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please let us know.

* RIBONUCLEASE INHIBITOR 09-MAY-94 1BTA *

LOGs for ID: 2402291154411098567

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2402291154411098567.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2402291154411098567.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2402291154411098567.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     89
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     89
            Number of atoms found    =   1434
            Mean number per residue  =     16.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     0.109569 +/-     7.950585 From:   -15.075000 To:    18.412000
 =     0.174148 +/-     6.435683 From:   -16.210000 To:    13.690000
 =     0.078338 +/-     5.692482 From:   -12.811000 To:    14.019000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is  11.5728 % Filled.
 Pdbmat>      1071150  non-zero elements.
 Pdbmat>       118079 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    164.68 +/-     59.12
         Maximum number =    279
         Minimum number =     22

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.361580E+06
 Pdbmat> Larger element =  987.246    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
89 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2402291154411098567.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2402291154411098567.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2402291154411098567.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1434 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    89 residues.
 Blocpdb>    24 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     25
 Blocpdb>    10 atoms in block      3
 Block first atom:     47
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     57
 Blocpdb>    19 atoms in block      5
 Block first atom:     73
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     92
 Blocpdb>     7 atoms in block      7
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    15 atoms in block      8
 Block first atom:    113
 Blocpdb>    17 atoms in block      9
 Block first atom:    128
 Blocpdb>    19 atoms in block     10
 Block first atom:    145
 Blocpdb>    24 atoms in block     11
 Block first atom:    164
 Blocpdb>    11 atoms in block     12
 Block first atom:    188
 Blocpdb>    19 atoms in block     13
 Block first atom:    199
 Blocpdb>    11 atoms in block     14
 Block first atom:    218
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    229
 Blocpdb>    19 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    260
 Blocpdb>    17 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    294
 Blocpdb>    19 atoms in block     20
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    22 atoms in block     21
 Block first atom:    327
 Blocpdb>    22 atoms in block     22
 Block first atom:    349
 Blocpdb>    15 atoms in block     23
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    19 atoms in block     24
 Block first atom:    386
 Blocpdb>    10 atoms in block     25
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    19 atoms in block     26
 Block first atom:    415
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    448
 Blocpdb>    21 atoms in block     29
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    21 atoms in block     30
 Block first atom:    484
 Blocpdb>     7 atoms in block     31
 Block first atom:    505
 Blocpdb>    15 atoms in block     32
 Block first atom:    512
 Blocpdb>    14 atoms in block     33
 Block first atom:    527
 Blocpdb>    19 atoms in block     34
 Block first atom:    541
 Blocpdb>    12 atoms in block     35
 Block first atom:    560
 Blocpdb>    10 atoms in block     36
 Block first atom:    572
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    582
 Blocpdb>    24 atoms in block     38
 Block first atom:    601
 Blocpdb>    12 atoms in block     39
 Block first atom:    625
 Blocpdb>    11 atoms in block     40
 Block first atom:    637
 Blocpdb>    19 atoms in block     41
 Block first atom:    648
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    667
 Blocpdb>     7 atoms in block     43
 Block first atom:    681
 Blocpdb>    24 atoms in block     44
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    16 atoms in block     45
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    15 atoms in block     46
 Block first atom:    728
 Blocpdb>    21 atoms in block     47
 Block first atom:    743
 Blocpdb>    14 atoms in block     48
 Block first atom:    764
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    797
 Blocpdb>    19 atoms in block     51
 Block first atom:    813
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    832
 Blocpdb>    24 atoms in block     53
 Block first atom:    847
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    871
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    895
 Blocpdb>    20 atoms in block     56
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    932
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    947
 Blocpdb>    11 atoms in block     59
 Block first atom:    964
 Blocpdb>    22 atoms in block     60
 Block first atom:    975
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    997
 Blocpdb>    19 atoms in block     62
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    14 atoms in block     63
 Block first atom:   1033
 Blocpdb>    15 atoms in block     64
 Block first atom:   1047
 Blocpdb>    14 atoms in block     65
 Block first atom:   1062
 Blocpdb>     7 atoms in block     66
 Block first atom:   1076
 Blocpdb>    10 atoms in block     67
 Block first atom:   1083
 Blocpdb>    15 atoms in block     68
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    11 atoms in block     69
 Block first atom:   1108
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1119
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1135
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    16 atoms in block     73
 Block first atom:   1171
 Blocpdb>    20 atoms in block     74
 Block first atom:   1187
 Blocpdb>    24 atoms in block     75
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    15 atoms in block     76
 Block first atom:   1231
 Blocpdb>    10 atoms in block     77
 Block first atom:   1246
 Blocpdb>    22 atoms in block     78
 Block first atom:   1256
 Blocpdb>    10 atoms in block     79
 Block first atom:   1278
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1288
 Blocpdb>     7 atoms in block     81
 Block first atom:   1303
 Blocpdb>    11 atoms in block     82
 Block first atom:   1310
 Blocpdb>    12 atoms in block     83
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    19 atoms in block     84
 Block first atom:   1333
 Blocpdb>    14 atoms in block     85
 Block first atom:   1352
 Blocpdb>    19 atoms in block     86
 Block first atom:   1366
 Blocpdb>    19 atoms in block     87
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    19 atoms in block     88
 Block first atom:   1404
 Blocpdb>    12 atoms in block     89
 Block first atom:   1422

