*** 3CYE ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228061031935674.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228061031935674.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228061031935674.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 326
First residue number = 83
Last residue number = 413
Number of atoms found = 2549
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 2.485661 +/- 10.479387 From: -21.307000 To: 27.895000
= 24.190777 +/- 10.353921 From: -0.559000 To: 48.212000
= -0.410902 +/- 11.744636 From: -28.559000 To: 24.981000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3952 % Filled.
Pdbmat> 992823 non-zero elements.
Pdbmat> 108631 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.23 +/- 24.51
Maximum number = 145
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 2.172620E+06
Pdbmat> Larger element = 500.462
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
326 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228061031935674.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228061031935674.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228061031935674.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2549 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 326 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 15 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 43
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 55
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 69
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 84
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 94
Blocpdb> 20 atoms in block 9
Block first atom: 113
Blocpdb> 15 atoms in block 10
Block first atom: 133
Blocpdb> 16 atoms in block 11
Block first atom: 148
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 164
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 176
Blocpdb> 10 atoms in block 14
Block first atom: 195
Blocpdb> 13 atoms in block 15
Block first atom: 205
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 218
Blocpdb> 18 atoms in block 17
Block first atom: 233
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 251
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 270
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 286
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 305
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 317
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 333
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 350
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 367
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 385
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 404
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 420
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 429
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 445
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 461
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 480
Blocpdb> 11 atoms in block 33
Block first atom: 494
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 505
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 521
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 540
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 553
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 576
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 591
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 605
Blocpdb> 11 atoms in block 41
Block first atom: 618
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 629
Blocpdb> 16 atoms in block 43
Block first atom: 643
Blocpdb> 27 atoms in block 44
Block first atom: 659
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 686
Blocpdb> 20 atoms in block 46
Block first atom: 703
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 723
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 736
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 755
Blocpdb> 11 atoms in block 50
Block first atom: 766
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 777
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 793
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 805
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 817
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 839
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 854
Blocpdb> 10 atoms in block 57
Block first atom: 866
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 876
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 891
Blocpdb> 12 atoms in block 60
Block first atom: 903
Blocpdb> 12 atoms in block 61
Block first atom: 915
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 927
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 944
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 964
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 976
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 991
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1006
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1023
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1043
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1062
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1078
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1097
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1113
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1128
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1143
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1154
Blocpdb> 10 atoms in block 77
Block first atom: 1169
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1196
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1211
Blocpdb> 12 atoms in block 81
Block first atom: 1226
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1238
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1251
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1263
Blocpdb> 18 atoms in block 85
Block first atom: 1277
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1295
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1312
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1329
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1346
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1359
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1375
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1391
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1405
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1422
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1435
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 1450
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 1472
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1493
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1508
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1520
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1539
Blocpdb> 13 atoms in block 102
Block first atom: 1554
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1567
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1582
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1595
Blocpdb> 16 atoms in block 106
Block first atom: 1612
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 1628
Blocpdb> 10 atoms in block 108
Block first atom: 1652
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1662
Blocpdb> 21 atoms in block 110
Block first atom: 1681
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1702
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1715
Blocpdb> 22 atoms in block 113
Block first atom: 1734
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1756
Blocpdb> 21 atoms in block 115
Block first atom: 1772
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1793
Blocpdb> 20 atoms in block 117
Block first atom: 1805
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1825
Blocpdb> 11 atoms in block 119
Block first atom: 1837
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1848
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1863
Blocpdb> 18 atoms in block 122
Block first atom: 1879
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1897
Blocpdb> 12 atoms in block 124
Block first atom: 1912
Blocpdb> 11 atoms in block 125
Block first atom: 1924
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 1935
Blocpdb> 11 atoms in block 127
Block first atom: 1947
Blocpdb> 13 atoms in block 128
Block first atom: 1958
Blocpdb> 17 atoms in block 129
Block first atom: 1971
Blocpdb> 9 atoms in block 130
Block first atom: 1988
Blocpdb> 12 atoms in block 131
Block first atom: 1997
Blocpdb> 17 atoms in block 132
Block first atom: 2009
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2026
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 2041
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 2058
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 2081
Blocpdb> 11 atoms in block 137
Block first atom: 2097
Blocpdb> 22 atoms in block 138
Block first atom: 2108
Blocpdb> 15 atoms in block 139
Block first atom: 2130
Blocpdb> 16 atoms in block 140
Block first atom: 2145
Blocpdb> 13 atoms in block 141
Block first atom: 2161
Blocpdb> 12 atoms in block 142
Block first atom: 2174
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2186
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2203
Blocpdb> 17 atoms in block 145
Block first atom: 2218
Blocpdb> 22 atoms in block 146
Block first atom: 2235
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2257
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2272
Blocpdb> 21 atoms in block 149
Block first atom: 2284
Blocpdb> 16 atoms in block 150
Block first atom: 2305
Blocpdb> 14 atoms in block 151
Block first atom: 2321
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2335
Blocpdb> 13 atoms in block 153
Block first atom: 2352
Blocpdb> 20 atoms in block 154
Block first atom: 2365
Blocpdb> 16 atoms in block 155
Block first atom: 2385
Blocpdb> 12 atoms in block 156
Block first atom: 2401
Blocpdb> 15 atoms in block 157
Block first atom: 2413
Blocpdb> 22 atoms in block 158
Block first atom: 2428
Blocpdb> 10 atoms in block 159
Block first atom: 2450
Blocpdb> 18 atoms in block 160
Block first atom: 2460
Blocpdb> 10 atoms in block 161
Block first atom: 2478
Blocpdb> 18 atoms in block 162
Block first atom: 2488
Blocpdb> 44 atoms in block 163
Block first atom: 2505
Blocpdb> 163 blocks.
