*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2404080914462961919.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2404080914462961919.atom to be opened.
Openam> File opened: 2404080914462961919.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 537
First residue number = 79
Last residue number = 615
Number of atoms found = 4292
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 160.160855 +/- 11.034816 From: 130.113000 To: 186.779000
= 154.437666 +/- 13.828729 From: 120.053000 To: 190.270000
= 172.454616 +/- 17.067006 From: 132.344000 To: 210.543000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.8390 % Filled.
Pdbmat> 1524545 non-zero elements.
Pdbmat> 166557 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.61 +/- 19.03
Maximum number = 119
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 3.331140E+06
Pdbmat> Larger element = 473.962
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
537 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2404080914462961919.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2404080914462961919.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2404080914462961919.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4292 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 537 residues.
Blocpdb> 27 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 27 atoms in block 2
Block first atom: 28
Blocpdb> 24 atoms in block 3
Block first atom: 55
Blocpdb> 27 atoms in block 4
Block first atom: 79
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 106
Blocpdb> 21 atoms in block 6
Block first atom: 127
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 148
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 171
Blocpdb> 36 atoms in block 9
Block first atom: 190
Blocpdb> 27 atoms in block 10
Block first atom: 226
Blocpdb> 27 atoms in block 11
Block first atom: 253
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 280
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 296
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 316
Blocpdb> 27 atoms in block 15
Block first atom: 339
Blocpdb> 21 atoms in block 16
Block first atom: 366
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 387
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 406
Blocpdb> 31 atoms in block 19
Block first atom: 429
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 460
Blocpdb> 21 atoms in block 21
Block first atom: 482
Blocpdb> 33 atoms in block 22
Block first atom: 503
Blocpdb> 18 atoms in block 23
Block first atom: 536
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 554
Blocpdb> 34 atoms in block 25
Block first atom: 576
Blocpdb> 21 atoms in block 26
Block first atom: 610
Blocpdb> 28 atoms in block 27
Block first atom: 631
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 659
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 675
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 700
Blocpdb> 28 atoms in block 31
Block first atom: 722
Blocpdb> 19 atoms in block 32
Block first atom: 750
Blocpdb> 32 atoms in block 33
Block first atom: 769
Blocpdb> 23 atoms in block 34
Block first atom: 801
Blocpdb> 24 atoms in block 35
Block first atom: 824
Blocpdb> 32 atoms in block 36
Block first atom: 848
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 880
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 902
Blocpdb> 25 atoms in block 39
Block first atom: 926
Blocpdb> 28 atoms in block 40
Block first atom: 951
Blocpdb> 21 atoms in block 41
Block first atom: 979
Blocpdb> 28 atoms in block 42
Block first atom: 1000
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 1028
Blocpdb> 21 atoms in block 44
Block first atom: 1047
Blocpdb> 31 atoms in block 45
Block first atom: 1068
Blocpdb> 23 atoms in block 46
Block first atom: 1099
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1122
Blocpdb> 29 atoms in block 48
Block first atom: 1145
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1174
Blocpdb> 18 atoms in block 50
Block first atom: 1197
Blocpdb> 29 atoms in block 51
Block first atom: 1215
Blocpdb> 30 atoms in block 52
Block first atom: 1244
Blocpdb> 25 atoms in block 53
Block first atom: 1274
Blocpdb> 27 atoms in block 54
Block first atom: 1299
Blocpdb> 26 atoms in block 55
Block first atom: 1326
Blocpdb> 21 atoms in block 56
Block first atom: 1352
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 1373
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 1393
Blocpdb> 31 atoms in block 59
Block first atom: 1411
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 1442
Blocpdb> 24 atoms in block 61
Block first atom: 1461
Blocpdb> 26 atoms in block 62
Block first atom: 1485
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 1511
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1538
Blocpdb> 27 atoms in block 65
Block first atom: 1563
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1590
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1613
Blocpdb> 28 atoms in block 68
Block first atom: 1632
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1660
Blocpdb> 25 atoms in block 70
Block first atom: 1679
Blocpdb> 28 atoms in block 71
Block first atom: 1704
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1732
Blocpdb> 23 atoms in block 73
Block first atom: 1753
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1776
Blocpdb> 22 atoms in block 75
Block first atom: 1796
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 1818
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1841
Blocpdb> 31 atoms in block 78
Block first atom: 1863
Blocpdb> 24 atoms in block 79
Block first atom: 1894
Blocpdb> 31 atoms in block 80
Block first atom: 1918
Blocpdb> 25 atoms in block 81
