*** 4JBU ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228061230937826.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228061230937826.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228061230937826.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 276
First residue number = 1
Last residue number = 276
Number of atoms found = 2216
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 11.402252 +/- 16.413788 From: -22.370000 To: 49.961000
= 7.031739 +/- 7.409186 From: -10.717000 To: 25.137000
= 13.212480 +/- 16.955333 From: -24.863000 To: 47.498000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.6178 % Filled.
Pdbmat> 799585 non-zero elements.
Pdbmat> 87376 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.86 +/- 21.50
Maximum number = 129
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.747520E+06
Pdbmat> Larger element = 494.203
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
276 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228061230937826.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228061230937826.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228061230937826.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2216 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 276 residues.
Blocpdb> 9 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 12 atoms in block 2
Block first atom: 10
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 22
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 34
Blocpdb> 18 atoms in block 5
Block first atom: 49
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 67
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 82
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 99
Blocpdb> 17 atoms in block 9
Block first atom: 112
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 129
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 145
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 166
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 183
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 204
Blocpdb> 17 atoms in block 15
Block first atom: 219
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 236
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 250
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 266
Blocpdb> 19 atoms in block 19
Block first atom: 282
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 301
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 316
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 331
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 347
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 364
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 381
Blocpdb> 13 atoms in block 26
Block first atom: 395
Blocpdb> 23 atoms in block 27
Block first atom: 408
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 431
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 446
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 463
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 476
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 489
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 497
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 519
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 17 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 569
Blocpdb> 26 atoms in block 38
Block first atom: 586
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 612
Blocpdb> 20 atoms in block 40
Block first atom: 628
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 648
Blocpdb> 12 atoms in block 42
Block first atom: 665
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 677
Blocpdb> 16 atoms in block 44
Block first atom: 692
Blocpdb> 23 atoms in block 45
Block first atom: 708
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 731
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 750
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 766
Blocpdb> 20 atoms in block 49
Block first atom: 779
Blocpdb> 21 atoms in block 50
Block first atom: 799
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 820
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 834
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 846
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 865
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 881
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 897
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 913
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 929
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 944
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 958
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 974
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 994
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 1006
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1022
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1037
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 1056
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1074
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1087
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1104
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1116
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1133
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1150
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1168
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1183
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1197
Blocpdb> 17 atoms in block 76
Block first atom: 1214
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1231
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1249
Blocpdb> 10 atoms in block 79
Block first atom: 1264
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1274
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1289
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 1305
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1323
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1338
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1354
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1370
Blocpdb> 16 atoms in block 87
Block first atom: 1387
Blocpdb> 16 atoms in block 88
Block first atom: 1403
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1419
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1438
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1455
Blocpdb> 20 atoms in block 92
Block first atom: 1472
Blocpdb> 11 atoms in block 93
Block first atom: 1492
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1503
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 1517
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1538
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1554
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1572
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1587
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1603
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1618
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1634
Blocpdb> 11 atoms in block 103
Block first atom: 1646
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 1657
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1675
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1690
Blocpdb> 17 atoms in block 107
Block first atom: 1704
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 1721
Blocpdb> 10 atoms in block 109
Block first atom: 1740
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 1750
Blocpdb> 20 atoms in block 111
Block first atom: 1767
Blocpdb> 11 atoms in block 112
Block first atom: 1787
Blocpdb> 13 atoms in block 113
Block first atom: 1798
Blocpdb> 12 atoms in block 114
Block first atom: 1811
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1823
Blocpdb> 14 atoms in block 116
Block first atom: 1840
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1854
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1872
Blocpdb> 16 atoms in block 119
Block first atom: 1892
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1908
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1921
Blocpdb> 18 atoms in block 122
Block first atom: 1934
Blocpdb> 14 atoms in block 123
Block first atom: 1952
Blocpdb> 17 atoms in block 124
Block first atom: 1966
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 1983
Blocpdb> 15 atoms in block 126
Block first atom: 1997
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 2012
Blocpdb> 19 atoms in block 128
Block first atom: 2029
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2048
Blocpdb> 17 atoms in block 130
Block first atom: 2062
Blocpdb> 13 atoms in block 131
Block first atom: 2079
Blocpdb> 19 atoms in block 132
Block first atom: 2092
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2111
Blocpdb> 18 atoms in block 134
Block first atom: 2130
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2148
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2168
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2181
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2197
Blocpdb> 138 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 799723 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6648
Prepmat> Matrix trace = 1747520.0000
Prepmat> Last element read: 6648 6648 201.9303
Prepmat> 9592 lines saved.
