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***  struct  ***

LOGs for ID: 22123022351880756

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22123022351880756.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22123022351880756.atom to be opened. Openam> File opened: 22123022351880756.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 386 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 3048 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.973080 +/- 12.667476 From: -30.858000 To: 34.734000 = -3.882707 +/- 20.255456 From: -42.572000 To: 34.742000 = -1.426198 +/- 9.308399 From: -23.349000 To: 29.171000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6351 % Filled. Pdbmat> 1101743 non-zero elements. Pdbmat> 120405 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.01 +/- 24.74 Maximum number = 133 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 2.408100E+06 Pdbmat> Larger element = 493.948 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 386 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22123022351880756.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22123022351880756.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22123022351880756.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3048 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 386 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 30 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 44 Blocpdb> 13 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 73 Blocpdb> 13 atoms in block 7 Block first atom: 89 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 102 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 120 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 138 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 156 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 176 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 195 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 214 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 227 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 241 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 257 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 271 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 285 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 299 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 315 Blocpdb> 11 atoms in block 22 Block first atom: 333 Blocpdb> 13 atoms in block 23 Block first atom: 344 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 357 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 372 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 386 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 398 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 415 Blocpdb> 13 atoms in block 29 Block first atom: 431 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 444 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 460 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 474 Blocpdb> 12 atoms in block 33 Block first atom: 491 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 503 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 521 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 535 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 550 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 564 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 578 Blocpdb> 10 atoms in block 40 Block first atom: 591 Blocpdb> 18 atoms in block 41 Block first atom: 601 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 619 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 633 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 651 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 669 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 683 Blocpdb> 14 atoms in block 47 Block first atom: 698 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 712 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 730 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 745 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 764 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 779 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 795 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 807 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 827 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 841 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 856 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 872 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 883 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 902 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 918 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 931 Blocpdb> 12 atoms in block 63 Block first atom: 944 Blocpdb> 12 atoms in block 64 Block first atom: 956 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 968 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 987 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 998 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1011 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1027 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1042 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1060 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1076 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 1092 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1103 Blocpdb> 18 atoms in block 75 Block first atom: 1123 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1141 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1160 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1176 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1192 Blocpdb> 12 atoms in block 80 Block first atom: 1211 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1223 Blocpdb> 15 atoms in block 82 Block first atom: 1243 Blocpdb> 14 atoms in block 83 Block first atom: 1258 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1272 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1292 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1307 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1324 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1337 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1358 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1371 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1383 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 1399 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1415 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1429 Blocpdb> 11 atoms in block 95 Block first atom: 1448 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1459 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1480 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 