*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 23010914385880449.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 23010914385880449.atom to be opened.
Openam> File opened: 23010914385880449.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 480
First residue number = 2
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3769
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.346232 +/- 12.505447 From: -25.578000 To: 33.220000
= 2.768875 +/- 13.063977 From: -27.450000 To: 33.394000
= -0.177757 +/- 14.308467 From: -35.600000 To: 35.358000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2673 % Filled.
Pdbmat> 1449456 non-zero elements.
Pdbmat> 158563 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.14 +/- 22.25
Maximum number = 127
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 3.171260E+06
Pdbmat> Larger element = 507.126
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
480 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 23010914385880449.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 23010914385880449.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
23010914385880449.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3769 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 480 residues.
Blocpdb> 21 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 22
Blocpdb> 21 atoms in block 3
Block first atom: 46
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 89
Blocpdb> 26 atoms in block 6
Block first atom: 112
Blocpdb> 22 atoms in block 7
Block first atom: 138
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 160
Blocpdb> 24 atoms in block 9
Block first atom: 183
Blocpdb> 32 atoms in block 10
Block first atom: 207
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 239
Blocpdb> 26 atoms in block 12
Block first atom: 261
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 287
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 308
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 330
Blocpdb> 23 atoms in block 16
Block first atom: 352
Blocpdb> 21 atoms in block 17
Block first atom: 375
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 396
Blocpdb> 25 atoms in block 19
Block first atom: 419
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 444
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 466
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 488
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 510
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 531
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 554
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 572
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 588
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 614
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 638
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 660
Blocpdb> 27 atoms in block 31
Block first atom: 680
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 707
Blocpdb> 27 atoms in block 33
Block first atom: 735
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 762
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 786
Blocpdb> 33 atoms in block 36
Block first atom: 808
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 841
Blocpdb> 27 atoms in block 38
Block first atom: 866
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 893
Blocpdb> 27 atoms in block 40
Block first atom: 915
Blocpdb> 27 atoms in block 41
Block first atom: 942
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 969
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 990
Blocpdb> 26 atoms in block 44
Block first atom: 1016
Blocpdb> 29 atoms in block 45
Block first atom: 1042
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1071
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1095
Blocpdb> 35 atoms in block 48
Block first atom: 1120
Blocpdb> 21 atoms in block 49
Block first atom: 1155
Blocpdb> 29 atoms in block 50
Block first atom: 1176
Blocpdb> 25 atoms in block 51
Block first atom: 1205
Blocpdb> 24 atoms in block 52
Block first atom: 1230
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1254
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 1275
Blocpdb> 25 atoms in block 55
Block first atom: 1291
Blocpdb> 32 atoms in block 56
Block first atom: 1316
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1348
Blocpdb> 21 atoms in block 58
Block first atom: 1372
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1393
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 1415
Blocpdb> 23 atoms in block 61
Block first atom: 1436
Blocpdb> 28 atoms in block 62
Block first atom: 1459
Blocpdb> 26 atoms in block 63
Block first atom: 1487
Blocpdb> 24 atoms in block 64
Block first atom: 1513
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1537
Blocpdb> 25 atoms in block 66
Block first atom: 1555
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1580
Blocpdb> 23 atoms in block 68
Block first atom: 1599
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1622
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1644
Blocpdb> 24 atoms in block 71
Block first atom: 1663
Blocpdb> 23 atoms in block 72
