*** 1IKQ_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220092014169949.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220092014169949.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220092014169949.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 606
First residue number = 1
Last residue number = 606
Number of atoms found = 4652
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.495109 +/- 17.736421 From: -42.594000 To: 48.156000
= 1.348578 +/- 11.129386 From: -25.031000 To: 31.625000
= -2.961852 +/- 16.609649 From: -37.469000 To: 40.812000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7143 % Filled.
Pdbmat> 1669584 non-zero elements.
Pdbmat> 182678 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.54 +/- 23.63
Maximum number = 130
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 3.653560E+06
Pdbmat> Larger element = 502.179
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
606 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220092014169949.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220092014169949.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220092014169949.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4652 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 606 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 38 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 29 atoms in block 3
Block first atom: 73
Blocpdb> 26 atoms in block 4
Block first atom: 102
Blocpdb> 33 atoms in block 5
Block first atom: 128
Blocpdb> 28 atoms in block 6
Block first atom: 161
Blocpdb> 31 atoms in block 7
Block first atom: 189
Blocpdb> 27 atoms in block 8
Block first atom: 220
Blocpdb> 28 atoms in block 9
Block first atom: 247
Blocpdb> 25 atoms in block 10
Block first atom: 275
Blocpdb> 37 atoms in block 11
Block first atom: 300
Blocpdb> 29 atoms in block 12
Block first atom: 337
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 366
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 391
Blocpdb> 29 atoms in block 15
Block first atom: 421
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 450
Blocpdb> 29 atoms in block 17
Block first atom: 477
Blocpdb> 27 atoms in block 18
Block first atom: 506
Blocpdb> 39 atoms in block 19
Block first atom: 533
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 572
Blocpdb> 31 atoms in block 21
Block first atom: 596
Blocpdb> 36 atoms in block 22
Block first atom: 627
Blocpdb> 39 atoms in block 23
Block first atom: 663
Blocpdb> 26 atoms in block 24
Block first atom: 702
Blocpdb> 36 atoms in block 25
Block first atom: 728
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 764
Blocpdb> 31 atoms in block 27
Block first atom: 800
Blocpdb> 30 atoms in block 28
Block first atom: 831
Blocpdb> 35 atoms in block 29
Block first atom: 861
Blocpdb> 35 atoms in block 30
Block first atom: 896
Blocpdb> 25 atoms in block 31
Block first atom: 931
Blocpdb> 33 atoms in block 32
Block first atom: 956
Blocpdb> 29 atoms in block 33
Block first atom: 989
Blocpdb> 35 atoms in block 34
Block first atom: 1018
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 1053
Blocpdb> 30 atoms in block 36
Block first atom: 1082
Blocpdb> 33 atoms in block 37
Block first atom: 1112
Blocpdb> 31 atoms in block 38
Block first atom: 1145
Blocpdb> 34 atoms in block 39
Block first atom: 1176
Blocpdb> 33 atoms in block 40
Block first atom: 1210
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1243
Blocpdb> 28 atoms in block 42
Block first atom: 1276
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 1304
Blocpdb> 27 atoms in block 44
Block first atom: 1329
Blocpdb> 29 atoms in block 45
Block first atom: 1356
Blocpdb> 40 atoms in block 46
Block first atom: 1385
Blocpdb> 34 atoms in block 47
Block first atom: 1425
Blocpdb> 28 atoms in block 48
Block first atom: 1459
Blocpdb> 30 atoms in block 49
Block first atom: 1487
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1517
Blocpdb> 39 atoms in block 51
Block first atom: 1544
Blocpdb> 31 atoms in block 52
Block first atom: 1583
Blocpdb> 33 atoms in block 53
Block first atom: 1614
Blocpdb> 31 atoms in block 54
Block first atom: 1647
Blocpdb> 36 atoms in block 55
Block first atom: 1678
Blocpdb> 40 atoms in block 56
Block first atom: 1714
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1754
Blocpdb> 29 atoms in block 58
Block first atom: 1778
Blocpdb> 34 atoms in block 59
Block first atom: 1807
Blocpdb> 32 atoms in block 60
Block first atom: 1841
Blocpdb> 28 atoms in block 61
Block first atom: 1873
Blocpdb> 39 atoms in block 62
Block first atom: 1901
Blocpdb> 31 atoms in block 63
Block first atom: 1940
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1971
Blocpdb> 25 atoms in block 65
Block first atom: 1994
Blocpdb> 30 atoms in block 66
Block first atom: 2019
Blocpdb> 33 atoms in block 67
Block first atom: 2049
Blocpdb> 34 atoms in block 68
