*** EXP_1P5V_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_1_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912381935461.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912381935461.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912381935461.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 136
First residue number = 1
Last residue number = 136
Number of atoms found = 1008
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.726353 +/- 10.258011 From: -26.703000 To: 23.984000
= 0.395457 +/- 6.556946 From: -14.789000 To: 16.703000
= 0.513209 +/- 9.409542 From: -20.000000 To: 18.484000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 7.3905 % Filled.
Pdbmat> 338027 non-zero elements.
Pdbmat> 36916 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.25 +/- 24.36
Maximum number = 125
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 738320.
Pdbmat> Larger element = 499.650
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
136 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912381935461.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912381935461.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912381935461.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1008 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 136 residues.
Blocpdb> 7 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 9 atoms in block 2
Block first atom: 8
Blocpdb> 7 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 5 atoms in block 4
Block first atom: 24
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 29
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 40
Blocpdb> 7 atoms in block 7
Block first atom: 48
Blocpdb> 8 atoms in block 8
Block first atom: 55
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 63
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 70
Blocpdb> 9 atoms in block 11
Block first atom: 82
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 91
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 100
Blocpdb> 5 atoms in block 14
Block first atom: 104
Blocpdb> 7 atoms in block 15
Block first atom: 109
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 116
Blocpdb> 7 atoms in block 17
Block first atom: 124
Blocpdb> 8 atoms in block 18
Block first atom: 131
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 139
Blocpdb> 8 atoms in block 20
Block first atom: 147
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 155
Blocpdb> 4 atoms in block 22
Block first atom: 163
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 167
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 175
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 183
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 191
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 198
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 207
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 215
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 223
Blocpdb> 4 atoms in block 31
Block first atom: 230
Blocpdb> 7 atoms in block 32
Block first atom: 234
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 241
Blocpdb> 7 atoms in block 34
Block first atom: 249
Blocpdb> 8 atoms in block 35
Block first atom: 256
Blocpdb> 4 atoms in block 36
Block first atom: 264
Blocpdb> 4 atoms in block 37
Block first atom: 268
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 272
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 284
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 293
Blocpdb> 4 atoms in block 41
Block first atom: 300
Blocpdb> 7 atoms in block 42
Block first atom: 304
Blocpdb> 7 atoms in block 43
Block first atom: 311
Blocpdb> 6 atoms in block 44
Block first atom: 318
Blocpdb> 7 atoms in block 45
Block first atom: 324
Blocpdb> 6 atoms in block 46
Block first atom: 331
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 337
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 344
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 352
Blocpdb> 7 atoms in block 50
Block first atom: 363
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 370
Blocpdb> 5 atoms in block 52
Block first atom: 378
Blocpdb> 5 atoms in block 53
Block first atom: 383
Blocpdb> 4 atoms in block 54
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 55
Block first atom: 392
Blocpdb> 7 atoms in block 56
Block first atom: 400
Blocpdb> 8 atoms in block 57
Block first atom: 407
Blocpdb> 12 atoms in block 58
