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***  1fup-abcd  ***

LOGs for ID: 23010419050363783

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 23010419050363783.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 23010419050363783.atom to be opened. Openam> File opened: 23010419050363783.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1820 First residue number = 5 Last residue number = 459 Number of atoms found = 13808 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 104.000000 +/- 22.868840 From: 46.312000 To: 161.688000 = 140.567420 +/- 20.323969 From: 93.401000 To: 188.076000 = 65.025000 +/- 18.390334 From: 20.376000 To: 109.674000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6533 % Filled. Pdbmat> 5605392 non-zero elements. Pdbmat> 613725 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.89 +/- 20.19 Maximum number = 130 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 1.227450E+07 Pdbmat> Larger element = 504.689 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1820 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 23010419050363783.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 23010419050363783.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 23010419050363783.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13808 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1820 residues. Blocpdb> 74 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 75 atoms in block 2 Block first atom: 75 Blocpdb> 91 atoms in block 3 Block first atom: 150 Blocpdb> 75 atoms in block 4 Block first atom: 241 Blocpdb> 76 atoms in block 5 Block first atom: 316 Blocpdb> 71 atoms in block 6 Block first atom: 392 Blocpdb> 76 atoms in block 7 Block first atom: 463 Blocpdb> 69 atoms in block 8 Block first atom: 539 Blocpdb> 88 atoms in block 9 Block first atom: 608 Blocpdb> 68 atoms in block 10 Block first atom: 696 Blocpdb> 77 atoms in block 11 Block first atom: 764 Blocpdb> 69 atoms in block 12 Block first atom: 841 Blocpdb> 84 atoms in block 13 Block first atom: 910 Blocpdb> 78 atoms in block 14 Block first atom: 994 Blocpdb> 70 atoms in block 15 Block first atom: 1072 Blocpdb> 82 atoms in block 16 Block first atom: 1142 Blocpdb> 81 atoms in block 17 Block first atom: 1224 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1305 Blocpdb> 76 atoms in block 19 Block first atom: 1383 Blocpdb> 77 atoms in block 20 Block first atom: 1459 Blocpdb> 82 atoms in block 21 Block first atom: 1536 Blocpdb> 81 atoms in block 22 Block first atom: 1618 Blocpdb> 59 atoms in block 23 Block first atom: 1699 Blocpdb> 81 atoms in block 24 Block first atom: 1758 Blocpdb> 75 atoms in block 25 Block first atom: 1839 Blocpdb> 72 atoms in block 26 Block first atom: 1914 Blocpdb> 72 atoms in block 27 Block first atom: 1986 Blocpdb> 69 atoms in block 28 Block first atom: 2058 Blocpdb> 70 atoms in block 29 Block first atom: 2127 Blocpdb> 79 atoms in block 30 Block first atom: 2197 Blocpdb> 71 atoms in block 31 Block first atom: 2276 Blocpdb> 68 atoms in block 32 Block first atom: 2347 Blocpdb> 73 atoms in block 33 Block first atom: 2415 Blocpdb> 72 atoms in block 34 Block first atom: 2488 Blocpdb> 59 atoms in block 35 Block first atom: 2560 Blocpdb> 88 atoms in block 36 Block first atom: 2619 Blocpdb> 85 atoms in block 37 Block first atom: 2707 Blocpdb> 75 atoms in block 38 Block first atom: 2792 Blocpdb> 73 atoms in block 39 Block first atom: 2867 Blocpdb> 89 atoms in block 40 Block first atom: 2940 Blocpdb> 72 atoms in block 41 Block first atom: 3029 Blocpdb> 78 atoms in block 42 Block first atom: 3101 Blocpdb> 75 atoms in block 43 Block first atom: 3179 Blocpdb> 69 atoms in block 44 Block first atom: 3254 Blocpdb> 83 atoms in block 45 Block first atom: 3323 Blocpdb> 