CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  EUTLA  ***

LOGs for ID: 22123022061855342

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22123022061855342.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22123022061855342.atom to be opened. Openam> File opened: 22123022061855342.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 578 First residue number = 7 Last residue number = 295 Number of atoms found = 4581 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 55.476188 +/- 13.359956 From: 21.857000 To: 87.328000 = 24.507522 +/- 12.915420 From: -9.251000 To: 56.402000 = 27.439933 +/- 15.928007 From: -6.835000 To: 60.759000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8562 % Filled. Pdbmat> 1753018 non-zero elements. Pdbmat> 191758 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.72 +/- 22.26 Maximum number = 133 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 3.835160E+06 Pdbmat> Larger element = 491.239 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 578 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22123022061855342.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22123022061855342.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22123022061855342.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4581 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 578 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 34 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 23 atoms in block 3 Block first atom: 58 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 81 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 103 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 124 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 148 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 166 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 181 Blocpdb> 21 atoms in block 10 Block first atom: 199 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 220 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 248 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 272 Blocpdb> 29 atoms in block 14 Block first atom: 287 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 316 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 340 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 365 Blocpdb> 28 atoms in block 18 Block first atom: 381 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 409 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 427 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 447 Blocpdb> 28 atoms in block 22 Block first atom: 469 Blocpdb> 26 atoms in block 23 Block first atom: 497 Blocpdb> 25 atoms in block 24 Block first atom: 523 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 548 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 573 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 591 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 615 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 630 Blocpdb> 25 atoms in block 30 Block first atom: 656 Blocpdb> 27 atoms in block 31 Block first atom: 681 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 708 Blocpdb> 21 atoms in block 33 Block first atom: 727 Blocpdb> 22 atoms in block 34 Block first atom: 748 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 770 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 791 Blocpdb> 22 atoms in block 37 Block first atom: 819 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 841 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 865 Blocpdb> 19 atoms in block 40 Block first atom: 885 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 904 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 930 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 954 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 977 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 994 Blocpdb> 29 atoms in block 46 Block first atom: 1018 Blocpdb> 20 atoms in block 47 Block first atom: 1047 Blocpdb> 31 atoms in block 48 Block first atom: 1067 Blocpdb> 27 atoms in block 49 Block first atom: 1098 Blocpdb> 29 atoms in block 50 Block first atom: 1125 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 1154 Blocpdb> 26 atoms in block 52 Block first atom: 1178 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1204 Blocpdb> 29 atoms in block 54 Block first atom: 1228 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 1257 Blocpdb> 25 atoms in block 56 Block first atom: 1275 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1300 Blocpdb> 32 atoms in block 58 Block first atom: 1322 Blocpdb> 25 atoms in block 59 Block first atom: 1354 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1379 Blocpdb> 28 atoms in block 61 Block first atom: 1399 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1427 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1449 Blocpdb> 22 atoms in block 64 Block first atom: 1473 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1495 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1517 Blocpdb> 20 atoms in block 67 Block first atom: 1545 Blocpdb> 25 atoms in block 68 Block first atom: 1565 Blocpdb> 25 atoms in block 69 Block first atom: 1590 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1615 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 1638 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1662 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 1680 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1708 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1735 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1759 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 1777 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1802 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1821 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1847 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 1872 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1904 Blocpdb> 23 atoms in block 83 Block first atom: 1926 Blocpdb> 25 atoms in block 84 Block first atom: 1949 Blocpdb> 31 atoms in block 85 Block first atom: 1974 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 2005 Blocpdb> 28 atoms in block 87 Block first atom: 2033 Blocpdb> 30 atoms in block 88 Block first atom: 2061 Blocpdb> 30 atoms in block 89 Block first atom: 2091 Blocpdb> 27 atoms in block 90 Block first atom: 2121 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 2148 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2162 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2191 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2210 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2232 