*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240722150104714692.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240722150104714692.atom to be opened.
Openam> File opened: 240722150104714692.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 71
First residue number = 1
Last residue number = 71
Number of atoms found = 2281
Mean number per residue = 32.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.945249 +/- 14.594053 From: 11.861000 To: 73.296000
= 10.737340 +/- 16.740130 From: -20.621000 To: 50.334000
= -86.459285 +/- 19.866078 From: -123.290000 To: -46.131000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'DC5 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 71 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.5403 % Filled.
Pdbmat> 829028 non-zero elements.
Pdbmat> 90608 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.45 +/- 21.86
Maximum number = 148
Minimum number = 24
Pdbmat> Matrix trace = 1.812160E+06
Pdbmat> Larger element = 598.040
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
71 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240722150104714692.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240722150104714692.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240722150104714692.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2281 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 71 residues.
Blocpdb> 28 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 33 atoms in block 2
Block first atom: 29
Blocpdb> 32 atoms in block 3
Block first atom: 62
Blocpdb> 32 atoms in block 4
Block first atom: 94
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 126
Blocpdb> 33 atoms in block 6
Block first atom: 156
Blocpdb> 33 atoms in block 7
Block first atom: 189
Blocpdb> 32 atoms in block 8
Block first atom: 222
Blocpdb> 30 atoms in block 9
Block first atom: 254
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 284
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 317
Blocpdb> 30 atoms in block 12
Block first atom: 349
Blocpdb> 33 atoms in block 13
Block first atom: 379
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 412
Blocpdb> 32 atoms in block 15
Block first atom: 442
Blocpdb> 32 atoms in block 16
Block first atom: 474
Blocpdb> 33 atoms in block 17
Block first atom: 506
Blocpdb> 30 atoms in block 18
Block first atom: 539
Blocpdb> 32 atoms in block 19
Block first atom: 569
Blocpdb> 33 atoms in block 20
Block first atom: 601
Blocpdb> 32 atoms in block 21
Block first atom: 634
Blocpdb> 33 atoms in block 22
Block first atom: 666
Blocpdb> 33 atoms in block 23
Block first atom: 699
Blocpdb> 32 atoms in block 24
Block first atom: 732
Blocpdb> 33 atoms in block 25
Block first atom: 764
Blocpdb> 33 atoms in block 26
Block first atom: 797
Blocpdb> 32 atoms in block 27
Block first atom: 830
Blocpdb> 33 atoms in block 28
Block first atom: 862
Blocpdb> 33 atoms in block 29
Block first atom: 895
Blocpdb> 32 atoms in block 30
Block first atom: 928
Blocpdb> 32 atoms in block 31
Block first atom: 960
Blocpdb> 33 atoms in block 32
Block first atom: 992
Blocpdb> 33 atoms in block 33
Block first atom: 1025
Blocpdb> 33 atoms in block 34
Block first atom: 1058
Blocpdb> 33 atoms in block 35
Block first atom: 1091
Blocpdb> 33 atoms in block 36
Block first atom: 1124
Blocpdb> 32 atoms in block 37
Block first atom: 1157
Blocpdb> 33 atoms in block 38
Block first atom: 1189
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 1222
Blocpdb> 32 atoms in block 40
Block first atom: 1255
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1287
Blocpdb> 33 atoms in block 42
Block first atom: 1320
Blocpdb> 33 atoms in block 43
Block first atom: 1353
Blocpdb> 32 atoms in block 44
Block first atom: 1386
Blocpdb> 33 atoms in block 45
Block first atom: 1418
Blocpdb> 33 atoms in block 46
Block first atom: 1451
Blocpdb> 33 atoms in block 47
Block first atom: 1484
Blocpdb> 32 atoms in block 48
Block first atom: 1517
Blocpdb> 32 atoms in block 49
Block first atom: 1549
Blocpdb> 33 atoms in block 50
Block first atom: 1581
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1614
Blocpdb> 32 atoms in block 52
Block first atom: 1647
Blocpdb> 32 atoms in block 53
Block first atom: 1679
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1711
Blocpdb> 32 atoms in block 55
Block first atom: 1741
Blocpdb> 30 atoms in block 56
Block first atom: 1773
Blocpdb> 33 atoms in block 57
Block first atom: 1803
Blocpdb> 32 atoms in block 58
Block first atom: 1836
Blocpdb> 33 atoms in block 59
Block first atom: 1868
Blocpdb> 33 atoms in block 60
Block first atom: 1901
Blocpdb> 32 atoms in block 61
Block first atom: 1934
Blocpdb> 33 atoms in block 62
Block first atom: 1966
Blocpdb> 30 atoms in block 63
Block first atom: 1999
Blocpdb> 32 atoms in block 64
Block first atom: 2029
Blocpdb> 30 atoms in block 65
Block first atom: 2061
Blocpdb> 33 atoms in block 66
Block first atom: 2091
Blocpdb> 33 atoms in block 67
Block first atom: 2124
Blocpdb> 32 atoms in block 68
Block first atom: 2157
Blocpdb> 32 atoms in block 69
Block first atom: 2189
Blocpdb> 30 atoms in block 70
Block first atom: 2221
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2250
Blocpdb> 71 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 829099 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6843
Prepmat> Matrix trace = 1812160.0000
Prepmat> Last element read: 6843 6843 230.8763
Prepmat> 2557 lines saved.