Block first atom: 2082
Blocpdb> 41 atoms in block 69
Block first atom: 2116
Blocpdb> 36 atoms in block 70
Block first atom: 2157
Blocpdb> 35 atoms in block 71
Block first atom: 2193
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 2228
Blocpdb> 34 atoms in block 73
Block first atom: 2259
Blocpdb> 28 atoms in block 74
Block first atom: 2293
Blocpdb> 30 atoms in block 75
Block first atom: 2321
Blocpdb> 39 atoms in block 76
Block first atom: 2351
Blocpdb> 32 atoms in block 77
Block first atom: 2390
Blocpdb> 35 atoms in block 78
Block first atom: 2422
Blocpdb> 26 atoms in block 79
Block first atom: 2457
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 2483
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 2506
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 2530
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 2556
Blocpdb> 34 atoms in block 84
Block first atom: 2592
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 2626
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2654
Blocpdb> 29 atoms in block 87
Block first atom: 2680
Blocpdb> 40 atoms in block 88
Block first atom: 2709
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 2749
Blocpdb> 30 atoms in block 90
Block first atom: 2773
Blocpdb> 22 atoms in block 91
Block first atom: 2803
Blocpdb> 27 atoms in block 92
Block first atom: 2825
Blocpdb> 27 atoms in block 93
Block first atom: 2852
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2879
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2903
Blocpdb> 24 atoms in block 96
Block first atom: 2927
Blocpdb> 23 atoms in block 97
Block first atom: 2951
Blocpdb> 36 atoms in block 98
Block first atom: 2974
Blocpdb> 34 atoms in block 99
Block first atom: 3010
Blocpdb> 29 atoms in block 100
Block first atom: 3044
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 3073
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 3097
Blocpdb> 35 atoms in block 103
Block first atom: 3122
Blocpdb> 28 atoms in block 104
Block first atom: 3157
Blocpdb> 37 atoms in block 105
Block first atom: 3185
Blocpdb> 36 atoms in block 106
Block first atom: 3222
Blocpdb> 35 atoms in block 107
Block first atom: 3258
Blocpdb> 37 atoms in block 108
Block first atom: 3293
Blocpdb> 34 atoms in block 109
Block first atom: 3330
Blocpdb> 33 atoms in block 110
Block first atom: 3364
Blocpdb> 30 atoms in block 111
Block first atom: 3397
Blocpdb> 28 atoms in block 112
Block first atom: 3427
Blocpdb> 32 atoms in block 113
Block first atom: 3455
Blocpdb> 26 atoms in block 114
Block first atom: 3487
Blocpdb> 31 atoms in block 115
Block first atom: 3513
Blocpdb> 29 atoms in block 116
Block first atom: 3544
Blocpdb> 37 atoms in block 117
Block first atom: 3573
Blocpdb> 36 atoms in block 118
Block first atom: 3610
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 3646
Blocpdb> 29 atoms in block 120
Block first atom: 3670
Blocpdb> 34 atoms in block 121
Block first atom: 3699
Blocpdb> 33 atoms in block 122
Block first atom: 3733
Blocpdb> 31 atoms in block 123
Block first atom: 3766
Blocpdb> 31 atoms in block 124
Block first atom: 3797
Blocpdb> 32 atoms in block 125
Block first atom: 3828
Blocpdb> 33 atoms in block 126
Block first atom: 3860
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 3893
Blocpdb> 34 atoms in block 128
Block first atom: 3924
Blocpdb> 32 atoms in block 129
Block first atom: 3958
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 3990
Blocpdb> 26 atoms in block 131
Block first atom: 4015
Blocpdb> 29 atoms in block 132
Block first atom: 4041
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 4070
Blocpdb> 32 atoms in block 134
Block first atom: 4101
Blocpdb> 35 atoms in block 135
Block first atom: 4133
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 4168
Blocpdb> 34 atoms in block 137
Block first atom: 4192
Blocpdb> 27 atoms in block 138
Block first atom: 4226
Blocpdb> 32 atoms in block 139
Block first atom: 4253
Blocpdb> 33 atoms in block 140
Block first atom: 4285
Blocpdb> 32 atoms in block 141
Block first atom: 4318
Blocpdb> 29 atoms in block 142
Block first atom: 4350
Blocpdb> 26 atoms in block 143
Block first atom: 4379
Blocpdb> 33 atoms in block 144
Block first atom: 4405
Blocpdb> 23 atoms in block 145
Block first atom: 4438
Blocpdb> 31 atoms in block 146
Block first atom: 4461
Blocpdb> 27 atoms in block 147
Block first atom: 4492
Blocpdb> 35 atoms in block 148
Block first atom: 4519
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 4554
Blocpdb> 35 atoms in block 150
Block first atom: 4578
Blocpdb> 27 atoms in block 151
Block first atom: 4613
Blocpdb> 13 atoms in block 152
Block first atom: 4639
Blocpdb> 152 blocks.
Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1669736 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13956
Prepmat> Matrix trace = 3653560.0000
Prepmat> Last element read: 13956 13956 8.5432
Prepmat> 11629 lines saved.