44 atoms in block 46 Block first atom: 3406 Blocpdb> 79 atoms in block 47 Block first atom: 3450 Blocpdb> 69 atoms in block 48 Block first atom: 3529 Blocpdb> 81 atoms in block 49 Block first atom: 3598 Blocpdb> 88 atoms in block 50 Block first atom: 3679 Blocpdb> 72 atoms in block 51 Block first atom: 3767 Blocpdb> 75 atoms in block 52 Block first atom: 3839 Blocpdb> 74 atoms in block 53 Block first atom: 3914 Blocpdb> 73 atoms in block 54 Block first atom: 3988 Blocpdb> 79 atoms in block 55 Block first atom: 4061 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 4140 Blocpdb> 79 atoms in block 57 Block first atom: 4212 Blocpdb> 68 atoms in block 58 Block first atom: 4291 Blocpdb> 83 atoms in block 59 Block first atom: 4359 Blocpdb> 75 atoms in block 60 Block first atom: 4442 Blocpdb> 78 atoms in block 61 Block first atom: 4517 Blocpdb> 76 atoms in block 62 Block first atom: 4595 Blocpdb> 79 atoms in block 63 Block first atom: 4671 Blocpdb> 80 atoms in block 64 Block first atom: 4750 Blocpdb> 81 atoms in block 65 Block first atom: 4830 Blocpdb> 72 atoms in block 66 Block first atom: 4911 Blocpdb> 79 atoms in block 67 Block first atom: 4983 Blocpdb> 85 atoms in block 68 Block first atom: 5062 Blocpdb> 67 atoms in block 69 Block first atom: 5147 Blocpdb> 67 atoms in block 70 Block first atom: 5214 Blocpdb> 85 atoms in block 71 Block first atom: 5281 Blocpdb> 70 atoms in block 72 Block first atom: 5366 Blocpdb> 74 atoms in block 73 Block first atom: 5436 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 5510 Blocpdb> 70 atoms in block 75 Block first atom: 5577 Blocpdb> 80 atoms in block 76 Block first atom: 5647 Blocpdb> 67 atoms in block 77 Block first atom: 5727 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 5794 Blocpdb> 72 atoms in block 79 Block first atom: 5842 Blocpdb> 73 atoms in block 80 Block first atom: 5914 Blocpdb> 68 atoms in block 81 Block first atom: 5987 Blocpdb> 70 atoms in block 82 Block first atom: 6055 Blocpdb> 89 atoms in block 83 Block first atom: 6125 Blocpdb> 74 atoms in block 84 Block first atom: 6214 Blocpdb> 75 atoms in block 85 Block first atom: 6288 Blocpdb> 88 atoms in block 86 Block first atom: 6363 Blocpdb> 77 atoms in block 87 Block first atom: 6451 Blocpdb> 79 atoms in block 88 Block first atom: 6528 Blocpdb> 74 atoms in block 89 Block first atom: 6607 Blocpdb> 68 atoms in block 90 Block first atom: 6681 Blocpdb> 77 atoms in block 91 Block first atom: 6749 Blocpdb> 79 atoms in block 92 Block first atom: 6826 Blocpdb> 74 atoms in block 93 Block first atom: 6905 Blocpdb> 75 atoms in block 94 Block first atom: 6979 Blocpdb> 91 atoms in block 95 Block first atom: 7054 Blocpdb> 75 atoms in block 96 Block first atom: 7145 Blocpdb> 76 atoms in block 97 Block first atom: 7220 Blocpdb> 71 atoms in block 98 Block first atom: 7296 Blocpdb> 76 atoms in block 99 Block first atom: 7367 Blocpdb> 69 atoms in block 100 Block first atom: 7443 Blocpdb> 88 atoms in block 101 Block first atom: 7512 Blocpdb> 68 atoms in block 102 Block first atom: 7600 Blocpdb> 77 atoms in block 103 Block first atom: 7668 Blocpdb> 69 atoms in block 104 Block first atom: 7745 Blocpdb> 84 atoms in block 105 Block first atom: 7814 Blocpdb> 78 atoms in block 106 Block first atom: 7898 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7976 Blocpdb> 82 atoms in block 108 Block first atom: 8046 Blocpdb> 81 atoms in block 109 Block first atom: 8128 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 8209 Blocpdb> 76 atoms in block 111 Block first atom: 8287 Blocpdb> 77 atoms in block 112 Block first atom: 8363 Blocpdb> 82 atoms in block 113 Block first atom: 8440 Blocpdb> 81 atoms in block 114 Block first atom: 8522 Blocpdb> 59 atoms in block 115 Block first atom: 8603 Blocpdb> 81 atoms