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please let us know.

* no_ter *

LOGs for ID: 22123015423170986

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 22123015423170986.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 22123015423170986.atom to be opened.

 Openam> File opened: 22123015423170986.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    236
            First residue number     =     54
            Last  residue number     =    289
            Number of atoms found    =   2167
            Mean number per residue  =      9.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.046669 +/-    10.867302 From:   -24.381000 To:    31.119000
 =    -0.852969 +/-     9.792559 From:   -26.408000 To:    19.733000
 =    -1.710099 +/-    10.464332 From:   -25.063000 To:    25.870000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.3373 % Filled.
 Pdbmat>       916667  non-zero elements.
 Pdbmat>       100425 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     92.69 +/-     26.85
         Maximum number =    148
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.008500E+06
 Pdbmat> Larger element =  589.166    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
236 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 22123015423170986.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 22123015423170986.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 22123015423170986.atom                                                                                                          

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2167 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   236 residues.
 Blocpdb>    21 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    21 atoms in block      2
 Block first atom:     22
 Blocpdb>    13 atoms in block      3
 Block first atom:     43
 Blocpdb>    12 atoms in block      4
 Block first atom:     56
 Blocpdb>    21 atoms in block      5
 Block first atom:     68
 Blocpdb>    19 atoms in block      6
 Block first atom:     89
 Blocpdb>    23 atoms in block      7
 Block first atom:    108
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    17 atoms in block      9
 Block first atom:    143
 Blocpdb>    18 atoms in block     10
 Block first atom:    160
 Blocpdb>    19 atoms in block     11
 Block first atom:    178
 Blocpdb>    19 atoms in block     12
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    18 atoms in block     13
 Block first atom:    216
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    234
 Blocpdb>    25 atoms in block     15
 Block first atom:    248
 Blocpdb>    18 atoms in block     16
 Block first atom:    273
 Blocpdb>    18 atoms in block     17
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     18
 Block first atom:    309
 Blocpdb>    20 atoms in block     19
 Block first atom:    325
 Blocpdb>    22 atoms in block     20
 Block first atom:    345
 Blocpdb>    24 atoms in block     21
 Block first atom:    367
 Blocpdb>    24 atoms in block     22
 Block first atom:    391
 Blocpdb>    20 atoms in block     23
 Block first atom:    415
 Blocpdb>    17 atoms in block     24
 Block first atom:    435
 Blocpdb>    15 atoms in block     25
 Block first atom:    452
 Blocpdb>    24 atoms in block     26
 Block first atom:    467
 Blocpdb>    19 atoms in block     27
 Block first atom:    491
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    510
 Blocpdb>    17 atoms in block     29
 Block first atom:    525
 Blocpdb>    17 atoms in block     30
 Block first atom:    542
 Blocpdb>    18 atoms in block     31
 Block first atom:    559
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    577
 Blocpdb>    19 atoms in block     33
 Block first atom:    593
 Blocpdb>    14 atoms in block     34
 Block first atom:    612
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    626
 Blocpdb>    21 atoms in block     36
 Block first atom:    641
 Blocpdb>    21 atoms in block     37
 Block first atom:    662
 Blocpdb>    18 atoms in block     38
 Block first atom:    683
 Blocpdb>    16 atoms in block     39
 Block first atom:    701
 Blocpdb>    19 atoms in block     40
 Block first atom:    717
 Blocpdb>    16 atoms in block     41
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    20 atoms in block     42
 Block first atom:    752
 Blocpdb>    18 atoms in block     43
 Block first atom:    772
 Blocpdb>    15 atoms in block     44
 Block first atom:    790
 Blocpdb>    15 atoms in block     45
 Block first atom:    805
 Blocpdb>    18 atoms in block     46
 Block first atom:    820
 Blocpdb>    15 atoms in block     47
 Block first atom:    838
 Blocpdb>    20 atoms in block     48
 Block first atom:    853
 Blocpdb>    23 atoms in block     49
 Block first atom:    873
 Blocpdb>    19 atoms in block     50
 Block first atom:    896
 Blocpdb>    23 atoms in block     51
 Block first atom:    915
 Blocpdb>    22 atoms in block     52
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    22 atoms in block     53
 Block first atom:    960
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    982
 Blocpdb>    22 atoms in block     55
 Block first atom:   1006
 Blocpdb>    15 atoms in block     56
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:   1043
 Blocpdb>    19 atoms in block     58
 Block first atom:   1058
 Blocpdb>    21 atoms in block     59
 Block first atom:   1077
 Blocpdb>    19 atoms in block     60
 Block first atom:   1098
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    19 atoms in block     62
 Block first atom:   1133
 Blocpdb>    14 atoms in block     63
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:   1166
 Blocpdb>    20 atoms in block     65
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    24 atoms in block     67
 Block first atom:   1221
 Blocpdb>    20 atoms in block     68
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    19 atoms in block     69
 Block first atom:   1265
 Blocpdb>    19 atoms in block     70
 Block first atom:   1284
 Blocpdb>    21 atoms in block     71
 Block first atom:   1303
 Blocpdb>    19 atoms in block     72
 Block first atom:   1324
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1343
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1356
 Blocpdb>    21 atoms in block     75
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1391
 Blocpdb>    22 atoms in block     77
 Block first atom:   1408
 Blocpdb>    16 atoms in block     78
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     80
 Block first atom:   1461
 Blocpdb>    20 atoms in block     81
 Block first atom:   1479
 Blocpdb>    16 atoms in block     82
 Block first atom:   1499
 Blocpdb>    20 atoms in block     83
 Block first atom:   1515
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1552
 Blocpdb>    17 atoms in block     86
 Block first atom:   1571
 Blocpdb>    20 atoms in block     87
 Block first atom:   1588
 Blocpdb>    21 atoms in block     88
 Block first atom:   1608
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    14 atoms in block     90
 Block first atom:   1644
 Blocpdb>    13 atoms in block     91
 Block first atom:   1658
 Blocpdb>    18 atoms in block     92
 Block first atom:   1671
 Blocpdb>    25 atoms in block     93
 Block first atom:   1689
 Blocpdb>    16 atoms in block     94
 Block first atom:   1714
 Blocpdb>    20 atoms in block     95
 Block first atom:   1730
 Blocpdb>    18 atoms in block     96
 Block first atom:   1750
 Blocpdb>    18 atoms in block     97
 Block first atom:   1768
 Blocpdb>    14 atoms in block     98
 Block first atom:   1786
 Blocpdb>    23 atoms in block     99
 Block first atom:   1800
 Blocpdb>    21 atoms in block    100
 Block first atom:   1823
 Blocpdb>    18 atoms in block    101
 Block first atom:   1844
 Blocpdb>    18 atoms in block    102
 Block first atom:   1862
 Blocpdb>    16 atoms in block    103
 Block first atom:   1880
 Blocpdb>    24 atoms in block    104
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    19 atoms in block    105
 Block first atom:   1920
 Blocpdb>    14 atoms in block    106
 Block first atom:   1939
 Blocpdb>    24 atoms in block    107
 Block first atom:   1953
 Blocpdb>    19 atoms in block    108
 Block first atom:   1977
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1996
 Blocpdb>    13 atoms in block    110
 Block first atom:   2015
 Blocpdb>    18 atoms in block    111
 Block first atom:   2028
 Blocpdb>    15 atoms in block    112
 Block first atom:   2046
 Blocpdb>    22 atoms in block    113
 Block first atom:   2061
 Blocpdb>    17 atoms in block    114
 Block first atom:   2083
 Blocpdb>    18 atoms in block    115
 Block first atom:   2100
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   2118
 Blocpdb>    14 atoms in block    117
 Block first atom:   2134
 Blocpdb>    20 atoms in block    118
 Block first atom:   2147