Blocpdb> At most, 44 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 992986 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7647
Prepmat> Matrix trace = 2172620.0000
Prepmat> Last element read: 7647 7647 0.3353
Prepmat> 13367 lines saved.
Prepmat> 11520 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2549
RTB> Total mass = 2549.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2549
RTB> Number of blocks = 163
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 238183.2237
RTB> 64011 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 978
Diagstd> Nb of non-zero elements: 64011
Diagstd> Projected matrix trace = 238183.2237
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 978 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 238183.2237
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.0058485 2.4494395 3.7335357 5.8210415
6.9654671 7.2362998 9.2181878 11.2201674 11.6543862
12.5700809 13.2365336 14.0749453 14.2585305 15.3376408
16.4521885 16.8243120 18.2474526 18.7678219 19.7386798
21.1875108 21.6867384 22.4067364 23.3504980 23.7892310
24.5640229 25.2969895 26.5514073 26.9819661 27.9982995
28.6137155 30.3481073 31.1887623 31.4220059 32.8670155
33.2760910 33.7697478 35.1675277 35.6319023 35.7943725
36.3532496 37.5933741 38.9749636 39.1320875 39.8086001
40.5602505 40.9979640 42.0402808 42.7959330 43.6235043
43.6568174 44.3452878 45.5069002 45.7335694 46.8384888
47.1734696 48.3603294 48.8821304 49.9062013 50.3898319
51.2361014 52.8636963 53.1310700 54.3379390 54.8870947
55.4750817 56.4828401 57.3846119 57.6140453 58.5528930
59.0050837 59.9297241 60.1904581 60.8176502 61.5663156
62.0790338 62.8319681 63.1532973 63.6439742 64.3110211
65.2420189 66.1358973 66.3435760 67.5971337 68.5414667
69.1325444 70.1878766 70.9253018 71.8381018 72.0840076
72.4889215 73.8739299 74.5587296 75.1373638 75.8066694
75.9847054 76.2376649 76.9483071 77.6162810 78.4067397
79.7140389
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034329 0.0034338 0.0034342 0.0034359
0.0034361 153.7957517 169.9529247 209.8241307 261.9965834
286.5961829 292.1147956 329.6993233 363.7432542 370.7148506
385.0031800 395.0776065 407.3977609 410.0460808 425.2796105
440.4606534 445.4140755 463.8701244 470.4378074 482.4522443
499.8448807 505.6993560 514.0254035 524.7390124 529.6457378
538.2016526 546.1723375 559.5501970 564.0687977 574.5940283
580.8746285 598.2202163 606.4490923 608.7125182 622.5516877
626.4139658 631.0433417 643.9708358 648.2085945 649.6847268
654.7370227 665.8109500 677.9351306 679.3002720 685.1469566
691.5850468 695.3067170 704.0898509 710.3894938 717.2252250
717.4990270 723.1343957 732.5443230 734.3664531 743.1846270
745.8374562 755.1616134 759.2247249 767.1363063 770.8444234
777.2904261 789.5398295 791.5339763 800.4733196 804.5080648
808.8057975 816.1191025 822.6081441 824.2509669 830.9396047
834.1420130 840.6523266 842.4790396 846.8570329 852.0534956
855.5940479 860.7670063 862.9652258 866.3111931 870.8392257
877.1199240 883.1081754 884.4936487 892.8107707 899.0254315
902.8935510 909.7589404 914.5256202 920.3917231 921.9656534
924.5514825 933.3421559 937.6581437 941.2895933 945.4726892
946.5822844 948.1566014 952.5654271 956.6910147 961.5502345
969.5332043
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2549
Rtb_to_modes> Number of blocs = 163
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.006
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.449
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.734
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.821
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.965
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.236
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.218
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.71
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 978 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
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1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45882 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99996 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228061031935674.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228061031935674.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228061031935674.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228061031935674.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 326
First residue number = 83
Last residue number = 413
Number of atoms found = 2549
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.449
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.734
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.965
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.218
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.71
Bfactors> 106 vectors, 7647 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.006000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.523 for 333 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.023 +/- 0.03
Bfactors> = 12.170 +/- 4.55
Bfactors> Shiftng-fct= 12.147
Bfactors> Scaling-fct= 171.429
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061031935674 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061031935674.eigenfacs
240228061031935674.atom
240228061031935674.10.pdb
240228061031935674.11.pdb
240228061031935674.12.pdb
240228061031935674.13.pdb
240228061031935674.14.pdb
240228061031935674.15.pdb
240228061031935674.16.pdb
240228061031935674.7.pdb
240228061031935674.8.pdb
240228061031935674.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m15.084s
user 0m15.027s
sys 0m0.040s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228061031935674.Chkmod.res: No such file or directory
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