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***  LYASE/RNA 29-JUN-11 3SNP  ***

CA distance fluctuations for 22100319494474332

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ASP 866 0.07 SER 2 -0.22 LYS 889
GLY 777 0.07 ASN 3 -0.18 LYS 889
GLU 801 0.09 PRO 4 -0.16 LYS 889
GLY 777 0.09 PHE 5 -0.14 LYS 889
GLY 777 0.07 ALA 6 -0.16 LYS 889
SER 391 0.08 TYR 7 -0.14 LYS 889
GLY 777 0.08 LEU 8 -0.12 LYS 889
SER 391 0.07 ALA 9 -0.12 LYS 113
ALA 381 0.07 GLU 10 -0.11 ASP 110
ALA 381 0.07 PRO 11 -0.11 ASP 110
ALA 381 0.08 LEU 12 -0.09 ASP 110
ALA 381 0.08 ASP 13 -0.09 LYS 632
ALA 381 0.07 PRO 14 -0.10 ASP 110
ALA 381 0.07 ALA 15 -0.10 LYS 632
ALA 381 0.06 GLN 16 -0.11 LYS 632
ALA 381 0.06 PRO 17 -0.12 ASP 110
ALA 381 0.06 GLY 18 -0.13 GLU 112
ALA 381 0.06 LYS 19 -0.12 ARG 165
ALA 381 0.07 LYS 20 -0.11 LYS 113
ALA 381 0.07 PHE 21 -0.10 LYS 113
GLY 777 0.08 PHE 22 -0.11 LYS 113
SER 391 0.09 ASN 23 -0.10 LYS 113
GLY 777 0.10 LEU 24 -0.09 LYS 889
SER 391 0.10 ASN 25 -0.08 LYS 889
SER 391 0.10 LYS 26 -0.10 LYS 889
GLY 777 0.10 LEU 27 -0.10 LYS 889
GLY 777 0.11 ASP 28 -0.09 LYS 889
ALA 395 0.12 TYR 29 -0.08 LYS 889
ALA 395 0.13 SER 30 -0.07 LYS 889
GLY 777 0.13 ARG 31 -0.07 LYS 889
GLY 777 0.12 TYR 32 -0.07 LYS 889
ALA 395 0.12 GLY 33 -0.06 LYS 889
ALA 395 0.14 ARG 34 -0.06 LYS 889
GLY 777 0.14 LEU 35 -0.06 LYS 889
SER 778 0.14 PRO 36 -0.05 ASN 842
SER 778 0.12 PHE 37 -0.05 LYS 889
SER 778 0.14 SER 38 -0.05 THR 844
SER 778 0.15 ILE 39 -0.06 ASP 868
SER 778 0.13 ARG 40 -0.06 LYS 889
SER 778 0.12 VAL 41 -0.06 LYS 889
SER 778 0.14 LEU 42 -0.06 LYS 889
SER 778 0.13 LEU 43 -0.08 LYS 889
SER 778 0.11 GLU 44 -0.08 LYS 113
SER 778 0.11 ALA 45 -0.08 LYS 113
GLY 777 0.12 ALA 46 -0.09 LYS 889
GLY 777 0.11 VAL 47 -0.10 LYS 889
GLY 777 0.08 ARG 48 -0.12 LYS 113
GLY 777 0.08 ASN 49 -0.12 LYS 113
GLY 777 0.09 CYS 50 -0.13 LYS 889
GLY 777 0.07 ASP 51 -0.16 LYS 886
ASP 866 0.10 LYS 52 -0.13 LYS 886
ASP 866 0.09 PHE 53 -0.12 LYS 886
GLY 777 0.08 LEU 54 -0.08 LYS 886
GLY 777 0.11 VAL 55 -0.09 LYS 886
GLU 801 0.13 LYS 56 -0.10 LYS 889
GLU 801 0.13 LYS 57 -0.11 LYS 889
GLU 801 0.15 GLU 58 -0.09 LYS 889
GLY 777 0.15 ASP 59 -0.08 LYS 889
GLY 777 0.14 ILE 60 -0.09 LYS 889
GLY 777 0.15 GLU 61 -0.09 LYS 889
GLY 777 0.17 ASN 62 -0.08 ASN 842
GLY 777 0.16 ILE 63 -0.07 LYS 889
GLY 777 0.14 LEU 64 -0.08 LYS 889
GLY 777 0.16 ASN 65 -0.07 LYS 889
GLY 777 0.17 TRP 66 -0.07 ASN 842
