*** 4XFX ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228060830932497.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228060830932497.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228060830932497.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 216
First residue number = 1
Last residue number = 216
Number of atoms found = 1680
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 8.532507 +/- 15.428810 From: -15.291000 To: 43.913000
= -26.682197 +/- 7.992935 From: -46.914000 To: -2.795000
= 0.359021 +/- 14.248008 From: -30.641000 To: 35.077000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.4642 % Filled.
Pdbmat> 567100 non-zero elements.
Pdbmat> 61900 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.69 +/- 22.54
Maximum number = 126
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.238000E+06
Pdbmat> Larger element = 490.062
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
216 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228060830932497.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228060830932497.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228060830932497.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1680 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 216 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 12 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 28
Blocpdb> 19 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 13 atoms in block 5
Block first atom: 59
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 72
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 85
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 103
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 119
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 138
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 154
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 168
Blocpdb> 14 atoms in block 13
Block first atom: 186
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 200
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 233
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 248
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 263
Blocpdb> 13 atoms in block 19
Block first atom: 280
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 9 atoms in block 21
Block first atom: 308
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 317
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 331
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 348
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 364
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 379
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 395
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 409
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 417
Blocpdb> 10 atoms in block 30
Block first atom: 436
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 446
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 463
Blocpdb> 18 atoms in block 33
Block first atom: 479
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 497
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 512
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 529
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 543
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 557
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 579
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 598
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 615
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 632
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 641
Blocpdb> 12 atoms in block 44
Block first atom: 656
Blocpdb> 13 atoms in block 45
Block first atom: 668
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 681
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 700
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 716
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 731
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 745
Blocpdb> 11 atoms in block 51
Block first atom: 758
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 769
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 782
Blocpdb> 18 atoms in block 54
Block first atom: 797
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 815
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 832
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 850
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 865
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 883
Blocpdb> 15 atoms in block 60
Block first atom: 897
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 912
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 923
Blocpdb> 21 atoms in block 63
Block first atom: 940
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 961
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 986
Blocpdb> 12 atoms in block 66
Block first atom: 1002
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1014
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1030
Blocpdb> 18 atoms in block 69
Block first atom: 1047
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1065
Blocpdb> 13 atoms in block 71
Block first atom: 1085
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1098
Blocpdb> 16 atoms in block 73
Block first atom: 1111
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1127
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1143
Blocpdb> 11 atoms in block 76
Block first atom: 1163
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1174
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1192
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1210
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1229
Blocpdb> 19 atoms in block 81
Block first atom: 1248
Blocpdb> 23 atoms in block 82
Block first atom: 1267
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1290
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1306
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1325
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1339
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1353
Blocpdb> 16 atoms in block 88
Block first atom: 1368
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1384
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 1401
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1423
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1439
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1454
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1469
Blocpdb> 13 atoms in block 95
Block first atom: 1486
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1499
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1514
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1529
Blocpdb> 17 atoms in block 99
Block first atom: 1544
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1561
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 1574
Blocpdb> 9 atoms in block 102
Block first atom: 1585
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1594
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 1609
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1627
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1643
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1655
Blocpdb> 11 atoms in block 108
Block first atom: 1669
Blocpdb> 108 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 567208 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5040
Prepmat> Matrix trace = 1238000.0000
Prepmat> Last element read: 5040 5040 193.0276
Prepmat> 5887 lines saved.
