***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22122720180123252.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22122720180123252.atom to be opened.
Openam> File opened: 22122720180123252.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 349
First residue number = 1
Last residue number = 349
Number of atoms found = 2833
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -22.329667 +/- 8.054368 From: -44.432000 To: -0.907000
= -29.823808 +/- 12.960348 From: -63.229000 To: -2.023000
= 26.224716 +/- 14.670007 From: -5.717000 To: 63.368000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.9079 % Filled.
Pdbmat> 1050345 non-zero elements.
Pdbmat> 114833 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.07 +/- 22.86
Maximum number = 130
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 2.296660E+06
Pdbmat> Larger element = 493.159
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
349 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22122720180123252.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22122720180123252.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22122720180123252.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2833 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 349 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 66
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 85
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 101
Blocpdb> 17 atoms in block 8
Block first atom: 121
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 138
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 156
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 172
Blocpdb> 13 atoms in block 12
Block first atom: 187
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 200
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 222
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 238
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 268
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 284
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 299
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 316
Blocpdb> 18 atoms in block 21
Block first atom: 335
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 353
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 370
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 390
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 401
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 414
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 428
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 446
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 461
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 10 atoms in block 31
Block first atom: 488
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 521
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 554
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 569
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 583
Blocpdb> 15 atoms in block 39
Block first atom: 596
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 629
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 644
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 661
Blocpdb> 20 atoms in block 44
Block first atom: 674
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 694
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 711
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 730
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 752
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 765
Blocpdb> 18 atoms in block 50
Block first atom: 784
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 802
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 821
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 841
Blocpdb> 11 atoms in block 54
Block first atom: 858
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 869
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 889
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 907
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 927
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 943
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 961
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 972
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 987
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1005
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 1025
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 1036
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1052
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1066
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1084
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1098
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1111
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1128
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1146
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1162
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1182
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1197
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1212
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1228
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1241
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 1253
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1276
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1290
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1306
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1322
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1337
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1354
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1373
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1390
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1407
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1422
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1437
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 1452
Blocpdb> 13 atoms in block 92
Block first atom: 1470
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1483
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1500
Blocpdb> 18 atoms in block 95
Block first atom: 1513
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1531
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 1548
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 1576
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 1595
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1614
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1633
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1647
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1664
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1679
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1695
Blocpdb> 16 atoms in block 106
Block first atom: 1714
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 1730
Blocpdb> 21 atoms in block 108
Block first atom: 1754
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1775
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1788
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1806
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1823
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1835
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1852
Blocpdb> 21 atoms in block 115
Block first atom: 1866
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1887
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1900
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1917
Blocpdb> 19 atoms in block 119
Block first atom: 1932
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1951
Blocpdb> 18 atoms in block 121
Block first atom: 1970
Blocpdb> 10 atoms in block 122
Block first atom: 1988
Blocpdb> 20 atoms in block 123
Block first atom: 1998
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 2018
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 2033
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 2050
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 2062
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 2075
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2095
Blocpdb> 17 atoms in block 130
Block first atom: 2109
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2126
Blocpdb> 17 atoms in block 132
Block first atom: 2141
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2158
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 2177
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2194
Blocpdb> 25 atoms in block 136
Block first atom: 2208
Blocpdb> 14 atoms in block 137
Block first atom: 2233
Blocpdb> 24 atoms in block 138
Block first atom: 2247
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2271
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2290
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2305
Blocpdb> 11 atoms in block 142
Block first atom: 2319
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2330
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2347
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2363
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2381
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2398
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 2414
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2432
Blocpdb> 16 atoms in block 150
Block first atom: 2447
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2463
Blocpdb> 15 atoms in block 152
Block first atom: 2475
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 2490
Blocpdb> 15 atoms in block 154
Block first atom: 2501
Blocpdb> 8 atoms in block 155
Block first atom: 2516
Blocpdb> 12 atoms in block 156
Block first atom: 2524
Blocpdb> 17 atoms in block 157
Block first atom: 2536
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2553
Blocpdb> 20 atoms in block 159
Block first atom: 2573
Blocpdb> 13 atoms in block 160
Block first atom: 2593
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 2606
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2624
Blocpdb> 21 atoms in block 163
Block first atom: 2640
Blocpdb> 12 atoms in block 164
Block first atom: 2661
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 2673
Blocpdb> 12 atoms in block 166
Block first atom: 2692
Blocpdb> 17 atoms in block 167
Block first atom: 2704
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2721
Blocpdb> 10 atoms in block 169
Block first atom: 2737
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2747
Blocpdb> 9 atoms in block 171
Block first atom: 2762
Blocpdb> 21 atoms in block 172
Block first atom: 2771
Blocpdb> 16 atoms in block 173
Block first atom: 2792
Blocpdb> 18 atoms in block 174
Block first atom: 2808
Blocpdb> 8 atoms in block 175
Block first atom: 2825
Blocpdb> 175 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1050520 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8499
Prepmat> Matrix trace = 2296660.0000
Prepmat> Last element read: 8499 8499 75.0455
Prepmat> 15401 lines saved.