GLY 777 0.17 ASN 67 -0.07 ASN 842
GLY 777 0.18 VAL 68 -0.08 ASN 842
GLY 777 0.20 THR 69 -0.09 THR 844
GLY 777 0.21 GLN 70 -0.09 THR 844
GLY 777 0.22 HIS 71 -0.10 THR 844
GLY 777 0.23 MET 72 -0.12 THR 844
GLY 777 0.26 ASN 73 -0.12 THR 844
GLY 777 0.23 ILE 74 -0.13 ASP 868
GLY 777 0.22 GLU 75 -0.15 THR 867
GLY 777 0.17 VAL 76 -0.13 ASP 868
SER 778 0.15 PRO 77 -0.10 ASP 868
SER 778 0.14 PHE 78 -0.07 ASP 868
SER 778 0.11 LYS 79 -0.06 SER 475
SER 778 0.09 PRO 80 -0.07 SER 475
GLY 684 0.06 ALA 81 -0.07 SER 475
GLY 684 0.06 ARG 82 -0.08 SER 475
GLY 684 0.07 VAL 83 -0.08 SER 475
GLY 710 0.08 ILE 84 -0.09 SER 475
GLY 710 0.08 LEU 85 -0.09 SER 475
SER 711 0.11 GLN 86 -0.10 SER 475
GLN 86 0.11 ASP 87 -0.09 PRO 512
SER 206 0.10 PHE 88 -0.08 SER 779
SER 711 0.12 THR 89 -0.09 SER 779
THR 204 0.08 GLY 90 -0.07 PRO 512
SER 206 0.07 VAL 91 -0.07 PRO 512
THR 204 0.07 PRO 92 -0.06 PRO 512
GLY 223 0.05 SER 93 -0.06 PRO 512
GLN 377 0.04 VAL 94 -0.07 ASP 193
SER 206 0.05 VAL 95 -0.06 ASP 193
GLY 223 0.04 ASP 96 -0.06 SER 2
GLN 377 0.04 PHE 97 -0.08 SER 2
GLN 377 0.04 ALA 98 -0.08 ASP 193
GLN 377 0.04 ALA 99 -0.08 SER 2
GLN 377 0.04 MET 100 -0.10 SER 2
GLN 377 0.03 ARG 101 -0.11 SER 2
LYS 660 0.04 ASP 102 -0.11 SER 2
LEU 652 0.05 ALA 103 -0.11 SER 2
LEU 654 0.04 VAL 104 -0.14 SER 2
GLN 657 0.04 LYS 105 -0.13 SER 2
GLN 657 0.05 LYS 106 -0.12 SER 2
GLN 657 0.04 LEU 107 -0.14 SER 2
GLN 657 0.03 GLY 108 -0.15 SER 2
TRP 623 0.03 GLY 109 -0.17 SER 2
TRP 623 0.04 ASP 110 -0.17 SER 2
ALA 163 0.04 PRO 111 -0.14 SER 2
ALA 163 0.05 GLU 112 -0.15 ASP 193
GLN 377 0.03 LYS 113 -0.17 SER 2
GLN 377 0.03 ILE 114 -0.13 SER 2
GLN 377 0.03 ASN 115 -0.11 ASP 193
GLN 377 0.03 PRO 116 -0.07 ASN 49
GLN 377 0.04 ILE 117 -0.09 ASN 49
GLY 684 0.04 CYS 118 -0.07 SER 475
LYS 379 0.04 PRO 119 -0.08 SER 475
GLY 710 0.04 VAL 120 -0.08 SER 475
GLY 710 0.04 ASP 121 -0.09 SER 475
SER 711 0.04 LEU 122 -0.09 PRO 512
SER 711 0.06 VAL 123 -0.10 SER 475
ASN 150 0.08 ILE 124 -0.10 PRO 512
GLU 146 0.10 ASP 125 -0.12 SER 475
GLU 146 0.15 HIS 126 -0.12 PRO 512
GLU 146 0.22 SER 127 -0.14 PRO 512
SER 127 0.22 GLU 146 -0.07 GLU 515
SER 127 0.20 PHE 147 -0.09 PRO 512
SER 127 0.14 GLU 148 -0.07 GLU 515
SER 127 0.15 ARG 149 -0.06 GLU 515
SER 127 0.13 ASN 150 -0.07 PRO 512
SER 127 0.11 ARG 151 -0.08 PRO 512
SER 127 0.08 GLU 152 -0.07 PRO 512
SER 206 0.08 ARG 153 -0.07 PRO 512
SER 127 0.07 PHE 154 -0.09 PRO 512
