CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  1RE5  ***

LOGs for ID: 23010418392238138

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 23010418392238138.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 23010418392238138.atom to be opened. Openam> File opened: 23010418392238138.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1767 First residue number = 3 Last residue number = 450 Number of atoms found = 13185 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.509440 +/- 16.874477 From: -30.668000 To: 43.460000 = 75.638523 +/- 25.899520 From: 18.622000 To: 133.983000 = 1.247961 +/- 17.737968 From: -45.129000 To: 45.654000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6707 % Filled. Pdbmat> 5247145 non-zero elements. Pdbmat> 574330 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.12 +/- 19.76 Maximum number = 128 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 1.148660E+07 Pdbmat> Larger element = 517.860 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1767 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 23010418392238138.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 23010418392238138.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 23010418392238138.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13185 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1767 residues. Blocpdb> 79 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 70 atoms in block 2 Block first atom: 80 Blocpdb> 71 atoms in block 3 Block first atom: 150 Blocpdb> 67 atoms in block 4 Block first atom: 221 Blocpdb> 61 atoms in block 5 Block first atom: 288 Blocpdb> 55 atoms in block 6 Block first atom: 349 Blocpdb> 61 atoms in block 7 Block first atom: 404 Blocpdb> 56 atoms in block 8 Block first atom: 465 Blocpdb> 62 atoms in block 9 Block first atom: 521 Blocpdb> 53 atoms in block 10 Block first atom: 583 Blocpdb> 77 atoms in block 11 Block first atom: 636 Blocpdb> 60 atoms in block 12 Block first atom: 713 Blocpdb> 70 atoms in block 13 Block first atom: 773 Blocpdb> 67 atoms in block 14 Block first atom: 843 Blocpdb> 63 atoms in block 15 Block first atom: 910 Blocpdb> 70 atoms in block 16 Block first atom: 973 Blocpdb> 75 atoms in block 17 Block first atom: 1043 Blocpdb> 63 atoms in block 18 Block first atom: 1118 Blocpdb> 58 atoms in block 19 Block first atom: 1181 Blocpdb> 85 atoms in block 20 Block first atom: 1239 Blocpdb> 77 atoms in block 21 Block first atom: 1324 Blocpdb> 53 atoms in block 22 Block first atom: 1401 Blocpdb> 59 atoms in block 23 Block first atom: 1454 Blocpdb> 67 atoms in block 24 Block first atom: 1513 Blocpdb> 79 atoms in block 25 Block first atom: 1580 Blocpdb> 81 atoms in block 26 Block first atom: 1659 Blocpdb> 54 atoms in block 27 Block first atom: 1740 Blocpdb> 69 atoms in block 28 Block first atom: 1794 Blocpdb> 64 atoms in block 29 Block first atom: 1863 Blocpdb> 61 atoms in block 30 Block first atom: 1927 Blocpdb> 53 atoms in block 31 Block first atom: 1988 Blocpdb> 62 atoms in block 32 Block first atom: 2041 Blocpdb> 62 atoms in block 33 Block first atom: 2103 Blocpdb> 77 atoms in block 34 Block first atom: 2165 Blocpdb> 80 atoms in block 35 Block first atom: 2242 Blocpdb> 64 atoms in block 36 Block first atom: 2322 Blocpdb> 66 atoms in block 37 Block first atom: 2386 Blocpdb> 60 atoms in block 38 Block first atom: 2452 Blocpdb> 80 atoms in block 39 Block first atom: 2512 Blocpdb> 62 atoms in block 40 Block first atom: 2592 Blocpdb> 66 atoms in block 41 Block first atom: 2654 Blocpdb> 80 atoms in block 42 Block first atom: 2720 Blocpdb> 57 atoms in block 43 Block first atom: 2800 Blocpdb> 73 atoms in block 44 Block first atom: 2857 Blocpdb> 68 atoms in block 45 Block first atom: 2930 Blocpdb> 67 atoms in block 46 Block first atom: 2998 Blocpdb> 68 atoms in block 47 Block first atom: 3065 Blocpdb> 73 atoms in block 48 Block first atom: 3133 Blocpdb> 63 atoms in block 49 Block first atom: 3206 Blocpdb> 79 atoms in block 50 Block first atom: 3269 Blocpdb> 70 atoms in block 51 Block first atom: 3348 Blocpdb> 71 atoms in block 52 Block first atom: 3418 Blocpdb> 67 atoms in