*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2401051456063961408.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2401051456063961408.atom to be opened.
Openam> File opened: 2401051456063961408.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 413
First residue number = 1
Last residue number = 413
Number of atoms found = 5958
Mean number per residue = 14.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 80.811292 +/- 14.247518 From: 50.190000 To: 119.100000
= 80.789193 +/- 18.584362 From: 44.390000 To: 135.190000
= 80.803617 +/- 26.991763 From: 21.440000 To: 142.810000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9962 % Filled.
Pdbmat> 3188972 non-zero elements.
Pdbmat> 350966 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 117.81 +/- 41.49
Maximum number = 223
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 7.019320E+06
Pdbmat> Larger element = 815.845
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
413 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2401051456063961408.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2401051456063961408.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2401051456063961408.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5958 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 413 residues.
Blocpdb> 54 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 40 atoms in block 2
Block first atom: 55
Blocpdb> 37 atoms in block 3
Block first atom: 95
Blocpdb> 32 atoms in block 4
Block first atom: 132
Blocpdb> 48 atoms in block 5
Block first atom: 164
Blocpdb> 51 atoms in block 6
Block first atom: 212
Blocpdb> 42 atoms in block 7
Block first atom: 263
Blocpdb> 45 atoms in block 8
Block first atom: 305
Blocpdb> 36 atoms in block 9
Block first atom: 350
Blocpdb> 40 atoms in block 10
Block first atom: 386
Blocpdb> 43 atoms in block 11
Block first atom: 426
Blocpdb> 45 atoms in block 12
Block first atom: 469
Blocpdb> 36 atoms in block 13
Block first atom: 514
Blocpdb> 38 atoms in block 14
Block first atom: 550
Blocpdb> 30 atoms in block 15
Block first atom: 588
Blocpdb> 36 atoms in block 16
Block first atom: 618
Blocpdb> 35 atoms in block 17
Block first atom: 654
Blocpdb> 38 atoms in block 18
Block first atom: 689
Blocpdb> 30 atoms in block 19
Block first atom: 727
Blocpdb> 39 atoms in block 20
Block first atom: 757
Blocpdb> 52 atoms in block 21
Block first atom: 796
Blocpdb> 46 atoms in block 22
Block first atom: 848
Blocpdb> 46 atoms in block 23
Block first atom: 894
Blocpdb> 52 atoms in block 24
Block first atom: 940
Blocpdb> 50 atoms in block 25
Block first atom: 992
Blocpdb> 54 atoms in block 26
Block first atom: 1042
Blocpdb> 52 atoms in block 27
Block first atom: 1096
Blocpdb> 42 atoms in block 28
Block first atom: 1148
Blocpdb> 41 atoms in block 29
Block first atom: 1190
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 1231
Blocpdb> 46 atoms in block 31
Block first atom: 1259
Blocpdb> 41 atoms in block 32
Block first atom: 1305
Blocpdb> 38 atoms in block 33
Block first atom: 1346
Blocpdb> 43 atoms in block 34
Block first atom: 1384
Blocpdb> 54 atoms in block 35
Block first atom: 1427
Blocpdb> 35 atoms in block 36
Block first atom: 1481
Blocpdb> 41 atoms in block 37
Block first atom: 1516
Blocpdb> 53 atoms in block 38
Block first atom: 1557
Blocpdb> 37 atoms in block 39
Block first atom: 1610
Blocpdb> 41 atoms in block 40
Block first atom: 1647
Blocpdb> 43 atoms in block 41
Block first atom: 1688
Blocpdb> 38 atoms in block 42
Block first atom: 1731
Blocpdb> 40 atoms in block 43
Block first atom: 1769
Blocpdb> 45 atoms in block 44
Block first atom: 1809
Blocpdb> 48 atoms in block 45
Block first atom: 1854
Blocpdb> 55 atoms in block 46
Block first atom: 1902
Blocpdb> 58 atoms in block 47
Block first atom: 1957
Blocpdb> 37 atoms in block 48
Block first atom: 2015
Blocpdb> 52 atoms in block 49
Block first atom: 2052
Blocpdb> 40 atoms in block 50
Block first atom: 2104
Blocpdb> 43 atoms in block 51
Block first atom: 2144
Blocpdb> 41 atoms in block 52
Block first atom: 2187
Blocpdb> 44 atoms in block 53
Block first atom: 2228
Blocpdb> 35 atoms in block 54
Block first atom: 2272
Blocpdb> 35 atoms in block 55
Block first atom: 2307
Blocpdb> 46 atoms in block 56
Block first atom: 2342
Blocpdb> 36 atoms in block 57
Block first atom: 2388
Blocpdb> 51 atoms in block 58
Block first atom: 2424
Blocpdb> 35 atoms in block 59
Block first atom: 2475
Blocpdb> 44 atoms in block 60
Block first atom: 2510
Blocpdb> 35 atoms in block 61
Block first atom: 2554
Blocpdb> 42 atoms in block 62
Block first atom: 2589
Blocpdb> 47 atoms in block 63
Block first atom: 2631
Blocpdb> 50 atoms in block 64
Block first atom: 2678
Blocpdb> 47 atoms in block 65
Block first atom: 2728
Blocpdb> 47 atoms in block 66
Block first atom: 2775
Blocpdb> 36 atoms in block 67
Block first atom: 2822
Blocpdb> 49 atoms in block 68
Block first atom: 2858
Blocpdb> 41 atoms in block 69
Block first atom: 2907
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 2948
Blocpdb> 38 atoms in block 71
Block first atom: 2979
Blocpdb> 67 atoms in block 72
Block first atom: 3017
Blocpdb> 60 atoms in block 73
Block first atom: 3084
Blocpdb> 38 atoms in block 74
Block first atom: 3144
Blocpdb> 50 atoms in block 75
Block first atom: 3182
Blocpdb> 35 atoms in block 76
Block first atom: 3232
Blocpdb> 47 atoms in block 77
Block first atom: 3267
Blocpdb> 56 atoms in block 78
Block first atom: 3314
Blocpdb> 38 atoms in block 79
Block first atom: 3370
Blocpdb> 52 atoms in block 80