 Blocpdb>   118 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    12 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       916785 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6501

 Prepmat> Matrix trace    =    2008500.0000
 Prepmat> Last element read:    6501   6501       174.4762
 Prepmat>         7022 lines saved.
 Prepmat>         5747 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2167
 RTB> Total mass =        2167.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2167
 RTB> Number of blocks =   118
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  181850.8433
 RTB>     44094 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      708
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    44094
 Diagstd> Projected matrix trace =  181850.8433

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    708 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 181850.8433
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.5896095      3.0599182      6.0342813      8.1681109
      9.2508773     10.2785885     11.1280061     12.3336843     13.1972115
     14.9753987     15.6513997     16.7281309     18.6982271     20.4803398
     21.7726746     22.9410016     23.8268993     24.6593500     25.7906226
     26.5368622     27.6940129     28.0353268     29.5248179     29.8619801
     31.9768488     32.5320850     34.3387271     35.0037071     35.4440368
     36.0572175     37.7655446     38.5403697     39.7279802     40.2704715
     41.5615745     42.1464390     43.8026411     44.0975627     45.0938815
     46.4026003     48.3841748     48.6309828     49.6063018     50.5464382
     51.0648910     51.6575846     52.6491392     53.6801483     54.5674490
     55.3787817     56.9213693     58.1525254     58.8998962     59.3907833
     60.0896391     60.5476191     61.7946021     62.9515678     63.7087168
     63.9020674     65.0889264     66.0572185     67.4381981     67.6998522
     68.7046061     69.8484115     70.8597438     71.1351878     72.0105792
     72.7696782     73.9391002     74.5788707     74.7009253     76.5512348
     77.3077547     78.7774511     79.8551310     80.0492647     81.3042290
     81.7779452     82.5519654     82.8096496     83.9622554     85.5536681
     85.6730917     87.0319962     88.4510666     88.9922702     90.1691316
     91.5158918     92.4141397     92.8677358     94.1305010     94.3535554
     94.9046552     95.8965924     96.3154958     96.9457038     97.2423077
     99.0205312