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2260 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 2287 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2295 Blocpdb> 34 atoms in block 99 Block first atom: 2318 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 2352 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2375 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2397 Blocpdb> 24 atoms in block 103 Block first atom: 2418 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 2442 Blocpdb> 15 atoms in block 105 Block first atom: 2460 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 2475 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 2493 Blocpdb> 28 atoms in block 108 Block first atom: 2514 Blocpdb> 24 atoms in block 109 Block first atom: 2542 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 2566 Blocpdb> 29 atoms in block 111 Block first atom: 2581 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2610 Blocpdb> 25 atoms in block 113 Block first atom: 2634 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 2659 Blocpdb> 28 atoms in block 115 Block first atom: 2675 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 2703 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 2721 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2741 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 2763 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2791 Blocpdb> 25 atoms in block 121 Block first atom: 2817 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2842 Blocpdb> 18 atoms in block 123 Block first atom: 2867 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2885 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 2909 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 2950 Blocpdb> 27 atoms in block 128 Block first atom: 2975 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 3002 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 3021 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3042 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 3064 Blocpdb> 28 atoms in block 133 Block first atom: 3085 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3113 Blocpdb> 24 atoms in block 135 Block first atom: 3135 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 3159 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 3179 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 3198 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 3224 Blocpdb> 23 atoms in block 140 Block first atom: 3248 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 142 Block first atom: 3288 Blocpdb> 29 atoms in block 143 Block first atom: 3312 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3341 Blocpdb> 31 atoms in block 145 Block first atom: 3361 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 3392 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 3419 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 3448 Blocpdb> 26 atoms in block 149 Block first atom: 3472 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 3498 Blocpdb> 29 atoms in block 151 Block first atom: 3522 Blocpdb> 18 atoms in block 152 Block first atom: 3551 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 3569 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 3594 Blocpdb> 25 atoms in block 155 Block first atom: 3616 Blocpdb> 25 atoms in block 156 Block first atom: 3641 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 3666 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 3686 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3714 Blocpdb> 24 atoms in block 160 Block first atom: 3736 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3760 Blocpdb> 22 atoms in block 162 Block first atom: 3782 Blocpdb> 28 atoms in block 163 Block first atom: 3804 Blocpdb> 20 atoms in block 164 Block first atom: 3832 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 3852 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3877 Blocpdb> 23 atoms in block 167 Block first atom: 3902 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3925 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 3949 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 3967 Blocpdb> 27 atoms in block 171 Block first atom: 3995 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 4022 Blocpdb> 18 atoms in block 173 Block first atom: 4046 Blocpdb> 25 atoms in block 174 Block first atom: 4064 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 4089 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 4108 Blocpdb> 25 atoms in block 177 Block first atom: 4134 Blocpdb> 32 atoms in block 178 Block first atom: 4159 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 4191 Blocpdb> 23 atoms in block 180 Block first atom: 4213 Blocpdb> 25 atoms in block 181 Block first atom: 4236 Blocpdb> 31 atoms in block 182 Block first atom: 4261 Blocpdb> 28 atoms in block 183 Block first atom: 4292 Blocpdb> 28 atoms in block 184 Block first atom: 4320 Blocpdb> 30 atoms in block 185 Block first atom: 4348 Blocpdb> 30 atoms in block 186 Block first atom: 4378 Blocpdb> 27 atoms in block 187 Block first atom: 4408 Blocpdb> 14 atoms in block 188 Block first atom: 4435 Blocpdb> 29 atoms in block 189 Block first atom: 4449 Blocpdb> 19 atoms in block 190 Block first atom: 4478 Blocpdb> 22 atoms in block 191 Block first atom: 4497 Blocpdb> 28 atoms in block 192 Block first atom: 4519 Blocpdb> 27 atoms in block 193 Block first atom: 4547 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 4573 Blocpdb> 194 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1753212 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13743 Prepmat> Matrix trace = 3835160.0000 Prepmat> Last element read: 13743 13743 381.9659 Prepmat> 18916 lines saved. Prepmat> 16975 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4581 RTB> Total mass = 4581.