block 53 Block first atom: 3489 Blocpdb> 61 atoms in block 54 Block first atom: 3556 Blocpdb> 55 atoms in block 55 Block first atom: 3617 Blocpdb> 61 atoms in block 56 Block first atom: 3672 Blocpdb> 56 atoms in block 57 Block first atom: 3733 Blocpdb> 62 atoms in block 58 Block first atom: 3789 Blocpdb> 53 atoms in block 59 Block first atom: 3851 Blocpdb> 77 atoms in block 60 Block first atom: 3904 Blocpdb> 60 atoms in block 61 Block first atom: 3981 Blocpdb> 70 atoms in block 62 Block first atom: 4041 Blocpdb> 67 atoms in block 63 Block first atom: 4111 Blocpdb> 63 atoms in block 64 Block first atom: 4178 Blocpdb> 70 atoms in block 65 Block first atom: 4241 Blocpdb> 75 atoms in block 66 Block first atom: 4311 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4386 Blocpdb> 58 atoms in block 68 Block first atom: 4449 Blocpdb> 85 atoms in block 69 Block first atom: 4507 Blocpdb> 77 atoms in block 70 Block first atom: 4592 Blocpdb> 53 atoms in block 71 Block first atom: 4669 Blocpdb> 59 atoms in block 72 Block first atom: 4722 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 4781 Blocpdb> 79 atoms in block 74 Block first atom: 4848 Blocpdb> 81 atoms in block 75 Block first atom: 4927 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 5008 Blocpdb> 69 atoms in block 77 Block first atom: 5062 Blocpdb> 64 atoms in block 78 Block first atom: 5131 Blocpdb> 61 atoms in block 79 Block first atom: 5195 Blocpdb> 65 atoms in block 80 Block first atom: 5256 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 5321 Blocpdb> 66 atoms in block 82 Block first atom: 5375 Blocpdb> 73 atoms in block 83 Block first atom: 5441 Blocpdb> 75 atoms in block 84 Block first atom: 5514 Blocpdb> 73 atoms in block 85 Block first atom: 5589 Blocpdb> 63 atoms in block 86 Block first atom: 5662 Blocpdb> 66 atoms in block 87 Block first atom: 5725 Blocpdb> 75 atoms in block 88 Block first atom: 5791 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 5866 Blocpdb> 64 atoms in block 90 Block first atom: 5930 Blocpdb> 78 atoms in block 91 Block first atom: 5994 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 6072 Blocpdb> 75 atoms in block 93 Block first atom: 6133 Blocpdb> 65 atoms in block 94 Block first atom: 6208 Blocpdb> 62 atoms in block 95 Block first atom: 6273 Blocpdb> 77 atoms in block 96 Block first atom: 6335 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 6412 Blocpdb> 75 atoms in block 98 Block first atom: 6485 Blocpdb> 6 atoms in block 99 Block first atom: 6560 Blocpdb> 79 atoms in block 100 Block first atom: 6566 Blocpdb> 70 atoms in block 101 Block first atom: 6645 Blocpdb> 71 atoms in block 102 Block first atom: 6715 Blocpdb> 67 atoms in block 103 Block first atom: 6786 Blocpdb> 61 atoms in block 104 Block first atom: 6853 Blocpdb> 55 atoms in block 105 Block first atom: 6914 Blocpdb> 61 atoms in block 106 Block first atom: 6969 Blocpdb> 56 atoms in block 107 Block first atom: 7030 Blocpdb> 62 atoms in block 108 Block first atom: 7086 Blocpdb> 53 atoms in block 109 Block first atom: 7148 Blocpdb> 77 atoms in block 110 Block first atom: 7201 Blocpdb> 60 atoms in block 111 Block first atom: 7278 Blocpdb> 70 atoms in block 112 Block first atom: 7338 Blocpdb> 67 atoms in block 113 Block first atom: 7408 Blocpdb> 63 atoms in block 114 Block first atom: 7475 Blocpdb> 70 atoms in block 115 Block first atom: 7538 Blocpdb> 75 atoms in block 116 Block first atom: 7608 Blocpdb> 63 atoms in block 117 Block first atom: 7683 Blocpdb> 58 atoms in block 118 Block first atom: 7746 Blocpdb> 85 atoms in block 119 Block first atom: 7804 Blocpdb> 77 atoms in block 120 Block first atom: 7889 Blocpdb> 53 atoms in block 121 Block first atom: 7966 Blocpdb> 59 atoms in block 122 Block first atom: 8019 Blocpdb> 67 atoms in block 123 Block first atom: 8078 Blocpdb> 79 atoms in block 124 Block first atom: 8145 Blocpdb> 81 atoms in block 125 Block first atom: 8224 Blocpdb> 54 atoms in block 126 Block first atom: 8305 Blocpdb> 69 atoms in block 127 Block first atom: 8359 Blocpdb> 64 atoms in block 128 Block first atom: 8428 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 