1494 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 1509 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1526 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1548 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 1562 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1582 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1601 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 1618 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1636 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1652 Blocpdb> 13 atoms in block 108 Block first atom: 1667 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1680 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1695 Blocpdb> 13 atoms in block 111 Block first atom: 1712 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1725 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 1738 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1757 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1771 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1786 Blocpdb> 13 atoms in block 117 Block first atom: 1801 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1814 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 1829 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1850 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1862 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1881 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1891 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1907 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1923 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 1938 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1960 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 1977 Blocpdb> 16 atoms in block 129 Block first atom: 1997 Blocpdb> 22 atoms in block 130 Block first atom: 2013 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 2035 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2051 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 2067 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2084 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 2097 Blocpdb> 17 atoms in block 136 Block first atom: 2117 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2134 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2148 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2161 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 2176 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2190 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2206 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2221 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 2236 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2251 Blocpdb> 16 atoms in block 146 Block first atom: 2270 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2286 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 2301 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2320 Blocpdb> 15 atoms in block 150 Block first atom: 2337 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2352 Blocpdb> 12 atoms in block 152 Block first atom: 2367 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2379 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2396 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2412 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 2425 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2440 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2454 Blocpdb> 26 atoms in block 159 Block first atom: 2470 Blocpdb> 12 atoms in block 160 Block first atom: 2496 Blocpdb> 10 atoms in block 161 Block first atom: 2508 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2518 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2534 Blocpdb> 11 atoms in block 164 Block first atom: 2548 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2559 Blocpdb> 16 atoms in block 166 Block first atom: 2574 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 2590 Blocpdb> 11 atoms in block 168 Block first atom: 2609 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 2620 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 2637 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 2654 Blocpdb> 21 atoms in block 172 Block first atom: 2672 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 2693 Blocpdb> 13 atoms in block 174 Block first atom: 2713 Blocpdb> 22 atoms in block 175 Block first atom: 2726 Blocpdb> 12 atoms in block 176 Block first atom: 2748 Blocpdb> 14 atoms in block 177 Block first atom: 2760 Blocpdb> 22 atoms in block 178 Block first atom: 2774 Blocpdb> 11 atoms in block 179 Block first atom: 2796 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 2807 Blocpdb> 20 atoms in block 181 Block first atom: 2828 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2848 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 2865 Blocpdb> 13 atoms in block 184 Block first atom: 2881 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 2894 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 2911 Blocpdb> 16 atoms in block 187 Block first atom: 2927 Blocpdb> 17 atoms in block 188 Block first atom: 2943 Blocpdb> 21 atoms in block 189 Block first atom: 2960 Blocpdb> 15 atoms in block 190 Block first atom: 2981 Blocpdb> 16 atoms in block 191 Block first atom: 2996 Blocpdb> 20 atoms in block 192 Block first atom: 3012 Blocpdb> 17 atoms in block 193 Block first atom: 3031 Blocpdb> 193 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1101936 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9144 Prepmat> Matrix trace = 2408100.0000 Prepmat> Last element read: 9144 9144 207.2918 Prepmat> 18722 lines saved. Prepmat> 16762 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3048 RTB> Total mass = 3048.