*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 221207114401132337.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 221207114401132337.atom to be opened.
Openam> File opened: 221207114401132337.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1573
First residue number = 149
Last residue number = 38
Number of atoms found = 14779
Mean number per residue = 9.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 21.699779 +/- 32.773196 From: -46.153000 To: 89.935000
= 49.505141 +/- 20.788101 From: 3.561000 To: 101.539000
= 58.426356 +/- 22.636740 From: 0.881000 To: 115.542000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 145 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5598 % Filled.
Pdbmat> 5501938 non-zero elements.
Pdbmat> 601571 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.41 +/- 21.41
Maximum number = 127
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.203142E+07
Pdbmat> Larger element = 520.033
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1573 non-zero elements, NRBL set to 8
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 221207114401132337.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 8
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 221207114401132337.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
221207114401132337.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 14779 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 8 residue(s) per block.
Blocpdb> 1573 residues.
Blocpdb> 67 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 72 atoms in block 2
Block first atom: 68
Blocpdb> 56 atoms in block 3
Block first atom: 140
Blocpdb> 70 atoms in block 4
Block first atom: 196
Blocpdb> 72 atoms in block 5
Block first atom: 266
Blocpdb> 65 atoms in block 6
Block first atom: 338
Blocpdb> 67 atoms in block 7
Block first atom: 403
Blocpdb> 63 atoms in block 8
Block first atom: 470
Blocpdb> 67 atoms in block 9
Block first atom: 533
Blocpdb> 73 atoms in block 10
Block first atom: 600
Blocpdb> 68 atoms in block 11
Block first atom: 673
Blocpdb> 73 atoms in block 12
Block first atom: 741
Blocpdb> 62 atoms in block 13
Block first atom: 814
Blocpdb> 55 atoms in block 14
Block first atom: 876
Blocpdb> 71 atoms in block 15
Block first atom: 931
Blocpdb> 68 atoms in block 16
Block first atom: 1002
Blocpdb> 61 atoms in block 17
Block first atom: 1070
Blocpdb> 60 atoms in block 18
Block first atom: 1131
Blocpdb> 62 atoms in block 19
Block first atom: 1191
Blocpdb> 62 atoms in block 20
Block first atom: 1253
Blocpdb> 57 atoms in block 21
Block first atom: 1315
Blocpdb> 66 atoms in block 22
Block first atom: 1372
Blocpdb> 62 atoms in block 23
Block first atom: 1438
Blocpdb> 61 atoms in block 24
Block first atom: 1500
Blocpdb> 76 atoms in block 25
Block first atom: 1561
Blocpdb> 58 atoms in block 26
Block first atom: 1637
Blocpdb> 71 atoms in block 27
Block first atom: 1695
Blocpdb> 66 atoms in block 28
Block first atom: 1766
Blocpdb> 66 atoms in block 29
Block first atom: 1832
Blocpdb> 58 atoms in block 30
Block first atom: 1898
Blocpdb> 59 atoms in block 31
Block first atom: 1956
Blocpdb> 68 atoms in block 32
Block first atom: 2015
Blocpdb> 72 atoms in block 33
Block first atom: 2083
Blocpdb> 62 atoms in block 34
Block first atom: 2155
Blocpdb> 69 atoms in block 35
Block first atom: 2217
Blocpdb> 72 atoms in block 36
Block first atom: 2286
Blocpdb> 71 atoms in block 37
Block first atom: 2358
Blocpdb> 62 atoms in block 38
Block first atom: 2429
Blocpdb> 66 atoms in block 39
Block first atom: 2491
Blocpdb> 74 atoms in block 40
Block first atom: 2557
Blocpdb> 73 atoms in block 41
Block first atom: 2631
Blocpdb> 68 atoms in block 42
Block first atom: 2704
Blocpdb> 67 atoms in block 43
Block first atom: 2772
Blocpdb> 69 atoms in block 44
Block first atom: 2839
Blocpdb> 45 atoms in block 45
Block first atom: 2908
Blocpdb> 67 atoms in block 46
Block first atom: 2953
Blocpdb> 72 atoms in block 47
Block first atom: 3020
Blocpdb> 56 atoms in block 48
Block first atom: 3092
Blocpdb> 70 atoms in block 49
Block first atom: 3148
Blocpdb> 72 atoms in block 50