Block first atom: 1949
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1974
Blocpdb> 29 atoms in block 83
Block first atom: 1994
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 2023
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 2041
Blocpdb> 28 atoms in block 86
Block first atom: 2063
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 2091
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 2110
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2129
Blocpdb> 21 atoms in block 90
Block first atom: 2152
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2173
Blocpdb> 28 atoms in block 92
Block first atom: 2199
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2227
Blocpdb> 29 atoms in block 94
Block first atom: 2249
Blocpdb> 20 atoms in block 95
Block first atom: 2278
Blocpdb> 20 atoms in block 96
Block first atom: 2298
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 2318
Blocpdb> 21 atoms in block 98
Block first atom: 2339
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 2360
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2384
Blocpdb> 26 atoms in block 101
Block first atom: 2406
Blocpdb> 19 atoms in block 102
Block first atom: 2432
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2451
Blocpdb> 28 atoms in block 104
Block first atom: 2476
Blocpdb> 25 atoms in block 105
Block first atom: 2504
Blocpdb> 22 atoms in block 106
Block first atom: 2529
Blocpdb> 21 atoms in block 107
Block first atom: 2551
Blocpdb> 17 atoms in block 108
Block first atom: 2572
Blocpdb> 21 atoms in block 109
Block first atom: 2589
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 2610
Blocpdb> 24 atoms in block 111
Block first atom: 2637
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2661
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 2683
Blocpdb> 18 atoms in block 114
Block first atom: 2704
Blocpdb> 29 atoms in block 115
Block first atom: 2722
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2751
Blocpdb> 30 atoms in block 117
Block first atom: 2772
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 2802
Blocpdb> 19 atoms in block 119
Block first atom: 2826
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2845
Blocpdb> 23 atoms in block 121
Block first atom: 2867
Blocpdb> 21 atoms in block 122
Block first atom: 2890
Blocpdb> 19 atoms in block 123
Block first atom: 2911
Blocpdb> 19 atoms in block 124
Block first atom: 2930
Blocpdb> 25 atoms in block 125
Block first atom: 2949
Blocpdb> 28 atoms in block 126
Block first atom: 2974
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 3002
Blocpdb> 31 atoms in block 128
Block first atom: 3028
Blocpdb> 31 atoms in block 129
Block first atom: 3059
Blocpdb> 20 atoms in block 130
Block first atom: 3090
Blocpdb> 22 atoms in block 131
Block first atom: 3110
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3132
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 3156
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 3177
Blocpdb> 26 atoms in block 135
Block first atom: 3199
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 3225
Blocpdb> 26 atoms in block 137
Block first atom: 3238
Blocpdb> 25 atoms in block 138
Block first atom: 3264
Blocpdb> 30 atoms in block 139
Block first atom: 3289
Blocpdb> 16 atoms in block 140
Block first atom: 3319
Blocpdb> 19 atoms in block 141
Block first atom: 3335
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3354
Blocpdb> 21 atoms in block 143
Block first atom: 3376
Blocpdb> 21 atoms in block 144
Block first atom: 3397
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 3418
Blocpdb> 37 atoms in block 146
Block first atom: 3436
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 3473
Blocpdb> 26 atoms in block 148
Block first atom: 3492
Blocpdb> 26 atoms in block 149
Block first atom: 3518
Blocpdb> 26 atoms in block 150
Block first atom: 3544
Blocpdb> 23 atoms in block 151
Block first atom: 3570
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 3593
Blocpdb> 39 atoms in block 153
Block first atom: 3610
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 3649
Blocpdb> 26 atoms in block 155
Block first atom: 3674
Blocpdb> 21 atoms in block 156
Block first atom: 3700
Blocpdb> 27 atoms in block 157
Block first atom: 3721
Blocpdb> 27 atoms in block 158
Block first atom: 3748
Blocpdb> 20 atoms in block 159
Block first atom: 3775
Blocpdb> 27 atoms in block 160
Block first atom: 3795
Blocpdb> 20 atoms in block 161
Block first atom: 3822
Blocpdb> 28 atoms in block 162
Block first atom: 3842
Blocpdb> 28 atoms in block 163
Block first atom: 3870
Blocpdb> 32 atoms in block 164
Block first atom: 3898
Blocpdb> 33 atoms in block 165
Block first atom: 3930
Blocpdb> 22 atoms in block 166
Block first atom: 3963
Blocpdb> 24 atoms in block 167
Block first atom: 3985
Blocpdb> 18 atoms in block 168
Block first atom: 4009
Blocpdb> 19 atoms in block 169
Block first atom: 4027
Blocpdb> 25 atoms in block 170
Block first atom: 4046
Blocpdb> 22 atoms in block 171
Block first atom: 4071
Blocpdb> 25 atoms in block 172
Block first atom: 4093
Blocpdb> 31 atoms in block 173
Block first atom: 4118
Blocpdb> 23 atoms in block 174
Block first atom: 4149
Blocpdb> 18 atoms in block 175
Block first atom: 4172
Blocpdb> 29 atoms in block 176
Block first atom: 4190
Blocpdb> 27 atoms in block 177
Block first atom: 4219
Blocpdb> 23 atoms in block 178
Block first atom: 4246
Blocpdb> 24 atoms in block 179
Block first atom: 4268
Blocpdb> 179 blocks.
Blocpdb> At most, 39 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1524724 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12876
Prepmat> Matrix trace = 3331140.0000
Prepmat> Last element read: 12876 12876 194.4371