 Blocpdb>    89 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1071239 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4302

 Prepmat> Matrix trace    =    2361580.0000
 Prepmat> Last element read:    4302   4302       226.7977
 Prepmat>         4006 lines saved.
 Prepmat>         2680 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1434
 RTB> Total mass =        1434.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1434
 RTB> Number of blocks =    89
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  265114.8444
 RTB>     46365 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      534
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    46365
 Diagstd> Projected matrix trace =  265114.8444

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    534 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 265114.8444
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000     21.8574512     23.6057454     32.7465196     34.1360180
     40.7797062     45.1354929     53.5193289     55.8779443     60.0116308
     63.9788578     67.1590946     68.7291846     72.1133154     76.1845820
     78.1019753     83.1312819     84.8415308     90.7801189     95.2163415
     96.8943931    101.4782268    102.2397400    107.3269101    110.5297882
    114.6882308    117.2002745    121.9245183    123.7531881    126.1900379
    129.6251567    131.7665190    135.8084320    140.1394219    141.5383203
    143.8683724    146.3744294    153.8858551    156.5951783    157.5736035
    158.7183566    160.7670642    162.4689047    164.1633912    166.2732980
    170.5383583    172.7029802    175.3171386    177.3371163    178.1104180
    183.0762903    185.8801780    188.0485705    189.0662893    190.1588378
    192.1855679    195.2441575    197.3491026    198.7710167    200.5438379
    203.2465667    205.6637750    206.1037661    209.1358049    211.1220277
    214.8377339    217.4751480    219.2868701    219.6308186    220.5801494
    223.2993409    225.3588814    226.4165163    227.1403840    230.2025496
    231.3990261    232.5677615    234.5049949    237.0046843    238.4472202
    243.3324544    243.7788769    246.4753358    247.6088082    250.0022429
    250.6222371    253.9459571    254.9642795    256.0546279    257.2965246
    258.2843833    261.9180280    263.2652668    264.7492800    266.3901002
    269.0090048    271.4599482    272.9444658    274.5292212    274.9911169
    275.6679977