Block first atom: 1687
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1710
Blocpdb> 21 atoms in block 74
Block first atom: 1730
Blocpdb> 21 atoms in block 75
Block first atom: 1751
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 1772
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1795
Blocpdb> 23 atoms in block 78
Block first atom: 1813
Blocpdb> 18 atoms in block 79
Block first atom: 1836
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1854
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 1872
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 1901
Blocpdb> 26 atoms in block 83
Block first atom: 1927
Blocpdb> 25 atoms in block 84
Block first atom: 1953
Blocpdb> 18 atoms in block 85
Block first atom: 1978
Blocpdb> 29 atoms in block 86
Block first atom: 1996
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 2025
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 2047
Blocpdb> 25 atoms in block 89
Block first atom: 2069
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 2094
Blocpdb> 30 atoms in block 91
Block first atom: 2116
Blocpdb> 21 atoms in block 92
Block first atom: 2146
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2167
Blocpdb> 26 atoms in block 94
Block first atom: 2192
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2218
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2240
Blocpdb> 25 atoms in block 97
Block first atom: 2265
Blocpdb> 25 atoms in block 98
Block first atom: 2290
Blocpdb> 26 atoms in block 99
Block first atom: 2315
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2341
Blocpdb> 25 atoms in block 101
Block first atom: 2363
Blocpdb> 28 atoms in block 102
Block first atom: 2388
Blocpdb> 27 atoms in block 103
Block first atom: 2416
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 2443
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2461
Blocpdb> 25 atoms in block 106
Block first atom: 2485
Blocpdb> 27 atoms in block 107
Block first atom: 2510
Blocpdb> 24 atoms in block 108
Block first atom: 2537
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2561
Blocpdb> 26 atoms in block 110
Block first atom: 2587
Blocpdb> 27 atoms in block 111
Block first atom: 2613
Blocpdb> 24 atoms in block 112
Block first atom: 2640
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 2664
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2688
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 2711
Blocpdb> 23 atoms in block 116
Block first atom: 2738
Blocpdb> 21 atoms in block 117
Block first atom: 2761
Blocpdb> 27 atoms in block 118
Block first atom: 2782
Blocpdb> 23 atoms in block 119
Block first atom: 2809
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2832
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 2856
Blocpdb> 26 atoms in block 122
Block first atom: 2881
Blocpdb> 21 atoms in block 123
Block first atom: 2907
Blocpdb> 22 atoms in block 124
Block first atom: 2928
Blocpdb> 21 atoms in block 125
Block first atom: 2950
Blocpdb> 23 atoms in block 126
Block first atom: 2971
Blocpdb> 29 atoms in block 127
Block first atom: 2994
Blocpdb> 26 atoms in block 128
Block first atom: 3023
Blocpdb> 26 atoms in block 129
Block first atom: 3049
Blocpdb> 26 atoms in block 130
Block first atom: 3075
Blocpdb> 19 atoms in block 131
Block first atom: 3101
Blocpdb> 27 atoms in block 132
Block first atom: 3120
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3147
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 3171
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 3188
Blocpdb> 21 atoms in block 136
Block first atom: 3208
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 3229
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 3253
Blocpdb> 23 atoms in block 139
Block first atom: 3274
Blocpdb> 28 atoms in block 140
Block first atom: 3297
Blocpdb> 25 atoms in block 141
Block first atom: 3325
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 3350
Blocpdb> 18 atoms in block 143
Block first atom: 3367
Blocpdb> 23 atoms in block 144
Block first atom: 3385
Blocpdb> 29 atoms in block 145
Block first atom: 3408
Blocpdb> 26 atoms in block 146
Block first atom: 3437
Blocpdb> 22 atoms in block 147
Block first atom: 3463
Blocpdb> 26 atoms in block 148
Block first atom: 3485
Blocpdb> 21 atoms in block 149
Block first atom: 3511
Blocpdb> 21 atoms in block 150
Block first atom: 3532
Blocpdb> 20 atoms in block 151
Block first atom: 3553
Blocpdb> 24 atoms in block 152
Block first atom: 3573
Blocpdb> 25 atoms in block 153
Block first atom: 3597
Blocpdb> 27 atoms in block 154
Block first atom: 3622
Blocpdb> 23 atoms in block 155
Block first atom: 3649
Blocpdb> 14 atoms in block 156
Block first atom: 3672
Blocpdb> 16 atoms in block 157
Block first atom: 3686
Blocpdb> 19 atoms in block 158
Block first atom: 3702
Blocpdb> 23 atoms in block 159
Block first atom: 3721
Blocpdb> 26 atoms in block 160
Block first atom: 3743
Blocpdb> 160 blocks.
Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1449616 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11307
Prepmat> Matrix trace = 3171260.0000
Prepmat> Last element read: 11307 11307 175.3432
Prepmat> 12881 lines saved.
