Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* TRANSFERASE 17-JUL-00 1FBZ *

LOGs for ID: 2301201524599102

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2301201524599102.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2301201524599102.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2301201524599102.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    208
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    304
            Number of atoms found    =   2076
            Mean number per residue  =     10.0

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    16.960699 +/-     9.040694 From:    -5.554000 To:    39.427000
 =    34.707711 +/-    17.327431 From:     1.798000 To:    65.976000
 =    40.747527 +/-    17.179484 From:     9.794000 To:    77.944000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.5343 % Filled.
 Pdbmat>       879515  non-zero elements.
 Pdbmat>        96356 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     92.83 +/-     29.74
         Maximum number =    157
         Minimum number =     14

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.927120E+06
 Pdbmat> Larger element =  591.037    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
208 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2301201524599102.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2301201524599102.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2301201524599102.atom                                                                                                           

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2076 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   208 residues.
 Blocpdb>    15 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    17 atoms in block      2
 Block first atom:     16
 Blocpdb>    28 atoms in block      3
 Block first atom:     33
 Blocpdb>    25 atoms in block      4
 Block first atom:     61
 Blocpdb>    20 atoms in block      5
 Block first atom:     86
 Blocpdb>    25 atoms in block      6
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    22 atoms in block      7
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:    153
 Blocpdb>    29 atoms in block      9
 Block first atom:    169
 Blocpdb>    18 atoms in block     10
 Block first atom:    198
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:    216
 Blocpdb>    16 atoms in block     12
 Block first atom:    229
 Blocpdb>    22 atoms in block     13
 Block first atom:    245
 Blocpdb>    13 atoms in block     14
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    21 atoms in block     15
 Block first atom:    280
 Blocpdb>    26 atoms in block     16
 Block first atom:    301
 Blocpdb>    18 atoms in block     17
 Block first atom:    327
 Blocpdb>    18 atoms in block     18
 Block first atom:    345
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    363
 Blocpdb>    13 atoms in block     20
 Block first atom:    378
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    391
 Blocpdb>    17 atoms in block     22
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    25 atoms in block     23
 Block first atom:    427
 Blocpdb>    21 atoms in block     24
 Block first atom:    452
 Blocpdb>    21 atoms in block     25
 Block first atom:    473
 Blocpdb>    23 atoms in block     26
 Block first atom:    494
 Blocpdb>    15 atoms in block     27
 Block first atom:    517
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    532
 Blocpdb>    26 atoms in block     29
 Block first atom:    548
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    574
 Blocpdb>    26 atoms in block     31
 Block first atom:    601
 Blocpdb>    20 atoms in block     32
 Block first atom:    627
 Blocpdb>    20 atoms in block     33
 Block first atom:    647
 Blocpdb>    10 atoms in block     34
 Block first atom:    667
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:    677
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    24 atoms in block     37
 Block first atom:    720
 Blocpdb>    18 atoms in block     38
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    19 atoms in block     39
 Block first atom:    762
 Blocpdb>    14 atoms in block     40
 Block first atom:    781
 Blocpdb>    23 atoms in block     41
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    17 atoms in block     42
 Block first atom:    818
 Blocpdb>    30 atoms in block     43
 Block first atom:    835
 Blocpdb>    23 atoms in block     44
 Block first atom:    865
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    17 atoms in block     46
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    14 atoms in block     47
 Block first atom:    922
 Blocpdb>    16 atoms in block     48
 Block first atom:    936
 Blocpdb>    26 atoms in block     49
 Block first atom:    952
 Blocpdb>    25 atoms in block     50
 Block first atom:    978
 Blocpdb>    14 atoms in block     51
 Block first atom:   1003
 Blocpdb>    22 atoms in block     52
 Block first atom:   1017
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:   1039
 Blocpdb>    17 atoms in block     54
 Block first atom:   1054
 Blocpdb>    28 atoms in block     55
 Block first atom:   1071
 Blocpdb>    25 atoms in block     56
 Block first atom:   1099
 Blocpdb>    20 atoms in block     57
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    25 atoms in block     58
 Block first atom:   1144
 Blocpdb>    22 atoms in block     59
 Block first atom:   1169
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    29 atoms in block     61
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    18 atoms in block     62
 Block first atom:   1236
 Blocpdb>    13 atoms in block     63
 Block first atom:   1254
 Blocpdb>    16 atoms in block     64
 Block first atom:   1267
 Blocpdb>    22 atoms in block     65
 Block first atom:   1283
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:   1305
 Blocpdb>    21 atoms in block     67
 Block first atom:   1318
 Blocpdb>    26 atoms in block     68
 Block first atom:   1339
 Blocpdb>    18 atoms in block     69
 Block first atom:   1365
 Blocpdb>    18 atoms in block     70
 Block first atom:   1383
 Blocpdb>    15 atoms in block     71
 Block first atom:   1401
 Blocpdb>    13 atoms in block     72
 Block first atom:   1416
 Blocpdb>    19 atoms in block     73
 Block first atom:   1429
 Blocpdb>    17 atoms in block     74
 Block first atom:   1448
 Blocpdb>    25 atoms in block     75
 Block first atom:   1465
 Blocpdb>    21 atoms in block     76
 Block first atom:   1490
 Blocpdb>    21 atoms in block     77
 Block first atom:   1511
 Blocpdb>    23 atoms in block     78
 Block first atom:   1532
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1555
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    26 atoms in block     81
 Block first atom:   1586
 Blocpdb>    27 atoms in block     82
 Block first atom:   1612
 Blocpdb>    26 atoms in block     83
 Block first atom:   1639
 Blocpdb>    20 atoms in block     84
 Block first atom:   1665
 Blocpdb>    20 atoms in block     85
 Block first atom:   1685
 Blocpdb>    10 atoms in block     86
 Block first atom:   1705
 Blocpdb>    26 atoms in block     87
 Block first atom:   1715
 Blocpdb>    17 atoms in block     88
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    24 atoms in block     89
 Block first atom:   1758
 Blocpdb>    18 atoms in block     90
 Block first atom:   1782
 Blocpdb>    19 atoms in block     91
 Block first atom:   1800
 Blocpdb>    14 atoms in block     92
 Block first atom:   1819
 Blocpdb>    23 atoms in block     93
 Block first atom:   1833
 Blocpdb>    17 atoms in block     94
 Block first atom:   1856
 Blocpdb>    30 atoms in block     95
 Block first atom:   1873
 Blocpdb>    23 atoms in block     96
 Block first atom:   1903
 Blocpdb>    17 atoms in block     97
 Block first atom:   1926
 Blocpdb>    17 atoms in block     98
 Block first atom:   1943
 Blocpdb>    14 atoms in block     99
 Block first atom:   1960
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1974
 Blocpdb>    26 atoms in block    101
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    25 atoms in block    102
 Block first atom:   2016
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   2041
 Blocpdb>    22 atoms in block    104
 Block first atom:   2054