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034317      0.0034325      0.0034328      0.0034335      0.0034338
      0.0034343    507.6858266    527.5992140    621.4094518    634.4562936
    693.4534718    729.5488460    794.4208056    811.7372774    841.2265961
    868.5873931    889.9132979    900.2556922    922.1530597    947.8264520
    959.6796575    990.0964856   1000.2291983   1034.6433098   1059.6221439
   1068.9185249   1093.9103093   1098.0071000   1124.9924126   1141.6551740
   1162.9330332   1175.6000470   1199.0596940   1208.0182022   1219.8538907
   1236.3457135   1246.5158835   1265.4897963   1285.5099457   1291.9101161
   1302.5006403   1313.7958562   1347.0838559   1358.8905329   1363.1291771
   1368.0717006   1376.8728007   1384.1412340   1391.3405344   1400.2530774
   1418.0982437   1427.0697365   1437.8297562   1446.0892621   1449.2387634
   1469.3028876   1480.5116192   1489.1220637   1493.1461905   1497.4541629
   1505.4130134   1517.3448805   1525.5022700   1530.9880817   1537.8002997
   1548.1280850   1557.3068069   1558.9717453   1570.3970700   1577.8367037
   1591.6609510   1601.4010088   1608.0575771   1609.3181910   1612.7924938
   1622.7028574   1630.1689597   1633.9897666   1636.5996656   1647.5945433
   1651.8706760   1656.0370034   1662.9198944   1671.7592894   1676.8391773
   1693.9293722   1695.4825184   1704.8336692   1708.7492038   1716.9878928
   1719.1156004   1730.4774003   1733.9435330   1737.6471607   1741.8559658
   1745.1965845   1757.4297599   1761.9438454   1766.9028618   1772.3697166
   1781.0605701   1789.1558024   1794.0412596   1799.2419542   1800.7549313
   1802.9698161

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1434
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     89

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9866E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9932E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9988E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   123.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   129.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   140.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   146.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   153.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   156.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   157.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   158.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   160.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   162.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   164.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   166.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   170.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   172.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   175.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   177.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   178.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   185.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   188.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   189.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   190.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   192.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   195.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   197.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   198.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   200.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   203.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   205.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   206.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   209.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   211.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   214.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   217.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   219.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   219.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   220.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   223.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   225.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   226.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   227.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   230.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   231.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   232.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   234.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   237.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   238.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   243.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   243.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   246.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   247.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   250.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   250.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   253.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   255.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   256.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   257.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   258.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   261.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   263.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   264.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   266.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   269.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   271.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   272.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   274.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   275.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   275.7    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    534 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 1.00004 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00003 0.99996 1.00004
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002
 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00002
 0.99998 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 1.00001 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00005 1.00000 1.00000 1.00003
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99997 1.00004 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    25812 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 1.00004 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00003 0.99996 1.00004
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002
 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00002
 0.99998 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 1.00001 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00005 1.00000 1.00000 1.00003
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99997 1.00004 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2402291154411098567.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2402291154411098567.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2402291154411098567.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2402291154411098567.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     89
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     89
            Number of atoms found    =   1434
            Mean number per residue  =     16.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9866E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9932E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9988E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   129.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   140.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   146.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   153.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   156.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   157.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   158.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   160.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   162.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   166.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   170.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   172.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   175.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   177.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   178.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   185.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   188.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   189.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   190.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   192.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   195.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   197.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   198.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   200.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   203.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   205.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   206.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   209.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   211.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   214.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   217.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   219.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   219.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   220.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   223.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   225.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   226.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   227.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   230.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   231.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   232.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   234.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   237.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   238.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   243.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   243.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   246.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   247.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   250.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   250.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   253.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   255.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   256.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   257.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   258.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   261.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   263.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   264.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   266.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   269.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   271.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   272.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   274.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   275.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   275.7    

 Bfactors>  106 vectors,   4302 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :    21.860000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.274 for     89 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.005 +/-   0.01
 Bfactors> =      0.377 +/-   0.23
 Bfactors> Shiftng-fct=      0.371
 Bfactors> Scaling-fct=     42.950

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402291154411098567 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
making animated gifs
11 models are in 2402291154411098567.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402291154411098567.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402291154411098567.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402291154411098567 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
making animated gifs
11 models are in 2402291154411098567.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402291154411098567.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402291154411098567.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402291154411098567 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402291154411098567.eigenfacs
2402291154411098567.atom
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calculating perturbed structure for DQ=60
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2402291154411098567.atom
making animated gifs
11 models are in 2402291154411098567.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402291154411098567 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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2402291154411098567.8.pdb
2402291154411098567.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m3.580s
user	0m3.548s
sys	0m0.032s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402291154411098567.Chkmod.res: No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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It was developed by Karsten Suhre.
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