Block first atom: 3408
Blocpdb> 62 atoms in block 81
Block first atom: 3460
Blocpdb> 58 atoms in block 82
Block first atom: 3522
Blocpdb> 62 atoms in block 83
Block first atom: 3580
Blocpdb> 49 atoms in block 84
Block first atom: 3642
Blocpdb> 41 atoms in block 85
Block first atom: 3691
Blocpdb> 41 atoms in block 86
Block first atom: 3732
Blocpdb> 38 atoms in block 87
Block first atom: 3773
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 3811
Blocpdb> 42 atoms in block 89
Block first atom: 3856
Blocpdb> 67 atoms in block 90
Block first atom: 3898
Blocpdb> 48 atoms in block 91
Block first atom: 3965
Blocpdb> 30 atoms in block 92
Block first atom: 4013
Blocpdb> 40 atoms in block 93
Block first atom: 4043
Blocpdb> 34 atoms in block 94
Block first atom: 4083
Blocpdb> 47 atoms in block 95
Block first atom: 4117
Blocpdb> 62 atoms in block 96
Block first atom: 4164
Blocpdb> 50 atoms in block 97
Block first atom: 4226
Blocpdb> 52 atoms in block 98
Block first atom: 4276
Blocpdb> 50 atoms in block 99
Block first atom: 4328
Blocpdb> 58 atoms in block 100
Block first atom: 4378
Blocpdb> 43 atoms in block 101
Block first atom: 4436
Blocpdb> 52 atoms in block 102
Block first atom: 4479
Blocpdb> 56 atoms in block 103
Block first atom: 4531
Blocpdb> 40 atoms in block 104
Block first atom: 4587
Blocpdb> 51 atoms in block 105
Block first atom: 4627
Blocpdb> 53 atoms in block 106
Block first atom: 4678
Blocpdb> 41 atoms in block 107
Block first atom: 4731
Blocpdb> 28 atoms in block 108
Block first atom: 4772
Blocpdb> 27 atoms in block 109
Block first atom: 4800
Blocpdb> 36 atoms in block 110
Block first atom: 4827
Blocpdb> 24 atoms in block 111
Block first atom: 4863
Blocpdb> 53 atoms in block 112
Block first atom: 4887
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 4940
Blocpdb> 25 atoms in block 114
Block first atom: 4973
Blocpdb> 32 atoms in block 115
Block first atom: 4998
Blocpdb> 33 atoms in block 116
Block first atom: 5030
Blocpdb> 37 atoms in block 117
Block first atom: 5063
Blocpdb> 40 atoms in block 118
Block first atom: 5100
Blocpdb> 40 atoms in block 119
Block first atom: 5140
Blocpdb> 35 atoms in block 120
Block first atom: 5180
Blocpdb> 46 atoms in block 121
Block first atom: 5215
Blocpdb> 45 atoms in block 122
Block first atom: 5261
Blocpdb> 40 atoms in block 123
Block first atom: 5306
Blocpdb> 51 atoms in block 124
Block first atom: 5346
Blocpdb> 32 atoms in block 125
Block first atom: 5397
Blocpdb> 44 atoms in block 126
Block first atom: 5429
Blocpdb> 50 atoms in block 127
Block first atom: 5473
Blocpdb> 41 atoms in block 128
Block first atom: 5523
Blocpdb> 52 atoms in block 129
Block first atom: 5564
Blocpdb> 32 atoms in block 130
Block first atom: 5616
Blocpdb> 32 atoms in block 131
Block first atom: 5648
Blocpdb> 48 atoms in block 132
Block first atom: 5680
Blocpdb> 38 atoms in block 133
Block first atom: 5728
Blocpdb> 42 atoms in block 134
Block first atom: 5766
Blocpdb> 39 atoms in block 135
Block first atom: 5808
Blocpdb> 46 atoms in block 136
Block first atom: 5847
Blocpdb> 43 atoms in block 137
Block first atom: 5893
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 5935
Blocpdb> 138 blocks.
Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3189110 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 17874
Prepmat> Matrix trace = 7019320.0000
Prepmat> Last element read: 17874 17874 145.7827
Prepmat> 9592 lines saved.
Prepmat> 8629 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5958
RTB> Total mass = 5958.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5958
RTB> Number of blocks = 138
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 234015.7045
RTB> 32562 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 828
Diagstd> Nb of non-zero elements: 32562
Diagstd> Projected matrix trace = 234015.7045
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 828 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 234015.7045
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0005575 0.0023248 0.0035920 0.0353563
0.1062446 0.1374735 0.2111057 0.3794890 0.4485350
0.5099166 0.5764737 0.7598194 0.8425754 0.9737305
1.1747649 1.2495068 1.3172291 1.4096920 1.8693734
1.9871868 2.5081178 2.7017993 2.8523321 3.0879003
3.2032087 3.3302394 3.9613596 4.2595678 4.4258184
4.7849353 5.1157439 5.3534292 5.8809697 5.8832606
5.9925767 6.1656698 6.5206414 7.1986476 7.2741307
7.5356438 7.8237570 8.2739358 8.4294604 8.9782338
9.0826818 10.2668244 10.5761509 10.7931011 11.1373844
12.2174860 12.3194485 12.8576603 13.6677664 13.9974036
14.1365751 14.7504307 15.1840052 15.5129118 15.9254207
16.9931192 17.2989608 18.2757095 18.7643743 19.7874670
20.0690356 20.8642548 20.9795426 22.3518013 22.5494793
23.2506325 23.4564589 23.8488991 24.8231647 25.2442858
26.4676267 26.7532449 27.5565822 28.1927311 29.0331923
29.9504830 31.1016049 31.5223899 32.4605374 33.6828028
35.2605267 36.0170040 36.1771865 36.6215424 37.9212609
38.6034205 39.7640464 40.8194313 41.1663936 41.6724328
42.2238825 42.4267163 42.8178948 44.6641910 45.4303365
46.1843683
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034332 0.0034338 0.0034338 0.0034348
0.0034355 2.5639462 5.2358624 6.5082572 20.4187144
35.3955599 40.2628712 49.8936456 66.8951833 72.7266258
77.5434018 82.4489346 94.6565029 99.6780797 107.1555496
117.6984537 121.3848794 124.6309618 128.9310146 148.4715741
153.0786518 171.9765545 178.4932610 183.3983080 190.8213290
194.3515011 198.1677625 216.1311740 224.1186748 228.4504809
237.5381200 245.6120554 251.2530329 263.3417702 263.3930579