Prepmat> 16111 lines saved.
Prepmat> 14360 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4292
RTB> Total mass = 4292.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4292
RTB> Number of blocks = 179
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 216082.2694
RTB> 60315 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1074
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60315
Diagstd> Projected matrix trace = 216082.2694
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1074 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 216082.2694
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.4187780 1.9293496 2.8370128 3.0403535
4.1100894 5.1609634 5.3315216 5.8553044 6.4389496
6.8268067 7.2273973 8.2793397 8.5334571 9.1470984
9.7374556 10.3856000 10.7043182 11.2577228 12.2055865
12.4655402 13.3091181 13.5628626 14.1858353 14.7247552
14.9471315 15.2484725 15.5215225 16.2472525 16.8842218
17.5521004 18.0487924 18.6694132 18.9405295 19.2318976
20.0325489 20.0675483 20.5916590 21.1372241 21.8672997
22.6177904 23.0535414 23.5726592 24.0640877 24.8633384
25.1332760 25.3751978 25.7719020 25.9378482 26.7013338
27.3661536 27.6554183 28.8029520 29.1223238 29.9074420
30.3587959 30.5522392 31.0693045 31.8661241 32.1254124
32.5563062 32.9161073 33.3490265 33.8064804 34.6345788
34.7649746 35.3250678 35.7218369 35.8508715 36.8993035
37.1803916 37.3537220 37.4855140 38.0508422 38.4993364
39.0676323 39.4891762 39.6369377 40.5524805 41.0165702
41.7260087 41.9996779 42.2170583 42.8105648 43.3187076
43.7969007 44.0263584 44.4229174 44.6669843 44.8783111
45.7251693 45.7506601 46.1227125 47.0362272 47.6210922
48.3297053 48.7445456 49.7514640 50.0422218 50.3475408
51.2433538
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034333 0.0034341 0.0034341 0.0034346
0.0034353 129.3458498 150.8345196 182.9051488 189.3465161
220.1511287 246.6951832 250.7384091 262.7665133 275.5515087
283.7292321 291.9350537 312.4590660 317.2179723 328.4255658
338.8582195 349.9540928 355.2832932 364.3514940 379.3801517
383.3988728 396.1593579 399.9180087 408.9994624 416.6959910
419.8307138 424.0415871 427.8213358 437.7087675 446.2064098
454.9459753 461.3381343 469.2028202 472.5974113 476.2185944
486.0303456 486.4547388 492.7662431 499.2513594 507.8001903
516.4405895 521.3916902 527.2293385 532.6966694 541.4707497
544.4021481 547.0159609 551.2752772 553.0472691 561.1277650
568.0703995 571.0648059 582.7922674 586.0144077 593.8611502
598.3255543 600.2287635 605.2865813 612.9991918 615.4880652
619.6020455 623.0164513 627.1000864 631.3864530 639.0726554
640.2745480 645.4116228 649.0261146 650.1972660 659.6360230
662.1437132 663.6853346 664.8551163 669.8497774 673.7858743
678.7405971 682.3926138 683.6681173 691.5188010 695.4644755
701.4532022 703.7497604 705.5686311 710.5109230 714.7152121
718.6492385 720.5293280 723.7670680 725.7525930 727.4673939
734.2990079 734.5036571 737.4841667 744.7517291 749.3676767
754.9224724 758.1555059 765.9461063 768.1810189 770.5208792
777.3454363
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4292
Rtb_to_modes> Number of blocs = 179
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.040
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.110
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.161
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.855
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.05
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.24
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1074 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
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1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999
0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 77256 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99997
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1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999
0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2404080914462961919.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2404080914462961919.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2404080914462961919.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2404080914462961919.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 537
First residue number = 79
Last residue number = 615
Number of atoms found = 4292
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.419
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.837
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.040
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.332
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.855
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.439
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.827
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.24
Bfactors> 106 vectors, 12876 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.419000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.275 for 537 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.022 +/- 0.03
Bfactors> = 229.092 +/- 15.82
Bfactors> Shiftng-fct= 229.070
Bfactors> Scaling-fct= 590.847
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2404080914462961919.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2404080914462961919.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2404080914462961919.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2404080914462961919.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2404080914462961919.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2404080914462961919.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.3
Projmod> 106 vectors, 12876 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 537