Block first atom: 3218
Blocpdb> 65 atoms in block 51
Block first atom: 3290
Blocpdb> 67 atoms in block 52
Block first atom: 3355
Blocpdb> 63 atoms in block 53
Block first atom: 3422
Blocpdb> 67 atoms in block 54
Block first atom: 3485
Blocpdb> 73 atoms in block 55
Block first atom: 3552
Blocpdb> 68 atoms in block 56
Block first atom: 3625
Blocpdb> 73 atoms in block 57
Block first atom: 3693
Blocpdb> 62 atoms in block 58
Block first atom: 3766
Blocpdb> 55 atoms in block 59
Block first atom: 3828
Blocpdb> 71 atoms in block 60
Block first atom: 3883
Blocpdb> 68 atoms in block 61
Block first atom: 3954
Blocpdb> 61 atoms in block 62
Block first atom: 4022
Blocpdb> 60 atoms in block 63
Block first atom: 4083
Blocpdb> 62 atoms in block 64
Block first atom: 4143
Blocpdb> 62 atoms in block 65
Block first atom: 4205
Blocpdb> 57 atoms in block 66
Block first atom: 4267
Blocpdb> 66 atoms in block 67
Block first atom: 4324
Blocpdb> 62 atoms in block 68
Block first atom: 4390
Blocpdb> 61 atoms in block 69
Block first atom: 4452
Blocpdb> 76 atoms in block 70
Block first atom: 4513
Blocpdb> 58 atoms in block 71
Block first atom: 4589
Blocpdb> 71 atoms in block 72
Block first atom: 4647
Blocpdb> 66 atoms in block 73
Block first atom: 4718
Blocpdb> 66 atoms in block 74
Block first atom: 4784
Blocpdb> 58 atoms in block 75
Block first atom: 4850
Blocpdb> 59 atoms in block 76
Block first atom: 4908
Blocpdb> 68 atoms in block 77
Block first atom: 4967
Blocpdb> 72 atoms in block 78
Block first atom: 5035
Blocpdb> 62 atoms in block 79
Block first atom: 5107
Blocpdb> 69 atoms in block 80
Block first atom: 5169
Blocpdb> 72 atoms in block 81
Block first atom: 5238
Blocpdb> 71 atoms in block 82
Block first atom: 5310
Blocpdb> 62 atoms in block 83
Block first atom: 5381
Blocpdb> 66 atoms in block 84
Block first atom: 5443
Blocpdb> 74 atoms in block 85
Block first atom: 5509
Blocpdb> 73 atoms in block 86
Block first atom: 5583
Blocpdb> 68 atoms in block 87
Block first atom: 5656
Blocpdb> 67 atoms in block 88
Block first atom: 5724
Blocpdb> 69 atoms in block 89
Block first atom: 5791
Blocpdb> 45 atoms in block 90
Block first atom: 5860
Blocpdb> 67 atoms in block 91
Block first atom: 5905
Blocpdb> 72 atoms in block 92
Block first atom: 5972
Blocpdb> 56 atoms in block 93
Block first atom: 6044
Blocpdb> 70 atoms in block 94
Block first atom: 6100
Blocpdb> 72 atoms in block 95
Block first atom: 6170
Blocpdb> 65 atoms in block 96
Block first atom: 6242
Blocpdb> 67 atoms in block 97
Block first atom: 6307
Blocpdb> 63 atoms in block 98
Block first atom: 6374
Blocpdb> 67 atoms in block 99
Block first atom: 6437
Blocpdb> 73 atoms in block 100
Block first atom: 6504
Blocpdb> 68 atoms in block 101
Block first atom: 6577
Blocpdb> 73 atoms in block 102
Block first atom: 6645
Blocpdb> 62 atoms in block 103
Block first atom: 6718
Blocpdb> 55 atoms in block 104
Block first atom: 6780
Blocpdb> 71 atoms in block 105
Block first atom: 6835
Blocpdb> 68 atoms in block 106
Block first atom: 6906
Blocpdb> 61 atoms in block 107
Block first atom: 6974
Blocpdb> 60 atoms in block 108
Block first atom: 7035
Blocpdb> 62 atoms in block 109
Block first atom: 7095
Blocpdb> 62 atoms in block 110
Block first atom: 7157
Blocpdb> 57 atoms in block 111
Block first atom: 7219
Blocpdb> 66 atoms in block 112
Block first atom: 7276
Blocpdb> 62 atoms in block 113
Block first atom: 7342
Blocpdb> 61 atoms in block 114
Block first atom: 7404
Blocpdb> 76 atoms in block 115
Block first atom: 7465
Blocpdb> 58 atoms in block 116
Block first atom: 7541
Blocpdb> 71 atoms in block 117
Block first atom: 7599
Blocpdb> 66 atoms in block 118
Block first atom: 7670
Blocpdb> 66 atoms in block 119
Block first atom: 7736
Blocpdb> 58 atoms in block 120
Block first atom: 7802
Blocpdb> 59 atoms in block 121
Block first atom: 7860
Blocpdb> 68 atoms in block 122
Block first atom: 7919
Blocpdb> 72 atoms in block 123
Block first atom: 7987
Blocpdb> 62 atoms in block 124
Block first atom: 8059
Blocpdb> 69 atoms in block 125
Block first atom: 8121
Blocpdb> 72 atoms in block 126
Block first atom: 8190