SER 127 0.06 GLU 155 -0.08 PRO 512
SER 206 0.05 PHE 156 -0.07 ASP 193
SER 206 0.05 LEU 157 -0.08 PRO 512
SER 127 0.05 LYS 158 -0.09 ASP 193
SER 127 0.04 TRP 159 -0.10 ASP 193
GLN 377 0.03 GLY 160 -0.10 ASP 193
GLN 377 0.03 SER 161 -0.11 ASP 193
GLU 112 0.03 LYS 162 -0.13 ASP 193
GLU 112 0.05 ALA 163 -0.13 ASP 193
GLU 112 0.03 PHE 164 -0.14 ASP 193
GLN 377 0.03 ARG 165 -0.18 ASP 193
LYS 379 0.03 ASN 166 -0.13 ASP 193
GLN 377 0.03 MET 167 -0.10 ASP 193
LYS 379 0.03 ARG 168 -0.09 PRO 512
LYS 379 0.03 ILE 169 -0.10 PRO 512
GLU 146 0.04 ILE 170 -0.10 PRO 512
PRO 301 0.04 PRO 171 -0.11 PRO 512
PHE 147 0.06 PRO 172 -0.12 PRO 512
PHE 147 0.06 GLY 173 -0.14 PRO 512
GLU 146 0.05 SER 174 -0.13 PRO 512
GLU 146 0.07 GLY 175 -0.14 SER 475
GLU 146 0.11 ILE 176 -0.18 SER 475
GLU 146 0.11 ILE 177 -0.21 SER 475
GLU 146 0.11 HIS 178 -0.16 SER 475
ARG 704 0.09 GLN 179 -0.14 SER 475
GLU 146 0.08 VAL 180 -0.13 SER 475
GLU 146 0.07 ASN 181 -0.13 SER 475
GLY 684 0.08 LEU 182 -0.12 SER 475
GLY 684 0.07 GLU 183 -0.10 SER 475
ASN 685 0.05 TYR 184 -0.10 SER 475
GLY 684 0.05 LEU 185 -0.10 SER 475
GLY 684 0.07 ALA 186 -0.09 SER 475
GLY 684 0.06 ARG 187 -0.08 SER 475
GLY 684 0.07 VAL 188 -0.07 SER 475
LYS 379 0.07 VAL 189 -0.07 VAL 498
LYS 379 0.06 PHE 190 -0.09 ARG 165
ALA 381 0.06 ASP 191 -0.11 ARG 165
ALA 381 0.05 GLN 192 -0.16 ARG 165
ALA 381 0.05 ASP 193 -0.18 ARG 165
ALA 381 0.05 GLY 194 -0.14 ARG 165
ALA 381 0.06 TYR 195 -0.13 ARG 165
ALA 381 0.07 TYR 196 -0.10 ARG 165
LYS 379 0.07 TYR 197 -0.09 ARG 165
SER 778 0.08 PRO 198 -0.07 ARG 165
GLY 684 0.07 ASP 199 -0.07 SER 475
GLY 684 0.09 SER 200 -0.07 SER 475
GLY 684 0.09 LEU 201 -0.08 SER 475
GLY 684 0.11 VAL 202 -0.08 SER 475
GLY 710 0.12 GLY 203 -0.09 SER 475
GLY 710 0.16 THR 204 -0.09 SER 475
GLY 710 0.16 ASP 205 -0.11 SER 475
GLY 684 0.21 SER 206 -0.10 ARG 802
GLY 684 0.17 HIS 207 -0.09 SER 475
GLY 684 0.14 THR 208 -0.09 SER 475
GLY 684 0.15 THR 209 -0.07 ASP 866
GLY 684 0.14 MET 210 -0.08 SER 475
GLY 684 0.12 ILE 211 -0.08 SER 475
GLY 684 0.13 ASP 212 -0.06 SER 475
GLY 684 0.12 GLY 213 -0.05 SER 475
GLY 684 0.10 LEU 214 -0.06 SER 475
GLY 684 0.10 GLY 215 -0.06 SER 475
GLY 684 0.10 VAL 216 -0.07 SER 475
GLY 684 0.11 LEU 217 -0.06 SER 475
GLY 684 0.13 GLY 218 -0.07 SER 475
GLY 684 0.16 TRP 219 -0.08 ASP 866
GLY 684 0.18 GLY 220 -0.09 ARG 802
SER 779 0.14 VAL 221 -0.11 ILE 803
SER 779 0.16 GLY 222 -0.12 ILE 803