Prepmat> 11197 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3769
RTB> Total mass = 3769.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3769
RTB> Number of blocks = 160
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 214156.1712
RTB> 58188 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 960
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58188
Diagstd> Projected matrix trace = 214156.1712
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 960 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 214156.1712
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.1943515 1.9492609 2.5012028 3.8949589
4.2460493 4.4340313 6.0907793 6.8315517 8.2705846
8.5462704 8.6665981 10.2758459 10.7229986 11.7821765
12.4121276 12.6097152 13.5511500 14.6161489 15.5081285
15.7084219 16.8740809 17.7638807 18.4592430 18.8322658
19.8985422 20.9054940 21.1515468 21.7699229 22.3526981
23.6557482 23.8866658 24.0317013 25.0245007 26.5819791
27.4891425 28.6729961 29.9243225 30.5103957 30.7392558
31.8190237 31.9709033 32.4877624 33.8313393 33.9875399
34.4249306 34.8624514 35.4093384 36.0429658 37.2268652
37.7304594 37.7820430 38.5219283 39.1169733 39.9584601
40.3934578 40.9984486 41.1733978 41.5598253 42.2754150
42.4553992 43.7275559 44.7417532 45.0561073 45.6528964
46.6721597 46.8612784 47.5025907 48.2419006 49.0138005
49.5746238 49.6182007 50.6374749 51.3507813 52.1351752
52.6625635 52.8498401 53.5073755 54.6986912 55.4635571
55.9089961 56.2837900 56.3829470 56.9457038 57.3159702
57.9557208 58.2842233 58.4868862 59.2538792 60.2286986
60.6672842 61.3045850 62.0879481 62.5638957 63.0098030
63.3995763 63.9540318 64.3578057 64.8138600 65.2280386
65.5105538
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034337 0.0034342 0.0034342 0.0034343
0.0034350 118.6755770 151.6108440 171.7393183 214.3121149
223.7627528 228.6623474 267.9980989 283.8278194 312.2938164
317.4560397 319.6830489 348.1000391 355.5931654 372.7417514
382.5765943 385.6096719 399.7452907 415.1564210 427.6367065
430.3893929 446.0723913 457.6823915 466.5543291 471.2447968
484.4019809 496.5071393 499.4204791 506.6682917 513.4051920
528.1577103 530.7292785 532.3380860 543.2228009 559.8722427
569.3454790 581.4760321 594.0287215 599.8175936 602.0630225
612.5459956 614.0061676 618.9494490 631.6185486 633.0749733
637.1355189 641.1715462 646.1810035 651.9368653 662.5574070
667.0237947 667.4796036 673.9835389 679.1690738 686.4353679
690.1616068 695.3108266 696.7927675 700.0549599 706.0561174
707.5575098 718.0800847 726.3597644 728.9069884 733.7184641
741.8638842 743.3654058 748.4347236 754.2363950 760.2465704
764.5836271 764.9195944 772.7362764 778.1598301 784.0805824
788.0364000 789.4363485 794.3320848 803.1261144 808.7217807
811.9627905 814.6797984 815.3971065 819.4562328 822.1160074
826.6914308 829.0310318 830.4711128 835.8987466 842.7466212
845.8094968 850.2404422 855.6554756 858.9288141 861.9842710
864.6462417 868.4188555 871.1559241 874.2370818 877.0259423
878.9231744
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3769
Rtb_to_modes> Number of blocs = 160
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.895
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.246
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.434
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.832
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.51
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 960 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 0.99995 0.99995
1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 0.99995 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 67842 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 0.99995 0.99995
1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 0.99995 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23010914385880449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23010914385880449.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 23010914385880449.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23010914385880449.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 480
