR 438 0.06 ASN 181 -0.04 SER 778
THR 438 0.04 LEU 182 -0.03 SER 776
SER 436 0.04 GLU 183 -0.02 ARG 802
SER 436 0.05 TYR 184 -0.02 SER 776
SER 436 0.04 LEU 185 -0.02 LYS 329
SER 436 0.03 ALA 186 -0.02 TRP 623
SER 436 0.03 ARG 187 -0.04 ASN 166
GLN 602 0.02 VAL 188 -0.03 ARG 165
GLN 602 0.03 VAL 189 -0.05 ARG 165
THR 610 0.03 PHE 190 -0.07 ARG 165
ARG 325 0.03 ASP 191 -0.08 ARG 165
THR 610 0.03 GLN 192 -0.12 ARG 165
THR 610 0.02 ASP 193 -0.13 ARG 165
GLY 486 0.03 GLY 194 -0.10 ARG 165
GLN 602 0.03 TYR 195 -0.09 ARG 165
GLN 602 0.03 TYR 196 -0.08 ARG 165
GLN 602 0.03 TYR 197 -0.07 ARG 165
GLN 602 0.02 PRO 198 -0.05 ARG 165
GLY 684 0.02 ASP 199 -0.04 ARG 165
GLY 684 0.03 SER 200 -0.03 ARG 165
GLY 710 0.03 LEU 201 -0.02 ILE 803
GLY 710 0.04 VAL 202 -0.03 ILE 803
PRO 301 0.05 GLY 203 -0.04 ILE 803
THR 89 0.08 THR 204 -0.05 ILE 803
SER 206 0.09 ASP 205 -0.05 SER 778
SER 711 0.09 SER 206 -0.06 ARG 802
ASP 87 0.08 HIS 207 -0.05 GLY 476
ASP 87 0.06 THR 208 -0.04 ARG 802
GLY 684 0.06 THR 209 -0.04 GLY 476
GLU 146 0.06 MET 210 -0.04 GLY 476
GLU 146 0.04 ILE 211 -0.02 ARG 802
GLY 684 0.05 ASP 212 -0.02 THR 867
GLY 684 0.05 GLY 213 -0.02 ASN 439
GLY 684 0.03 LEU 214 -0.02 VAL 366
GLY 684 0.04 GLY 215 -0.03 ARG 165
GLY 684 0.03 VAL 216 -0.02 ARG 165
GLY 684 0.04 LEU 217 -0.02 GLN 377
GLY 684 0.05 GLY 218 -0.03 THR 867
GLY 710 0.06 TRP 219 -0.03 ARG 802
GLY 710 0.08 GLY 220 -0.05 ARG 802
THR 306 0.07 VAL 221 -0.06 ILE 803
GLY 275 0.07 GLY 222 -0.06 ILE 803
GLY 275 0.06 GLY 223 -0.05 LEU 85
GLY 275 0.05 ILE 224 -0.04 LEU 85
MET 237 0.05 GLU 225 -0.04 ILE 803
PRO 301 0.04 ALA 226 -0.03 ILE 803
PRO 301 0.04 GLU 227 -0.02 ILE 803
PRO 301 0.02 ALA 228 -0.02 SER 2
GLY 710 0.02 VAL 229 -0.02 ASN 49
PRO 301 0.02 MET 230 -0.03 ASN 49
GLU 617 0.02 LEU 231 -0.04 ASN 49
GLU 617 0.02 GLY 232 -0.05 ASN 49
GLY 777 0.03 GLN 233 -0.03 MET 887
SER 778 0.04 PRO 234 -0.02 VAL 76
SER 779 0.05 ILE 235 -0.03 THR 867
SER 778 0.07 SER 236 -0.05 THR 867
SER 778 0.11 MET 237 -0.05 THR 867
GLY 777 0.12 VAL 238 -0.06 THR 867
GLY 777 0.10 LEU 239 -0.05 GLN 377
SER 778 0.11 PRO 240 -0.06 GLN 377
SER 778 0.11 GLN 241 -0.07 GLN 377
SER 778 0.09 VAL 242 -0.07 GLN 377