Block first atom: 415
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 427
Blocpdb> 7 atoms in block 60
Block first atom: 435
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 442
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 453
Blocpdb> 6 atoms in block 63
Block first atom: 460
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 466
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 475
Blocpdb> 4 atoms in block 66
Block first atom: 483
Blocpdb> 8 atoms in block 67
Block first atom: 487
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 495
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 503
Blocpdb> 9 atoms in block 70
Block first atom: 513
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 522
Blocpdb> 7 atoms in block 72
Block first atom: 533
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 540
Blocpdb> 9 atoms in block 74
Block first atom: 547
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 556
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 563
Blocpdb> 4 atoms in block 77
Block first atom: 571
Blocpdb> 9 atoms in block 78
Block first atom: 575
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 584
Blocpdb> 6 atoms in block 80
Block first atom: 592
Blocpdb> 11 atoms in block 81
Block first atom: 598
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 609
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 84
Block first atom: 628
Blocpdb> 8 atoms in block 85
Block first atom: 636
Blocpdb> 6 atoms in block 86
Block first atom: 644
Blocpdb> 7 atoms in block 87
Block first atom: 650
Blocpdb> 9 atoms in block 88
Block first atom: 657
Blocpdb> 7 atoms in block 89
Block first atom: 666
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 673
Blocpdb> 4 atoms in block 91
Block first atom: 681
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 685
Blocpdb> 8 atoms in block 93
Block first atom: 694
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 702
Blocpdb> 7 atoms in block 95
Block first atom: 710
Blocpdb> 4 atoms in block 96
Block first atom: 717
Blocpdb> 8 atoms in block 97
Block first atom: 721
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 729
Blocpdb> 7 atoms in block 99
Block first atom: 737
Blocpdb> 7 atoms in block 100
Block first atom: 744
Blocpdb> 8 atoms in block 101
Block first atom: 751
Blocpdb> 5 atoms in block 102
Block first atom: 759
Blocpdb> 7 atoms in block 103
Block first atom: 764
Blocpdb> 4 atoms in block 104
Block first atom: 771
Blocpdb> 6 atoms in block 105
Block first atom: 775
Blocpdb> 9 atoms in block 106
Block first atom: 781
Blocpdb> 8 atoms in block 107
Block first atom: 790
Blocpdb> 11 atoms in block 108
Block first atom: 798
Blocpdb> 11 atoms in block 109
Block first atom: 809
Blocpdb> 7 atoms in block 110
Block first atom: 820
Blocpdb> 11 atoms in block 111
Block first atom: 827
Blocpdb> 6 atoms in block 112
Block first atom: 838
Blocpdb> 8 atoms in block 113
Block first atom: 844
Blocpdb> 4 atoms in block 114
Block first atom: 852
Blocpdb> 6 atoms in block 115
Block first atom: 856
Blocpdb> 9 atoms in block 116
Block first atom: 862
Blocpdb> 4 atoms in block 117
Block first atom: 871
Blocpdb> 4 atoms in block 118
Block first atom: 875
Blocpdb> 9 atoms in block 119
Block first atom: 879
Blocpdb> 8 atoms in block 120
Block first atom: 888
Blocpdb> 5 atoms in block 121
Block first atom: 896
Blocpdb> 5 atoms in block 122
Block first atom: 901
Blocpdb> 4 atoms in block 123
Block first atom: 906
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 910
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 919
Blocpdb> 7 atoms in block 126
Block first atom: 931
Blocpdb> 8 atoms in block 127
Block first atom: 938
Blocpdb> 5 atoms in block 128
Block first atom: 946
Blocpdb> 7 atoms in block 129
Block first atom: 951
Blocpdb> 7 atoms in block 130
Block first atom: 958
Blocpdb> 7 atoms in block 131
Block first atom: 965
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 972
Blocpdb> 7 atoms in block 133
Block first atom: 979
Blocpdb> 6 atoms in block 134
Block first atom: 986
Blocpdb> 8 atoms in block 135
Block first atom: 992
Blocpdb> 9 atoms in block 136
Block first atom: 999
Blocpdb> 136 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 338163 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3024
Prepmat> Matrix trace = 738320.0000
Prepmat> Last element read: 3024 3024 311.9756
Prepmat> 9317 lines saved.