First residue number = 2
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3769
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.949
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.895
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.246
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.434
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.832
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51
Bfactors> 106 vectors, 11307 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.194000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.613 for 480 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.022 +/- 0.02
Bfactors> = 96.587 +/- 21.06
Bfactors> Shiftng-fct= 96.565
Bfactors> Scaling-fct= 1034.460
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23010914385880449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23010914385880449.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Chkmod> 106 vectors, 11307 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3769 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7457
0.0034 0.7603
0.0034 0.7391
0.0034 0.8312
0.0034 0.8136
0.0034 0.6948
118.6530 0.4901
151.5942 0.5283
171.7250 0.3549
214.3040 0.2853
223.7518 0.2539
228.6517 0.1313
267.9914 0.1329
283.8249 0.3735
312.2883 0.5306
317.4374 0.3525
319.6767 0.5414
348.1554 0.4735
355.5282 0.2948
372.6913 0.3676
382.5274 0.7230
385.5975 0.3486
399.7112 0.1764
415.1933 0.1027
427.6442 0.5341
430.3925 0.1844
445.9993 0.5400
457.6128 0.3974
466.5439 0.4272
471.1962 0.2018
484.3989 0.4938
496.5393 0.4385
499.3808 0.3931
506.6474 0.4568
513.3522 0.4585
528.1825 0.4514
530.7435 0.5176
532.2964 0.3514
543.1506 0.6152
559.8274 0.5510
569.3299 0.4640
581.4207 0.5995
593.9603 0.3342
599.7880 0.1521
602.0445 0.5338
612.5291 0.4562
613.9711 0.6465
618.9442 0.4022
631.5789 0.3219
633.0707 0.3766
637.0625 0.4245
641.1215 0.3718
646.1593 0.5058
651.8821 0.4543
662.5569 0.4127
666.9911 0.5823
667.4329 0.4213
673.9377 0.5699
679.1662 0.1844
686.4191 0.4917
690.1024 0.3670
695.2941 0.5881
696.7341 0.4881
700.0264 0.3880
706.0641 0.3316
707.5655 0.4381
718.0693 0.5103
726.3144 0.5772
728.9072 0.4380
733.6637 0.4707
741.8149 0.3086
743.3234 0.4427
748.3822 0.5114
754.1892 0.3846
760.1845 0.5150
764.5152 0.4270
764.9006 0.3860
772.7224 0.5146
778.1205 0.4917
784.0832 0.5118
787.9834 0.4128
789.4037 0.5233
794.3175 0.5437
803.1012 0.4736
808.6611 0.4345
811.9352 0.5041
814.6174 0.3632
815.3408 0.5693
819.4520 0.5128
822.1096 0.3961
826.6865 0.4460
828.9654 0.4493
830.4576 0.4778
835.8355 0.5426
842.7195 0.3781
845.7921 0.4195
850.1721 0.4717
855.6329 0.5203
858.8652 0.4848
861.9486 0.5420
864.6120 0.4587
868.3542 0.4210
871.1334 0.4864
874.1735 0.4021
877.0015 0.3510
878.8817 0.4984
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 23010914385880449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23010914385880449.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 23010914385880449.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23010914385880449.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 23010914385880449.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
23010914385880449.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Projmod> 106 vectors, 11307 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 480
First residue number = 2
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3769
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 480
First residue number = 2
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3769
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 3769 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 5.11
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.166 Sum= 0.027 q= -51.9582
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.043 Sum= 0.029 q= -13.4550
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.044 Sum= 0.031 q= -13.7665