 Blocpdb>   104 blocks.

 Blocpdb> At most,     30 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    10 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       879619 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6228

 Prepmat> Matrix trace    =    1927120.0000
 Prepmat> Last element read:    6228   6228        92.0456
 Prepmat>         5461 lines saved.
 Prepmat>         4491 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2076
 RTB> Total mass =        2076.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2076
 RTB> Number of blocks =   104
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  160095.9205
 RTB>     33324 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      624
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    33324
 Diagstd> Projected matrix trace =  160095.9205

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    624 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 160095.9205
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>     12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0000000      4.9400794      5.9565323      6.3026775
      7.0429641      7.9433842      8.1877614      8.5555934     11.7951380
     13.9378602     15.5622460     17.1864226     17.3759661     17.6858870
     17.8023325     19.5611673     20.4506069     21.1480224     24.4092081
     25.8924827     26.7984619     28.3633008     28.5849138     30.5220981
     31.4865821     31.5035530     33.2804724     34.8180991     35.4383890
     36.6060314     36.9290246     37.7693140     38.6416012     38.6765783
     39.9534185     41.3878194     42.1194990     43.6628383     44.1381204
     45.7891923     46.1180624     46.4901277     47.5285843     48.9140812
     49.6631795     50.1167009     51.8217593     51.8693871     52.6334671
     53.3939966     54.7725263     54.8193063     56.3102186     59.3078877
     59.8831063     60.1218194     61.5478738     61.8656418     62.3441394
     63.0859914     63.7654578     65.7045395     66.0887725     67.4029752
     68.8290570     69.1877030     69.4371195     70.2403520     71.0672021
     71.6989664     73.4043465     75.7981616     76.1836152     77.4804377
     78.5305910     80.0896111     81.1930931     82.5110628     83.1971338
     84.7747345     85.0610088     85.4679257     87.7830626     88.6047989
     89.1140809     89.9752789     90.6983239     92.1743214     94.0013875
     94.6379784     96.4343110     97.1483579     98.1609172     98.7835768
    100.9591331