GLY 710 0.12 GLY 223 -0.09 SER 475
MET 237 0.09 ILE 224 -0.08 SER 475
MET 237 0.10 GLU 225 -0.08 SER 475
GLY 710 0.08 ALA 226 -0.08 SER 475
GLY 710 0.06 GLU 227 -0.07 SER 475
ALA 683 0.06 ALA 228 -0.07 SER 475
GLY 684 0.06 VAL 229 -0.07 SER 475
GLY 684 0.04 MET 230 -0.07 SER 475
GLN 377 0.04 LEU 231 -0.07 SER 475
SER 778 0.05 GLY 232 -0.06 SER 475
SER 778 0.07 GLN 233 -0.06 SER 475
SER 778 0.10 PRO 234 -0.07 SER 475
SER 778 0.14 ILE 235 -0.08 THR 867
SER 778 0.18 SER 236 -0.13 THR 867
SER 778 0.24 MET 237 -0.13 THR 867
GLY 777 0.26 VAL 238 -0.13 THR 867
GLY 777 0.22 LEU 239 -0.10 THR 867
SER 778 0.24 PRO 240 -0.09 THR 867
SER 778 0.22 GLN 241 -0.09 THR 844
SER 778 0.19 VAL 242 -0.07 THR 844
GLN 377 0.17 ILE 243 -0.07 THR 844
LYS 379 0.17 GLY 244 -0.06 THR 844
LYS 379 0.19 TYR 245 -0.06 THR 844
LYS 379 0.18 ARG 246 -0.05 THR 844
VAL 366 0.21 LEU 247 -0.05 GLU 594
VAL 366 0.19 MET 248 -0.06 GLU 594
ALA 381 0.17 GLY 249 -0.06 GLU 594
SER 383 0.16 LYS 250 -0.05 GLU 594
SER 383 0.16 PRO 251 -0.06 LYS 364
SER 383 0.19 HIS 252 -0.04 PRO 845
SER 383 0.13 PRO 253 -0.04 PRO 591
SER 383 0.12 LEU 254 -0.04 PRO 820
ALA 381 0.14 VAL 255 -0.04 PRO 820
ALA 381 0.11 THR 256 -0.05 PRO 820
ALA 381 0.11 SER 257 -0.05 PRO 845
LYS 379 0.12 THR 258 -0.06 PRO 820
LYS 379 0.18 ASP 259 -0.06 PRO 820
LYS 379 0.17 ILE 260 -0.08 THR 365
LYS 379 0.17 VAL 261 -0.06 PRO 845
GLN 377 0.23 LEU 262 -0.07 THR 365
LYS 379 0.28 THR 263 -0.10 THR 365
LYS 379 0.22 ILE 264 -0.07 THR 365
GLN 377 0.23 THR 265 -0.08 PRO 845
GLN 377 0.31 LYS 266 -0.08 THR 365
GLN 377 0.29 HIS 267 -0.08 PRO 845
GLN 377 0.24 LEU 268 -0.08 PRO 845
GLN 377 0.26 ARG 269 -0.09 PRO 845
GLN 377 0.29 GLN 270 -0.09 PRO 845
GLN 377 0.24 VAL 271 -0.09 PRO 845
GLN 377 0.22 GLY 272 -0.10 PRO 845
SER 778 0.20 VAL 273 -0.10 PRO 845
SER 778 0.24 VAL 274 -0.12 PRO 845
SER 778 0.30 GLY 275 -0.13 ASP 866
SER 778 0.24 LYS 276 -0.10 PRO 845
SER 778 0.20 PHE 277 -0.08 PRO 845
SER 778 0.16 VAL 278 -0.07 PRO 845
GLN 377 0.15 GLU 279 -0.06 THR 844
LYS 379 0.16 PHE 280 -0.05 THR 844
VAL 366 0.16 PHE 281 -0.04 THR 844
VAL 366 0.18 GLY 282 -0.04 THR 844
VAL 366 0.17 PRO 283 -0.05 ALA 598
VAL 366 0.21 GLY 284 -0.05 ALA 286
VAL 366 0.17 VAL 285 -0.06 ALA 286
VAL 366 0.13 ALA 286 -0.06 VAL 285
ALA 381 0.13 GLN 287 -0.05 GLU 594
ALA 381 0.13 LEU 288 -0.05 PRO 845
ALA 381 0.10 SER 289 -0.06 GLY 486
GLY 684 0.10 ILE 290 -0.06 GLY 486
