*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22121317404857062.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22121317404857062.atom to be opened.
Openam> File opened: 22121317404857062.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2100
First residue number = 1
Last residue number = 190
Number of atoms found = 17262
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 12.462008 +/- 23.982603 From: -46.788000 To: 69.311000
= 43.206097 +/- 25.293977 From: -17.548000 To: 106.751000
= 27.205965 +/- 21.204312 From: -19.026000 To: 72.004000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -0.8338 % Filled.
Pdbmat> 6725408 non-zero elements.
Pdbmat> 735884 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.26 +/- 22.90
Maximum number = 150
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.471768E+07
Pdbmat> Larger element = 582.654
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2100 non-zero elements, NRBL set to 11
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22121317404857062.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 11
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22121317404857062.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22121317404857062.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 17262 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 11 residue(s) per block.
Blocpdb> 2100 residues.
Blocpdb> 88 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 97 atoms in block 2
Block first atom: 89
Blocpdb> 84 atoms in block 3
Block first atom: 186
Blocpdb> 87 atoms in block 4
Block first atom: 270
Blocpdb> 95 atoms in block 5
Block first atom: 357
Blocpdb> 82 atoms in block 6
Block first atom: 452
Blocpdb> 99 atoms in block 7
Block first atom: 534
Blocpdb> 88 atoms in block 8
Block first atom: 633
Blocpdb> 103 atoms in block 9
Block first atom: 721
Blocpdb> 64 atoms in block 10
Block first atom: 824
Blocpdb> 104 atoms in block 11
Block first atom: 888
Blocpdb> 80 atoms in block 12
Block first atom: 992
Blocpdb> 87 atoms in block 13
Block first atom: 1072
Blocpdb> 88 atoms in block 14
Block first atom: 1159
Blocpdb> 83 atoms in block 15
Block first atom: 1247
Blocpdb> 96 atoms in block 16
Block first atom: 1330
Blocpdb> 88 atoms in block 17
Block first atom: 1426
Blocpdb> 97 atoms in block 18
Block first atom: 1514
Blocpdb> 84 atoms in block 19
Block first atom: 1611
Blocpdb> 87 atoms in block 20
Block first atom: 1695
Blocpdb> 95 atoms in block 21
Block first atom: 1782
Blocpdb> 82 atoms in block 22
Block first atom: 1877
Blocpdb> 99 atoms in block 23
Block first atom: 1959
Blocpdb> 88 atoms in block 24
Block first atom: 2058
Blocpdb> 103 atoms in block 25
Block first atom: 2146
Blocpdb> 71 atoms in block 26
Block first atom: 2249
Blocpdb> 98 atoms in block 27
Block first atom: 2320
Blocpdb> 82 atoms in block 28
Block first atom: 2418
Blocpdb> 88 atoms in block 29
Block first atom: 2500
Blocpdb> 85 atoms in block 30
Block first atom: 2588
Blocpdb> 87 atoms in block 31
Block first atom: 2673
Blocpdb> 96 atoms in block 32
Block first atom: 2760
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 2856
Blocpdb> 88 atoms in block 34
Block first atom: 2878
Blocpdb> 97 atoms in block 35
Block first atom: 2966
Blocpdb> 84 atoms in block 36
Block first atom: 3063
Blocpdb> 87 atoms in block 37
Block first atom: 3147
Blocpdb> 95 atoms in block 38
Block first atom: 3234
Blocpdb> 82 atoms in block 39
Block first atom: 3329
Blocpdb> 99 atoms in block 40
Block first atom: 3411
Blocpdb> 88 atoms in block 41
Block first atom: 3510
Blocpdb> 103 atoms in block 42
Block first atom: 3598
Blocpdb> 71 atoms in block 43
Block first atom: 3701
Blocpdb> 98 atoms in block 44
Block first atom: 3772
Blocpdb> 82 atoms in block 45
Block first atom: 3870
Blocpdb> 88 atoms in block 46
Block first atom: 3952
Blocpdb> 85 atoms in block 47
Block first atom: 4040
Blocpdb> 87 atoms in block 48
Block first atom: 4125
Blocpdb> 96 atoms in block 49
Block first atom: 4212
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 4308
