*** 1CU1_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_1_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220091621165856.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220091621165856.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220091621165856.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 645
First residue number = 1
Last residue number = 645
Number of atoms found = 4807
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -3.759374 +/- 19.454529 From: -50.781000 To: 40.344000
= -2.986967 +/- 13.254935 From: -38.219000 To: 31.797000
= -3.331963 +/- 14.711566 From: -33.906000 To: 39.500000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7192 % Filled.
Pdbmat> 1787842 non-zero elements.
Pdbmat> 195740 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.44 +/- 23.54
Maximum number = 133
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 3.914800E+06
Pdbmat> Larger element = 498.774
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
645 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220091621165856.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220091621165856.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220091621165856.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4807 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 645 residues.
Blocpdb> 24 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 30 atoms in block 2
Block first atom: 25
Blocpdb> 30 atoms in block 3
Block first atom: 55
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 85
Blocpdb> 32 atoms in block 5
Block first atom: 105
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 137
Blocpdb> 31 atoms in block 7
Block first atom: 168
Blocpdb> 26 atoms in block 8
Block first atom: 199
Blocpdb> 28 atoms in block 9
Block first atom: 225
Blocpdb> 32 atoms in block 10
Block first atom: 253
Blocpdb> 33 atoms in block 11
Block first atom: 285
Blocpdb> 29 atoms in block 12
Block first atom: 318
Blocpdb> 27 atoms in block 13
Block first atom: 347
Blocpdb> 27 atoms in block 14
Block first atom: 374
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 401
Blocpdb> 25 atoms in block 16
Block first atom: 432
Blocpdb> 34 atoms in block 17
Block first atom: 457
Blocpdb> 33 atoms in block 18
Block first atom: 491
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 524
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 548
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 572
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 599
Blocpdb> 34 atoms in block 23
Block first atom: 631
Blocpdb> 33 atoms in block 24
Block first atom: 665
Blocpdb> 34 atoms in block 25
Block first atom: 698
Blocpdb> 23 atoms in block 26
Block first atom: 732
Blocpdb> 30 atoms in block 27
Block first atom: 755
Blocpdb> 27 atoms in block 28
Block first atom: 785
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 812
Blocpdb> 36 atoms in block 30
Block first atom: 834
Blocpdb> 35 atoms in block 31
Block first atom: 870
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 905
Blocpdb> 36 atoms in block 33
Block first atom: 933
Blocpdb> 29 atoms in block 34
Block first atom: 969
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 998
Blocpdb> 32 atoms in block 36
Block first atom: 1027
Blocpdb> 32 atoms in block 37
Block first atom: 1059
Blocpdb> 27 atoms in block 38
Block first atom: 1091
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 1118
Blocpdb> 29 atoms in block 40
Block first atom: 1139
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 1168
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1193
Blocpdb> 28 atoms in block 43
Block first atom: 1223
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1251
Blocpdb> 26 atoms in block 45
Block first atom: 1279
Blocpdb> 33 atoms in block 46
Block first atom: 1305
Blocpdb> 29 atoms in block 47
Block first atom: 1338
Blocpdb> 31 atoms in block 48
Block first atom: 1367
Blocpdb> 32 atoms in block 49
Block first atom: 1398
Blocpdb> 33 atoms in block 50
Block first atom: 1430
Blocpdb> 27 atoms in block 51
Block first atom: 1463
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1490
Blocpdb> 35 atoms in block 53
Block first atom: 1516
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1551
Blocpdb> 29 atoms in block 55
Block first atom: 1581
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 1610
Blocpdb> 29 atoms in block 57
Block first atom: 1633
Blocpdb> 29 atoms in block 58
Block first atom: 1662
Blocpdb> 23 atoms in block 59
Block first atom: 1691
Blocpdb> 36 atoms in block 60
Block first atom: 1714
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1750
Blocpdb> 23 atoms in block 62
Block first atom: 1780
Blocpdb> 30 atoms in block 63
Block first atom: 1803
Blocpdb> 29 atoms in block 64
Block first atom: 1833
Blocpdb> 30 atoms in block 65
Block first atom: 1862
Blocpdb> 27 atoms in block 66
Block first atom: 1892
Blocpdb> 34 atoms in block 67
Block first atom: 1919
Blocpdb> 29 atoms in block 68
Block first atom: 1953
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 1982
Blocpdb> 26 atoms in block 70
Block first atom: 2008
Blocpdb> 37 atoms in block 71
Block first atom: 2034
Blocpdb> 32 atoms in block 72
Block first atom: 2071
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 2103
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 2124
Blocpdb> 33 atoms in block 75
Block first atom: 2144
Blocpdb> 30 atoms in block 76
Block first atom: 2177
Blocpdb> 31 atoms in block 77
Block first atom: 2207
Blocpdb> 28 atoms in block 78
Block first atom: 2238