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3048 RTB> Number of blocks = 193 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 254882.6368 RTB> 67618 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1158 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67618 Diagstd> Projected matrix trace = 254882.6368 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1158 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 254882.6368 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0583958 0.0862740 0.2653723 0.3948102 0.7068261 0.7788848 0.9942454 1.1332812 1.2940961 1.7970974 2.3962226 2.6430481 3.1897626 3.7341293 4.0373128 4.8269266 5.2135632 5.8055187 6.6940857 7.0814664 7.6414898 8.5314240 8.9153252 9.1181840 9.2401616 9.9446119 10.4451582 11.3887117 11.7351242 12.5423445 12.7880012 13.3567116 13.5522712 13.9601789 14.0862014 14.7831542 15.0441495 15.2326548 15.6637750 16.3242162 16.7683074 17.6498830 17.7673913 18.4767942 18.7054488 19.4209665 20.5035459 20.9910675 21.2961101 21.6649491 22.5038660 22.9972626 23.1415762 23.4719350 24.1243319 24.2545873 24.5688883 24.9238948 26.1065304 26.4786623 26.5084761 27.5212280 27.8936720 28.5969214 28.7710800 29.3183226 29.6793334 30.3687350 30.8922743 31.3327138 31.5697069 31.7978436 31.9563605 32.7350023 33.2636095 33.5686119 33.9865870 34.4591728 35.4227587 35.5936953 35.6595513 37.2856328 37.6669898 37.7287218 38.0258481 38.4593839 39.4589199 39.5562974 39.8571822 40.2076709 40.7809279 40.9952748 41.3632228 42.5922913 42.9975121 43.6322953 44.0870898 44.7572822 45.2701158 45.4000613 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034330 0.0034332 0.0034336 0.0034338 0.0034339 26.2413404 31.8959352 55.9400750 68.2322176 91.2959598 95.8367074 108.2784620 115.6016741 123.5317359 145.5730848 168.0965739 176.5419084 193.9431585 209.8408117 218.1933340 238.5781293 247.9491377 261.6470213 280.9576841 288.9727422 300.1817595 317.1801820 324.2379721 327.9060705 330.0920497 342.4437153 350.9560960 366.4650653 371.9967323 384.5781833 388.3261299 396.8670600 399.7618276 405.7334104 407.5606325 417.5214902 421.1910181 423.8215943 429.7773255 438.7442612 444.6721132 456.2114656 457.7276144 466.7760786 469.6554285 478.5537237 491.7108227 497.5222897 501.1242535 505.4452464 515.1383082 520.7548851 522.3862634 526.1017267 533.3630530 534.8010171 538.2549512 542.1297430 554.8426772 558.7831491 559.0976425 569.6776544 573.5194157 580.7041380 582.4697324 587.9830951 591.5920802 598.4234878 603.5596827 607.8470118 610.1414853 612.3420936 613.8665034 621.3001639 626.2964742 629.1612576 633.0660988 637.4523172 646.3034445 647.8609738 648.4600376 663.0801687 666.4625297 667.0084352 669.6297423 673.4361749 682.1311417 682.9723107 685.5649035 688.5726021 693.4638588 695.2839130 698.3971604 708.6973071 712.0605808 717.2974886 721.0261176 726.4858063 730.6360271 731.6839015 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3048 Rtb_to_modes> Number of blocs = 193 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8396E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6274E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.294 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.037 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.827 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.806 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.118 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1158 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99996 0.99998 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54864 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99996 0.99998 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22123022351880756.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22123022351880756.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22123022351880756.atom Openam> file on opening on unit 11: 22123022351880756.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 386 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 3048 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8396E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6274E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.294 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.037 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.827 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.806 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.118 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40 Bfactors> 106 vectors, 9144 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.058396 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.444 for 386 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.235 +/- 1.47 Bfactors> = 87.285 +/- 14.60 Bfactors> Shiftng-fct= 87.050 Bfactors> Scaling-fct= 9.914 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22123022351880756.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22123022351880756.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.6 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vecteur en lecture: 612.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7 Chkmod> 106 vectors, 9144 coordinates in file. Chkmod> That is: 3048 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 56 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9196 0.0034 0.7772 0.0034 0.9279 0.0034 0.8328 0.0034 0.8549 0.0034 0.7391 26.2403 0.0135 31.8946 0.0268 55.9406 0.6948 68.2284 0.3934 91.2904 0.0934 95.8335 0.1986 108.2713 0.2526 115.5824 0.0867 123.5218 0.2068 145.5629 0.3797 168.0815 0.1530 176.5327 0.2451 193.9420 0.5328 209.8282 0.7274 218.1755 0.0509 238.5697 0.3511 247.9489 0.3850 261.6466 0.1244 280.9438 0.0126 288.9508 0.3341 300.1593 0.4037 317.1587 0.1903 324.2181 0.4233 327.8887 0.2154 330.0750 0.4000 342.4357 0.2997 351.0224 0.1628 366.4701 0.1579 372.0580 0.1498 384.5257 0.2668 388.3398 0.3910 396.8989 0.2391 399.7112 0.2105 405.7134 0.2275 407.5981 0.4011 417.4590 0.1767 421.1148 0.3692 423.7665 0.0293 429.7071 0.4049 438.6688 0.3096 444.6755 0.4340 456.1934 0.3365 457.7416 0.4705 466.7965 0.1801 469.6924 0.5120 478.5213 0.3939 491.6472 0.2791 497.4883 0.2969 501.1485 0.4224 505.3658 0.1317 515.0719 0.4580 520.7635 0.3846 522.3460 0.4481 526.0575 0.2035 533.2923 0.3434 534.7275 0.3165 538.2440 0.3953 542.0641 0.1953 554.8557 0.3208 558.7733 0.1844 559.0897 0.2352 569.6405 0.4064 573.4570 0.3300 580.7105 0.3395 582.4338 0.2892 587.9747 0.2820 591.5733 0.1297 598.4103 0.2315 603.5116 0.1996 607.7946 0.1920 610.1181 0.3002 612.3366 0.3369 613.8751 0.2273 621.3209 0.4325 626.2356 0.2786 629.1473 0.3158 633.0707 0.4487 637.4326 0.1635 646.2505 0.3269 647.7995 0.2952 648.4363 0.2398 663.0905 0.2065 666.4605 0.3860 666.9911 0.3874 669.6376 0.4080 673.4127 0.2518 682.1112 0.3641 682.9750 0.4919 685.5597 0.4123 688.5630 0.1643 693.4262 0.3901 695.2941 0.3781 698.3400 0.3319 708.6478 0.4029 712.0506 0.3083 717.2478 0.3825 721.0190 0.4290 726.4767 0.3118 730.6037 0.4443 731.6520 0.2250 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022351880756 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022351880756.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022351880756.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022351880756 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom making animated gifs 11 models are in 22123022351880756.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022351880756.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022351880756.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022351880756 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022351880756.eigenfacs 22123022351880756.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022351880756.eigenfacs 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