Blocpdb> 71 atoms in block 127
Block first atom: 8262
Blocpdb> 62 atoms in block 128
Block first atom: 8333
Blocpdb> 66 atoms in block 129
Block first atom: 8395
Blocpdb> 74 atoms in block 130
Block first atom: 8461
Blocpdb> 73 atoms in block 131
Block first atom: 8535
Blocpdb> 68 atoms in block 132
Block first atom: 8608
Blocpdb> 67 atoms in block 133
Block first atom: 8676
Blocpdb> 69 atoms in block 134
Block first atom: 8743
Blocpdb> 45 atoms in block 135
Block first atom: 8812
Blocpdb> 67 atoms in block 136
Block first atom: 8857
Blocpdb> 72 atoms in block 137
Block first atom: 8924
Blocpdb> 56 atoms in block 138
Block first atom: 8996
Blocpdb> 70 atoms in block 139
Block first atom: 9052
Blocpdb> 72 atoms in block 140
Block first atom: 9122
Blocpdb> 65 atoms in block 141
Block first atom: 9194
Blocpdb> 67 atoms in block 142
Block first atom: 9259
Blocpdb> 63 atoms in block 143
Block first atom: 9326
Blocpdb> 67 atoms in block 144
Block first atom: 9389
Blocpdb> 73 atoms in block 145
Block first atom: 9456
Blocpdb> 68 atoms in block 146
Block first atom: 9529
Blocpdb> 73 atoms in block 147
Block first atom: 9597
Blocpdb> 62 atoms in block 148
Block first atom: 9670
Blocpdb> 55 atoms in block 149
Block first atom: 9732
Blocpdb> 71 atoms in block 150
Block first atom: 9787
Blocpdb> 68 atoms in block 151
Block first atom: 9858
Blocpdb> 61 atoms in block 152
Block first atom: 9926
Blocpdb> 60 atoms in block 153
Block first atom: 9987
Blocpdb> 62 atoms in block 154
Block first atom: 10047
Blocpdb> 62 atoms in block 155
Block first atom: 10109
Blocpdb> 57 atoms in block 156
Block first atom: 10171
Blocpdb> 66 atoms in block 157
Block first atom: 10228
Blocpdb> 62 atoms in block 158
Block first atom: 10294
Blocpdb> 61 atoms in block 159
Block first atom: 10356
Blocpdb> 76 atoms in block 160
Block first atom: 10417
Blocpdb> 58 atoms in block 161
Block first atom: 10493
Blocpdb> 71 atoms in block 162
Block first atom: 10551
Blocpdb> 66 atoms in block 163
Block first atom: 10622
Blocpdb> 66 atoms in block 164
Block first atom: 10688
Blocpdb> 58 atoms in block 165
Block first atom: 10754
Blocpdb> 59 atoms in block 166
Block first atom: 10812
Blocpdb> 68 atoms in block 167
Block first atom: 10871
Blocpdb> 72 atoms in block 168
Block first atom: 10939
Blocpdb> 62 atoms in block 169
Block first atom: 11011
Blocpdb> 69 atoms in block 170
Block first atom: 11073
Blocpdb> 72 atoms in block 171
Block first atom: 11142
Blocpdb> 71 atoms in block 172
Block first atom: 11214
Blocpdb> 62 atoms in block 173
Block first atom: 11285
Blocpdb> 66 atoms in block 174
Block first atom: 11347
Blocpdb> 74 atoms in block 175
Block first atom: 11413
Blocpdb> 73 atoms in block 176
Block first atom: 11487
Blocpdb> 68 atoms in block 177
Block first atom: 11560
Blocpdb> 67 atoms in block 178
Block first atom: 11628
Blocpdb> 69 atoms in block 179
Block first atom: 11695
Blocpdb> 45 atoms in block 180
Block first atom: 11764
Blocpdb> 162 atoms in block 181
Block first atom: 11809
Blocpdb> 165 atoms in block 182
Block first atom: 11971
Blocpdb> 166 atoms in block 183
Block first atom: 12136
Blocpdb> 162 atoms in block 184
Block first atom: 12302
Blocpdb> 102 atoms in block 185
Block first atom: 12464
Blocpdb> 164 atoms in block 186
Block first atom: 12566
Blocpdb> 165 atoms in block 187
Block first atom: 12730
Blocpdb> 164 atoms in block 188
Block first atom: 12895
Blocpdb> 163 atoms in block 189
Block first atom: 13059
Blocpdb> 82 atoms in block 190
Block first atom: 13222
Blocpdb> 162 atoms in block 191
Block first atom: 13304
Blocpdb> 165 atoms in block 192
Block first atom: 13466
Blocpdb> 166 atoms in block 193
Block first atom: 13631
Blocpdb> 162 atoms in block 194
Block first atom: 13797
Blocpdb> 83 atoms in block 195
Block first atom: 13959
Blocpdb> 164 atoms in block 196
Block first atom: 14042
Blocpdb> 165 atoms in block 197
Block first atom: 14206
Blocpdb> 164 atoms in block 198
Block first atom: 14371
Blocpdb> 163 atoms in block 199
Block first atom: 14535
Blocpdb> 82 atoms in block 200
Block first atom: 14697
Blocpdb> 200 blocks.