Prepmat> 4902 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1680
RTB> Total mass = 1680.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1680
RTB> Number of blocks = 108
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 129678.1078
RTB> 33804 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 648
Diagstd> Nb of non-zero elements: 33804
Diagstd> Projected matrix trace = 129678.1078
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 648 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 129678.1078
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2630692 0.3988351 0.5815879 1.8621636
2.1575566 2.6663336 3.3344824 4.9059482 5.4269473
6.0526149 6.3351530 7.3241636 8.5597786 9.5233751
9.7875429 11.1011637 12.7473792 13.3202408 13.5359190
14.6996278 15.5774996 15.6648493 16.7347399 17.5815330
19.5466347 20.1948165 20.3327297 21.6891082 23.1974175
23.7672005 24.4852646 25.7856223 26.6347349 26.8156533
27.1332001 27.5733372 29.6390968 30.1041763 31.2807865
32.4698756 32.5657078 33.9420399 34.4176318 35.1142190
35.9756052 36.0567543 37.5095229 37.6950192 38.5690927
39.4164147 40.0212875 40.4164243 40.8113115 41.2742507
42.1468012 43.8136663 44.3287516 44.8079990 45.2491868
45.4798141 46.9302482 47.5349700 48.0969801 49.0618611
49.6991941 49.9761317 51.3379531 52.2187988 53.0841094
53.7900386 53.9144701 54.5992856 55.8629369 56.5963866
56.8306081 58.3868294 58.9545638 60.5466442 61.1636468
61.7162237 62.0588589 62.5746398 62.7412238 64.0889388
64.4537943 65.5971411 66.1253300 66.7285774 68.0718204
69.2601158 69.7260163 70.0636627 70.9346098 71.5926601
72.3486140 72.6299323 73.9818325 75.0214081 75.2146680
76.4255998
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034331 0.0034331 0.0034333 0.0034336
0.0034344 55.6968064 68.5791303 82.8138440 148.1849844
159.5057647 177.3178774 198.2939635 240.5230807 252.9723647
267.1571496 273.3215241 293.8828874 317.7068263 335.1125749
339.7286074 361.8091402 387.7088659 396.3248625 399.5205787
416.3402984 428.5920926 429.7920632 444.2268085 455.3272583
480.0995281 487.9948470 489.6583037 505.7269848 523.0161503
529.4004372 537.3381561 551.4219996 560.4275405 562.3276925
565.6473916 570.2167183 591.1909305 595.8111887 607.3431148
618.7790373 619.6915026 632.6510749 637.0679725 643.4825693
651.3273796 652.0615554 665.0679971 666.7104540 674.3960092
681.7636464 686.9748031 690.3577811 693.7221411 697.6456319
704.9812875 718.7867757 722.9995560 726.8972992 730.4671155
732.3262825 743.9122426 748.6897583 753.1026658 760.6192096
765.5436416 767.6735884 778.0626264 784.7091539 791.1840951
796.4274283 797.3480766 802.3960098 811.6282641 816.9390056
818.6276923 829.7604416 833.7848416 844.9681111 849.2625357
853.0901994 855.4550083 859.0025629 860.1452055 869.3343105
871.8053393 879.5038325 883.0376208 887.0563585 895.9400746
903.7262290 906.7607369 908.9535678 914.5856276 918.8180748
923.6562813 925.4502986 934.0235412 940.5629903 941.7736863
949.3245414
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1680
Rtb_to_modes> Number of blocs = 108
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2631
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3988
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5816
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.862
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.158
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.666
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.906
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.427
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.335
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.324
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.560
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.788
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.43
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 648 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 0.99999 0.99996 1.00002 1.00003
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1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
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1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999
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0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 30240 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 0.99996 1.00002 1.00003
1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
1.00000 0.99997 1.00000 1.00004 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99995
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
1.00000 1.00000 0.99995 1.00003 1.00002
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000
0.99999 0.99995 0.99998 1.00003 0.99997
1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002
0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999
0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228060830932497.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228060830932497.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228060830932497.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228060830932497.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 216
First residue number = 1
Last residue number = 216
Number of atoms found = 1680
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2631
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5816
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.862
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.666
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.906
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.427
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.053
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.335
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.324
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.523
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.43
Bfactors> 106 vectors, 5040 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.263100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.576 for 216 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.120 +/- 0.12
Bfactors> = 46.572 +/- 17.63
Bfactors> Shiftng-fct= 46.453
Bfactors> Scaling-fct= 147.789
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060830932497 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060830932497.eigenfacs
240228060830932497.atom
240228060830932497.10.pdb
240228060830932497.11.pdb
240228060830932497.12.pdb
240228060830932497.13.pdb
240228060830932497.14.pdb
240228060830932497.15.pdb
240228060830932497.16.pdb
240228060830932497.7.pdb
240228060830932497.8.pdb
240228060830932497.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m5.115s
user 0m5.094s
sys 0m0.020s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228060830932497.Chkmod.res: No such file or directory
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