Blocpdb> 88 atoms in block 51
Block first atom: 4330
Blocpdb> 97 atoms in block 52
Block first atom: 4418
Blocpdb> 84 atoms in block 53
Block first atom: 4515
Blocpdb> 87 atoms in block 54
Block first atom: 4599
Blocpdb> 95 atoms in block 55
Block first atom: 4686
Blocpdb> 82 atoms in block 56
Block first atom: 4781
Blocpdb> 99 atoms in block 57
Block first atom: 4863
Blocpdb> 88 atoms in block 58
Block first atom: 4962
Blocpdb> 103 atoms in block 59
Block first atom: 5050
Blocpdb> 64 atoms in block 60
Block first atom: 5153
Blocpdb> 104 atoms in block 61
Block first atom: 5217
Blocpdb> 80 atoms in block 62
Block first atom: 5321
Blocpdb> 87 atoms in block 63
Block first atom: 5401
Blocpdb> 88 atoms in block 64
Block first atom: 5488
Blocpdb> 83 atoms in block 65
Block first atom: 5576
Blocpdb> 96 atoms in block 66
Block first atom: 5659
Blocpdb> 88 atoms in block 67
Block first atom: 5755
Blocpdb> 97 atoms in block 68
Block first atom: 5843
Blocpdb> 84 atoms in block 69
Block first atom: 5940
Blocpdb> 87 atoms in block 70
Block first atom: 6024
Blocpdb> 95 atoms in block 71
Block first atom: 6111
Blocpdb> 82 atoms in block 72
Block first atom: 6206
Blocpdb> 99 atoms in block 73
Block first atom: 6288
Blocpdb> 88 atoms in block 74
Block first atom: 6387
Blocpdb> 103 atoms in block 75
Block first atom: 6475
Blocpdb> 71 atoms in block 76
Block first atom: 6578
Blocpdb> 98 atoms in block 77
Block first atom: 6649
Blocpdb> 82 atoms in block 78
Block first atom: 6747
Blocpdb> 88 atoms in block 79
Block first atom: 6829
Blocpdb> 85 atoms in block 80
Block first atom: 6917
Blocpdb> 87 atoms in block 81
Block first atom: 7002
Blocpdb> 96 atoms in block 82
Block first atom: 7089
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 7185
Blocpdb> 88 atoms in block 84
Block first atom: 7207
Blocpdb> 97 atoms in block 85
Block first atom: 7295
Blocpdb> 84 atoms in block 86
Block first atom: 7392
Blocpdb> 87 atoms in block 87
Block first atom: 7476
Blocpdb> 95 atoms in block 88
Block first atom: 7563
Blocpdb> 82 atoms in block 89
Block first atom: 7658
Blocpdb> 99 atoms in block 90
Block first atom: 7740
Blocpdb> 88 atoms in block 91
Block first atom: 7839
Blocpdb> 103 atoms in block 92
Block first atom: 7927
Blocpdb> 64 atoms in block 93
Block first atom: 8030
Blocpdb> 104 atoms in block 94
Block first atom: 8094
Blocpdb> 80 atoms in block 95
Block first atom: 8198
Blocpdb> 87 atoms in block 96
Block first atom: 8278
Blocpdb> 88 atoms in block 97
Block first atom: 8365
Blocpdb> 83 atoms in block 98
Block first atom: 8453
Blocpdb> 96 atoms in block 99
Block first atom: 8536
Blocpdb> 88 atoms in block 100
Block first atom: 8632
Blocpdb> 97 atoms in block 101
Block first atom: 8720
Blocpdb> 84 atoms in block 102
Block first atom: 8817
Blocpdb> 87 atoms in block 103
Block first atom: 8901
Blocpdb> 95 atoms in block 104
Block first atom: 8988
Blocpdb> 82 atoms in block 105
Block first atom: 9083
Blocpdb> 99 atoms in block 106
Block first atom: 9165
Blocpdb> 88 atoms in block 107
Block first atom: 9264
Blocpdb> 103 atoms in block 108
Block first atom: 9352
Blocpdb> 71 atoms in block 109
Block first atom: 9455
Blocpdb> 98 atoms in block 110
Block first atom: 9526
Blocpdb> 82 atoms in block 111
Block first atom: 9624
Blocpdb> 88 atoms in block 112
Block first atom: 9706
Blocpdb> 85 atoms in block 113
Block first atom: 9794
Blocpdb> 87 atoms in block 114
Block first atom: 9879
Blocpdb> 96 atoms in block 115
Block first atom: 9966
Blocpdb> 22 atoms in block 116
Block first atom: 10062
Blocpdb> 88 atoms in block 117
Block first atom: 10084
Blocpdb> 97 atoms in block 118
Block first atom: 10172
Blocpdb> 84 atoms in block 119
Block first atom: 10269
Blocpdb> 87 atoms in block 120
Block first atom: 10353
Blocpdb> 95 atoms in block 121
Block first atom: 10440
Blocpdb> 82 atoms in block 122
Block first atom: 10535
Blocpdb> 99 atoms in block 123
Block first atom: 10617
Blocpdb> 88 atoms in block 124
Block first atom: 10716
Blocpdb> 103 atoms in block 125
Block first atom: 10804