ARG 704 0.10 ALA 291 -0.06 SER 470
GLY 684 0.11 ASP 292 -0.05 PRO 845
GLY 684 0.12 ARG 293 -0.05 PRO 845
GLY 684 0.12 ALA 294 -0.06 ASP 866
GLY 684 0.13 THR 295 -0.06 ASP 866
GLY 684 0.14 ILE 296 -0.07 PRO 845
GLY 684 0.15 ALA 297 -0.07 ASP 866
GLY 684 0.16 ASN 298 -0.08 ASP 866
GLY 684 0.18 MET 299 -0.08 ASP 866
GLY 684 0.19 CYS 300 -0.09 ASP 866
GLY 684 0.23 PRO 301 -0.11 ARG 802
GLY 684 0.22 GLU 302 -0.10 ASP 866
GLY 684 0.21 TYR 303 -0.10 ASP 866
GLY 684 0.23 GLY 304 -0.12 ASP 866
SER 778 0.21 ALA 305 -0.10 ASP 866
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ARG 704 0.09 ILE 434 -0.11 THR 479
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ARG 704 0.14 ASN 439 -0.07 PRO 820
ARG 704 0.13 THR 440 -0.07 ARG 802
ARG 704 0.12 SER 441 -0.06 ASP 866
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ARG 704 0.10 PRO 443 -0.07 SER 470
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ARG 704 0.08 GLY 450 -0.07 SER 470
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ARG 704 0.07 ALA 456 -0.04 ILE 562
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ARG 704 0.06 ALA 459 -0.03 PRO 820
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ARG 704 0.06 LEU 461 -0.04 ARG 483
ARG 704 0.06 ASN 462 -0.08 TYR 490
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ARG 704 0.07 GLY 486 -0.19 SER 485
ARG 704 0.08 VAL 487 -0.12 SER 485
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SER 475 0.08 PRO 489 -0.12 ASN 418
ARG 704 0.07 TYR 490 -0.09 PRO 465
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ARG 704 0.09 LEU 556 -0.04 PRO 820
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ARG 704 0.06 ILE 562 -0.06 ARG 483
THR 365 0.09 ALA 563 -0.05 ARG 483
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GLU 421 0.06 GLN 583 -0.03 PRO 820
ARG 704 0.06 VAL 584 -0.03 PRO 820
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ARG 704 0.07 ARG 587 -0.03 PRO 820
ARG 704 0.07 ASP 588 -0.03 PRO 820
ARG 704 0.07 ILE 589 -0.04 PRO 820
ARG 704 0.08 TRP 590 -0.04 PRO 820
ARG 704 0.08 PRO 591 -0.05 LYS 250
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GLU 571 0.08 GLU 594 -0.06 MET 248
ARG 704 0.08 GLU 595 -0.05 MET 248
ARG 704 0.08 ILE 596 -0.05 SER 470
ARG 704 0.08 GLN 597 -0.06 GLY 486
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ARG 704 0.07 ARG 601 -0.09 GLY 486
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