8492 Blocpdb> 65 atoms in block 130 Block first atom: 8541 Blocpdb> 51 atoms in block 131 Block first atom: 8606 Blocpdb> 65 atoms in block 132 Block first atom: 8657 Blocpdb> 72 atoms in block 133 Block first atom: 8722 Blocpdb> 75 atoms in block 134 Block first atom: 8794 Blocpdb> 76 atoms in block 135 Block first atom: 8869 Blocpdb> 64 atoms in block 136 Block first atom: 8945 Blocpdb> 64 atoms in block 137 Block first atom: 9009 Blocpdb> 74 atoms in block 138 Block first atom: 9073 Blocpdb> 67 atoms in block 139 Block first atom: 9147 Blocpdb> 60 atoms in block 140 Block first atom: 9214 Blocpdb> 77 atoms in block 141 Block first atom: 9274 Blocpdb> 66 atoms in block 142 Block first atom: 9351 Blocpdb> 75 atoms in block 143 Block first atom: 9417 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 9492 Blocpdb> 60 atoms in block 145 Block first atom: 9556 Blocpdb> 77 atoms in block 146 Block first atom: 9616 Blocpdb> 70 atoms in block 147 Block first atom: 9693 Blocpdb> 79 atoms in block 148 Block first atom: 9763 Blocpdb> 13 atoms in block 149 Block first atom: 9842 Blocpdb> 79 atoms in block 150 Block first atom: 9855 Blocpdb> 70 atoms in block 151 Block first atom: 9934 Blocpdb> 71 atoms in block 152 Block first atom: 10004 Blocpdb> 67 atoms in block 153 Block first atom: 10075 Blocpdb> 61 atoms in block 154 Block first atom: 10142 Blocpdb> 55 atoms in block 155 Block first atom: 10203 Blocpdb> 61 atoms in block 156 Block first atom: 10258 Blocpdb> 56 atoms in block 157 Block first atom: 10319 Blocpdb> 62 atoms in block 158 Block first atom: 10375 Blocpdb> 53 atoms in block 159 Block first atom: 10437 Blocpdb> 77 atoms in block 160 Block first atom: 10490 Blocpdb> 60 atoms in block 161 Block first atom: 10567 Blocpdb> 70 atoms in block 162 Block first atom: 10627 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 10697 Blocpdb> 63 atoms in block 164 Block first atom: 10764 Blocpdb> 70 atoms in block 165 Block first atom: 10827 Blocpdb> 75 atoms in block 166 Block first atom: 10897 Blocpdb> 63 atoms in block 167 Block first atom: 10972 Blocpdb> 58 atoms in block 168 Block first atom: 11035 Blocpdb> 85 atoms in block 169 Block first atom: 11093 Blocpdb> 77 atoms in block 170 Block first atom: 11178 Blocpdb> 53 atoms in block 171 Block first atom: 11255 Blocpdb> 59 atoms in block 172 Block first atom: 11308 Blocpdb> 67 atoms in block 173 Block first atom: 11367 Blocpdb> 79 atoms in block 174 Block first atom: 11434 Blocpdb> 81 atoms in block 175 Block first atom: 11513 Blocpdb> 54 atoms in block 176 Block first atom: 11594 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 11648 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 11717 Blocpdb> 65 atoms in block 179 Block first atom: 11781 Blocpdb> 55 atoms in block 180 Block first atom: 11846 Blocpdb> 57 atoms in block 181 Block first atom: 11901 Blocpdb> 62 atoms in block 182 Block first atom: 11958 Blocpdb> 62 atoms in block 183 Block first atom: 12020 Blocpdb> 77 atoms in block 184 Block first atom: 12082 Blocpdb> 80 atoms in block 185 Block first atom: 12159 Blocpdb> 64 atoms in block 186 Block first atom: 12239 Blocpdb> 66 atoms in block 187 Block first atom: 12303 Blocpdb> 60 atoms in block 188 Block first atom: 12369 Blocpdb> 80 atoms in block 189 Block first atom: 12429 Blocpdb> 62 atoms in block 190 Block first atom: 12509 Blocpdb> 66 atoms in block 191 Block first atom: 12571 Blocpdb> 80 atoms in block 192 Block first atom: 12637 Blocpdb> 57 atoms in block 193 Block first atom: 12717 Blocpdb> 73 atoms in block 194 Block first atom: 12774 Blocpdb> 68 atoms in block 195 Block first atom: 12847 Blocpdb> 67 atoms in block 196 Block first atom: 12915 Blocpdb> 68 atoms in block 197 Block first atom: 12982 Blocpdb> 73 atoms in block 198 Block first atom: 13050 Blocpdb> 63 atoms in block 199 Block first atom: 13122 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5247344 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39555 Prepmat> Matrix trace = 11486600.0000 Prepmat> Last element read: 39555 39555 50.6686 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 18192 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13185 RTB> Total mass = 13185.