Blocpdb> 64 atoms in block 126
Block first atom: 10907
Blocpdb> 104 atoms in block 127
Block first atom: 10971
Blocpdb> 80 atoms in block 128
Block first atom: 11075
Blocpdb> 87 atoms in block 129
Block first atom: 11155
Blocpdb> 88 atoms in block 130
Block first atom: 11242
Blocpdb> 83 atoms in block 131
Block first atom: 11330
Blocpdb> 96 atoms in block 132
Block first atom: 11413
Blocpdb> 88 atoms in block 133
Block first atom: 11509
Blocpdb> 97 atoms in block 134
Block first atom: 11597
Blocpdb> 84 atoms in block 135
Block first atom: 11694
Blocpdb> 87 atoms in block 136
Block first atom: 11778
Blocpdb> 95 atoms in block 137
Block first atom: 11865
Blocpdb> 82 atoms in block 138
Block first atom: 11960
Blocpdb> 99 atoms in block 139
Block first atom: 12042
Blocpdb> 88 atoms in block 140
Block first atom: 12141
Blocpdb> 103 atoms in block 141
Block first atom: 12229
Blocpdb> 71 atoms in block 142
Block first atom: 12332
Blocpdb> 98 atoms in block 143
Block first atom: 12403
Blocpdb> 82 atoms in block 144
Block first atom: 12501
Blocpdb> 88 atoms in block 145
Block first atom: 12583
Blocpdb> 85 atoms in block 146
Block first atom: 12671
Blocpdb> 87 atoms in block 147
Block first atom: 12756
Blocpdb> 96 atoms in block 148
Block first atom: 12843
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 12939
Blocpdb> 88 atoms in block 150
Block first atom: 12961
Blocpdb> 97 atoms in block 151
Block first atom: 13049
Blocpdb> 84 atoms in block 152
Block first atom: 13146
Blocpdb> 87 atoms in block 153
Block first atom: 13230
Blocpdb> 95 atoms in block 154
Block first atom: 13317
Blocpdb> 82 atoms in block 155
Block first atom: 13412
Blocpdb> 99 atoms in block 156
Block first atom: 13494
Blocpdb> 88 atoms in block 157
Block first atom: 13593
Blocpdb> 103 atoms in block 158
Block first atom: 13681
Blocpdb> 64 atoms in block 159
Block first atom: 13784
Blocpdb> 104 atoms in block 160
Block first atom: 13848
Blocpdb> 80 atoms in block 161
Block first atom: 13952
Blocpdb> 87 atoms in block 162
Block first atom: 14032
Blocpdb> 88 atoms in block 163
Block first atom: 14119
Blocpdb> 83 atoms in block 164
Block first atom: 14207
Blocpdb> 96 atoms in block 165
Block first atom: 14290
Blocpdb> 88 atoms in block 166
Block first atom: 14386
Blocpdb> 97 atoms in block 167
Block first atom: 14474
Blocpdb> 84 atoms in block 168
Block first atom: 14571
Blocpdb> 87 atoms in block 169
Block first atom: 14655
Blocpdb> 95 atoms in block 170
Block first atom: 14742
Blocpdb> 82 atoms in block 171
Block first atom: 14837
Blocpdb> 99 atoms in block 172
Block first atom: 14919
Blocpdb> 88 atoms in block 173
Block first atom: 15018
Blocpdb> 103 atoms in block 174
Block first atom: 15106
Blocpdb> 71 atoms in block 175
Block first atom: 15209
Blocpdb> 98 atoms in block 176
Block first atom: 15280
Blocpdb> 82 atoms in block 177
Block first atom: 15378
Blocpdb> 88 atoms in block 178
Block first atom: 15460
Blocpdb> 85 atoms in block 179
Block first atom: 15548
Blocpdb> 87 atoms in block 180
Block first atom: 15633
Blocpdb> 96 atoms in block 181
Block first atom: 15720
Blocpdb> 22 atoms in block 182
Block first atom: 15816
Blocpdb> 88 atoms in block 183
Block first atom: 15838
Blocpdb> 97 atoms in block 184
Block first atom: 15926
Blocpdb> 84 atoms in block 185
Block first atom: 16023
Blocpdb> 87 atoms in block 186
Block first atom: 16107
Blocpdb> 95 atoms in block 187
Block first atom: 16194
Blocpdb> 82 atoms in block 188
Block first atom: 16289
Blocpdb> 99 atoms in block 189
Block first atom: 16371
Blocpdb> 88 atoms in block 190
Block first atom: 16470
Blocpdb> 103 atoms in block 191
Block first atom: 16558
Blocpdb> 64 atoms in block 192
Block first atom: 16661
Blocpdb> 104 atoms in block 193
Block first atom: 16725
Blocpdb> 80 atoms in block 194
Block first atom: 16829
Blocpdb> 87 atoms in block 195
Block first atom: 16909
Blocpdb> 88 atoms in block 196
Block first atom: 16996
Blocpdb> 83 atoms in block 197
Block first atom: 17084
Blocpdb> 96 atoms in block 198
Block first atom: 17166
Blocpdb> 198 blocks.
Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 6725606 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 51786
Prepmat> Matrix trace = 14717680.0001
Prepmat> Last element read: 51786 51786 206.4305
Prepmat> 19702 lines saved.
Prepmat> 18246 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 17262
RTB> Total mass = 17262.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 17262
RTB> Number of blocks = 198
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 181538.3757
RTB> 49410 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1188
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49410
Diagstd> Projected matrix trace = 181538.3757
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1188 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 181538.3757
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1474223 0.2386592 0.6097277 0.6534027
0.7673184 0.9445846 1.0444684 1.1379975 1.2530435
1.3728947 1.5068748 1.6425974 2.0785801 2.2205760
2.3502700 2.4223982 2.7483451 2.8784917 3.0981374
3.3048064 3.6316931 3.7193359 3.7713578 3.8251650
3.9169176 4.0332361 4.1685260 4.2538729 4.5913829
4.9876536 5.2478728 5.4107292 5.5428624 5.6418750
5.7068565 5.7791028 5.9043742 6.0881977 6.1776764
6.2894963 6.3398920 6.4492170 6.5684734 7.0903627
7.3584252 7.7046239 7.7478918 8.3326120 8.4163915
8.5451931 8.8630734 8.9461453 9.2392650 9.5615567
9.8632443 10.6004566 10.7172249 10.8323674 11.1656473
11.6608727 12.1222023 12.2328779 12.6054770 12.7466713
13.2761799 13.4440163 14.0018429 14.1349178 14.4381103
14.5954954 14.8233701 14.9926635 15.3847879 15.7810821
15.9636332 16.4180929 16.6384056 16.9163581 17.5027473
17.6586119 17.8729634 18.3642984 18.4385830 19.1675118
19.4824318 19.6380665 19.9600063 20.3193966 20.7406072
20.9209950 21.1999667 21.2878051 22.1865935 22.3515567
22.5884208 22.7494118 23.0504421 23.6183744 24.1087903
24.5307349
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034321 0.0034335 0.0034336 0.0034344 0.0034352
0.0034356 41.6943175 53.0498794 84.7936363 87.7780131
95.1224641 105.5396654 110.9795421 115.8419715 121.5565477
127.2371407 133.3011423 139.1748762 156.5592244 161.8184735
166.4769698 169.0121956 180.0242097 184.2373886 191.1373740
197.4096099 206.9425751 209.4247370 210.8842524 212.3833008
214.9153813 218.0831459 221.7106397 223.9688054 232.6842754
242.5176898 248.7636567 252.5940877 255.6597311 257.9330590
259.4142064 261.0510766 263.8652614 267.9412950 269.9030908
272.3348445 273.4237333 275.7711144 278.3091624 289.1542002
294.5694603 301.4192626 302.2644369 313.4626937 315.0345923
317.4360311 323.2864143 324.7979302 330.0760338 335.7836780
341.0398859 353.5554742 355.4974190 357.4019932 362.8584436
370.8179999 378.0820363 379.8040584 385.5448642 387.6981002
395.6688357 398.1619868 406.3384134 408.2647876 412.6201747
414.8629971 418.0890139 420.4696726 425.9327520 431.3836396
433.8715278 440.0040106 442.9463561 446.6308476 454.3059152
456.3242627 459.0854862 465.3529281 466.2931667 475.4207681
479.3104109 481.2210803 485.1495329 489.4977315 494.5452252
496.6911804 499.9917861 501.0265302 511.4940583 513.3920838
516.1051769 517.9410899 521.3566407 527.7403269 533.1912213
537.8368565
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 17262
Rtb_to_modes> Number of blocs = 198
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2387
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6097
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6534
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7673
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9446
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.044
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.138
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.373
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.507
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.643
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.221
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.422
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.878
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.098
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.632
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.719
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.771
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.033
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.169
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.254
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.988
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.248
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.411
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.543
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.642
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.707
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.779
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.904
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.088
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.289
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.449
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.568
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.705
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.333
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.416
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.545
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.863
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.946
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.239
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.562
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.863
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.53
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998
0.99995 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001
1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999
1.00004 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99995 1.00002 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000
1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 310716 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998
0.99995 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001
1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999
1.00004 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99995 1.00002 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22121317404857062.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317404857062.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22121317404857062.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22121317404857062.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2100
First residue number = 1
Last residue number = 190
Number of atoms found = 17262
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2387
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6534
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7673
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.044
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.507
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.643
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.221
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.350
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.422
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.748
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.863
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.863
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.53
Bfactors> 106 vectors, 51786 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.147400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.591 for 2100 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.028 +/- 0.03
Bfactors> = 70.388 +/- 17.19
Bfactors> Shiftng-fct= 70.360
Bfactors> Scaling-fct= 668.782
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22121317404857062.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317404857062.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.8
Chkmod> 106 vectors, 51786 coordinates in file.
