*** EXP_3LZG_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912312226987.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912312226987.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912312226987.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 172
First residue number = 1
Last residue number = 172
Number of atoms found = 1389
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.139210 +/- 32.265092 From: -49.781000 To: 49.438000
= -3.940015 +/- 8.768758 From: -26.422000 To: 21.562000
= -0.515037 +/- 35.620308 From: -74.312000 To: 51.844000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7957 % Filled.
Pdbmat> 416464 non-zero elements.
Pdbmat> 45475 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 65.48 +/- 18.94
Maximum number = 128
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 909500.
Pdbmat> Larger element = 478.223
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
172 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912312226987.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912312226987.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912312226987.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1389 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 172 residues.
Blocpdb> 4 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 8 atoms in block 2
Block first atom: 5
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 13
Blocpdb> 4 atoms in block 4
Block first atom: 24
Blocpdb> 5 atoms in block 5
Block first atom: 28
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 33
Blocpdb> 5 atoms in block 7
Block first atom: 41
Blocpdb> 4 atoms in block 8
Block first atom: 46
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 50
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 11
Block first atom: 69
Blocpdb> 4 atoms in block 12
Block first atom: 78
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 82
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 86
Blocpdb> 7 atoms in block 15
Block first atom: 100
Blocpdb> 4 atoms in block 16
Block first atom: 107
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 111
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 119
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 126
Blocpdb> 4 atoms in block 20
Block first atom: 134
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 138
Blocpdb> 12 atoms in block 22
Block first atom: 152
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 164
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 168
Blocpdb> 10 atoms in block 25
Block first atom: 180
Blocpdb> 10 atoms in block 26
Block first atom: 190
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 200
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 209
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 217
Blocpdb> 9 atoms in block 30
Block first atom: 226
Blocpdb> 4 atoms in block 31
Block first atom: 235
Blocpdb> 6 atoms in block 32
Block first atom: 239
Blocpdb> 4 atoms in block 33
Block first atom: 245
Blocpdb> 12 atoms in block 34
Block first atom: 249
Blocpdb> 5 atoms in block 35
Block first atom: 261
Blocpdb> 5 atoms in block 36
Block first atom: 266
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 271
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 279
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 287
Blocpdb> 6 atoms in block 40
Block first atom: 296
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 302
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 309
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 318
Blocpdb> 5 atoms in block 44
Block first atom: 326
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 331
Blocpdb> 8 atoms in block 46
Block first atom: 339
Blocpdb> 9 atoms in block 47
Block first atom: 347
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 356
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 364
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 371
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 379
Blocpdb> 7 atoms in block 52
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 395
Blocpdb> 6 atoms in block 54
Block first atom: 403
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 409
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 416
Blocpdb> 9 atoms in block 57
Block first atom: 424
Blocpdb> 9 atoms in block 58
Block first atom: 433
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 442
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 450
Blocpdb> 7 atoms in block 61
Block first atom: 458
Blocpdb> 9 atoms in block 62
Block first atom: 465
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 474
Blocpdb> 7 atoms in block 64
Block first atom: 485
Blocpdb> 5 atoms in block 65
Block first atom: 492
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 497
Blocpdb> 4 atoms in block 67
Block first atom: 504
Blocpdb> 9 atoms in block 68
Block first atom: 508
Blocpdb> 9 atoms in block 69
Block first atom: 517
Blocpdb> 11 atoms in block 70
Block first atom: 526
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 537
Blocpdb> 10 atoms in block 72
Block first atom: 545
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 555
Blocpdb> 9 atoms in block 74
Block first atom: 563
Blocpdb> 9 atoms in block 75
Block first atom: 572
Blocpdb> 11 atoms in block 76
Block first atom: 581
Blocpdb> 8 atoms in block 77