Prepmat> 7755 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1008
RTB> Total mass = 1008.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1008
RTB> Number of blocks = 136
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 180559.4807
RTB> 54156 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 816
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54156
Diagstd> Projected matrix trace = 180559.4807
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 816 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 180559.4807
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5310534 1.5044668 2.9275882 3.2388907
4.4958631 5.3737379 8.1919545 8.8393596 9.8345265
10.1421585 10.7640983 11.5510928 12.1707847 13.5779079
14.3566862 15.0633785 16.0359399 16.9100441 18.1281725
20.0773650 21.5062669 22.3135425 22.6778381 23.3017660
24.7500875 26.8578797 27.6297222 28.8163266 29.9763019
30.9192631 31.3430560 32.3173741 33.0666942 33.4447715
34.0707771 34.7741145 36.0533994 36.8036762 37.7004966
38.1044515 39.7584764 40.2629576 40.7900798 41.1516688
42.1138506 43.2174813 43.8993916 45.1850607 45.6729573
47.0052459 47.2656437 48.0837522 49.2120040 49.3427585
50.8698718 51.1118423 51.5962792 52.5493029 53.4610169
54.1525880 54.8413066 55.8526879 56.2994881 57.7557604
58.4521647 60.1880908 60.5962140 61.0515351 61.4899848
62.1000675 62.7414009 63.6466019 63.9075267 65.0424099
65.3890863 65.9588606 66.1754160 66.5266729 67.9944509
69.1562097 70.2075630 70.6072878 71.3054721 71.6954776
72.5958318 72.9389651 74.0647921 74.2951979 74.8710272
76.1156135 76.2781383 76.6263830 77.5780066 79.1355937
79.6754890 79.9308144 80.7992372 81.3868782 82.1900732
82.4782361
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034330 0.0034336 0.0034340 0.0034348
0.0034350 79.1342321 133.1945885 185.8019514 195.4309879
230.2511562 251.7291575 310.8057502 322.8536358 340.5430400
345.8282584 356.2739826 369.0683616 378.8389036 400.1397616
411.4550382 421.4601085 434.8530194 446.5474875 462.3515238
486.5737072 503.5908101 512.9553244 517.1256812 524.1911673
540.2361600 562.7702650 570.7994409 582.9275610 594.5444200
603.8232724 607.9473218 617.3242153 624.4399353 627.9996429
633.8497153 640.3587086 652.0312187 658.7807208 666.7588910
670.3214818 684.7154811 689.0458433 693.5416667 696.6088796
704.7056544 713.8796576 719.4896168 729.9493320 733.8796524
744.5064161 746.5657618 752.9990969 761.7821738 762.7935164
774.5074538 776.3473015 780.0177261 787.1885343 793.9879068
799.1069145 804.1724245 811.5538068 814.7934017 825.2640619
830.2245663 842.4624719 845.3139298 848.4838386 851.5251376
855.7389824 860.1464197 866.3290767 868.1030568 875.7771147
878.1079616 881.9254043 883.3719814 885.7133333 895.4307736
903.0480760 909.8865169 912.4730473 916.9733421 919.4776162
925.2330189 927.4170563 934.5470786 935.9995767 939.6198350
947.3973300 948.4082491 950.5707429 956.4551023 966.0090894
969.2987421 970.8505909 976.1103337 979.6534575 984.4756164
986.1999188
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1008
Rtb_to_modes> Number of blocs = 136
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5311
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.928
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.239
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.496
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.374
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.839
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.835
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.48
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 816 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
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1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
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0.99998 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999
0.99997
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 18144 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001
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1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999
0.99994 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002
0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997
1.00002 0.99998 0.99998 0.99997 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00002 1.00004 0.99999 1.00001 1.00004
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
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1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999
0.99997
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912381935461.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912381935461.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912381935461.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912381935461.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 136
First residue number = 1
Last residue number = 136
Number of atoms found = 1008
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5311
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.928
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.239
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.496
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.374
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.839
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.835
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.48
Bfactors> 106 vectors, 3024 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.531100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.644 for 136 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.079 +/- 0.26
Bfactors> = 90.177 +/- 9.08
Bfactors> Shiftng-fct= 90.099
Bfactors> Scaling-fct= 34.927
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912381935461 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912381935461.eigenfacs
24021912381935461.atom
24021912381935461.10.pdb
24021912381935461.11.pdb
24021912381935461.12.pdb
24021912381935461.13.pdb
24021912381935461.14.pdb
24021912381935461.15.pdb
24021912381935461.16.pdb
24021912381935461.7.pdb
24021912381935461.8.pdb
24021912381935461.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m7.802s
user 0m7.782s
sys 0m0.020s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912381935461.Chkmod.res: No such file or directory
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