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13185 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 207639.6118 RTB> 58503 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58503 Diagstd> Projected matrix trace = 207639.6118 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 207639.6118 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1949409 1.6295039 1.8367120 1.9723293 2.2673577 2.3552818 2.9205656 3.0952382 3.2827293 4.0548518 4.4642262 5.0787765 5.6937832 6.0640881 6.6541521 6.7753263 7.0637892 7.5660328 8.0083177 8.0970014 8.3388574 8.6465361 9.0171938 9.1743769 9.7991247 10.6828555 11.0362200 11.6007556 11.8286740 12.0098962 12.3371102 12.7503451 13.0324513 14.0546230 14.1219682 14.5215660 14.6955318 15.2686862 15.8407934 16.0068618 16.5046345 16.9917574 17.3879928 18.0245648 18.5529864 19.6532468 19.6867078 20.6659117 22.0319122 22.1134568 22.6390416 23.0314925 23.2633206 23.8039088 24.9391857 24.9975724 25.2477507 25.9910181 26.3560090 26.7584424 26.9383252 27.1076572 27.4178502 28.5850117 28.8932770 29.2758596 29.6246275 29.7400848 30.2582786 30.5423696 31.3091949 31.4636817 31.8941032 32.6046889 33.0471012 33.1543889 33.5046695 33.9296050 34.3235830 35.2631608 35.9025717 36.1138462 36.5707111 37.4828882 38.2126887 39.0662488 39.2732128 39.9516324 40.3183685 40.4931963 40.5161277 40.6500608 41.2085323 41.3283606 42.0871482 42.3243756 43.0016768 43.0362477 43.3215429 43.8293860 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034320 0.0034329 0.0034333 0.0034345 0.0034347 118.7048592 138.6190699 147.1688214 152.5053188 163.5141358 166.6543745 185.5789720 191.0479216 196.7491284 218.6667607 229.4396000 244.7230242 259.1169036 267.4102393 280.1184033 282.6574174 288.6118420 298.6959881 307.3023832 308.9992232 313.5801424 319.3128229 326.0851198 328.9149156 339.9295527 354.9269334 360.7492644 369.8608981 373.4765263 376.3265909 381.4187176 387.7539673 392.0201002 407.1035422 408.0777309 413.8109770 416.2822886 424.3225521 432.1989877 434.4585798 441.1621406 447.6250991 452.8141674 461.0283942 467.7375042 481.4070363 481.8166767 493.6538920 509.7079138 510.6503089 516.6831504 521.1422953 523.7585590 529.8091068 542.2960177 542.9304476 545.6405363 553.6138240 557.4874609 561.7275117 563.6124473 565.3810819 568.6067094 580.5832031 583.7053590 587.5571399 591.0466083 592.1972439 597.3342115 600.1318058 607.6188386 609.1160601 613.2682453 620.0622768 624.2549075 625.2674112 628.5617504 632.5351764 636.1969586 644.8458344 650.6659183 652.5775847 656.6923892 664.8318301 671.2728438 678.7285787 680.5240778 686.3767194 689.5198216 691.0131461 691.2087796 692.3502922 697.0900019 698.1027830 704.4822091 706.4648528 712.0950645 712.3812485 714.7386015 718.9157095 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13185 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9854E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.630 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.283 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.566 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.017 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.799 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.83 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 237330 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23010418392238138.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23010418392238138.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 23010418392238138.atom Openam> file on opening on unit 11: 23010418392238138.