in block 116 Block first atom: 8662 Blocpdb> 75 atoms in block 117 Block first atom: 8743 Blocpdb> 72 atoms in block 118 Block first atom: 8818 Blocpdb> 72 atoms in block 119 Block first atom: 8890 Blocpdb> 69 atoms in block 120 Block first atom: 8962 Blocpdb> 70 atoms in block 121 Block first atom: 9031 Blocpdb> 79 atoms in block 122 Block first atom: 9101 Blocpdb> 71 atoms in block 123 Block first atom: 9180 Blocpdb> 68 atoms in block 124 Block first atom: 9251 Blocpdb> 73 atoms in block 125 Block first atom: 9319 Blocpdb> 72 atoms in block 126 Block first atom: 9392 Blocpdb> 59 atoms in block 127 Block first atom: 9464 Blocpdb> 88 atoms in block 128 Block first atom: 9523 Blocpdb> 85 atoms in block 129 Block first atom: 9611 Blocpdb> 75 atoms in block 130 Block first atom: 9696 Blocpdb> 73 atoms in block 131 Block first atom: 9771 Blocpdb> 89 atoms in block 132 Block first atom: 9844 Blocpdb> 72 atoms in block 133 Block first atom: 9933 Blocpdb> 78 atoms in block 134 Block first atom: 10005 Blocpdb> 75 atoms in block 135 Block first atom: 10083 Blocpdb> 69 atoms in block 136 Block first atom: 10158 Blocpdb> 83 atoms in block 137 Block first atom: 10227 Blocpdb> 44 atoms in block 138 Block first atom: 10310 Blocpdb> 79 atoms in block 139 Block first atom: 10354 Blocpdb> 69 atoms in block 140 Block first atom: 10433 Blocpdb> 81 atoms in block 141 Block first atom: 10502 Blocpdb> 88 atoms in block 142 Block first atom: 10583 Blocpdb> 72 atoms in block 143 Block first atom: 10671 Blocpdb> 75 atoms in block 144 Block first atom: 10743 Blocpdb> 74 atoms in block 145 Block first atom: 10818 Blocpdb> 73 atoms in block 146 Block first atom: 10892 Blocpdb> 79 atoms in block 147 Block first atom: 10965 Blocpdb> 72 atoms in block 148 Block first atom: 11044 Blocpdb> 79 atoms in block 149 Block first atom: 11116 Blocpdb> 68 atoms in block 150 Block first atom: 11195 Blocpdb> 83 atoms in block 151 Block first atom: 11263 Blocpdb> 75 atoms in block 152 Block first atom: 11346 Blocpdb> 78 atoms in block 153 Block first atom: 11421 Blocpdb> 76 atoms in block 154 Block first atom: 11499 Blocpdb> 79 atoms in block 155 Block first atom: 11575 Blocpdb> 80 atoms in block 156 Block first atom: 11654 Blocpdb> 81 atoms in block 157 Block first atom: 11734 Blocpdb> 72 atoms in block 158 Block first atom: 11815 Blocpdb> 79 atoms in block 159 Block first atom: 11887 Blocpdb> 85 atoms in block 160 Block first atom: 11966 Blocpdb> 67 atoms in block 161 Block first atom: 12051 Blocpdb> 67 atoms in block 162 Block first atom: 12118 Blocpdb> 85 atoms in block 163 Block first atom: 12185 Blocpdb> 70 atoms in block 164 Block first atom: 12270 Blocpdb> 74 atoms in block 165 Block first atom: 12340 Blocpdb> 67 atoms in block 166 Block first atom: 12414 Blocpdb> 70 atoms in block 167 Block first atom: 12481 Blocpdb> 80 atoms in block 168 Block first atom: 12551 Blocpdb> 67 atoms in block 169 Block first atom: 12631 Blocpdb> 48 atoms in block 170 Block first atom: 12698 Blocpdb> 72 atoms in block 171 Block first atom: 12746 Blocpdb> 73 atoms in block 172 Block first atom: 12818 Blocpdb> 68 atoms in block 173 Block first atom: 12891 Blocpdb> 70 atoms in block 174 Block first atom: 12959 Blocpdb> 89 atoms in block 175 Block first atom: 13029 Blocpdb> 74 atoms in block 176 Block first atom: 13118 Blocpdb> 75 atoms in block 177 Block first atom: 13192 Blocpdb> 88 atoms in block 178 Block first atom: 13267 Blocpdb> 77 atoms in block 179 Block first atom: 13355 Blocpdb> 79 atoms in block 180 Block first atom: 13432 Blocpdb> 74 atoms in block 181 Block first atom: 13511 Blocpdb> 68 atoms in block 182 Block first atom: 13585 Blocpdb> 77 atoms in block 183 Block first atom: 13653 Blocpdb> 79 atoms in block 184 Block first atom: 13729 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 91 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 44 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5605576 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 41424 Prepmat> Matrix trace = 12274500.0000 Prepmat> Last element read: 41424 41424 224.0879 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15437 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13808 RTB> Total mass = 13808.