*** 4CDB_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240221152119307497.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240221152119307497.atom to be opened.
Openam> File opened: 240221152119307497.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 417
First residue number = 1
Last residue number = 417
Number of atoms found = 3236
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 4.271271 +/- 20.109754 From: -47.375000 To: 49.906000
= -3.467876 +/- 7.524420 From: -21.172000 To: 20.750000
= -4.888314 +/- 19.541280 From: -48.375000 To: 47.562000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4260 % Filled.
Pdbmat> 1143325 non-zero elements.
Pdbmat> 125046 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.28 +/- 23.67
Maximum number = 123
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.500920E+06
Pdbmat> Larger element = 495.043
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
417 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240221152119307497.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240221152119307497.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240221152119307497.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3236 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 417 residues.
Blocpdb> 20 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 18 atoms in block 2
Block first atom: 21
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 39
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 58
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 80
Blocpdb> 27 atoms in block 6
Block first atom: 102
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 129
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 152
Blocpdb> 29 atoms in block 9
Block first atom: 177
Blocpdb> 21 atoms in block 10
Block first atom: 206
Blocpdb> 28 atoms in block 11
Block first atom: 227
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 255
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 280
Blocpdb> 26 atoms in block 14
Block first atom: 302
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 328
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 348
Blocpdb> 25 atoms in block 17
Block first atom: 370
Blocpdb> 25 atoms in block 18
Block first atom: 395
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 420
Blocpdb> 29 atoms in block 20
Block first atom: 441
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 470
Blocpdb> 27 atoms in block 22
Block first atom: 492
Blocpdb> 24 atoms in block 23
Block first atom: 519
Blocpdb> 25 atoms in block 24
Block first atom: 543
Blocpdb> 21 atoms in block 25
Block first atom: 568
Blocpdb> 25 atoms in block 26
Block first atom: 589
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 614
Blocpdb> 19 atoms in block 28
Block first atom: 636
Blocpdb> 21 atoms in block 29
Block first atom: 655
Blocpdb> 23 atoms in block 30
Block first atom: 676
Blocpdb> 20 atoms in block 31
Block first atom: 699
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 719
Blocpdb> 23 atoms in block 33
Block first atom: 741
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 764
Blocpdb> 24 atoms in block 35
Block first atom: 788
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 812
Blocpdb> 27 atoms in block 37
Block first atom: 834
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 861
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 883
Blocpdb> 24 atoms in block 40
Block first atom: 904
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 928
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 947
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 971
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 996
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 1018
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 1040
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1062
Blocpdb> 20 atoms in block 48
Block first atom: 1085
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1105
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1128
Blocpdb> 31 atoms in block 51
Block first atom: 1155
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1186
Blocpdb> 26 atoms in block 53
Block first atom: 1212
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1238
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 1260
Blocpdb> 28 atoms in block 56
Block first atom: 1280
Blocpdb> 25 atoms in block 57
Block first atom: 1308
Blocpdb> 25 atoms in block 58
Block first atom: 1333
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 1358
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1379
Blocpdb> 25 atoms in block 61
Block first atom: 1404
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 1429
Blocpdb> 25 atoms in block 63
Block first atom: 1445
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1470
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1493
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1515
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1541
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1558
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 1577
Blocpdb> 25 atoms in block 70
Block first atom: 1603
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 1628
Blocpdb> 26 atoms in block 72
Block first atom: 1653
Blocpdb> 32 atoms in block 73
Block first atom: 1679
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1711
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 1733
Blocpdb> 25 atoms in block 76
Block first atom: 1757
Blocpdb> 28 atoms in block 77
Block first atom: 1782
Blocpdb> 24 atoms in block 78
Block first atom: 1810
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1834
Blocpdb> 27 atoms in block 80
Block first atom: 1853
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1880
Blocpdb> 19 atoms in block 82
Block first atom: 1902
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1921
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1943
Blocpdb> 25 atoms in block 85
Block first atom: 1965
Blocpdb> 19 atoms in block 86
Block first atom: 1990
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 2009
Blocpdb> 27 atoms in block 88
Block first atom: 2030
Blocpdb> 29 atoms in block 89
Block first atom: 2057
Blocpdb> 21 atoms in block 90
Block first atom: 2086
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 2107
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 2131
Blocpdb> 21 atoms in block 93
Block first atom: 2153
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2174
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 2198
Blocpdb> 19 atoms in block 96
Block first atom: 2215
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 2234
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 2253
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 2272
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 2296
Blocpdb> 23 atoms in block 101
Block first atom: 2320
Blocpdb> 26 atoms in block 102
Block first atom: 2343
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 2369
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2389
Blocpdb> 20 atoms in block 105
Block first atom: 2409
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 2429
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 2453
Blocpdb> 20 atoms in block 108
Block first atom: 2478
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 2498
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 2518
Blocpdb> 25 atoms in block 111
Block first atom: 2545
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 2570
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 2588
Blocpdb> 27 atoms in block 114
Block first atom: 2614
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2641
Blocpdb> 20 atoms in block 116
Block first atom: 2659
Blocpdb> 26 atoms in block 117
Block first atom: 2679
Blocpdb> 27 atoms in block 118
Block first atom: 2705
Blocpdb> 25 atoms in block 119
Block first atom: 2732
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2757
Blocpdb> 24 atoms in block 121
Block first atom: 2779
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2803
Blocpdb> 29 atoms in block 123
Block first atom: 2825
Blocpdb> 23 atoms in block 124
Block first atom: 2854
Blocpdb> 20 atoms in block 125
Block first atom: 2877
Blocpdb> 27 atoms in block 126
Block first atom: 2897
Blocpdb> 21 atoms in block 127
Block first atom: 2924
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 2945
Blocpdb> 20 atoms in block 129
Block first atom: 2969
Blocpdb> 23 atoms in block 130
Block first atom: 2989
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 3012
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 3037
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 3059
Blocpdb> 27 atoms in block 134
Block first atom: 3090
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3117
Blocpdb> 21 atoms in block 136
Block first atom: 3141
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 3162
Blocpdb> 27 atoms in block 138
Block first atom: 3186
Blocpdb> 24 atoms in block 139
Block first atom: 3212
Blocpdb> 139 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1143464 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9708
Prepmat> Matrix trace = 2500920.0000
Prepmat> Last element read: 9708 9708 345.6155
Prepmat> 9731 lines saved.