Prepmat> 2228 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2281
RTB> Total mass = 2281.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2281
RTB> Number of blocks = 71
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 74928.7012
RTB> 10743 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 426
Diagstd> Nb of non-zero elements: 10743
Diagstd> Projected matrix trace = 74928.7012
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 426 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 74928.7012
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0007612 0.0012079 0.0030971 0.0082280
0.0168438 0.0472685 0.0616811 0.0764059 0.0930877
0.1681468 0.1729027 0.1998718 0.2599612 0.4317183
0.6104110 0.6806231 0.7689099 1.0388868 1.5504286
1.6367412 1.8668400 2.0274296 2.4068588 2.6839825
2.9512573 3.0296462 3.6339486 3.9339232 4.3262106
4.5462274 4.6793079 5.1960571 5.7837222 6.0136353
6.7366901 7.2645489 7.9897648 8.0422141 8.6986037
9.4832608 10.0361894 10.3059753 11.1329118 11.3457023
12.1894179 13.4555651 13.9812012 14.4565976 14.8309689
15.1236104 15.6444536 16.5215192 17.1138943 17.3609086
19.5722616 19.8535998 20.7677039 20.8110164 21.1602226
22.2619887 23.2406099 23.6327015 24.9619018 25.6106380
26.1550536 27.1685217 27.6978579 28.1972717 28.4512512
29.2141837 29.8681789 30.1777300 32.1454265 33.3828415
35.1423597 35.2161949 35.9472304 37.9744003 38.5393380
40.5038698 41.0197845 41.2838064 42.4076180 42.7514019
44.0414768 46.1625073 46.7742085 47.0415126 47.3291872
47.7252057 49.0011449 49.4138304 50.3663207 51.4332453
52.3293918 52.4930388 52.9130750 54.6071936 55.1170035
55.6939669
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034337 0.0034339 0.0034340 0.0034340
0.0034341 2.9960402 3.7741226 6.0432627 9.8501150
14.0933900 23.6091864 26.9694130 30.0164056 33.1315164
44.5286550 45.1539953 48.5479660 55.3668161 71.3502483
84.8411299 89.5877464 95.2210585 110.6826091 135.2138454
138.9265623 148.3709337 154.6208895 168.4692273 177.9037558
186.5515306 189.0128085 207.0068291 215.3814115 225.8650883
231.5372433 234.9016635 247.5325047 261.1553888 266.2954982
281.8503410 292.6844205 306.9462126 307.9520470 320.2727976
334.4060503 344.0168424 348.6099903 362.3261375 365.7724346
379.1287886 398.3329673 406.0387887 412.8842599 418.1961618
422.3018863 429.5121764 441.3877443 449.2309839 452.4613688
480.4141455 483.8546425 494.8681712 495.3839435 499.5228927
512.3624096 523.5028387 527.9003688 542.5429386 549.5478074
555.3580702 566.0154475 571.5028119 576.6321126 579.2232225
586.9379060 593.4712054 596.5386193 615.6797595 627.4179374
643.7403624 644.4162670 651.0704698 669.1765941 674.1358226
691.1042117 695.4917257 697.7263857 707.1592390 710.0198012
720.6530300 737.8022493 742.6744856 744.7935709 747.0674313
750.1863971 760.1484145 763.3426717 770.6645699 778.7844017
785.5396733 786.7670032 789.9084885 802.4541161 806.1912491
810.3998582
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2281
Rtb_to_modes> Number of blocs = 71
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6121E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2079E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0971E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2280E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6844E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7268E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1681E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6406E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3088E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1681
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1729
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1999
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4317
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6806
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7689
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.039
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.637
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.867
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.027
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.407
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.951
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.030
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.634
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.326
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.679
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.196
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.784
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.014
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.737
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.990
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.042
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.699
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.483
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.36
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 426 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002
1.00001 1.00004 1.00004 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00004
0.99998 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 0.99995 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999
1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
0.99998 0.99995 1.00002 1.00002 0.99997
0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998
1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 41058 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002