265.8288318 269.6406788 277.2939790 291.3538345 292.8773789
298.0955276 303.7406775 312.3570793 315.2790898 325.3799106
327.2670869 347.9472015 353.1499097 356.7536310 362.3989124
379.5650406 381.1456031 389.3823433 401.4616396 406.2739938
408.2887202 417.0591276 423.1442584 427.7026501 433.3519325
447.6430354 451.6534041 464.2291453 470.3945966 483.0481045
486.4727657 496.0171805 497.3856922 513.3948933 515.6601123
523.6157077 525.9282572 530.3095507 541.0331231 545.6030939
558.6666939 561.6729547 570.0434451 576.5856835 585.1169448
594.2883209 605.6011347 609.6840710 618.6900517 630.2304628
644.8217497 651.7020280 653.1496143 657.1486138 668.7082251
674.6960599 684.7634423 693.7911491 696.7334979 701.0027279
705.6256549 707.3184563 710.5717476 725.7298998 731.9278238
737.9769281
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5958
Rtb_to_modes> Number of blocs = 138
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5748E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3248E-03
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.18
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 828 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002
1.00003 1.00003 1.00002 0.99999 1.00004
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
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1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
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1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998
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1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 107244 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
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0.99997 0.99999 0.99997 1.00004 1.00001
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1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 0.99997 1.00004 0.99994 1.00000
0.99999 1.00000 0.99993 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
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0.99999 0.99997 1.00005 0.99999 0.99997
1.00001 1.00002 0.99995 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996
1.00002 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2401051456063961408.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2401051456063961408.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2401051456063961408.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2401051456063961408.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 413
First residue number = 1
Last residue number = 413
Number of atoms found = 5958
Mean number per residue = 14.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5748E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3248E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5920E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5356E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3795
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.852
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.203
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.353
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.993
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.166
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.199
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.824
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.429
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.978
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.083
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.18
Bfactors> 106 vectors, 17874 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000557
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 6.732 +/- 10.60
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -6.732
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2401051456063961408.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2401051456063961408.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2401051456063961408.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2401051456063961408.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2401051456063961408.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2401051456063961408.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.9
Projmod> 106 vectors, 17874 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 413
First residue number = 1
Last residue number = 413
Number of atoms found = 5958
Mean number per residue = 14.4
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 413
First residue number = 1
Last residue number = 413
Number of atoms found = 5958
Mean number per residue = 14.4
%Projmod-Wn> Atom 2 has name CA in a file and H1 in the other.
%Projmod-Wn> Atom 3 has name C in a file and H2 in the other.
%Projmod-Wn> Atom 4 has name O in a file and H3 in the other.
%Projmod-Wn> Atom 5 has name CB in a file and CA in the other.
%Projmod-Wn> ...
%Projmod-Wn> 5185 atoms have different names in the two pdb files.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 5958 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 146.18
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.150 Sum= 0.023 q= -1695.6122
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.303 Sum= 0.114 q= 3418.8235
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.911 Sum= 0.944 q= 10280.3932
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.018 Sum= 0.945 q= -207.2024
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.061 Sum= 0.949 q= 689.0127