Prepmat> 8474 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3236
RTB> Total mass = 3236.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3236
RTB> Number of blocks = 139
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 164528.5995
RTB> 43131 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 834
Diagstd> Nb of non-zero elements: 43131
Diagstd> Projected matrix trace = 164528.5995
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 834 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 164528.5995
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0957326 0.3645252 0.5654628 0.7788924
0.8321143 1.2179552 1.4264541 2.0873173 2.5239201
3.0699645 3.1270453 3.5524086 3.7550814 4.2029192
4.4571537 4.7461637 5.4986147 5.7859348 6.2021837
6.5419597 7.3841949 7.9869486 8.0386931 8.5333546
8.8827446 9.3947443 10.1706989 10.4253725 10.9000661
11.4050664 11.9019244 12.1179554 13.0164398 13.3609072
13.7474564 14.1120439 14.2400258 15.5296342 16.1523919
16.4373400 16.6901261 18.1616539 18.6048618 19.1773112
20.1169236 20.1466296 21.0938372 21.9975485 22.3321297
22.8318140 23.0287161 23.7854901 24.2145187 24.7458887
24.9234976 26.1938356 26.6416351 27.1511195 28.2804003
28.5076303 29.1480804 29.8424284 30.8850166 31.1167061
31.2284371 32.4134688 32.6335789 33.0938332 33.8922860
34.5587866 35.2042092 36.0404722 36.3295078 37.3538289
38.1448563 38.3266478 39.0624167 39.1807789 39.9675961
40.2339753 41.1709593 41.8666620 42.1527521 42.3371006
43.3621367 43.6943843 43.9801526 44.7694394 45.5982324
45.8678073 46.5064358 46.6816031 47.0834428 48.2366017
48.7866883 50.1015135 50.2377332 50.7582034 51.3282492
52.3408373
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034333 0.0034334 0.0034337 0.0034346
0.0034353 33.5989137 65.5630341 81.6577298 95.8371757
99.0573675 119.8425211 129.6952820 156.8879240 172.5174719
190.2663358 192.0270308 204.6712004 210.4286928 222.6233935
229.2577807 236.5737946 254.6372432 261.2053390 270.4379239
277.7468940 295.0848120 306.8921110 307.8846268 317.2160675
323.6449741 332.8417238 346.3145021 350.6235401 358.5170755
366.7281013 374.6311405 378.0158022 391.7792116 396.9293874
402.6303006 407.9343154 409.7799158 427.9331139 436.4291017
440.2618459 443.6342714 462.7782913 468.3909603 475.5422832
487.0528215 487.4122961 498.7387071 509.3102562 513.1689269
518.8782767 521.1108827 529.6040931 534.3590894 540.1903325
542.1254239 555.7696531 560.5001308 565.8341444 577.4814740
579.7968341 586.2734944 593.2153235 603.4887795 605.7481396
606.8346979 618.2413316 620.3369253 624.6961323 632.1872190
638.3730184 644.3065948 651.9143132 654.5231883 663.6862845
670.6767823 672.2730449 678.6952887 679.7227611 686.5138357
688.7978019 696.7721339 702.6344648 705.0310560 706.5710453
715.0733906 717.8076666 720.1511294 726.5844659 733.2790620
735.4434257 740.5456047 741.9389333 745.1254310 754.1949713
758.4831713 768.6359678 769.6801702 773.6568966 777.9890880
785.6255756
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3236
Rtb_to_modes> Number of blocs = 139
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.34
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 834 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002
1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999
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1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 58248 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
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1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
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1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002
1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999
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1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240221152119307497.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240221152119307497.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240221152119307497.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240221152119307497.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 417
First residue number = 1
Last residue number = 417
Number of atoms found = 3236
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5733E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3645
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7789
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.218
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.755
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.203
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.786
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.202
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.542
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.34
Bfactors> 106 vectors, 9708 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.095733
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.071 for 417 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.124 +/- 0.36
Bfactors> = 90.751 +/- 10.65
Bfactors> Shiftng-fct= 90.626
Bfactors> Scaling-fct= 29.429
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152119307497 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152119307497.eigenfacs
240221152119307497.atom
240221152119307497.10.pdb
240221152119307497.11.pdb
240221152119307497.12.pdb
240221152119307497.13.pdb
240221152119307497.14.pdb
240221152119307497.15.pdb
240221152119307497.16.pdb
240221152119307497.7.pdb
240221152119307497.8.pdb
240221152119307497.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.077s
user 0m12.033s
sys 0m0.044s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240221152119307497.Chkmod.res: No such file or directory
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