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13808 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195964.6866 RTB> 54222 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54222 Diagstd> Projected matrix trace = 195964.6866 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195964.6866 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2649340 1.3519171 1.8906549 1.9934039 2.1263162 2.1594250 2.4132702 2.5874214 2.8588153 3.0222373 3.2805524 3.2872425 3.7237180 4.6982464 5.0083367 5.0894585 5.5331853 5.7856960 5.8771445 6.9861417 7.5018278 7.9459291 8.1705954 8.5324901 8.6200194 9.1810535 9.6514273 9.8100955 9.9050952 10.9064207 11.3362036 12.2808378 12.3557636 13.5672786 13.7000826 14.2208208 14.3379168 15.1334842 15.9791665 16.0369039 16.5360748 17.5698126 18.0015281 18.1782456 19.0007629 20.4268073 21.0031221 21.2412896 21.8952163 22.0858435 22.5502638 22.5505744 23.3029944 24.1171956 24.3720357 24.9234890 25.6026707 25.7892657 26.4558882 26.7112363 27.1625610 27.5555647 27.9568732 28.1643475 28.1674810 28.6513881 29.1987556 29.9279372 30.4906666 30.6258209 32.4664306 32.5311477 32.8403051 33.2692945 33.6296315 34.1772207 34.2860591 34.5960559 35.4701877 36.2372731 36.8489771 37.8419719 38.1138444 38.9955600 40.0669664 40.3330496 40.3633527 40.5738467 41.2200335 41.2233017 42.9840118 43.3572106 44.5742869 44.5760753 44.7460234 45.2139476 45.5574535 46.2556082 46.9607355 47.4737983 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034340 0.0034341 0.0034342 0.0034346 0.0034356 122.1319282 126.2613162 149.3143043 153.3179253 158.3467669 159.5748143 168.6934634 174.6742409 183.6066167 188.7815558 196.6838817 196.8843310 209.5480730 235.3765411 243.0200137 244.9802463 255.4364611 261.1999469 263.2561139 287.0211990 297.4259282 306.1030266 310.4003005 317.1999979 318.8228228 329.0345771 337.3580306 340.1197869 341.7626566 358.6215667 365.6192885 380.5478545 381.7069570 399.9831091 401.9359690 409.5034951 411.1859892 422.4397182 434.0825632 434.8660895 441.5821340 455.1754660 460.7336863 462.9896295 473.3482756 490.7897973 497.6651264 500.4788397 508.1242243 510.3313819 515.6690826 515.6726339 524.2049835 533.2841586 536.0942914 542.1253303 549.4623198 551.4609555 558.5427947 561.2318060 565.9533532 570.0329209 574.1687852 576.2953657 576.3274239 581.2568898 586.7829037 594.0645977 599.6236308 600.9511206 618.7462109 619.3625946 622.2986688 626.3499919 629.7328289 634.8390773 635.8491058 638.7171467 646.7359809 653.6917968 659.1860354 668.0087635 670.4040955 678.1142344 687.3667357 689.6453468 689.9043713 691.7009502 697.1872730 697.2149115 711.9487862 715.0327717 724.9991246 725.0136687 726.3944264 730.1826238 732.9510996 738.5458769 744.1538367 748.2078669 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13808 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.859 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.724 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.786 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.905 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99995 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99996 1.00006 1.00001 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00003 1.00008 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99996 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 248544 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99995 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99996 1.00006 1.00001 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00003 1.00008 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99996 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23010419050363783.