*** floflo3 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2403041948001590542.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2403041948001590542.atom to be opened.
Openam> File opened: 2403041948001590542.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2557
First residue number = 23
Last residue number = 118
Number of atoms found = 18766
Mean number per residue = 7.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 198.503908 +/- 60.801067 From: 96.567000 To: 310.373000
= 211.724780 +/- 28.777789 From: 146.991000 To: 283.070000
= 194.077452 +/- 29.252751 From: 126.611000 To: 261.295000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -1.2337 % Filled.
Pdbmat> 6942393 non-zero elements.
Pdbmat> 758998 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.89 +/- 22.01
Maximum number = 135
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 1.517996E+07
Pdbmat> Larger element = 506.403
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2557 non-zero elements, NRBL set to 13
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2403041948001590542.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 13
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2403041948001590542.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2403041948001590542.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 18766 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 13 residue(s) per block.
Blocpdb> 2557 residues.
Blocpdb> 92 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 90 atoms in block 2
Block first atom: 93
Blocpdb> 102 atoms in block 3
Block first atom: 183
Blocpdb> 108 atoms in block 4
Block first atom: 285
Blocpdb> 97 atoms in block 5
Block first atom: 393
Blocpdb> 98 atoms in block 6
Block first atom: 490
Blocpdb> 78 atoms in block 7
Block first atom: 588
Blocpdb> 87 atoms in block 8
Block first atom: 666
Blocpdb> 107 atoms in block 9
Block first atom: 753
Blocpdb> 95 atoms in block 10
Block first atom: 860
Blocpdb> 113 atoms in block 11
Block first atom: 955
Blocpdb> 107 atoms in block 12
Block first atom: 1068
Blocpdb> 110 atoms in block 13
Block first atom: 1175
Blocpdb> 98 atoms in block 14
Block first atom: 1285
Blocpdb> 97 atoms in block 15
Block first atom: 1383
Blocpdb> 95 atoms in block 16
Block first atom: 1480
Blocpdb> 100 atoms in block 17
Block first atom: 1575
Blocpdb> 105 atoms in block 18
Block first atom: 1675
Blocpdb> 103 atoms in block 19
Block first atom: 1780
Blocpdb> 86 atoms in block 20
Block first atom: 1883
Blocpdb> 75 atoms in block 21
Block first atom: 1969
Blocpdb> 99 atoms in block 22
Block first atom: 2044
Blocpdb> 108 atoms in block 23
Block first atom: 2143
Blocpdb> 133 atoms in block 24
Block first atom: 2251
Blocpdb> 100 atoms in block 25
Block first atom: 2384
Blocpdb> 104 atoms in block 26
Block first atom: 2484
Blocpdb> 99 atoms in block 27
Block first atom: 2588
Blocpdb> 99 atoms in block 28
Block first atom: 2687
Blocpdb> 109 atoms in block 29
Block first atom: 2786
Blocpdb> 107 atoms in block 30
Block first atom: 2895
Blocpdb> 107 atoms in block 31
Block first atom: 3002
Blocpdb> 112 atoms in block 32
Block first atom: 3109
Blocpdb> 100 atoms in block 33
Block first atom: 3221
Blocpdb> 95 atoms in block 34
Block first atom: 3321
Blocpdb> 91 atoms in block 35
Block first atom: 3416
Blocpdb> 81 atoms in block 36
Block first atom: 3507
Blocpdb> 93 atoms in block 37
Block first atom: 3588
Blocpdb> 79 atoms in block 38
Block first atom: 3681
Blocpdb> 85 atoms in block 39
Block first atom: 3760
Blocpdb> 70 atoms in block 40
Block first atom: 3845
Blocpdb> 87 atoms in block 41
Block first atom: 3915
Blocpdb> 77 atoms in block 42
Block first atom: 4002
Blocpdb> 90 atoms in block 43
Block first atom: 4079
Blocpdb> 95 atoms in block 44
Block first atom: 4169
Blocpdb> 99 atoms in block 45
Block first atom: 4264
Blocpdb> 87 atoms in block 46
Block first atom: 4363
Blocpdb> 99 atoms in block 47
Block first atom: 4450
Blocpdb> 90 atoms in block 48
Block first atom: 4549
Blocpdb> 102 atoms in block 49
Block first atom: 4639
Blocpdb> 90 atoms in block 50
Block first atom: 4741
Blocpdb> 93 atoms in block 51
Block first atom: 4831
Blocpdb> 80 atoms in block 52
Block first atom: 4924
Blocpdb> 76 atoms in block 53
Block first atom: 5004
Blocpdb> 102 atoms in block 54
Block first atom: 5080
Blocpdb> 102 atoms in block 55
Block first atom: 5182
Blocpdb> 90 atoms in block 56
Block first atom: 5284
Blocpdb> 110 atoms in block 57
Block first atom: 5374
Blocpdb> 88 atoms in block 58
Block first atom: 5484
Blocpdb> 80 atoms in block 59
Block first atom: 5572