1.00001 1.00004 1.00004 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00004
0.99998 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 0.99995 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999
1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
0.99996 1.00001 0.99996 1.00003 0.99998
1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
0.99998 0.99995 1.00002 1.00002 0.99997
0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998
1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240722150104714692.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240722150104714692.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240722150104714692.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240722150104714692.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 71
First residue number = 1
Last residue number = 71
Number of atoms found = 2281
Mean number per residue = 32.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6121E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2079E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0971E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2280E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6844E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7268E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1681E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6406E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3088E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1681
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1729
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4317
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6806
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7689
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.637
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.867
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.027
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.407
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.634
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.326
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.196
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.784
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.014
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.990
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.699
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.483
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69
Bfactors> 106 vectors, 6843 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000761
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> 0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240722150104714692.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240722150104714692.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.774
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.043
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Chkmod> 106 vectors, 6843 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2281 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7366
0.0034 0.7854
0.0034 0.9830
0.0034 0.8253
0.0034 0.8814
0.0034 0.9454
2.9959 0.6171
3.7739 0.7445
6.0430 0.6862
9.8497 0.7160
14.0929 0.7590
23.6081 0.6220
26.9682 0.6938
30.0151 0.5155
33.1302 0.4516
44.5205 0.5279
45.1517 0.4501
48.5493 0.5617
55.3686 0.5504
71.3457 0.4563
84.8367 0.6938
89.5824 0.7058
95.2164 0.5123
110.6839 0.3800
135.1894 0.4637
138.9316 0.4480
148.3709 0.4709
154.5979 0.3590
168.4669 0.3046
177.8967 0.4178
186.5354 0.3770
189.0157 0.3241
206.9994 0.4441
215.3743 0.3113
225.8499 0.5034
231.5215 0.3345
234.8839 0.5026
247.5205 0.1185
261.1505 0.1868
266.2921 0.3603
281.8447 0.2990
292.6809 0.2666
306.9376 0.2424
307.9347 0.1977
320.2663 0.3093
334.3871 0.2394
344.0674 0.4697
348.6631 0.4126
362.2632 0.5513
365.8260 0.5529
379.1216 0.2962
398.3815 0.2494
406.0039 0.2501
412.9151 0.3230
418.1645 0.3969
422.2333 0.3229
429.4326 0.4286
441.3485 0.4638
449.1606 0.4213
452.4301 0.2224
480.3658 0.3030
483.7900 0.3928
494.8743 0.2844
495.3506 0.2862
499.4988 0.3732
512.3175 0.4724
523.4735 0.4748
527.8475 0.3392
542.4990 0.4850
549.5174 0.4804
555.3867 0.3818
566.0065 0.3047
571.5004 0.2726
576.6353 0.3207
579.1856 0.4364
586.8707 0.4570
593.4638 0.4580
596.5354 0.1751
615.6971 0.2453
627.3643 0.1604
643.6911 0.1535
644.4234 0.2886
651.0676 0.1758
669.1091 0.1746
674.1127 0.3308
691.0415 0.2262
695.4637 0.1998
697.6643 0.2202
707.1487 0.1410
709.9777 0.1885
720.6100 0.2904
737.7505 0.3583
742.6092 0.4507
744.7496 0.3936
747.0418 0.4257
750.1919 0.2998
760.1069 0.1779
763.2803 0.3401
770.6596 0.3432
778.7264 0.2400
785.5105 0.3152
786.7105 0.4094
789.8516 0.3369
802.4403 0.2969
806.1786 0.2530
810.3362 0.3136
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240722150104714692 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
making animated gifs
11 models are in 240722150104714692.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240722150104714692.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240722150104714692.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240722150104714692 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240722150104714692.eigenfacs
240722150104714692.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240722150104714692.eigenfacs
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m3.615s
user 0m3.585s
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rm: cannot remove '240722150104714692.sdijf': No such file or directory
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