Prepmat> 13502 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2833
RTB> Total mass = 2833.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2833
RTB> Number of blocks = 175
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 237982.4751
RTB> 65703 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1050
Diagstd> Nb of non-zero elements: 65703
Diagstd> Projected matrix trace = 237982.4751
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1050 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 237982.4751
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.1643834 1.6881772 2.4693166 3.9571032
4.8179289 5.0415359 5.8166835 6.6180215 7.5038013
7.6003039 9.0350418 9.8641153 10.2553028 10.6136518
10.9434209 12.5867148 13.0911447 14.5986401 15.1744442
15.4393261 15.6833137 16.2352492 16.4105306 17.5288013
17.7852366 18.2118378 19.0946576 20.3506423 20.7242059
21.4782378 21.9499353 22.1498015 22.7788324 23.5095725
24.0096285 24.8909596 25.5945512 26.2028088 26.8424139
27.2071626 28.3148415 28.9152626 30.2373730 30.9282928
31.3792583 31.5342617 31.8123912 32.6205975 33.0111954
33.5738085 34.6353776 35.4064539 36.0270784 36.6546915
37.6121997 38.1373886 38.3249944 38.7258398 39.0078530
40.0157648 41.2395749 41.4237679 42.0924726 42.9097342
43.4763022 43.8066622 44.0199293 44.7104597 45.2240146
46.0099407 46.3418451 46.8895942 47.6080269 48.1986720
48.8362537 49.5886249 49.8949018 50.3417677 50.6519084
51.6131831 52.3399950 53.0405383 53.6859636 54.2336858
54.3899992 54.7447555 55.3765622 55.5683875 56.4242255
57.2088002 57.6462767 58.8943447 59.6092948 60.2458873
60.6371917 60.9716986 61.3244179 62.1927600 62.8471777
64.3999742
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034339 0.0034343 0.0034344 0.0034347
0.0034349 117.1772463 141.0926202 170.6411105 216.0150298
238.3556631 243.8241461 261.8984925 279.3568769 297.4650468
299.3717100 326.4076751 341.0549451 347.7519109 353.7754543
359.2293663 385.2578311 392.9018671 414.9076874 423.0110151
426.6870383 430.0452890 437.5470491 439.9026633 454.6439223
457.9574234 463.4172191 474.5163900 489.8739450 494.3496487
503.2625377 508.7587624 511.0697775 518.2758944 526.5233621
532.0935571 541.7714312 549.3751864 555.8648394 562.6082090
566.4178176 577.8330090 583.9273950 597.1278245 603.9114368
608.2983208 609.7988685 612.4821521 620.2135300 623.9156883
629.2099541 639.0800253 646.1546831 651.7931661 657.4459654
665.9776378 670.6111289 672.2585434 675.7650128 678.2211114
686.9274021 697.3525131 698.9081107 704.5267689 711.3333862
716.0141085 718.7293201 720.4767165 726.1057031 730.2639073
736.5820261 739.2340130 743.5899601 749.2648711 753.8983914
758.8683684 764.6915885 767.0494560 770.4767020 772.8463968
780.1454900 785.6192543 790.8593288 795.6565758 799.7050536
800.8566873 803.4642186 808.0872899 809.4856936 815.6955322
821.3470468 824.4814924 833.3588989 838.4019357 842.8668685
845.5996997 847.9288801 850.3779640 856.3773955 860.8711824
871.4412767
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2833
Rtb_to_modes> Number of blocs = 175
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.164
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.688
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.469
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.957
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.818
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.042
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.817
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.035
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 0.99995
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00003
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002
0.99998 1.00001 0.99995 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 1.00003
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 50994 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 0.99995
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00003
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002
0.99998 1.00001 0.99995 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 1.00003
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22122720180123252.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22122720180123252.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22122720180123252.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22122720180123252.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 349