Blocpdb> 35 atoms in block 60
Block first atom: 5652
Blocpdb> 92 atoms in block 61
Block first atom: 5687
Blocpdb> 94 atoms in block 62
Block first atom: 5779
Blocpdb> 98 atoms in block 63
Block first atom: 5873
Blocpdb> 108 atoms in block 64
Block first atom: 5971
Blocpdb> 97 atoms in block 65
Block first atom: 6079
Blocpdb> 98 atoms in block 66
Block first atom: 6176
Blocpdb> 78 atoms in block 67
Block first atom: 6274
Blocpdb> 86 atoms in block 68
Block first atom: 6352
Blocpdb> 105 atoms in block 69
Block first atom: 6438
Blocpdb> 96 atoms in block 70
Block first atom: 6543
Blocpdb> 113 atoms in block 71
Block first atom: 6639
Blocpdb> 102 atoms in block 72
Block first atom: 6752
Blocpdb> 114 atoms in block 73
Block first atom: 6854
Blocpdb> 96 atoms in block 74
Block first atom: 6968
Blocpdb> 99 atoms in block 75
Block first atom: 7064
Blocpdb> 97 atoms in block 76
Block first atom: 7163
Blocpdb> 95 atoms in block 77
Block first atom: 7260
Blocpdb> 106 atoms in block 78
Block first atom: 7355
Blocpdb> 99 atoms in block 79
Block first atom: 7461
Blocpdb> 97 atoms in block 80
Block first atom: 7560
Blocpdb> 78 atoms in block 81
Block first atom: 7657
Blocpdb> 100 atoms in block 82
Block first atom: 7735
Blocpdb> 114 atoms in block 83
Block first atom: 7835
Blocpdb> 130 atoms in block 84
Block first atom: 7949
Blocpdb> 90 atoms in block 85
Block first atom: 8079
Blocpdb> 106 atoms in block 86
Block first atom: 8169
Blocpdb> 97 atoms in block 87
Block first atom: 8275
Blocpdb> 101 atoms in block 88
Block first atom: 8372
Blocpdb> 103 atoms in block 89
Block first atom: 8473
Blocpdb> 99 atoms in block 90
Block first atom: 8576
Blocpdb> 110 atoms in block 91
Block first atom: 8675
Blocpdb> 108 atoms in block 92
Block first atom: 8785
Blocpdb> 103 atoms in block 93
Block first atom: 8893
Blocpdb> 96 atoms in block 94
Block first atom: 8996
Blocpdb> 89 atoms in block 95
Block first atom: 9092
Blocpdb> 83 atoms in block 96
Block first atom: 9181
Blocpdb> 93 atoms in block 97
Block first atom: 9264
Blocpdb> 98 atoms in block 98
Block first atom: 9357
Blocpdb> 89 atoms in block 99
Block first atom: 9455
Blocpdb> 77 atoms in block 100
Block first atom: 9544
Blocpdb> 95 atoms in block 101
Block first atom: 9621
Blocpdb> 85 atoms in block 102
Block first atom: 9716
Blocpdb> 82 atoms in block 103
Block first atom: 9801
Blocpdb> 84 atoms in block 104
Block first atom: 9883
Blocpdb> 86 atoms in block 105
Block first atom: 9967
Blocpdb> 83 atoms in block 106
Block first atom: 10053
Blocpdb> 86 atoms in block 107
Block first atom: 10136
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 10222
Blocpdb> 81 atoms in block 109
Block first atom: 10247
Blocpdb> 95 atoms in block 110
Block first atom: 10328
Blocpdb> 71 atoms in block 111
Block first atom: 10423
Blocpdb> 86 atoms in block 112
Block first atom: 10494
Blocpdb> 89 atoms in block 113
Block first atom: 10580
Blocpdb> 100 atoms in block 114
Block first atom: 10669
Blocpdb> 107 atoms in block 115
Block first atom: 10769
Blocpdb> 109 atoms in block 116
Block first atom: 10876
Blocpdb> 104 atoms in block 117
Block first atom: 10985
Blocpdb> 85 atoms in block 118
Block first atom: 11089
Blocpdb> 97 atoms in block 119
Block first atom: 11174
Blocpdb> 79 atoms in block 120
Block first atom: 11271
Blocpdb> 94 atoms in block 121
Block first atom: 11350
Blocpdb> 84 atoms in block 122
Block first atom: 11444
Blocpdb> 72 atoms in block 123
Block first atom: 11528
Blocpdb> 98 atoms in block 124
Block first atom: 11600
Blocpdb> 98 atoms in block 125
Block first atom: 11698
Blocpdb> 110 atoms in block 126
Block first atom: 11796
Blocpdb> 99 atoms in block 127
Block first atom: 11906
Blocpdb> 86 atoms in block 128
Block first atom: 12005
Blocpdb> 107 atoms in block 129
Block first atom: 12091
Blocpdb> 95 atoms in block 130
Block first atom: 12198
Blocpdb> 85 atoms in block 131
Block first atom: 12293
Blocpdb> 102 atoms in block 132
Block first atom: 12378
Blocpdb> 103 atoms in block 133
Block first atom: 12480
Blocpdb> 110 atoms in block 134
Block first atom: 12583
Blocpdb> 95 atoms in block 135
Block first atom: 12693
Blocpdb> 94 atoms in block 136
Block first atom: 12788
Blocpdb> 30 atoms in block 137
Block first atom: 12882
Blocpdb> 77 atoms in block 138
Block first atom: 12912
Blocpdb> 97 atoms in block 139
Block first atom: 12989
Blocpdb> 104 atoms in block 140
Block first atom: 13086
Blocpdb> 94 atoms in block 141
Block first atom: 13190
Blocpdb> 108 atoms in block 142
Block first atom: 13284
Blocpdb> 96 atoms in block 143
Block first atom: 13392
Blocpdb> 88 atoms in block 144
Block first atom: 13488