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034329      0.0034340      0.0034342      0.0034345
      0.0034349    174.7480823    189.9547649    266.7522274    310.3531036
    330.2833946    348.1464897    362.2462989    381.3657556    394.4903368
    420.2275080    429.6075162    444.1390809    469.5647592    491.4324831
    506.7003114    520.1175017    530.0648978    539.2449573    551.4754626
    559.3969122    571.4631431    574.9738480    590.0501082    593.4096183
    614.0632576    619.3715164    636.3372935    642.4691832    646.4975295
    652.0657439    667.3338523    674.1448456    684.4528298    689.1101357
    700.0696922    704.9782584    718.6963331    721.1117525    729.2124753
    739.7184305    755.3477666    757.2718330    764.8278716    772.0413463
    775.9906440    780.4809874    787.9359533    795.6134821    802.1620390
    808.1034836    819.2811258    828.0938704    833.3981749    836.8638475
    841.7731674    844.9749137    853.6317314    861.5858457    866.7517143
    868.0659769    876.0902241    882.5827231    891.7605563    893.4888568
    900.0947061    907.5562397    914.1028628    915.8777774    921.4959532
    926.3401915    933.7537542    937.7847835    938.5518518    950.1045117
    954.7876885    963.8206853    970.3908513    971.5696814    979.1559071
    982.0042723    986.6406147    988.1793038    995.0326428   1004.4182556
   1005.1190406   1013.0590312   1021.2846807   1024.4043714   1031.1556453
   1038.8277402   1043.9134491   1046.4722318   1053.5628909   1054.8104291
   1057.8864099   1063.4005190   1065.7206048   1069.2015117   1070.8358654
   1080.5824412

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2167
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    118

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9937E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.590    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.060    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.034    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.168    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.251    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.02    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    708 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999
 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000
 1.00004 0.99998 1.00000 1.00003 0.99997
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99996
 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00005 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    39006 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999
 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000
 1.00004 0.99998 1.00000 1.00003 0.99997
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99996
 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00005 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22123015423170986.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22123015423170986.eigenfacs                                     
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 22123015423170986.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 22123015423170986.atom                                          
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    236
            First residue number     =     54
            Last  residue number     =    289
            Number of atoms found    =   2167
            Mean number per residue  =      9.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9937E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.590    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.060    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.034    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.168    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.251    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.02    

 Bfactors>  106 vectors,   6501 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.590000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !

 Bfactors> =      0.021 +/-   0.02
 Bfactors> =      0.000 +/-   0.00
 Bfactors> Shiftng-fct=     -0.021
 Bfactors> Scaling-fct=      0.000

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22123015423170986.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22123015423170986.eigenfacs                                     

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4319E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   174.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   189.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   266.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   310.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   330.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   348.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   362.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   381.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   394.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   420.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   429.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   444.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   469.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   491.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   520.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   530.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   539.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   551.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   571.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   575.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   590.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   593.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   614.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   619.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   636.3    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   921.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   938.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   950.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   971.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   979.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1039.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1044.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1055.    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1066.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1069.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1071.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1081.    

 Chkmod>  106 vectors,   6501 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2167 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    50 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7760
      0.0034      0.8577
      0.0034      0.6935
      0.0034      0.7218
      0.0034      0.9338
      0.0034      0.7814
    174.7538      0.4459
    189.9491      0.5124
    266.7346      0.3244
    310.3377      0.5309
    330.2714      0.3770
    348.1554      0.1969
    362.2632      0.4308
    381.2924      0.3973
    394.5151      0.3774
    420.2740      0.3355
    429.5699      0.5637
    444.1448      0.4863
    469.5669      0.3851
    491.4073      0.4166
    506.6474      0.3596
    520.0838      0.3696
    530.0766      0.4986
    539.2289      0.2561
    551.4451      0.5191
    559.4060      0.5103
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    574.9971      0.2359
    589.9766      0.3859
    593.3645      0.4277
    614.0672      0.3050
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    646.4330      0.4908
    652.0629      0.3116
    667.3446      0.4483
    674.1127      0.4867
    684.4408      0.2256
    689.0765      0.3595
    700.0264      0.5152
    704.9778      0.4215
    718.6438      0.2870
    721.1007      0.2417
    729.1498      0.5048
    739.6660      0.3788
    755.2828      0.5017
    757.2317      0.4639
    764.8235      0.2992
    772.0354      0.3017
    775.9202      0.4137
    780.4657      0.4511
    787.9086      0.4025
    795.5782      0.4423
    802.1464      0.4847
    808.0777      0.4684
    819.2361      0.5606
    828.0403      0.3410
    833.3631      0.4271
    836.8224      0.3859
    841.7396      0.5089
    844.9553      0.4975
    853.5633      0.4373
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    876.0598      0.4755
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    891.7342      0.4115
    893.4515      0.3514
    900.0259      0.5183
    907.5276      0.3844
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   1065.6998      0.4031
   1069.1793      0.3841
   1070.7772      0.2350
   1080.5332      0.2863
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22123015423170986 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123015423170986.eigenfacs
22123015423170986.atom
making animated gifs
11 models are in 22123015423170986.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22123015423170986 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123015423170986.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
22123015423170986.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
22123015423170986.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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22123015423170986.atom
making animated gifs
11 models are in 22123015423170986.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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normal mode computation
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123015423170986.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22123015423170986 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=20
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making animated gif 300x300
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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