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.226 Sum= 1.000 q= -2549.2561
Vector: 7 F= 2.56 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.9221
Vector: 8 F= 5.24 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.0762
Vector: 9 F= 6.51 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.3710
Vector: 10 F= 20.42 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.0338
Vector: 11 F= 35.39 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.5083
Vector: 12 F= 40.27 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.0945
Vector: 13 F= 49.89 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.5889
Vector: 14 F= 66.89 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.7542
Vector: 15 F= 72.72 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.1118
Vector: 16 F= 77.54 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.5704
Vector: 17 F= 82.45 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.2007
Vector: 18 F= 94.65 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.1600
Vector: 19 F= 99.68 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.1659
Vector: 20 F= 107.15 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.3575
Vector: 21 F= 117.71 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 2.8682
Vector: 22 F= 121.40 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 2.2760
Vector: 23 F= 124.61 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.5929
Vector: 24 F= 128.94 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -2.9128
Vector: 25 F= 148.45 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.6123
Vector: 26 F= 153.06 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.2252
Vector: 27 F= 171.97 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.9515
Vector: 28 F= 178.49 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.2634
Vector: 29 F= 183.38 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.0016
Vector: 30 F= 190.82 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.9085
Vector: 31 F= 194.34 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.4213
Vector: 32 F= 198.15 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.5527
Vector: 33 F= 216.11 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 2.9904
Vector: 34 F= 224.12 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.0865
Vector: 35 F= 228.45 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.2002
Vector: 36 F= 237.53 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.3655
Vector: 37 F= 245.61 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.6850
Vector: 38 F= 251.23 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.8414
Vector: 39 F= 263.33 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.2976
Vector: 40 F= 263.38 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.0035
Vector: 41 F= 265.83 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.0197
Vector: 42 F= 269.64 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.1799
Vector: 43 F= 277.29 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.7867
Vector: 44 F= 291.35 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.0071
Vector: 45 F= 292.86 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.5677
Vector: 46 F= 298.09 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.3635
%Projmod-Wn> Eigenvector 47 Norm= 0.9999
Vector: 47 F= 303.73 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.1240
Vector: 48 F= 312.34 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.4744
Vector: 49 F= 315.26 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.7320
Vector: 50 F= 325.36 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.6482
Vector: 51 F= 327.26 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.2453
Vector: 52 F= 347.99 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.5260
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%Projmod-Wn> Eigenvector 59 Norm= 0.9999
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Vector: 61 F= 408.32 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.0515
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%Projmod-Wn> Eigenvector 63 Norm= 0.9999
Vector: 63 F= 423.07 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.3390
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Vector: 75 F= 515.64 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.6709
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Vector: 77 F= 525.95 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.0204
Vector: 78 F= 530.30 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 1.3981
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Vector: 100 F= 700.95 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.7454
Vector: 101 F= 705.56 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.5635
Vector: 102 F= 707.32 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.1916
Vector: 103 F= 710.56 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 2.2991
Vector: 104 F= 725.66 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -0.2106
Vector: 105 F= 731.89 Cos= -0.000 Sum= 1.000 q= -1.0268
Vector: 106 F= 737.91 Cos= 0.000 Sum= 1.000 q= 0.5412
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 2.563842
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.91 for mode 3 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.830 0.973 1.000 1.000 1.000 1.000
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2401051456063961408 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 413 1.316 391 1.029
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 413 1.065 408 1.010