Block first atom: 592
Blocpdb> 9 atoms in block 78
Block first atom: 600
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 609
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 625
Blocpdb> 9 atoms in block 82
Block first atom: 633
Blocpdb> 9 atoms in block 83
Block first atom: 642
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 651
Blocpdb> 8 atoms in block 85
Block first atom: 658
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 666
Blocpdb> 4 atoms in block 87
Block first atom: 674
Blocpdb> 11 atoms in block 88
Block first atom: 678
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 689
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 697
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 705
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 713
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 727
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 734
Blocpdb> 8 atoms in block 95
Block first atom: 746
Blocpdb> 5 atoms in block 96
Block first atom: 754
Blocpdb> 9 atoms in block 97
Block first atom: 759
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 768
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 776
Blocpdb> 7 atoms in block 100
Block first atom: 784
Blocpdb> 8 atoms in block 101
Block first atom: 791
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 799
Blocpdb> 9 atoms in block 103
Block first atom: 807
Blocpdb> 8 atoms in block 104
Block first atom: 816
Blocpdb> 9 atoms in block 105
Block first atom: 824
Blocpdb> 11 atoms in block 106
Block first atom: 833
Blocpdb> 7 atoms in block 107
Block first atom: 844
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 851
Blocpdb> 8 atoms in block 109
Block first atom: 859
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 867
Blocpdb> 10 atoms in block 111
Block first atom: 879
Blocpdb> 8 atoms in block 112
Block first atom: 889
Blocpdb> 6 atoms in block 113
Block first atom: 897
Blocpdb> 8 atoms in block 114
Block first atom: 903
Blocpdb> 7 atoms in block 115
Block first atom: 911
Blocpdb> 9 atoms in block 116
Block first atom: 918
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 927
Blocpdb> 8 atoms in block 118
Block first atom: 935
Blocpdb> 12 atoms in block 119
Block first atom: 943
Blocpdb> 9 atoms in block 120
Block first atom: 955
Blocpdb> 9 atoms in block 121
Block first atom: 964
Blocpdb> 7 atoms in block 122
Block first atom: 973
Blocpdb> 11 atoms in block 123
Block first atom: 980
Blocpdb> 6 atoms in block 124
Block first atom: 991
Blocpdb> 9 atoms in block 125
Block first atom: 997
Blocpdb> 8 atoms in block 126
Block first atom: 1006
Blocpdb> 9 atoms in block 127
Block first atom: 1014
Blocpdb> 8 atoms in block 128
Block first atom: 1023
Blocpdb> 8 atoms in block 129
Block first atom: 1031
Blocpdb> 5 atoms in block 130
Block first atom: 1039
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1044
Blocpdb> 9 atoms in block 132
Block first atom: 1053
Blocpdb> 8 atoms in block 133
Block first atom: 1062
Blocpdb> 4 atoms in block 134
Block first atom: 1070
Blocpdb> 8 atoms in block 135
Block first atom: 1074
Blocpdb> 4 atoms in block 136
Block first atom: 1082
Blocpdb> 6 atoms in block 137
Block first atom: 1086
Blocpdb> 11 atoms in block 138
Block first atom: 1092
Blocpdb> 9 atoms in block 139
Block first atom: 1103
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 1112
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 1123
Blocpdb> 10 atoms in block 142
Block first atom: 1135
Blocpdb> 9 atoms in block 143
Block first atom: 1145
Blocpdb> 6 atoms in block 144
Block first atom: 1154
Blocpdb> 8 atoms in block 145
Block first atom: 1160
Blocpdb> 8 atoms in block 146
Block first atom: 1168
Blocpdb> 7 atoms in block 147
Block first atom: 1176
Blocpdb> 6 atoms in block 148
Block first atom: 1183
Blocpdb> 8 atoms in block 149
Block first atom: 1189
Blocpdb> 9 atoms in block 150
Block first atom: 1197
Blocpdb> 6 atoms in block 151
Block first atom: 1206
Blocpdb> 7 atoms in block 152
Block first atom: 1212
Blocpdb> 9 atoms in block 153
Block first atom: 1219
Blocpdb> 8 atoms in block 154
Block first atom: 1228
Blocpdb> 4 atoms in block 155
Block first atom: 1236
Blocpdb> 7 atoms in block 156
Block first atom: 1240
Blocpdb> 12 atoms in block 157
Block first atom: 1247
Blocpdb> 8 atoms in block 158
Block first atom: 1259
Blocpdb> 12 atoms in block 159
Block first atom: 1267
Blocpdb> 7 atoms in block 160
Block first atom: 1279
Blocpdb> 9 atoms in block 161
Block first atom: 1286
Blocpdb> 12 atoms in block 162
Block first atom: 1295
Blocpdb> 6 atoms in block 163
Block first atom: 1307
Blocpdb> 9 atoms in block 164
Block first atom: 1313
Blocpdb> 9 atoms in block 165
Block first atom: 1322
Blocpdb> 5 atoms in block 166
Block first atom: 1331
Blocpdb> 9 atoms in block 167
Block first atom: 1336
Blocpdb> 8 atoms in block 168
Block first atom: 1345
Blocpdb> 8 atoms in block 169
Block first atom: 1353
Blocpdb> 11 atoms in block 170
Block first atom: 1361
Blocpdb> 9 atoms in block 171
Block first atom: 1372
Blocpdb> 9 atoms in block 172
Block first atom: 1380
Blocpdb> 172 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 416636 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4167
Prepmat> Matrix trace = 909500.0000
Prepmat> Last element read: 4167 4167 105.3826
Prepmat> 14879 lines saved.