Prepmat> 10256 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4652
RTB> Total mass = 4652.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4652
RTB> Number of blocks = 152
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 174219.9048
RTB> 47112 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 912
Diagstd> Nb of non-zero elements: 47112
Diagstd> Projected matrix trace = 174219.9048
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 912 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 174219.9048
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3745789 0.5918312 0.9925571 1.7113639
1.8693537 2.2975452 2.4252292 3.2601099 3.6155577
3.7943278 4.6544701 4.8738222 6.0788390 7.2440800
7.8525560 8.1665191 8.2577653 8.9437978 9.5431337
9.9138107 10.7626466 11.3487198 11.6806705 12.6306258
13.2880637 13.7823630 14.2366052 14.5463316 14.9676637
16.2942835 16.6657953 17.5302652 17.8762648 18.3671681
18.7769890 19.0659223 19.9158147 20.5128107 20.7712112
21.0633177 21.3685414 21.7401701 22.4337034 22.5824212
23.3593130 23.8359549 24.0139428 24.5450302 24.6755618
25.2361330 25.5528326 26.2848149 26.5813972 27.7636882
28.1954019 28.5488936 29.2153470 29.5798306 29.8543875
30.1247452 30.5916129 30.9696871 31.9278887 32.1163391
32.6710489 33.2844759 33.5008415 33.9324504 34.7039445
34.9221951 35.5957297 35.9399134 37.2720967 37.4276988
37.5846022 38.5272179 38.7781994 38.9322840 39.7599079
40.2852520 40.9457984 41.3703240 41.6708471 42.3527104
42.8583839 43.5449699 43.8136544 44.2624488 44.5579288
45.3841361 45.6625508 46.1117858 46.6852868 46.9405313
47.4549749 47.9641340 48.2768412 48.4275440 48.5867801
49.1900358
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034337 0.0034340 0.0034342 0.0034345 0.0034350
0.0034354 66.4610135 83.5399527 108.1864879 142.0582523
148.4707898 164.5990468 169.1109288 196.0701139 206.4823483
211.5254881 234.2774026 239.7342699 267.7352780 292.2717890
304.2991941 310.3228609 312.0516972 324.7553150 335.4600315
341.9129824 356.2499560 365.8210704 371.1326543 385.9292665
395.8458810 403.1411432 409.7306962 414.1636909 420.1189671
438.3418276 443.3107899 454.6629053 459.1278843 465.3892857
470.5526850 474.1592086 484.6121722 491.8219031 494.9099570
498.3777774 501.9757299 506.3219423 514.3346306 516.0366322
524.8380501 530.1656161 532.1413617 537.9935456 539.4221867
545.5149839 548.9272680 556.7339963 559.8661144 572.1815629
576.6129938 580.2162950 586.9495920 590.5995638 593.3341744
596.0146999 600.6154060 604.3154380 613.5929780 615.4011415
620.6929595 626.4928830 628.5258413 632.5616983 639.7122986
641.7206984 647.8794880 651.0042048 662.9597967 664.3422039
665.7332668 674.0298105 676.2216947 677.5638413 684.7278070
689.2365858 694.8642246 698.4571083 700.9893906 706.7012911
710.9076302 716.5793318 718.7866784 722.4586558 724.8660809
731.5555625 733.7960412 737.3968045 741.9682063 743.9937392
748.0595203 752.0618940 754.5094845 755.6862190 756.9275973
761.6121251
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4652
Rtb_to_modes> Number of blocs = 152
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9926
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.711
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.869
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.298
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.616
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.794
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.654
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.874
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.244
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.853
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.167
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.944
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.543
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 912 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995
1.00002 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 1.00001 0.99992 1.00000
1.00005 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 0.99997 1.00003 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 83736 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995
1.00002 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 1.00001 0.99992 1.00000
1.00005 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 0.99997 1.00003 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220092014169949.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220092014169949.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220092014169949.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220092014169949.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 606
First residue number = 1
Last residue number = 606
Number of atoms found = 4652
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9926
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.711
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.298
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.425
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.616
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.794
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.244
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.853
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19
Bfactors> 106 vectors, 13956 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.374600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.278 for 606 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.038 +/- 0.04
Bfactors> = 71.783 +/- 17.11
Bfactors> Shiftng-fct= 71.744
Bfactors> Scaling-fct= 410.351
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220092014169949 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220092014169949.eigenfacs
240220092014169949.atom
240220092014169949.10.pdb
240220092014169949.11.pdb
240220092014169949.12.pdb
240220092014169949.13.pdb
240220092014169949.14.pdb
240220092014169949.15.pdb
240220092014169949.16.pdb
240220092014169949.7.pdb
240220092014169949.8.pdb
240220092014169949.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m17.811s
user 0m17.763s
sys 0m0.048s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220092014169949.Chkmod.res: No such file or directory
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