Blocpdb> 96 atoms in block 145
Block first atom: 13576
Blocpdb> 102 atoms in block 146
Block first atom: 13672
Blocpdb> 103 atoms in block 147
Block first atom: 13774
Blocpdb> 92 atoms in block 148
Block first atom: 13877
Blocpdb> 89 atoms in block 149
Block first atom: 13969
Blocpdb> 88 atoms in block 150
Block first atom: 14058
Blocpdb> 90 atoms in block 151
Block first atom: 14146
Blocpdb> 87 atoms in block 152
Block first atom: 14236
Blocpdb> 101 atoms in block 153
Block first atom: 14323
Blocpdb> 75 atoms in block 154
Block first atom: 14424
Blocpdb> 84 atoms in block 155
Block first atom: 14499
Blocpdb> 95 atoms in block 156
Block first atom: 14583
Blocpdb> 82 atoms in block 157
Block first atom: 14678
Blocpdb> 98 atoms in block 158
Block first atom: 14760
Blocpdb> 87 atoms in block 159
Block first atom: 14858
Blocpdb> 80 atoms in block 160
Block first atom: 14945
Blocpdb> 100 atoms in block 161
Block first atom: 15025
Blocpdb> 79 atoms in block 162
Block first atom: 15125
Blocpdb> 86 atoms in block 163
Block first atom: 15204
Blocpdb> 53 atoms in block 164
Block first atom: 15290
Blocpdb> 89 atoms in block 165
Block first atom: 15343
Blocpdb> 85 atoms in block 166
Block first atom: 15432
Blocpdb> 107 atoms in block 167
Block first atom: 15517
Blocpdb> 95 atoms in block 168
Block first atom: 15624
Blocpdb> 89 atoms in block 169
Block first atom: 15719
Blocpdb> 102 atoms in block 170
Block first atom: 15808
Blocpdb> 99 atoms in block 171
Block first atom: 15910
Blocpdb> 103 atoms in block 172
Block first atom: 16009
Blocpdb> 103 atoms in block 173
Block first atom: 16112
Blocpdb> 18 atoms in block 174
Block first atom: 16215
Blocpdb> 90 atoms in block 175
Block first atom: 16233
Blocpdb> 80 atoms in block 176
Block first atom: 16323
Blocpdb> 94 atoms in block 177
Block first atom: 16403
Blocpdb> 106 atoms in block 178
Block first atom: 16497
Blocpdb> 86 atoms in block 179
Block first atom: 16603
Blocpdb> 81 atoms in block 180
Block first atom: 16689
Blocpdb> 87 atoms in block 181
Block first atom: 16770
Blocpdb> 112 atoms in block 182
Block first atom: 16857
Blocpdb> 46 atoms in block 183
Block first atom: 16969
Blocpdb> 82 atoms in block 184
Block first atom: 17015
Blocpdb> 87 atoms in block 185
Block first atom: 17097
Blocpdb> 114 atoms in block 186
Block first atom: 17184
Blocpdb> 94 atoms in block 187
Block first atom: 17298
Blocpdb> 90 atoms in block 188
Block first atom: 17392
Blocpdb> 105 atoms in block 189
Block first atom: 17482
Blocpdb> 98 atoms in block 190
Block first atom: 17587
Blocpdb> 118 atoms in block 191
Block first atom: 17685
Blocpdb> 89 atoms in block 192
Block first atom: 17803
Blocpdb> 85 atoms in block 193
Block first atom: 17892
Blocpdb> 84 atoms in block 194
Block first atom: 17977
Blocpdb> 113 atoms in block 195
Block first atom: 18061
Blocpdb> 98 atoms in block 196
Block first atom: 18174
Blocpdb> 89 atoms in block 197
Block first atom: 18272
Blocpdb> 105 atoms in block 198
Block first atom: 18361
Blocpdb> 94 atoms in block 199
Block first atom: 18466
Blocpdb> 118 atoms in block 200
Block first atom: 18560
Blocpdb> 89 atoms in block 201
Block first atom: 18677
Blocpdb> 201 blocks.
Blocpdb> At most, 133 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 6942594 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 56298
Prepmat> Matrix trace = 15179960.0001
Prepmat> Last element read: 56298 56298 114.7525
Prepmat> 20302 lines saved.
Prepmat> 18796 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18766
RTB> Total mass = 18766.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 18766
RTB> Number of blocks = 201
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 181397.9351
RTB> 51165 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1206
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51165
Diagstd> Projected matrix trace = 181397.9351
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1206 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 181397.9351
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0052964 0.0085190 0.0224801 0.0270366
0.0640274 0.0996694 0.2798335 0.2904748 0.3741810
0.5549529 0.6131451 0.7986455 0.9561984 1.1204902
1.2821821 1.5895005 1.7157700 1.8394911 2.1230275
2.2332403 2.4888771 2.5355368 2.7508129 3.0589523
3.2617675 3.6600223 4.0726292 4.2800152 4.3690889
4.4295956 4.5980390 4.6530811 4.9628698 5.1081646
5.3514336 5.5137801 5.6826367 5.9248904 6.1334249
6.1970146 6.4072987 6.9369452 7.1550663 7.4250384
7.5692059 7.7842320 7.9090825 8.1845685 8.4176415
8.7621602 9.1959940 9.4417189 9.8249961 9.8969501