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 413 0.820 413 0.820
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 413 0.586 413 0.586
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 413 0.386 413 0.386
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 413 0.299 413 0.299
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 413 0.405 413 0.405
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 413 0.611 413 0.611
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 413 0.847 413 0.847
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 413 1.094 407 1.029
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 413 1.345 389 1.028
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2401051456063961408 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
making animated gifs
11 models are in 2401051456063961408.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 413 1.352 397 1.153
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 413 1.100 408 1.046
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 413 0.853 413 0.853
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 413 0.616 413 0.616
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 413 0.408 413 0.408
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 413 0.299 413 0.299
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 413 0.384 413 0.384
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 413 0.583 413 0.583
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 413 0.818 413 0.818
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 413 1.064 411 1.041
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 413 1.316 400 1.152
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2401051456063961408 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2401051456063961408.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
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2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
making animated gifs
11 models are in 2401051456063961408.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 413 1.321 397 1.055
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 413 1.070 405 0.949
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 413 0.825 412 0.812
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 413 0.591 413 0.591
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 413 0.390 413 0.390
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 413 0.299 413 0.299
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 413 0.401 413 0.401
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 413 0.606 413 0.606
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 413 0.841 411 0.815
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 413 1.088 404 0.947
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 413 1.339 398 1.065
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2401051456063961408 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
making animated gifs
11 models are in 2401051456063961408.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 413 1.342 410 1.318
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 413 1.087 413 1.087
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 413 0.837 413 0.837
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 413 0.599 413 0.599
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 413 0.393 413 0.393
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 413 0.299 413 0.299
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 413 0.403 413 0.403
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 413 0.612 413 0.612
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 413 0.851 413 0.851
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 413 1.101 413 1.101
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 413 1.357 408 1.321
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2401051456063961408 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2401051456063961408.eigenfacs
2401051456063961408.atom
making animated gifs
11 models are in 2401051456063961408.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2401051456063961408.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 413 1.314 395 0.983
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 413 1.062 404 0.926
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 413 0.815 413 0.815
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 413 0.580 413 0.580
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 413 0.381 413 0.381
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 413 0.299 413 0.299
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 413 0.412 413 0.412
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 413 0.621 413 0.621
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 413 0.859 408 0.781
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 413 1.107 403 0.919
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 413 1.360 397 1.029
2401051456063961408.10.pdb
2401051456063961408.11.pdb
2401051456063961408.7.pdb
2401051456063961408.8.pdb
2401051456063961408.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.979s
user 0m20.848s
sys 0m0.108s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2401051456063961408.Chkmod.res: No such file or directory
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elNémo
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Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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