SER 778 0.09 ILE 243 -0.08 GLN 377
SER 778 0.08 GLY 244 -0.07 GLN 377
GLY 684 0.08 TYR 245 -0.08 GLN 377
GLY 684 0.07 ARG 246 -0.07 GLN 377
GLY 684 0.07 LEU 247 -0.08 VAL 366
GLY 684 0.06 MET 248 -0.08 VAL 366
GLY 684 0.06 GLY 249 -0.07 VAL 366
ARG 704 0.06 LYS 250 -0.05 ALA 381
ARG 704 0.07 PRO 251 -0.05 ALA 381
ARG 704 0.07 HIS 252 -0.05 SER 383
ARG 704 0.06 PRO 253 -0.04 SER 383
GLU 146 0.07 LEU 254 -0.04 THR 592
GLU 146 0.08 VAL 255 -0.04 ALA 381
GLU 146 0.08 THR 256 -0.03 ARG 593
GLU 146 0.08 SER 257 -0.03 PRO 820
GLU 146 0.10 THR 258 -0.05 SER 553
GLU 146 0.09 ASP 259 -0.06 SER 553
GLU 146 0.08 ILE 260 -0.05 GLN 377
GLU 146 0.09 VAL 261 -0.06 ASN 535
GLU 146 0.10 LEU 262 -0.10 ASN 535
GLY 684 0.10 THR 263 -0.10 GLN 377
GLY 684 0.09 ILE 264 -0.08 GLN 377
GLY 684 0.11 THR 265 -0.09 ASN 535
GLY 684 0.11 LYS 266 -0.12 GLN 377
GLY 684 0.11 HIS 267 -0.13 GLN 377
GLY 684 0.11 LEU 268 -0.10 GLN 377
GLY 684 0.13 ARG 269 -0.10 GLN 377
GLY 684 0.12 GLN 270 -0.13 GLN 377
GLY 684 0.11 VAL 271 -0.12 GLN 377
SER 778 0.12 GLY 272 -0.10 GLN 377
SER 778 0.13 VAL 273 -0.08 GLN 377
SER 778 0.16 VAL 274 -0.08 ASN 537
SER 778 0.17 GLY 275 -0.06 ASN 537
SER 778 0.13 LYS 276 -0.06 GLN 377
SER 778 0.10 PHE 277 -0.06 GLN 377
SER 778 0.09 VAL 278 -0.06 GLN 377
GLY 684 0.07 GLU 279 -0.06 GLN 377
GLY 684 0.07 PHE 280 -0.06 GLN 377
GLY 684 0.06 PHE 281 -0.06 GLN 377
GLY 684 0.06 GLY 282 -0.07 VAL 366
GLY 684 0.05 PRO 283 -0.06 VAL 366
GLY 684 0.05 GLY 284 -0.08 VAL 366
GLY 684 0.05 VAL 285 -0.06 VAL 366
GLY 684 0.04 ALA 286 -0.05 VAL 366
GLY 684 0.05 GLN 287 -0.05 VAL 366
GLU 146 0.05 LEU 288 -0.03 VAL 366
GLU 146 0.04 SER 289 -0.02 TYR 319
GLU 146 0.04 ILE 290 -0.02 PRO 820
GLN 179 0.05 ALA 291 -0.02 PRO 820
GLU 146 0.06 ASP 292 -0.02 PRO 820
GLU 146 0.06 ARG 293 -0.02 ASN 535
GLU 146 0.06 ALA 294 -0.03 PRO 820
GLU 146 0.08 THR 295 -0.04 GLY 474
GLU 146 0.08 ILE 296 -0.06 ASN 439
GLY 684 0.07 ALA 297 -0.04 ASN 439
GLU 146 0.08 ASN 298 -0.05 GLY 474
GLY 684 0.10 MET 299 -0.07 ASN 439
GLY 684 0.11 CYS 300 -0.06 ASN 537
GLY 684 0.14 PRO 301 -0.07 ASN 537
GLY 684 0.14 GLU 302 -0.09 ASN 537
GLY 684 0.13 TYR 303 -0.09 ASN 537
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