Blocpdb> 27 atoms in block 79
Block first atom: 2266
Blocpdb> 26 atoms in block 80
Block first atom: 2293
Blocpdb> 30 atoms in block 81
Block first atom: 2319
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 2349
Blocpdb> 31 atoms in block 83
Block first atom: 2374
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 2405
Blocpdb> 26 atoms in block 85
Block first atom: 2432
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 2458
Blocpdb> 31 atoms in block 87
Block first atom: 2482
Blocpdb> 34 atoms in block 88
Block first atom: 2513
Blocpdb> 26 atoms in block 89
Block first atom: 2547
Blocpdb> 28 atoms in block 90
Block first atom: 2573
Blocpdb> 38 atoms in block 91
Block first atom: 2601
Blocpdb> 26 atoms in block 92
Block first atom: 2639
Blocpdb> 29 atoms in block 93
Block first atom: 2665
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2694
Blocpdb> 37 atoms in block 95
Block first atom: 2721
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 2758
Blocpdb> 33 atoms in block 97
Block first atom: 2791
Blocpdb> 30 atoms in block 98
Block first atom: 2824
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 2854
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 2882
Blocpdb> 25 atoms in block 101
Block first atom: 2906
Blocpdb> 39 atoms in block 102
Block first atom: 2931
Blocpdb> 29 atoms in block 103
Block first atom: 2970
Blocpdb> 29 atoms in block 104
Block first atom: 2999
Blocpdb> 27 atoms in block 105
Block first atom: 3028
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 3055
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 3081
Blocpdb> 31 atoms in block 108
Block first atom: 3109
Blocpdb> 30 atoms in block 109
Block first atom: 3140
Blocpdb> 29 atoms in block 110
Block first atom: 3170
Blocpdb> 29 atoms in block 111
Block first atom: 3199
Blocpdb> 29 atoms in block 112
Block first atom: 3228
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 3257
Blocpdb> 29 atoms in block 114
Block first atom: 3290
Blocpdb> 33 atoms in block 115
Block first atom: 3319
Blocpdb> 30 atoms in block 116
Block first atom: 3352
Blocpdb> 31 atoms in block 117
Block first atom: 3382
Blocpdb> 29 atoms in block 118
Block first atom: 3413
Blocpdb> 37 atoms in block 119
Block first atom: 3442
Blocpdb> 26 atoms in block 120
Block first atom: 3479
Blocpdb> 37 atoms in block 121
Block first atom: 3505
Blocpdb> 35 atoms in block 122
Block first atom: 3542
Blocpdb> 32 atoms in block 123
Block first atom: 3577
Blocpdb> 31 atoms in block 124
Block first atom: 3609
Blocpdb> 29 atoms in block 125
Block first atom: 3640
Blocpdb> 27 atoms in block 126
Block first atom: 3669
Blocpdb> 29 atoms in block 127
Block first atom: 3696
Blocpdb> 29 atoms in block 128
Block first atom: 3725
Blocpdb> 37 atoms in block 129
Block first atom: 3754
Blocpdb> 31 atoms in block 130
Block first atom: 3791
Blocpdb> 27 atoms in block 131
Block first atom: 3822
Blocpdb> 37 atoms in block 132
Block first atom: 3849
Blocpdb> 33 atoms in block 133
Block first atom: 3886
Blocpdb> 26 atoms in block 134
Block first atom: 3919
Blocpdb> 29 atoms in block 135
Block first atom: 3945
Blocpdb> 35 atoms in block 136
Block first atom: 3974
Blocpdb> 40 atoms in block 137
Block first atom: 4009
Blocpdb> 29 atoms in block 138
Block first atom: 4049
Blocpdb> 33 atoms in block 139
Block first atom: 4078
Blocpdb> 34 atoms in block 140
Block first atom: 4111
Blocpdb> 30 atoms in block 141
Block first atom: 4145
Blocpdb> 27 atoms in block 142
Block first atom: 4175
Blocpdb> 34 atoms in block 143
Block first atom: 4202
Blocpdb> 32 atoms in block 144
Block first atom: 4236
Blocpdb> 33 atoms in block 145
Block first atom: 4268
Blocpdb> 29 atoms in block 146
Block first atom: 4301
Blocpdb> 26 atoms in block 147
Block first atom: 4330
Blocpdb> 34 atoms in block 148
Block first atom: 4356
Blocpdb> 39 atoms in block 149
Block first atom: 4390
Blocpdb> 31 atoms in block 150
Block first atom: 4429
Blocpdb> 35 atoms in block 151
Block first atom: 4460
Blocpdb> 29 atoms in block 152
Block first atom: 4495
Blocpdb> 29 atoms in block 153
Block first atom: 4524
Blocpdb> 39 atoms in block 154
Block first atom: 4553
Blocpdb> 25 atoms in block 155
Block first atom: 4592
Blocpdb> 31 atoms in block 156
Block first atom: 4617
Blocpdb> 32 atoms in block 157
Block first atom: 4648
Blocpdb> 36 atoms in block 158
Block first atom: 4680
Blocpdb> 27 atoms in block 159
Block first atom: 4716
Blocpdb> 27 atoms in block 160
Block first atom: 4743
Blocpdb> 31 atoms in block 161
Block first atom: 4770
Blocpdb> 7 atoms in block 162
Block first atom: 4800
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 40 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1788004 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14421
Prepmat> Matrix trace = 3914800.0000
Prepmat> Last element read: 14421 14421 96.7718
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11729 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4807
RTB> Total mass = 4807.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4807
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 195945.0006
RTB> 50634 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50634
Diagstd> Projected matrix trace = 195945.0006
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 195945.0006
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1790286 0.2741538 0.6839545 0.8545866
1.1948166 1.5515721 1.7608473 2.0562053 2.3830880
2.6463046 3.2853591 3.6897076 5.4972085 5.8870536
6.1287866 6.5155337 7.5452749 8.7026656 9.8253786