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034321      0.0034327      0.0034334      0.0034335      0.0034337
      0.0034337      0.0034341      0.0034342      0.0034345      0.0034346
      0.0034348      0.0034364    241.3583039    265.0281668    272.6200685
    288.1860913    306.0540028    310.7261960    317.6291466    372.9467218
    405.4089508    428.3822018    450.1818935    452.6575413    456.6765410
    458.1774747    480.2779672    491.0756283    499.3788692    536.5029635
    552.5634162    562.1474104    578.3272628    580.5822090    599.9326147
    609.3376876    609.5018787    626.4552042    640.7635649    646.4460199
    657.0094317    659.9016262    667.3671554    675.0296313    675.3350695
    686.3920619    698.6047801    704.7529116    717.5485021    721.4432888
    734.8128994    737.4469885    740.4157523    748.6394682    759.4728102
    765.2662147    768.7524581    781.7202397    782.0793854    787.8186722
    793.4900677    803.6679819    804.0111065    814.8710463    836.2796108
    840.3253025    841.9985383    851.9258723    854.1222619    857.4189889
    862.5052482    867.1376066    880.2235184    882.7934927    891.5276430
    900.9095486    903.2536738    904.8802901    910.0989637    915.4400090
    919.4999878    930.3710083    945.4196321    947.8204379    955.8534521
    962.3093670    971.8144957    978.4864667    986.3961555    990.4885574
    999.8353773   1001.5221181   1003.9148122   1017.4208763   1022.1718164
   1025.1052230   1030.0466193   1034.1770861   1042.5580711   1052.8400870
   1056.3990638   1066.3777406   1070.3184515   1075.8818576   1079.2887594
   1091.1088710

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2076
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    104

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9891E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9928E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0014E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.940    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.957    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.303    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.043    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.943    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.188    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.556    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.0    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    624 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999
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 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00003 0.99998 0.99998 0.99997 1.00003
 1.00001 1.00003 0.99996 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00003 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003
 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998
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 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003
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 0.99997

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    37368 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999
 1.00003 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998
 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00003 0.99998 0.99998 0.99997 1.00003
 1.00001 1.00003 0.99996 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00003 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003
 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998
 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
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 0.99999 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999
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 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003
 1.00002 0.99996 0.99999 0.99998 0.99998
 0.99997 1.00000 1.00003 0.99997 0.99997
 0.99997

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2301201524599102.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2301201524599102.eigenfacs                                      
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2301201524599102.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2301201524599102.atom                                           
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    208
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    304
            Number of atoms found    =   2076
            Mean number per residue  =     10.0

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9891E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9928E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0014E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.940    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.957    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.303    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.043    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.943    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.188    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.556    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.0    

 Bfactors>  106 vectors,   6228 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>    12 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     4.940000
 Bfactors>    94 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.352 for    208 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.019 +/-   0.04
 Bfactors> =     37.305 +/-  15.60
 Bfactors> Shiftng-fct=     37.286
 Bfactors> Scaling-fct=    380.517

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2301201524599102.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2301201524599102.eigenfacs                                      

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4319E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4326E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4362E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   241.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   265.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   272.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   288.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   306.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   310.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   317.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   373.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   405.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   428.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   450.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   452.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   456.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   458.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   480.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   491.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   499.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   536.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   552.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   562.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   578.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   580.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   599.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   609.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   609.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   626.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   640.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   646.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   659.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   667.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   675.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   675.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   686.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   698.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   737.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   840.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   862.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   880.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   882.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   891.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   900.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   904.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   930.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   947.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   955.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   962.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   971.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   978.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   986.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   990.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   999.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1001.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1004.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1017.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1022.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1025.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1030.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1034.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1042.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1053.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1056.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1066.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1070.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1076.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1079.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1091.    

 Chkmod>  106 vectors,   6228 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2076 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    15 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    33 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
    241.3460         NaN
    265.0272         NaN
    272.6153         NaN
    288.1745         NaN
    306.0335         NaN
    310.7174         NaN
    317.6231         NaN
    373.0076         NaN
    405.4227         NaN
    428.3329         NaN
    450.2094         NaN
    452.6906         NaN
    456.7100         NaN
    458.1278         NaN
    480.2430         NaN
    491.0473         NaN
    499.3808         NaN
    536.4886         NaN
    552.5132         NaN
    562.1394         NaN
    578.2688         NaN
    580.5074         NaN
    599.8862         NaN
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    609.4413         NaN
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    640.7535         NaN
    646.4330         NaN
    657.0168         NaN
    659.8820         NaN
    667.3446         NaN
    674.9867         NaN
    675.3360         NaN
    686.3332         NaN
    698.5932         NaN
    704.7268         NaN
    717.4944         NaN
    721.4277         NaN
    734.7878         NaN
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    748.6185         NaN
    759.4085         NaN
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    782.0504         NaN
    787.7589         NaN
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    803.9817         NaN
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   1034.1422         NaN
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   1091.2828         NaN
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2301201524599102 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=60
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11 models are in 2301201524599102.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2301201524599102.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2301201524599102.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2301201524599102 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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11 models are in 2301201524599102.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2301201524599102.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2301201524599102.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2301201524599102 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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It was developed by Karsten Suhre.
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