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4581 RTB> Number of blocks = 194 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 254394.2646 RTB> 66930 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1164 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66930 Diagstd> Projected matrix trace = 254394.2646 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1164 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 254394.2646 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9306239 1.5802496 1.7503102 2.9960571 3.1369405 3.4556126 3.6741199 4.3110017 5.2588643 5.3124766 6.3490165 6.8277508 7.5961814 8.0344744 9.9465480 10.5954482 10.7279587 10.9899561 11.6151393 13.0747394 13.6031237 13.6891528 14.2608013 16.1431952 17.1210597 17.5212478 18.3716093 18.6898841 19.3214134 19.9793259 20.0537452 21.7395844 22.4160563 23.1570595 24.0629880 24.3746615 24.6901374 25.4993913 25.8072289 26.5068925 26.8056920 27.2037263 28.2633810 28.5465284 28.8829903 29.4900287 29.5249487 30.3305144 30.6308554 31.2366920 31.7396183 32.2080461 32.5417007 32.9658470 33.2186638 33.7347717 34.8535978 35.6782047 35.9062548 36.3758356 36.5444725 36.8431373 37.4311420 37.7083302 38.5078402 39.3607802 39.6606518 41.0898771 41.6757052 42.1057805 42.8553032 43.2752101 43.5340889 44.0074170 44.6802867 45.2082488 45.6055939 45.9894784 46.2498067 46.5462986 47.2892431 48.3475306 48.4921035 49.1936719 49.7080227 50.7486938 51.1509661 51.7271267 51.8467035 52.1868353 52.5931947 53.1422263 53.3264440 53.8773489 54.5738710 54.8922282 55.1538747 55.8854208 56.1247262 56.4255469 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034330 0.0034334 0.0034342 0.0034349 0.0034359 104.7568374 136.5080048 143.6656019 187.9621157 192.3306151 201.8635027 208.1478553 225.4677227 249.0240335 250.2901709 273.6204225 283.7488512 299.2905093 307.8038270 342.4770490 353.4719432 355.6753982 359.9923398 370.0901208 392.6556042 400.5111436 401.7756067 410.0787315 436.3048393 449.3250183 454.5459535 465.4455478 469.4599896 477.3255994 485.3842681 486.2874110 506.3151229 514.1322953 522.5609907 532.6844975 536.1231705 539.5814780 548.3529533 551.6529788 559.0809420 562.2232378 566.3820466 577.3076828 580.1922598 583.6014437 589.7023766 590.0514145 598.0467964 601.0005129 606.9148980 611.7812044 616.2791432 619.4630461 623.4869957 625.8732062 630.7164638 641.0901255 648.6296195 650.6992927 654.9403827 656.4567660 659.1337995 664.3727622 666.8281587 673.8602842 681.2823366 683.8726002 696.0856835 701.0302504 704.6381311 710.8820793 714.3562897 716.4897970 720.3743151 725.8606545 730.1366055 733.3382501 736.4182151 738.4995608 740.8629143 746.7521154 755.0616778 756.1897598 761.6402734 765.6116341 773.5844201 776.6443744 781.0061571 781.9083560 784.4689540 787.5172156 791.6170733 792.9879583 797.0735337 802.2092405 804.5456858 806.4608598 811.7915809 813.5277994 815.7050833 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4581 Rtb_to_modes> Number of blocs = 194 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.456 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.034 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.43 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 82458 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22123022061855342.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22123022061855342.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22123022061855342.atom Openam> file on opening on unit 11: 22123022061855342.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 578 First residue number = 7 Last residue number = 295 Number of atoms found = 4581 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.456 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.674 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.034 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.43 Bfactors> 106 vectors, 13743 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.930600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.596 for 579 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.025 +/- 0.02 Bfactors> = 61.003 +/- 15.42 Bfactors> Shiftng-fct= 60.978 Bfactors> Scaling-fct= 752.630 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22123022061855342.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22123022061855342.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.7 Chkmod> 106 vectors, 13743 coordinates in file. Chkmod> That is: 4581 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9171 0.0034 0.9366 0.0034 0.7284 0.0034 0.7652 0.0034 0.8789 0.0034 0.7275 104.7510 0.6899 136.4914 0.3333 143.6467 0.6028 187.9523 0.5799 192.3242 0.5670 201.8662 0.4772 208.1355 0.4503 225.4580 0.2737 249.0166 0.6313 250.2682 0.6231 273.6083 0.7605 283.7418 0.6776 299.2741 0.3988 307.7815 0.4650 342.4701 0.4919 353.5327 0.4705 355.6940 0.5713 359.9776 0.6644 370.1517 0.4857 392.5676 0.5185 400.4480 0.5540 401.7708 0.5407 410.0496 0.4430 436.2429 0.4568 449.2918 0.4397 454.5103 0.5293 465.4052 0.4900 469.4413 0.5813 477.2877 0.5896 485.3716 0.5315 486.2211 0.4647 506.2982 0.4134 514.1554 0.4329 522.5717 0.6798 532.6286 0.4933 536.0489 0.5289 539.5568 0.5597 548.3360 0.5370 551.6589 0.3566 559.0897 0.5473 562.2443 0.4283 566.3189 0.4559 577.2484 0.3700 580.2026 0.3645 583.5462 0.3620 589.6768 0.2796 589.9766 0.2348 598.0161 0.3401 600.9663 0.4098 606.9210 0.2843 611.7586 0.3325 616.2714 0.4413 619.4203 0.3362 623.4995 0.3950 625.8589 0.3479 630.6448 0.4578 641.0295 0.3692 648.6181 0.4139 650.7053 0.2973 654.9498 0.4110 656.3884 0.4561 659.0774 0.3452 664.3341 0.2651 666.8143 0.2411 673.8503 0.3851 681.2463 0.3807 683.8376 0.4235 696.0568 0.4884 701.0363 0.3921 704.6432 0.4783 710.8905 0.5428 714.3652 0.4493 716.4254 0.4828 720.3645 0.5132 725.8272 0.5632 730.1194 0.4891 733.3422 0.4824 736.3908 0.4703 738.4694 0.4106 740.8606 0.4631 746.7260 0.4372 755.0485 0.4505 756.1409 0.4912 761.5792 0.2501 765.5940 0.5500 773.5612 0.5053 776.6037 0.3678 780.9943 0.4246 781.8996 0.4801 784.4591 0.3980 787.4595 0.4414 791.5665 0.4514 792.9804 0.4906 797.0589 0.4488 802.1464 0.4282 804.4948 0.4414 806.3979 0.2510 811.7900 0.5022 813.4586 0.4300 815.7023 0.3219 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022061855342 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom making animated gifs 11 models are in 22123022061855342.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022061855342 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom making animated gifs 11 models are in 22123022061855342.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022061855342 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom making animated gifs 11 models are in 22123022061855342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022061855342 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom making animated gifs 11 models are in 22123022061855342.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22123022061855342 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22123022061855342.eigenfacs 22123022061855342.atom making animated gifs 11 models are in 22123022061855342.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22123022061855342.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22123022061855342.10.pdb 22123022061855342.11.pdb 22123022061855342.7.pdb 22123022061855342.8.pdb 22123022061855342.9.pdb STDERR: real 0m24.892s user 0m24.760s sys 0m0.064s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.