10.4958132 10.7985355 11.1240890 11.3530130 12.1096446
14.4931793 15.2016464 17.0856279 17.2955006 18.0263089
18.6315425 19.0624621 19.8427215 20.4420298 20.7407436
21.4811232 23.3283830 23.7212846 24.1008253 24.1737326
24.6388470 25.2200428 25.5056117 25.8968432 26.8479348
27.6017546 28.0113768 28.5761007 28.9765971 29.5453191
29.7714954 30.3226121 30.5825831 31.1809283 31.8030210
32.1741353 32.9027327 33.5786139 34.2729101 34.7550221
35.6354849 36.2272959 36.7781643 37.1385684 37.3699928
37.7009952 38.2450556 39.2483859 39.5893963 40.2552764
40.8391129 40.9894935 41.5405964 42.6989603 43.0522781
43.2572436 43.6011673 43.8815087 44.1902514 44.5148411
45.4554613 45.8919814 45.9888667 46.4363979 46.5199579
47.4437985 47.6636866 47.9896600 48.6882589 49.2225265
49.2891019 49.5503099 50.1081874 50.6080609 50.9864571
51.7256312 52.0600457 52.7800715 53.1529837 53.5924402
53.7239787
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034327 0.0034331 0.0034352 0.0034353
0.0034356 45.9469267 56.8581075 89.8067273 100.3860383
118.6986862 135.2636977 144.0973937 155.7143058 167.6352410
176.6506334 196.8279192 208.5889311 254.6046807 263.4779494
268.8329695 277.1853527 298.2859621 320.3475656 340.3846194
351.8060686 356.8434341 362.1825380 365.8902585 377.8861542
413.4063213 423.3899978 448.8598424 451.6082312 461.0506984
468.7266926 474.1161801 483.7220651 490.9726378 494.5468518
503.2963408 524.4904663 528.8888141 533.1031359 533.9088720
539.0207329 545.3410504 548.4198325 552.6099415 562.6660639
570.5104785 574.7282016 580.4927020 584.5463750 590.2549297
592.5098912 597.9688835 600.5267565 606.3729238 612.3919426
615.9546274 622.8898653 629.2549816 635.7271678 640.1828927
648.2411802 653.6018002 658.5523513 661.7711946 663.8298653
666.7633001 671.5570747 680.3089445 683.2579914 688.9801138
693.9583887 695.2348855 699.8929900 709.5841896 712.5139123
714.2079848 717.0415771 719.3430563 721.8692073 724.5155220
732.1301892 735.6372035 736.4133177 739.9877704 740.6532568
747.9714250 749.7027356 752.2619867 757.7176481 761.8636111
762.3786627 764.3961089 768.6871603 772.5118120 775.3944669
780.9948673 783.5154287 788.9150976 791.6971914 794.9632390
795.9382290
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4807
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1790
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6840
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.195
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.552
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.056
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.383
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.646
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.285
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.497
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.887
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.516
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.545
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.72
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997
0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00004
1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001
0.99998 0.99998 1.00003 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002
1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 86526 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997
0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00004
1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001
0.99998 0.99998 1.00003 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002
1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220091621165856.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220091621165856.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220091621165856.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220091621165856.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 645
First residue number = 1
Last residue number = 645
Number of atoms found = 4807
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1790
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6840
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.195
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.056
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.383
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.646
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.497
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.887
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.516
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.72
Bfactors> 106 vectors, 14421 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.179000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.189 for 645 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.062 +/- 0.05
Bfactors> = 88.807 +/- 10.30
Bfactors> Shiftng-fct= 88.745
Bfactors> Scaling-fct= 210.896
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091621165856 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091621165856.eigenfacs
240220091621165856.atom
240220091621165856.10.pdb
240220091621165856.11.pdb
240220091621165856.12.pdb
240220091621165856.13.pdb
240220091621165856.14.pdb
240220091621165856.15.pdb
240220091621165856.16.pdb
240220091621165856.7.pdb
240220091621165856.8.pdb
240220091621165856.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.014s
user 0m20.974s
sys 0m0.040s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220091621165856.Chkmod.res: No such file or directory
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