Blocpdb> At most, 166 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5502138 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 44337
Prepmat> Matrix trace = 12031420.0000
Prepmat> Last element read: 44337 44337 170.1644
Prepmat> 20101 lines saved.
Prepmat> 18525 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14779
RTB> Total mass = 14779.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 14779
RTB> Number of blocks = 200
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 190912.8884
RTB> 53700 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1200
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53700
Diagstd> Projected matrix trace = 190912.8884
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 190912.8884
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0964117 0.1682120 0.6392161 0.6936115
0.9460674 1.1016468 1.1842003 1.6921680 1.7728348
1.8275123 1.9201329 2.4177729 2.5176818 2.9196453
3.0745362 3.0973409 3.1942263 3.2956035 3.6765934
3.9079098 4.1139782 4.3114492 4.3453416 4.4944682
4.6207577 4.7946293 5.0047403 5.1174324 5.4724021
5.7243849 5.9989857 6.1349959 6.2277994 6.8061575
6.9882078 7.5062650 7.7429335 8.1237349 8.6249229
8.8840417 9.1338475 9.6481303 9.9857993 10.4193634
10.7550881 11.1858828 11.7373650 11.8646723 11.9676478
12.5818341 12.7910336 12.9999559 13.1995307 13.7853998
14.0969206 14.2165800 14.6728578 15.1734555 15.2644047
15.3092391 15.5156395 15.7354584 15.8779003 16.1048884
16.4140211 16.6752255 17.2112054 17.4599471 17.8539462
18.4234664 18.4792001 18.8736390 19.3769081 19.5809908
20.7453982 20.9589341 21.4049072 21.6256747 21.8351436
22.0376949 22.1736905 22.7731115 23.0768683 23.2577979
23.4622874 24.1051159 24.2685527 24.4761600 24.6892782
24.7863594 25.1925768 25.5456693 25.8123554 26.1109590
26.3339083 26.6690529 27.0684439 27.2743604 27.7158321
28.2229855
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034328 0.0034330 0.0034338 0.0034345
0.0034348 33.7178649 44.5372864 86.8198703 90.4385166
105.6224721 113.9767999 118.1701712 141.2592896 144.5870547
146.7997897 150.4738138 168.8507651 172.3041346 185.5497303
190.4079531 191.1128031 194.0788101 197.1345558 208.2179098
214.6681156 220.2552526 225.4794245 226.3639375 230.2154343
233.4274237 237.7786174 242.9327418 245.6525840 254.0295742
259.8122908 265.9709424 268.9691189 270.9958179 283.2998067
287.0636380 297.5138757 302.1677041 309.5089068 318.9134904
323.6686043 328.1875931 337.3004025 343.1521277 350.5224777
356.1248386 363.1870981 372.0322469 374.0443982 375.6640881
385.1831300 388.3721688 391.5310590 394.5249975 403.1855539
407.7156732 409.4424302 415.9610200 422.9972348 424.2630559
424.8856698 427.7402520 430.7596152 432.7049030 435.7868686
439.9494453 443.4361937 450.5063581 453.7501089 458.8411829
466.1019867 466.8064672 471.7621593 478.0105921 480.5212654
494.6023419 497.1413369 502.4026888 504.9869011 507.4266895
509.7748007 511.3453024 518.2108081 521.6554101 523.6963856
525.9935945 533.1505879 534.9549606 537.2382457 539.5720897
540.6318797 545.0440162 548.8503219 551.7077675 554.8897359
557.2536729 560.7884713 564.9720010 567.1168713 571.6882171
576.8949753
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14779
Rtb_to_modes> Number of blocs = 200
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6412E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1682
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6392
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6936
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9461
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.184
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.418
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.518
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.097
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.296
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.677
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.908
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.494
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.621
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.795
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.005
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.117
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.472
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.724
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.999
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.135
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.228
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.806
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.988
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.743
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.124
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.625
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.884
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.134
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.648
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.986
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 266022 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221207114401132337.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221207114401132337.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 221207114401132337.atom
Openam> file on opening on unit 11:
221207114401132337.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1573
First residue number = 149
Last residue number = 38
Number of atoms found = 14779
Mean number per residue = 9.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6412E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1682
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6392
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6936
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9461
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.184
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.296
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.677
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.908
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.494
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.621
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.795
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.005
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.117
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.472
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.724
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.135
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.806
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.743
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.124
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.625
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.884
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.134
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.648
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.986
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22
Bfactors> 106 vectors, 44337 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.096412
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.492 for 1428 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.035 +/- 0.02
Bfactors> = 184.304 +/- 40.20
Bfactors> Shiftng-fct= 184.269
Bfactors> Scaling-fct= 2057.728
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221207114401132337.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221207114401132337.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.8
Chkmod> 106 vectors, 44337 coordinates in file.