First residue number = 79
Last residue number = 615
Number of atoms found = 4292
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 540
First residue number = 78
Last residue number = 617
Number of atoms found = 4314
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 4292 of first conformer: GLU 615 OXT not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2404080914462961919 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 537 4.035 400 1.560
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 537 3.936 401 1.546
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 537 3.858 403 1.526
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 537 3.802 411 1.534
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 537 3.770 420 1.525
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 537 3.760 425 1.530
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 537 3.775 426 1.584
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 537 3.813 421 1.617
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 537 3.873 418 1.639
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 537 3.956 416 1.665
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 537 4.059 412 1.674
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2404080914462961919 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 537 4.071 384 1.728
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 537 3.966 395 1.681
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 537 3.882 408 1.639
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 537 3.819 416 1.581
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 537 3.778 415 1.556
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 537 3.760 425 1.530
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 537 3.766 427 1.559
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 537 3.796 420 1.595
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 537 3.848 419 1.674
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 537 3.922 410 1.723
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 537 4.018 403 1.784
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2404080914462961919 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2404080914462961919.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=60
2404080914462961919.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 537 4.004 399 1.679
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 537 3.912 404 1.612
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 537 3.840 419 1.610
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 537 3.791 424 1.575
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 537 3.764 423 1.569
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 537 3.760 425 1.530
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 537 3.780 423 1.533
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 537 3.822 416 1.527
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 537 3.887 413 1.558
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 537 3.972 403 1.608
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 537 4.077 392 1.590
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2404080914462961919 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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making animated gifs
11 models are in 2404080914462961919.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 537 3.780 394 1.633
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 537 3.731 402 1.621
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 537 3.704 413 1.556
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 537 3.700 422 1.560
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 537 3.719 424 1.533
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 537 3.760 425 1.530
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 537 3.823 425 1.553
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 537 3.907 426 1.598
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 537 4.010 421 1.637
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 537 4.131 415 1.684
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 537 4.269 404 1.730
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2404080914462961919 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2404080914462961919.eigenfacs
2404080914462961919.atom
making animated gifs
11 models are in 2404080914462961919.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2404080914462961919.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 537 4.105 382 1.683
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 537 3.998 388 1.633
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 537 3.910 393 1.599
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 537 3.840 407 1.596
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 537 3.790 420 1.562
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 537 3.760 425 1.530
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 537 3.752 427 1.537
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 537 3.766 427 1.569
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 537 3.800 421 1.596
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 537 3.855 420 1.633
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 537 3.929 420 1.672
2404080914462961919.10.pdb
2404080914462961919.11.pdb
2404080914462961919.7.pdb
2404080914462961919.8.pdb
2404080914462961919.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m23.638s
user 0m23.573s
sys 0m0.064s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2404080914462961919.Chkmod.res: No such file or directory
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