Chkmod> That is: 17262 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8175
0.0034 0.7537
0.0034 0.8018
0.0034 0.7388
0.0034 0.9127
0.0034 0.9641
41.6894 0.3894
53.0521 0.5424
84.7881 0.5063
87.7741 0.6580
95.1172 0.6682
105.5360 0.6360
110.9499 0.3085
115.8371 0.2861
121.5492 0.4014
127.2366 0.1521
133.3010 0.4916
139.1860 0.6656
156.5683 0.3879
161.8270 0.3983
166.4603 0.4751
168.9911 0.6077
180.0052 0.5064
184.2137 0.5154
191.1249 0.2989
197.4069 0.2398
206.9424 0.2840
209.4063 0.4569
210.8652 0.4848
212.3696 0.4529
214.9084 0.4246
218.0674 0.4444
221.7137 0.5114
223.9625 0.4445
232.6646 0.5087
242.5157 0.4149
248.7560 0.3979
252.5896 0.3115
255.6519 0.2639
257.9248 0.2438
259.4063 0.2328
261.0375 0.1069
263.8456 0.3252
267.9254 0.1729
269.8986 0.0115
272.3124 0.0991
273.4143 0.3468
275.7546 0.0796
278.2872 0.0768
289.1344 0.4547
294.5483 0.3920
301.4137 0.6964
302.2536 0.2844
313.4565 0.5110
315.0137 0.3414
317.4188 0.1711
323.2712 0.3552
324.7814 0.0161
330.0571 0.2207
335.7770 0.4665
341.0210 0.4463
353.5327 0.3364
355.5282 0.4781
357.3476 0.4895
362.9136 0.4033
370.7882 0.6042
378.0315 0.1974
379.7431 0.3367
385.5975 0.2325
387.7321 0.3314
395.7088 0.2887
398.0854 0.4837
406.2942 0.3222
408.1762 0.5263
412.6295 0.4221
414.9092 0.1654
418.0235 0.4994
420.4143 0.2234
425.8482 0.3888
431.3503 0.3132
433.8035 0.4264
440.0107 0.3496
442.9486 0.2471
446.6597 0.1303
454.2508 0.2846
456.3226 0.3931
459.0277 0.2785
465.2785 0.1901
466.2911 0.4223
475.4312 0.4547
479.2599 0.4152
481.2241 0.3152
485.1286 0.4058
489.4840 0.2980
494.5168 0.3096
496.6580 0.2652
499.9707 0.2388
501.0308 0.3890
511.5114 0.2873
513.3522 0.3872
516.1011 0.2530
517.9256 0.3691
521.3293 0.1138
527.7358 0.1926
533.1817 0.2967
537.8057 0.1761
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 22121317404857062.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317404857062.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 22121317404857062.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22121317404857062.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 22121317404857062.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
22121317404857062.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.8
Projmod> 106 vectors, 51786 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2100
First residue number = 1
Last residue number = 190
Number of atoms found = 17262
Mean number per residue = 8.2
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2256
First residue number = 1
Last residue number = 190
Number of atoms found = 18564
Mean number per residue = 8.2
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 17 of first conformer: THR 3 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317404857062 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317404857062.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 172 28.209
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 172 28.207
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 172 28.205
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 172 28.203
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 172 28.202
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 172 28.200
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 172 28.199
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 172 28.197
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 172 28.196
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 172 28.195
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 172 28.195
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317404857062 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317404857062.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 172 28.248
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 172 28.238
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 172 28.228
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 172 28.218
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 172 28.209
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 172 28.200
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 172 28.191
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 172 28.183
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 172 28.174
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 172 28.166
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 172 28.158
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317404857062 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317404857062.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 172 28.216
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 172 28.212
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 172 28.209
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 172 28.205
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 172 28.203
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 172 28.200
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 172 28.198
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 172 28.196
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 172 28.195
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 172 28.194
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 172 28.193
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317404857062 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317404857062.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317404857062.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317404857062.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
22121317404857062.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 22121317404857062.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 172 28.264
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 172 28.250
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 172 28.237
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 172 28.224
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 172 28.212
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 172 28.200
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 172 28.189
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 172 28.178
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 172 28.168
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 172 28.159
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 172 28.150
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317404857062 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
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22121317404857062.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
22121317404857062.eigenfacs
22121317404857062.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317404857062.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317404857062.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 172 28.223
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 172 28.218
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 172 28.212
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 172 28.207
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 172 28.203
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 172 28.200
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 172 28.197
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 172 28.195
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 172 28.194
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 172 28.193
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 172 28.193
22121317404857062.10.pdb
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real 1m36.311s
user 1m35.984s
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