10.2045483 10.2659063 10.5895680 11.1157956 11.2811130
11.9485670 12.1512626 12.7029732 12.7408683 13.0507606
13.1443094 13.5646207 13.6903211 13.8979936 14.2011346
14.5380053 14.9128050 15.1514309 15.3844103 15.9724730
16.5140544 16.6463060 17.2820125 17.3765201 17.8549036
17.9637634 17.9952644 18.2890713 18.7792555 19.3683797
19.5039709 19.6814003 20.0604299 20.3423679 20.4808699
20.8362714 21.1807992 21.5417258 21.8424912 22.0682286
22.2847217 22.3557557 22.5338920 22.8026251 22.9207686
23.0950004
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034337 0.0034339 0.0034339 0.0034342
0.0034343 7.9028587 10.0228276 16.2815053 17.8554661
27.4775713 34.2827983 57.4440571 58.5260931 66.4256992
80.8953101 85.0309286 97.0448074 106.1864924 114.9474434
122.9617778 136.9069894 142.2410057 147.2801187 158.2242680
162.2792563 171.3156357 172.9140323 180.1050143 189.9247817
196.1199520 207.7481410 219.1455793 224.6559561 226.9816352
228.5479439 232.8528764 234.2424445 241.9144003 245.4300412
251.2061983 254.9881513 258.8631459 264.3232965 268.9346779
270.3252037 274.8734335 286.0088117 290.4705532 295.8997725
298.7586169 302.9724697 305.3924752 310.6656056 315.0579865
321.4407065 329.3021914 333.6728056 340.3779937 341.6221093
346.8903135 347.9316432 353.3738449 362.0475021 364.7298051
375.3644952 378.5349499 387.0329771 387.6098402 392.2953787
393.6988690 399.9439283 401.7927507 404.8287378 409.2199539
414.0451401 419.3483612 422.6901288 425.9275256 433.9916373
441.2880179 443.0515055 451.4321001 452.6647584 458.8534851
460.2501555 460.6535221 464.3988195 470.5810843 477.9053871
479.5752923 481.7517238 486.3684536 489.7743445 491.4388429
495.6844366 499.7657060 504.0057918 507.5120574 510.1278298
512.6239446 513.4403056 515.4818574 518.5464956 519.8880901
521.8603093
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18766
Rtb_to_modes> Number of blocs = 201
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2964E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.5190E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2480E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7037E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9669E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2798
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2905
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6131
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7986
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.120
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.282
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.590
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.716
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.839
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.123
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.489
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.751
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.059
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.262
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.660
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.073
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.598
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.963
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.351
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.514
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.925
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.133
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.197
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.407
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.937
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.569
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.784
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.909
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.185
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.418
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.196
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.442
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.897
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 337788 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2403041948001590542.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2403041948001590542.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2403041948001590542.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2403041948001590542.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2557
First residue number = 23
Last residue number = 118
Number of atoms found = 18766