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.160 Sum= 0.057 q= -50.1976
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.342 Sum= 0.174 q= -107.2597
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.241 Sum= 0.232 q= -75.6532
Vector: 7 F= 118.65 Cos= -0.471 Sum= 0.454 q= -147.7333
Vector: 8 F= 151.59 Cos= 0.191 Sum= 0.490 q= 59.7538
%Projmod-Wn> Eigenvector 9 Norm= 0.9999
Vector: 9 F= 171.72 Cos= 0.311 Sum= 0.587 q= 97.5381
%Projmod-Wn> Eigenvector 10 Norm= 0.9999
Vector: 10 F= 214.30 Cos= -0.130 Sum= 0.604 q= -40.6478
Vector: 11 F= 223.75 Cos= -0.144 Sum= 0.624 q= -45.0445
Vector: 12 F= 228.65 Cos= -0.166 Sum= 0.652 q= -52.0621
Vector: 13 F= 267.99 Cos= -0.078 Sum= 0.658 q= -24.3316
Vector: 14 F= 283.82 Cos= 0.030 Sum= 0.659 q= 9.4018
Vector: 15 F= 312.29 Cos= -0.244 Sum= 0.719 q= -76.5337
Vector: 16 F= 317.44 Cos= 0.027 Sum= 0.719 q= 8.5933
Vector: 17 F= 319.68 Cos= 0.200 Sum= 0.759 q= 62.8573
Vector: 18 F= 348.16 Cos= -0.015 Sum= 0.760 q= -4.6167
Vector: 19 F= 355.53 Cos= -0.166 Sum= 0.787 q= -52.0416
Vector: 20 F= 372.69 Cos= 0.119 Sum= 0.801 q= 37.3580
Vector: 21 F= 382.53 Cos= -0.053 Sum= 0.804 q= -16.6922
Vector: 22 F= 385.60 Cos= 0.020 Sum= 0.805 q= 6.2539
%Projmod-Wn> Eigenvector 23 Norm= 0.9999
Vector: 23 F= 399.71 Cos= -0.018 Sum= 0.805 q= -5.7792
Vector: 24 F= 415.19 Cos= -0.009 Sum= 0.805 q= -2.8970
Vector: 25 F= 427.64 Cos= 0.115 Sum= 0.818 q= 36.2050
Vector: 26 F= 430.39 Cos= -0.015 Sum= 0.819 q= -4.7169
Vector: 27 F= 446.00 Cos= 0.026 Sum= 0.819 q= 8.0656
Vector: 28 F= 457.61 Cos= 0.015 Sum= 0.820 q= 4.7613
Vector: 29 F= 466.54 Cos= -0.013 Sum= 0.820 q= -4.0032
Vector: 30 F= 471.20 Cos= 0.016 Sum= 0.820 q= 4.8889
Vector: 31 F= 484.40 Cos= -0.038 Sum= 0.821 q= -11.9553
Vector: 32 F= 496.54 Cos= 0.016 Sum= 0.822 q= 5.0393
Vector: 33 F= 499.38 Cos= 0.071 Sum= 0.827 q= 22.2268
Vector: 34 F= 506.65 Cos= -0.065 Sum= 0.831 q= -20.4619
Vector: 35 F= 513.35 Cos= -0.064 Sum= 0.835 q= -20.0714
Vector: 36 F= 528.18 Cos= 0.071 Sum= 0.840 q= 22.3370
Vector: 37 F= 530.74 Cos= -0.001 Sum= 0.840 q= -0.3623
Vector: 38 F= 532.30 Cos= -0.015 Sum= 0.840 q= -4.7508
Vector: 39 F= 543.15 Cos= 0.009 Sum= 0.840 q= 2.7967
Vector: 40 F= 559.83 Cos= -0.022 Sum= 0.841 q= -6.8114
Vector: 41 F= 569.33 Cos= 0.006 Sum= 0.841 q= 1.9782
Vector: 42 F= 581.42 Cos= -0.006 Sum= 0.841 q= -1.7459
Vector: 43 F= 593.96 Cos= -0.041 Sum= 0.843 q= -12.8261
Vector: 44 F= 599.79 Cos= -0.037 Sum= 0.844 q= -11.5118
Vector: 45 F= 602.04 Cos= 0.036 Sum= 0.845 q= 11.4356
Vector: 46 F= 612.53 Cos= -0.050 Sum= 0.848 q= -15.5601
Vector: 47 F= 613.97 Cos= -0.041 Sum= 0.849 q= -12.9792
Vector: 48 F= 618.94 Cos= -0.013 Sum= 0.850 q= -3.9201
Vector: 49 F= 631.58 Cos= -0.008 Sum= 0.850 q= -2.6537
Vector: 50 F= 633.07 Cos= 0.007 Sum= 0.850 q= 2.3501
Vector: 51 F= 637.06 Cos= 0.015 Sum= 0.850 q= 4.7004
Vector: 52 F= 641.12 Cos= 0.029 Sum= 0.851 q= 9.2046
Vector: 53 F= 646.16 Cos= -0.088 Sum= 0.859 q= -27.7360
Vector: 54 F= 651.88 Cos= 0.024 Sum= 0.859 q= 7.4091
Vector: 55 F= 662.56 Cos= -0.020 Sum= 0.860 q= -6.1309
Vector: 56 F= 666.99 Cos= 0.005 Sum= 0.860 q= 1.4835
Vector: 57 F= 667.43 Cos= -0.008 Sum= 0.860 q= -2.3556
Vector: 58 F= 673.94 Cos= -0.016 Sum= 0.860 q= -4.9702
Vector: 59 F= 679.17 Cos= 0.003 Sum= 0.860 q= 1.0443
Vector: 60 F= 686.42 Cos= -0.007 Sum= 0.860 q= -2.2028
Vector: 61 F= 690.10 Cos= 0.000 Sum= 0.860 q= 0.0167
Vector: 62 F= 695.29 Cos= -0.043 Sum= 0.862 q= -13.5380
Vector: 63 F= 696.73 Cos= 0.053 Sum= 0.865 q= 16.5847
Vector: 64 F= 700.03 Cos= 0.020 Sum= 0.865 q= 6.2386
Vector: 65 F= 706.06 Cos= 0.004 Sum= 0.865 q= 1.2644
Vector: 66 F= 707.57 Cos= 0.011 Sum= 0.865 q= 3.3213
Vector: 67 F= 718.07 Cos= 0.010 Sum= 0.865 q= 3.2165
Vector: 68 F= 726.31 Cos= 0.006 Sum= 0.865 q= 1.7827
Vector: 69 F= 728.91 Cos= -0.023 Sum= 0.866 q= -7.2599
Vector: 70 F= 733.66 Cos= 0.000 Sum= 0.866 q= 0.1055
Vector: 71 F= 741.81 Cos= 0.036 Sum= 0.867 q= 11.2071
Vector: 72 F= 743.32 Cos= 0.021 Sum= 0.868 q= 6.5746