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23010419050363783.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 23010419050363783.atom Openam> file on opening on unit 11: 23010419050363783.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1820 First residue number = 5 Last residue number = 459 Number of atoms found = 13808 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.891 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.413 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.859 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.724 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.786 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.905 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47 Bfactors> 106 vectors, 41424 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.265000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.725 for 1820 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.012 +/- 0.01 Bfactors> = 26.917 +/- 20.14 Bfactors> Shiftng-fct= 26.905 Bfactors> Scaling-fct= 1439.045 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23010419050363783.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23010419050363783.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.1 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Chkmod> That is: 13808 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8962 0.0034 0.7659 0.0034 0.8724 0.0034 0.6964 0.0034 0.8750 0.0034 0.7428 122.1299 0.5117 126.2598 0.5712 149.3215 0.1348 153.2958 0.1700 158.3282 0.2767 159.5523 0.3395 168.6768 0.4140 174.6525 0.2006 183.6047 0.2638 188.7660 0.4612 196.6889 0.3058 196.8686 0.6128 209.5470 0.2967 235.3603 0.3571 243.0014 0.6212 244.9587 0.2277 255.4212 0.1480 261.1956 0.2738 263.2416 0.5647 287.0060 0.3563 297.4166 0.6432 306.0913 0.4043 310.3947 0.2916 317.1773 0.4402 318.8088 0.6566 329.0195 0.6153 337.3361 0.6435 340.1035 0.4457 341.7463 0.5502 358.6650 0.5542 365.6648 0.3954 380.5185 0.6061 381.7560 0.6013 400.0061 0.4668 401.9175 0.4663 409.4741 0.5980 411.1982 0.5301 422.3730 0.5698 434.0753 0.5632 434.8894 0.4413 441.6156 0.5065 455.1584 0.5797 460.6944 0.2538 462.9921 0.4343 473.3185 0.4867 490.8071 0.4588 497.6068 0.4802 500.4422 0.5479 508.1579 0.4777 510.3575 0.4606 515.6439 0.4762 515.6439 0.5926 524.1488 0.4559 533.2923 0.4813 536.0489 0.6201 542.0641 0.5773 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 23010419050363783 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom making animated gifs 11 models are in 23010419050363783.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 23010419050363783 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010419050363783.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 23010419050363783 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 23010419050363783 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010419050363783.eigenfacs 23010419050363783.atom making animated gifs 11 models are in 23010419050363783.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010419050363783.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 23010419050363783.10.pdb 23010419050363783.11.pdb 23010419050363783.7.pdb 23010419050363783.8.pdb 23010419050363783.9.pdb STDERR: real 1m14.022s user 1m13.792s sys 0m0.200s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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