Mean number per residue = 7.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2964E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.5190E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2480E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7037E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4027E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9669E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2798
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2905
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10
Bfactors> 106 vectors, 56298 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.005296
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.715 for 2557 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.373 +/- 0.27
Bfactors> = 38.801 +/- 34.64
Bfactors> Shiftng-fct= 38.428
Bfactors> Scaling-fct= 128.440
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2403041948001590542.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2403041948001590542.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2403041948001590542.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2403041948001590542.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2403041948001590542.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2403041948001590542.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9
Projmod> 106 vectors, 56298 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2557
First residue number = 23
Last residue number = 118
Number of atoms found = 18766
Mean number per residue = 7.3
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2307
First residue number = 41
Last residue number = 247
Number of atoms found = 16825
Mean number per residue = 7.3
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 735 71.054
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 735 71.105
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 735 71.156
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 735 71.207
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 735 71.258
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 735 71.359
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 735 71.410
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 735 71.461
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 735 71.512
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 735 71.563
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 735 71.502
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 735 71.463
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 735 71.424
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 735 71.386
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 735 71.347
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 735 71.270
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 735 71.232
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 735 71.193
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 735 71.155
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 735 71.116
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 735 70.911
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 735 70.991
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 735 71.071
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 735 71.150
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 735 71.229
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 735 71.388
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 735 71.467
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 735 71.546
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 735 71.625
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 735 71.704
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 735 71.637
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 735 71.571
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 735 71.505
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 735 71.439
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 735 71.374
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 735 71.243
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 735 71.178
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 735 71.113
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 735 71.049
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 735 70.984
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 735 71.112
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 735 71.151
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 735 71.190
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 735 71.229
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 735 71.269