Vector: 73 F= 748.38 Cos= -0.025 Sum= 0.868 q= -7.9913
Vector: 74 F= 754.19 Cos= -0.008 Sum= 0.868 q= -2.6489
Vector: 75 F= 760.18 Cos= -0.027 Sum= 0.869 q= -8.4126
Vector: 76 F= 764.52 Cos= 0.030 Sum= 0.870 q= 9.3172
Vector: 77 F= 764.90 Cos= 0.029 Sum= 0.871 q= 8.9991
Vector: 78 F= 772.72 Cos= 0.006 Sum= 0.871 q= 1.7889
Vector: 79 F= 778.12 Cos= -0.011 Sum= 0.871 q= -3.5057
Vector: 80 F= 784.08 Cos= -0.003 Sum= 0.871 q= -0.8165
Vector: 81 F= 787.98 Cos= 0.037 Sum= 0.872 q= 11.7030
Vector: 82 F= 789.40 Cos= 0.018 Sum= 0.873 q= 5.6056
Vector: 83 F= 794.32 Cos= -0.003 Sum= 0.873 q= -0.9941
Vector: 84 F= 803.10 Cos= 0.003 Sum= 0.873 q= 0.9528
Vector: 85 F= 808.66 Cos= 0.011 Sum= 0.873 q= 3.4435
Vector: 86 F= 811.94 Cos= -0.009 Sum= 0.873 q= -2.8987
Vector: 87 F= 814.62 Cos= 0.025 Sum= 0.873 q= 7.6918
Vector: 88 F= 815.34 Cos= -0.008 Sum= 0.873 q= -2.5821
Vector: 89 F= 819.45 Cos= -0.032 Sum= 0.874 q= -9.9270
Vector: 90 F= 822.11 Cos= 0.020 Sum= 0.875 q= 6.1885
Vector: 91 F= 826.69 Cos= 0.002 Sum= 0.875 q= 0.4799
Vector: 92 F= 828.97 Cos= 0.028 Sum= 0.876 q= 8.7648
Vector: 93 F= 830.46 Cos= 0.007 Sum= 0.876 q= 2.2477
Vector: 94 F= 835.84 Cos= 0.001 Sum= 0.876 q= 0.2836
Vector: 95 F= 842.72 Cos= -0.029 Sum= 0.877 q= -9.1708
Vector: 96 F= 845.79 Cos= -0.012 Sum= 0.877 q= -3.7559
Vector: 97 F= 850.17 Cos= 0.005 Sum= 0.877 q= 1.4658
Vector: 98 F= 855.63 Cos= 0.026 Sum= 0.877 q= 8.1514
Vector: 99 F= 858.87 Cos= 0.001 Sum= 0.877 q= 0.1791
Vector: 100 F= 861.95 Cos= -0.019 Sum= 0.878 q= -5.9157
Vector: 101 F= 864.61 Cos= 0.008 Sum= 0.878 q= 2.5219
Vector: 102 F= 868.35 Cos= -0.014 Sum= 0.878 q= -4.4869
Vector: 103 F= 871.13 Cos= -0.002 Sum= 0.878 q= -0.5702
Vector: 104 F= 874.17 Cos= -0.018 Sum= 0.878 q= -5.5658
Vector: 105 F= 877.00 Cos= -0.015 Sum= 0.879 q= -4.5641
Vector: 106 F= 878.88 Cos= 0.045 Sum= 0.881 q= 14.2147
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 118.653021
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.47 for mode 7 with F= 118.65 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.222 0.436 0.594 0.685 0.759 0.881
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 23010914385880449 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 480 3.665 352 1.388
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 480 3.742 352 1.309
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 480 3.844 351 1.246
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 480 3.967 350 1.231
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 480 4.111 344 1.248
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 480 4.273 334 1.101
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 480 4.452 334 1.221
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 480 4.645 329 1.253
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 480 4.850 323 1.323
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 480 5.067 320 1.459
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 480 5.294 275 1.300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 23010914385880449 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
making animated gifs
11 models are in 23010914385880449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 480 4.919 286 1.474
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 480 4.756 322 1.532
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 480 4.609 327 1.393
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 480 4.478 330 1.265
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 480 4.366 335 1.206
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 480 4.273 334 1.101
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 480 4.202 335 1.080
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 480 4.153 337 1.125
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 480 4.126 337 1.193
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 480 4.124 330 1.263
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 480 4.144 329 1.322