Prepmat> 13308 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1389
RTB> Total mass = 1389.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1389
RTB> Number of blocks = 172
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 199511.8241
RTB> 53940 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1032
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53940
Diagstd> Projected matrix trace = 199511.8241
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1032 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 199511.8241
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0039792 0.0053896 0.0134438 0.0259240
0.0436771 0.1234228 0.1317808 0.2756389 0.3826993
0.4754175 0.6745580 0.8522012 1.2482095 1.3227429
1.7943445 1.8249034 2.1185220 2.5126219 2.8563049
3.3896487 3.6020941 3.9838160 4.2410239 4.7187466
5.3223845 5.7816931 6.2526713 6.8439052 7.2710339
7.9030299 8.0775884 8.5314481 8.6599743 9.6078678
10.1480364 10.5365370 10.8154402 11.0323812 11.2059316
11.6612750 12.5901674 13.5836316 13.9852217 14.1921884
14.3891665 15.3926987 15.7038742 16.2247454 17.2538054
17.4244985 18.1293160 18.7878818 20.0529906 20.5841199
20.8686165 21.4398054 21.9840297 22.4561245 22.9895820
23.8419440 24.6523835 25.1776449 26.1687419 26.6357352
27.0626537 27.4758583 28.2152212 28.4134819 29.0683136
30.3000248 30.8393452 31.5592683 31.8144336 32.8457850
34.1189648 34.4005229 34.7490498 35.0331094 35.8996461
37.1039066 37.3747706 37.7022163 38.1871864 38.5152537
39.7963682 40.4674267 40.9835895 41.6539471 42.8195739
42.8482328 43.7672648 44.8432851 45.0548133 45.5699628
46.0488129 46.3009348 46.6571360 48.0562036 48.4251113
49.1282285
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034317 0.0034324 0.0034328 0.0034331 0.0034351
0.0034355 6.8500155 7.9720830 12.5908881 17.4842258
22.6945855 38.1498565 39.4204353 57.0118976 67.1775386
74.8743134 89.1876908 100.2458353 121.3218517 124.8915350
145.4615427 146.6949699 158.0562856 172.1309029 183.5259834
199.9275420 206.0975392 216.7429191 223.6302969 235.8894980
250.5234611 261.1095741 271.5364140 284.0843254 292.8150307
305.2755998 308.6285794 317.1806297 319.5608598 336.5958750
345.9284560 352.4879129 357.1226384 360.6865184 363.5124288
370.8243973 385.3106674 400.2240909 406.0971649 409.0910368
411.9202096 426.0422446 430.3270871 437.4054858 451.0635436
453.2892551 462.3661055 470.6891523 486.2782620 492.6760286
496.0690244 502.8120766 509.1537317 514.5915898 520.6679169
530.2322171 539.1687812 544.8824654 555.5033757 560.4380649
564.9115713 569.2078938 576.8156163 578.8386323 585.4707448
597.7461289 603.0424084 610.0406048 612.5018124 622.3505864
634.2977976 636.9096104 640.1278858 642.7389560 650.6394077
661.4623039 663.8722996 666.7740978 671.0488101 673.9251468
685.0416865 690.7932334 695.1848141 700.8472296 710.5856799
710.8234354 718.4060540 727.1834575 728.8965214 733.0517200
736.8931166 738.9076449 741.7444723 752.7833582 755.6672383
761.1334916
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1389
Rtb_to_modes> Number of blocs = 172
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5924E-02
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1234
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2756
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3827
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8522
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.323
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.794
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.856
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.390
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.241
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.719
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.322
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.782
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.253
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.078
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.531
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.660
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.608
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.13
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
1.00005 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
0.99996 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 0.99998 0.99997 0.99996 0.99998
1.00003 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 25002 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
1.00005 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
0.99996 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 0.99998 0.99997 0.99996 0.99998
1.00003 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912312226987.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912312226987.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912312226987.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912312226987.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 172
First residue number = 1
Last residue number = 172
Number of atoms found = 1389
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9792E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3896E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3444E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5924E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3677E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1234
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1318
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3827
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4754
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8522
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.248
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.323
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.794
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.856
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.241
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.719
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.078
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.660
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.608
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.13
Bfactors> 106 vectors, 4167 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.003979
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.234 for 172 C-alpha atoms.
Bfactors> = 6.505 +/- 3.89
Bfactors> = 92.146 +/- 4.07
Bfactors> Shiftng-fct= 85.641
Bfactors> Scaling-fct= 1.048
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912312226987 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912312226987.eigenfacs
24021912312226987.atom
24021912312226987.10.pdb
24021912312226987.11.pdb
24021912312226987.12.pdb
24021912312226987.13.pdb
24021912312226987.14.pdb
24021912312226987.15.pdb
24021912312226987.16.pdb
24021912312226987.7.pdb
24021912312226987.8.pdb
24021912312226987.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m14.744s
user 0m14.720s
sys 0m0.024s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912312226987.Chkmod.res: No such file or directory
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