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1767 First residue number = 3 Last residue number = 450 Number of atoms found = 13185 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9854E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.630 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.095 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.283 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.566 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.647 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.017 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.799 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.83 Bfactors> 106 vectors, 39555 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.195000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.838 for 1767 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.012 +/- 0.01 Bfactors> = 38.925 +/- 21.64 Bfactors> Shiftng-fct= 38.914 Bfactors> Scaling-fct= 1672.199 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23010418392238138.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23010418392238138.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.9 Chkmod> 106 vectors, 39555 coordinates in file. Chkmod> That is: 13185 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7429 0.0034 0.8464 0.0034 0.7749 0.0034 0.8254 0.0034 0.9184 0.0034 0.9701 118.7027 0.2055 138.6342 0.3783 147.1740 0.2774 152.4860 0.4238 163.4942 0.3039 166.6373 0.3384 185.5848 0.3776 191.0324 0.3190 196.7488 0.3169 218.6614 0.4293 229.4239 0.4241 244.7179 0.2423 259.1107 0.2688 267.3968 0.2000 280.1032 0.5295 282.6385 0.4507 288.6038 0.3993 298.6825 0.3642 307.2831 0.5352 308.9859 0.4399 313.5694 0.6093 319.3077 0.6490 326.0676 0.5064 328.8940 0.5572 339.9128 0.5494 354.8643 0.6258 360.7956 0.6745 369.8330 0.7113 373.4814 0.6040 376.3121 0.5857 381.4470 0.5165 387.7321 0.4698 391.9664 0.5304 407.0191 0.4124 408.0318 0.4925 413.7709 0.5342 416.3277 0.5587 424.3226 0.4091 432.1696 0.3536 434.4825 0.3712 441.0813 0.5344 447.5827 0.4525 452.8209 0.4660 460.9502 0.4559 467.6798 0.4189 481.3466 0.4370 481.8363 0.5111 493.6815 0.4859 509.6639 0.6180 510.5885 0.6085 516.6719 0.5557 521.1030 0.3663 523.6987 0.4208 529.7429 0.5957 542.2816 0.4907 542.9335 0.5343 545.6414 0.5911 553.5792 0.4006 557.5057 0.5144 561.7197 0.5113 563.6058 0.2224 565.3812 0.6902 568.6046 0.5844 580.6089 0.5031 583.6472 0.5521 587.5735 0.5396 590.9751 0.4826 592.1710 0.4540 597.3256 0.5007 600.0828 0.4146 607.6006 0.4318 609.0543 0.5179 613.2025 0.4728 619.9911 0.5494 624.2555 0.3855 625.1992 0.4427 628.4910 0.4000 632.5117 0.4583 636.1364 0.5149 644.7893 0.4384 650.6147 0.5014 652.5148 0.5688 656.6578 0.3480 664.7777 0.5657 671.2204 0.3018 678.7320 0.5331 680.4670 0.4318 686.3332 0.4751 689.5042 0.4970 690.9562 0.5495 691.2121 0.5672 692.3201 0.4586 697.0725 0.4245 698.0867 0.4067 704.4758 0.5501 706.3980 0.4913 712.0506 0.5143 712.3817 0.4891 714.6952 0.3430 718.8899 0.4830 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 23010418392238138 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom making animated gifs 11 models are in 23010418392238138.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 23010418392238138 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom making animated gifs 11 models are in 23010418392238138.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 23010418392238138 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom making animated gifs 11 models are in 23010418392238138.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 23010418392238138 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom making animated gifs 11 models are in 23010418392238138.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 23010418392238138 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=0 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=20 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=40 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=60 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=80 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom calculating perturbed structure for DQ=100 23010418392238138.eigenfacs 23010418392238138.atom making animated gifs 11 models are in 23010418392238138.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23010418392238138.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 23010418392238138.10.pdb 23010418392238138.11.pdb 23010418392238138.7.pdb 23010418392238138.8.pdb 23010418392238138.9.pdb STDERR: real 1m8.746s user 1m8.368s sys 0m0.272s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.