First residue number = 1
Last residue number = 349
Number of atoms found = 2833
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.688
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.469
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.957
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.818
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.817
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.618
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.035
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40
Bfactors> 106 vectors, 8499 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.164000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.827 for 350 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.030 +/- 0.04
Bfactors> = 35.373 +/- 14.92
Bfactors> Shiftng-fct= 35.343
Bfactors> Scaling-fct= 385.554
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22122720180123252.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22122720180123252.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Chkmod> 106 vectors, 8499 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2833 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7968
0.0034 0.7191
0.0034 0.9211
0.0034 0.7818
0.0034 0.7362
0.0034 0.8411
117.1529 0.5590
141.0792 0.5274
170.6228 0.0775
216.0029 0.5220
238.3472 0.0151
243.8249 0.2936
261.8944 0.3150
279.3444 0.6630
297.4562 0.4931
299.3529 0.4907
326.3929 0.1132
341.0383 0.2463
347.8166 0.3502
353.6994 0.3997
359.1578 0.5325
385.2916 0.5082
392.8678 0.3601
414.9092 0.0678
422.9309 0.1349
426.6780 0.1921
429.9814 0.4593
437.5923 0.3413
439.8767 0.3576
454.6399 0.2259
457.9991 0.4088
463.3739 0.2526
474.4381 0.3178
489.8452 0.2936
494.2783 0.1778
503.2616 0.2109
508.7377 0.3815
511.0501 0.2535
518.2669 0.3418
526.5055 0.3547
532.0748 0.5199
541.7377 0.5867
549.3028 0.3241
555.8112 0.4016
562.5588 0.5404
566.4230 0.4731
577.7588 0.4593
583.9502 0.3033
597.1281 0.5250
603.9022 0.0214
608.2794 0.3449
609.7315 0.3735
612.4328 0.3927
620.1812 0.4294
623.8776 0.4909
629.1473 0.3723
639.0952 0.1848
646.1593 0.3418
651.7916 0.5317
657.3757 0.4155
665.9296 0.4183
670.6053 0.5682
672.1859 0.3869
675.7723 0.4171
678.2107 0.4385
686.9343 0.4534
697.3262 0.3876
698.8463 0.4088
704.4758 0.4087
711.3051 0.5130
716.0138 0.3444
718.7258 0.3975
720.4464 0.3429
726.0708 0.3053
730.2001 0.3131
736.5509 0.4800
739.1876 0.3058
743.5613 0.2508
749.2482 0.4029
753.8764 0.3646
758.8649 0.3561
764.6694 0.3847
766.9789 0.4741
770.4301 0.4054
772.7987 0.4858
780.0879 0.3723
785.5856 0.3864
790.8214 0.4139
795.6523 0.4448
799.6436 0.3248
800.8223 0.4246
803.3948 0.3182
808.0777 0.4716
809.4627 0.4453
815.6300 0.1629
821.3204 0.5596
824.4727 0.5493
833.2924 0.4196
838.3709 0.5047
842.8595 0.3763
845.5830 0.2326
847.8807 0.4902
850.3108 0.2840
856.3216 0.3899
860.8536 0.4460
871.4040 0.2228
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22122720180123252 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
making animated gifs
11 models are in 22122720180123252.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22122720180123252 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
making animated gifs
11 models are in 22122720180123252.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22122720180123252 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
making animated gifs
11 models are in 22122720180123252.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22122720180123252 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
making animated gifs
11 models are in 22122720180123252.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22122720180123252 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122720180123252.eigenfacs
22122720180123252.atom
making animated gifs
11 models are in 22122720180123252.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122720180123252.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22122720180123252.10.pdb
22122720180123252.11.pdb
22122720180123252.7.pdb
22122720180123252.8.pdb
22122720180123252.9.pdb
STDERR:
real 0m14.434s
user 0m14.400s
sys 0m0.028s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|