Chkmod> That is: 14779 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8509
0.0034 0.8995
0.0034 0.7639
0.0034 0.6984
0.0034 0.7417
0.0034 0.7814
33.7165 0.7850
44.5338 0.7637
86.8151 0.6089
90.4339 0.5809
105.6198 0.7711
113.9902 0.6954
118.1551 0.7443
141.2462 0.6542
144.5876 0.4841
146.8131 0.4936
150.4621 0.4732
168.8514 0.6854
172.3076 0.4658
185.5530 0.3059
190.4141 0.3935
191.0941 0.4612
194.0636 0.3890
197.1380 0.4255
208.2205 0.2627
214.6614 0.3272
220.2464 0.4491
225.4580 0.4260
226.3453 0.2787
230.1936 0.4247
233.4235 0.4633
237.7776 0.4231
242.9286 0.2600
245.6317 0.4158
254.0093 0.5364
259.7924 0.5667
265.9598 0.5578
268.9577 0.5853
270.9885 0.4012
283.2844 0.4653
287.0470 0.4393
297.4959 0.4948
302.1560 0.4187
309.5007 0.2166
318.9012 0.4039
323.6539 0.3812
328.1762 0.3123
337.2836 0.5083
343.1408 0.5083
350.5181 0.2930
356.1909 0.4076
363.2383 0.4408
372.0580 0.5869
373.9547 0.5109
375.6849 0.4798
385.1385 0.5839
388.3398 0.5628
391.5149 0.7071
394.5151 0.3720
403.2355 0.5330
407.7427 0.4059
409.4741 0.4939
415.9027 0.6138
422.9309 0.6289
424.1836 0.5216
424.8780 0.4446
427.7820 0.5661
430.8033 0.6275
432.7149 0.5116
435.7020 0.6349
439.8767 0.5805
443.4806 0.4731
450.4712 0.6061
453.7313 0.5338
458.7708 0.4811
466.0381 0.3752
466.7965 0.4757
471.6964 0.5167
478.0282 0.4956
480.4885 0.5591
494.6360 0.5582
497.1326 0.5404
502.3235 0.5082
505.0157 0.4500
507.4613 0.5558
509.7796 0.5431
511.2808 0.5116
518.1532 0.3905
521.6684 0.3748
523.6987 0.4317
525.9454 0.4480
533.1817 0.5503
534.9479 0.4580
537.2573 0.3960
539.5568 0.4720
540.6484 0.4322
544.9927 0.4581
548.8733 0.4362
551.6589 0.3567
554.8557 0.3826
557.1884 0.2313
560.7744 0.5236
564.9640 0.5151
567.0472 0.4828
571.7067 0.4319
576.8397 0.4079
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 221207114401132337 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
making animated gifs
11 models are in 221207114401132337.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 221207114401132337 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
making animated gifs
11 models are in 221207114401132337.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 221207114401132337 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
making animated gifs
11 models are in 221207114401132337.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 221207114401132337 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
making animated gifs
11 models are in 221207114401132337.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 221207114401132337 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221207114401132337.eigenfacs
221207114401132337.atom
making animated gifs
11 models are in 221207114401132337.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221207114401132337.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
221207114401132337.10.pdb
221207114401132337.11.pdb
221207114401132337.7.pdb
221207114401132337.8.pdb
221207114401132337.9.pdb
STDERR:
real 1m17.924s
user 1m17.640s
sys 0m0.228s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