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 735 71.349
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 735 71.389
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 735 71.429
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 735 71.470
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 735 71.511
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 12 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
2403041948001590542.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-100 735 71.120
MODEL 2 MODE=12 DQ=-80 735 71.158
MODEL 3 MODE=12 DQ=-60 735 71.195
MODEL 4 MODE=12 DQ=-40 735 71.233
MODEL 5 MODE=12 DQ=-20 735 71.271
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=12 DQ=20 735 71.346
MODEL 8 MODE=12 DQ=40 735 71.384
MODEL 9 MODE=12 DQ=60 735 71.422
MODEL 10 MODE=12 DQ=80 735 71.460
MODEL 11 MODE=12 DQ=100 735 71.498
getting mode 13
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-100 735 71.264
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MODEL 4 MODE=13 DQ=-40 735 71.291
MODEL 5 MODE=13 DQ=-20 735 71.300
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=13 DQ=20 735 71.318
MODEL 8 MODE=13 DQ=40 735 71.327
MODEL 9 MODE=13 DQ=60 735 71.336
MODEL 10 MODE=13 DQ=80 735 71.345
MODEL 11 MODE=13 DQ=100 735 71.354
getting mode 14
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
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2403041948001590542.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2403041948001590542.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2403041948001590542.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-100 735 70.992
MODEL 2 MODE=14 DQ=-80 735 71.056
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MODEL 4 MODE=14 DQ=-40 735 71.183
MODEL 5 MODE=14 DQ=-20 735 71.246
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=14 DQ=20 735 71.371
MODEL 8 MODE=14 DQ=40 735 71.433
MODEL 9 MODE=14 DQ=60 735 71.495
MODEL 10 MODE=14 DQ=80 735 71.556
MODEL 11 MODE=14 DQ=100 735 71.617
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 15 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
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2403041948001590542.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-100 735 71.243
MODEL 2 MODE=15 DQ=-80 735 71.257
MODEL 3 MODE=15 DQ=-60 735 71.270
MODEL 4 MODE=15 DQ=-40 735 71.283
MODEL 5 MODE=15 DQ=-20 735 71.296
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=15 DQ=20 735 71.321
MODEL 8 MODE=15 DQ=40 735 71.334
MODEL 9 MODE=15 DQ=60 735 71.346
MODEL 10 MODE=15 DQ=80 735 71.358
MODEL 11 MODE=15 DQ=100 735 71.370
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2403041948001590542 16 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403041948001590542.eigenfacs
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2403041948001590542.eigenfacs
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2403041948001590542.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
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2403041948001590542.eigenfacs
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2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
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2403041948001590542.eigenfacs
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2403041948001590542.eigenfacs
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2403041948001590542.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2403041948001590542.eigenfacs
2403041948001590542.atom
making animated gifs
11 models are in 2403041948001590542.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403041948001590542.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-100 735 71.295
MODEL 2 MODE=16 DQ=-80 735 71.298
MODEL 3 MODE=16 DQ=-60 735 71.300
MODEL 4 MODE=16 DQ=-40 735 71.303
MODEL 5 MODE=16 DQ=-20 735 71.306
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 735 71.309
MODEL 7 MODE=16 DQ=20 735 71.312
MODEL 8 MODE=16 DQ=40 735 71.315
MODEL 9 MODE=16 DQ=60 735 71.318
MODEL 10 MODE=16 DQ=80 735 71.322
MODEL 11 MODE=16 DQ=100 735 71.326
2403041948001590542.10.pdb
2403041948001590542.11.pdb
2403041948001590542.12.pdb
2403041948001590542.13.pdb
2403041948001590542.14.pdb
2403041948001590542.15.pdb
2403041948001590542.16.pdb
2403041948001590542.7.pdb
2403041948001590542.8.pdb
2403041948001590542.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 2m22.037s
user 2m21.711s
sys 0m0.296s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2403041948001590542.Chkmod.res: No such file or directory
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