Prepmat> 8219 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2216
RTB> Total mass = 2216.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2216
RTB> Number of blocks = 138
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 180423.9713
RTB> 47322 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 828
Diagstd> Nb of non-zero elements: 47322
Diagstd> Projected matrix trace = 180423.9713
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 828 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 180423.9713
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2729660 0.3315359 0.4831586 2.0846920
2.4431378 3.1750599 3.4575863 4.3412101 5.9269241
6.3186920 8.4829554 8.5930357 8.8954837 9.8611180
11.2322453 11.2962125 13.5196863 13.9062350 14.6651937
15.9573985 16.4372779 16.9941788 17.7413118 18.2158919
19.2657867 19.5418067 21.1979835 21.7420278 22.0010048
23.8806566 24.4037902 24.8092204 25.6600152 26.3652968
27.3661958 27.9622709 28.7889549 29.3929645 29.5417603
30.5406270 31.7374002 32.0085934 33.8904789 34.4898112
34.7820414 36.0338423 37.2599209 37.6476029 38.1201523
39.0659849 39.4929571 39.9120716 40.5934597 41.6135577
42.4889938 42.8810072 44.2123019 44.7516593 45.5230164
46.3640330 47.1008878 47.5205832 48.1376150 49.3104318
49.7884799 50.5817440 52.0728858 52.4816562 53.4408612
54.1385898 54.3194522 55.1970302 55.6454385 56.8815405
57.0708580 57.7108071 57.8161544 59.0410274 60.4772582
60.8306941 61.3615854 62.4788463 63.2628684 63.5258165
64.4632085 65.7284697 65.8660477 66.2240136 67.2945274
68.1152917 68.5520978 69.4528628 70.0117984 71.0275127
71.4376490 72.1849534 72.4958530 72.9554834 73.2861658
74.6020218
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034336 0.0034338 0.0034348 0.0034348
0.0034353 56.7348075 62.5259906 75.4814315 156.7892308
169.7341617 193.4956647 201.9211434 226.2563011 264.3686558
272.9661994 316.2779187 318.3234178 323.8769683 341.0031244
363.9389762 364.9738153 399.2809478 404.9487501 415.8523713
433.7867930 440.2610142 447.6569918 457.3915585 463.4687972
476.6379900 480.0402324 499.9683994 506.3435746 509.3502674
530.6625168 536.4434187 540.8811404 550.0773143 557.5856814
568.0708374 574.2242108 582.6506431 588.7310958 590.2193795
600.1146855 611.7598268 614.3679837 632.1703650 637.7356406
640.4316909 651.8543487 662.8515015 666.2909966 670.4595692
678.7262859 682.4252809 686.0368043 691.8681106 700.5073614
707.8373966 711.0952359 722.0492876 726.4401706 732.6740264
739.4109599 745.2634569 748.5764520 753.4207291 762.5436048
766.2309911 772.3109279 783.6120460 786.6816972 793.8382196
799.0036253 800.3371401 806.7763079 810.0467145 818.9944432
820.3562309 824.9428339 825.6954299 834.3960383 844.4838085
846.9478426 850.6356233 858.3448011 863.7135239 865.5066479
871.8690057 880.3837966 881.3046922 883.6962854 890.8101445
896.2261066 899.0951498 904.9828649 908.6170818 915.1843473
917.8228318 922.6109836 924.5956853 927.5220653 929.6217597
937.9303280
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2216
Rtb_to_modes> Number of blocs = 138
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2730
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3315
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4832
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.60
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 828 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
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1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
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1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
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0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 39888 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
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1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002
0.99998 0.99997 1.00002 1.00000 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003
1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228061230937826.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228061230937826.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228061230937826.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228061230937826.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 276
First residue number = 1
Last residue number = 276
Number of atoms found = 2216
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2730
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4832
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.085
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.443
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.458
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.341
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.483
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.895
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.861
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.60
Bfactors> 106 vectors, 6648 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.273000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.455 for 283 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.093 +/- 0.09
Bfactors> = 24.352 +/- 7.21
Bfactors> Shiftng-fct= 24.259
Bfactors> Scaling-fct= 80.779
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061230937826 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061230937826.eigenfacs
240228061230937826.atom
240228061230937826.10.pdb
240228061230937826.11.pdb
240228061230937826.12.pdb
240228061230937826.13.pdb
240228061230937826.14.pdb
240228061230937826.15.pdb
240228061230937826.16.pdb
240228061230937826.7.pdb
240228061230937826.8.pdb
240228061230937826.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m9.639s
user 0m9.549s
sys 0m0.064s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228061230937826.Chkmod.res: No such file or directory
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