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 23010914385880449 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
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23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
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23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23010914385880449.eigenfacs
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23010914385880449.atom
making animated gifs
11 models are in 23010914385880449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 480 5.053 269 1.460
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 480 4.867 287 1.445
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 480 4.695 305 1.397
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 480 4.538 322 1.332
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 480 4.396 333 1.232
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 480 4.273 334 1.101
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 480 4.170 340 1.116
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 480 4.087 338 1.136
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 480 4.027 336 1.233
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 480 3.990 332 1.348
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 480 3.977 315 1.329
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 23010914385880449 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
making animated gifs
11 models are in 23010914385880449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23010914385880449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 480 4.294 312 1.449
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 480 4.249 322 1.443
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 480 4.223 332 1.384
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 480 4.219 337 1.299
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 480 4.236 337 1.194
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 480 4.273 334 1.101
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 480 4.331 334 1.111
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 480 4.408 330 1.136
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 480 4.503 329 1.232
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 480 4.615 323 1.250
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 480 4.744 320 1.363
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 23010914385880449 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23010914385880449.eigenfacs
23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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23010914385880449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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23010914385880449.atom
making animated gifs
11 models are in 23010914385880449.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 480 4.293 298 1.444
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 480 4.247 311 1.437
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 480 4.223 332 1.413
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 480 4.219 334 1.307
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 480 4.236 341 1.263
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 480 4.273 334 1.101
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 480 4.331 333 1.085
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 480 4.409 330 1.240
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 480 4.504 328 1.158
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 480 4.618 320 1.183
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 480 4.747 315 1.247
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23010914385880449.11.pdb
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STDERR:
real 0m14.323s
user 0m14.248s
sys 0m0.068s
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elNémo
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by Karsten Suhre.
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