*** AF-1A0L_recycle_9 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402070226571790538.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402070226571790538.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402070226571790538.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.467805 +/- 11.997162 From: -29.906000 To: 34.125000
= 0.915160 +/- 6.939489 From: -18.359000 To: 20.484000
= -0.416588 +/- 12.029865 From: -21.688000 To: 41.438000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.5901 % Filled.
Pdbmat> 658991 non-zero elements.
Pdbmat> 72095 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.73 +/- 25.54
Maximum number = 135
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 1.441900E+06
Pdbmat> Larger element = 494.685
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
228 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2402070226571790538.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2402070226571790538.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2402070226571790538.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1786 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 228 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 75
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 89
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 101
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 120
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 136
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 157
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 170
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 180
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 198
Blocpdb> 21 atoms in block 14
Block first atom: 213
Blocpdb> 28 atoms in block 15
Block first atom: 234
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 262
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 276
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 306
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 320
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 336
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 349
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 359
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 373
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 397
Blocpdb> 21 atoms in block 26
Block first atom: 409
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 19 atoms in block 28
Block first atom: 444
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 463
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 11 atoms in block 31
Block first atom: 489
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 500
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 513
Blocpdb> 10 atoms in block 34
Block first atom: 525
Blocpdb> 10 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 545
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 557
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 566
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 578
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 597
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 627
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 642
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 656
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 670
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 687
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 702
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 721
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 740
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 757
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 773
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 789
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 806
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 821
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 836
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 851
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 870
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 883
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 893
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 914
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 932
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 946
Blocpdb> 10 atoms in block 63
Block first atom: 961
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 971
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 982
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 996
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 1019
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1030
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 1050
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1060
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 1076
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1087
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1105
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1131
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1147
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1159
Blocpdb> 20 atoms in block 77
Block first atom: 1179
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1199
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1214
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1229
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1245
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1260
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1287
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1303
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1316
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1333
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1350
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1370
Blocpdb> 13 atoms in block 90
Block first atom: 1385
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1398
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1415
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1433
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1446
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1459
Blocpdb> 13 atoms in block 96
Block first atom: 1475
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 1488
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 1509
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 1520
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 1542
Blocpdb> 19 atoms in block 101
Block first atom: 1560
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 1579
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1599
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1627
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1642
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1654
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1672
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1684
Blocpdb> 23 atoms in block 110
Block first atom: 1703
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1726
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1743
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1755
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1772
Blocpdb> 114 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 659105 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5358
Prepmat> Matrix trace = 1441900.0000
Prepmat> Last element read: 5358 5358 119.6599
Prepmat> 6556 lines saved.
Prepmat> 5362 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1786
RTB> Total mass = 1786.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1786
RTB> Number of blocks = 114
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 153935.8844
RTB> 41227 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 684
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41227
Diagstd> Projected matrix trace = 153935.8844
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 684 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 153935.8844
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5984451 1.8215908 2.6145380 3.0918643
3.8735193 4.3487469 5.3003294 6.5015747 6.7747324
8.2737548 9.9734717 10.7828874 12.0536004 12.2417704
12.8400288 14.9340704 16.0598843 16.8648571 17.8059712
19.6001892 19.7306878 20.9042525 21.5826323 21.9936966
22.9371339 23.1642939 24.7779779 26.7021754 27.3299520
27.7479989 28.9923602 29.7472692 30.6831779 31.0814049
32.6780133 33.3729052 34.9718975 35.6579456 36.7568782
37.7774086 38.9104981 40.0532832 40.7249924 40.9301406
41.7016110 43.4182386 44.1494794 44.7411210 44.7949703
45.9269648 46.7389820 47.2740363 49.0779943 49.4923451
51.4012002 51.5694778 51.8070463 53.3674177 53.5834072
54.7167199 55.7635229 56.4320436 57.3280949 57.9506468
59.4073940 60.4432907 60.6747857 61.2427957 62.1666350
62.5860516 62.9517525 65.8292645 66.8139243 67.8482112
68.1753324 68.6775893 69.3450950 71.1119130 71.2135156
72.3844543 72.9994195 74.4836521 74.8859524 75.9087641
76.4993778 76.8538079 77.9101113 78.3760184 78.5229171
79.1661532 79.9654140 80.6517708 80.8761541 82.1372512
83.6441958 84.6138650 84.6997537 85.2979784 85.9286799
86.6608431
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034331 0.0034338 0.0034341 0.0034344
0.0034354 84.0054440 146.5617681 175.5871631 190.9437710
213.7214646 226.4526188 250.0038580 276.8882698 282.6450299
312.3536624 342.9402504 356.5847908 377.0106996 379.9420789
389.1152747 419.6472465 435.1775540 445.9504565 458.2242971
480.7567734 482.3545645 496.4923960 504.4841031 509.2656633
520.0736560 522.6426089 540.5404653 561.1366078 567.6945368
572.0198698 584.7053483 592.2687687 601.5135977 605.4044389
620.7591118 627.3245557 642.1771947 648.4454381 658.3617482
667.4386649 677.3742377 687.2493546 692.9881146 694.7313521
701.2480988 715.5358215 721.5361148 726.3546325 726.7916125
735.9175377 742.3947719 746.6320392 760.7442583 763.9488765
778.5417557 779.8151121 781.6092611 793.2925485 794.8962407
803.2584586 810.9057534 815.7520413 822.2029582 826.6552421
836.9808688 844.2466199 845.8617875 849.8118527 856.1975097
859.0808874 861.5871092 881.0585739 887.6234566 894.4673267
896.6210122 899.9177160 904.2804755 915.7279313 916.3818805
923.8850350 927.8013146 937.1859342 939.7134851 946.1091453
949.7826497 951.9803313 958.5001664 961.3618386 962.2623479
966.1955914 971.0606938 975.2191795 976.5748280 984.1592133
993.1461999 998.8862774 999.3931167 1002.9162068 1006.6172076
1010.8965982
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1786
Rtb_to_modes> Number of blocs = 114
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.822
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.092
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.874
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.502
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.775
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.973
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.66
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 684 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00004 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
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0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
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1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997
1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 32148 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00004 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99996
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00006
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997
1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402070226571790538.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402070226571790538.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402070226571790538.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402070226571790538.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.822
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.092
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.502
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.775
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.973
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.66
Bfactors> 106 vectors, 5358 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.598400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.490 for 228 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.054 +/- 0.21
Bfactors> = 88.872 +/- 11.67
Bfactors> Shiftng-fct= 88.818
Bfactors> Scaling-fct= 55.557
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070226571790538 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070226571790538.eigenfacs
2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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2402070226571790538.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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2402070226571790538.13.pdb
2402070226571790538.14.pdb
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2402070226571790538.16.pdb
2402070226571790538.7.pdb
2402070226571790538.8.pdb
2402070226571790538.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m6.164s
user 0m6.140s
sys 0m0.024s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402070226571790538.Chkmod.res: No such file or directory
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