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LOGs for ID: 221129135925108001

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221129135925108001.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221129135925108001.atom to be opened. Openam> File opened: 221129135925108001.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2916 First residue number = 27 Last residue number = 1147 Number of atoms found = 22812 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 209.999990 +/- 21.958653 From: 163.548000 To: 280.806000 = 209.999972 +/- 21.958650 From: 146.028000 To: 271.959000 = 207.259318 +/- 35.858545 From: 115.696000 To: 275.091000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.4794 % Filled. Pdbmat> 8703178 non-zero elements. Pdbmat> 952019 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.47 +/- 21.35 Maximum number = 130 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.904038E+07 Pdbmat> Larger element = 491.014 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2916 non-zero elements, NRBL set to 15 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221129135925108001.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 15 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221129135925108001.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221129135925108001.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 22812 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 15 residue(s) per block. Blocpdb> 2916 residues. Blocpdb> 126 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 123 atoms in block 2 Block first atom: 127 Blocpdb> 115 atoms in block 3 Block first atom: 250 Blocpdb> 117 atoms in block 4 Block first atom: 365 Blocpdb> 121 atoms in block 5 Block first atom: 482 Blocpdb> 112 atoms in block 6 Block first atom: 603 Blocpdb> 121 atoms in block 7 Block first atom: 715 Blocpdb> 30 atoms in block 8 Block first atom: 836 Blocpdb> 66 atoms in block 9 Block first atom: 866 Blocpdb> 134 atoms in block 10 Block first atom: 932 Blocpdb> 129 atoms in block 11 Block first atom: 1066 Blocpdb> 112 atoms in block 12 Block first atom: 1195 Blocpdb> 120 atoms in block 13 Block first atom: 1307 Blocpdb> 126 atoms in block 14 Block first atom: 1427 Blocpdb> 111 atoms in block 15 Block first atom: 1553 Blocpdb> 116 atoms in block 16 Block first atom: 1664 Blocpdb> 124 atoms in block 17 Block first atom: 1780 Blocpdb> 118 atoms in block 18 Block first atom: 1904 Blocpdb> 119 atoms in block 19 Block first atom: 2022 Blocpdb> 126 atoms in block 20 Block first atom: 2141 Blocpdb> 118 atoms in block 21 Block first atom: 2267 Blocpdb> 117 atoms in block 22 Block first atom: 2385 Blocpdb> 119 atoms in block 23 Block first atom: 2502 Blocpdb> 118 atoms in block 24 Block first atom: 2621 Blocpdb> 116 atoms in block 25 Block first atom: 2739 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 2855 Blocpdb> 75 atoms in block 27 Block first atom: 2870 Blocpdb> 63 atoms in block 28 Block first atom: 2945 Blocpdb> 111 atoms in block 29 Block first atom: 3008 Blocpdb> 125 atoms in block 30 Block first atom: 3119 Blocpdb> 105 atoms in block 31 Block first atom: 3244 Blocpdb> 119 atoms in block 32 Block first atom: 3349 Blocpdb> 115 atoms in block 33 Block first atom: 3468 Blocpdb> 118 atoms in block 34 Block first atom: 3583 Blocpdb> 117 atoms in block 35 Block first atom: 3701 Blocpdb> 99 atoms in block 36 Block first atom: 3818 Blocpdb> 100 atoms in block 37 Block first atom: 3917 Blocpdb> 112 atoms in block 38 Block first atom: 4017 Blocpdb> 108 atoms in block 39 Block first atom: 4129 Blocpdb> 45 atoms in block 40 Block first atom: 4237 Blocpdb> 109 atoms in block 41 Block first atom: 4282 Blocpdb> 112 atoms in block 42 Block first atom: 4391 Blocpdb> 111 atoms in block 43 Block first atom: 4503 Blocpdb> 109 atoms in block 44 Block first atom: 4614 Blocpdb> 116 atoms in block 45 Block first atom: 4723 Blocpdb> 113 atoms in block 46 Block first atom: 4839 Blocpdb> 125 atoms in block 47 Block first atom: 4952 Blocpdb> 120 atoms in block 48 Block first atom: 5077 Blocpdb> 124 atoms in block 49 Block first atom: 5197 Blocpdb> 31 atoms in block 50 Block first atom: 5321 Blocpdb> 116 atoms in block 51 Block first atom: 5352 Blocpdb> 107 atoms in block 52 Block first atom: 5468 Blocpdb> 108 atoms in block 53 Block first atom: 5575 Blocpdb> 116 atoms in block 54 Block first atom: 5683 Blocpdb> 127 atoms in block 55 Block first atom: 5799 Blocpdb> 101 atoms in block 56 Block first atom: 5926 Blocpdb> 109 atoms in block 57 Block first atom: 6027 Blocpdb> 112 atoms in block 58 Block first atom: 6136 Blocpdb> 115 atoms in block 59 Block first atom: 6248 Blocpdb> 118 atoms in block 60 Block first atom: 6363 Blocpdb> 122 atoms in block 61 Block first atom: 6481 Blocpdb> 105 atoms in block 62 Block first atom: 6603 Blocpdb> 118 atoms in block 63 Block first atom: 6708 Blocpdb> 114 atoms in block 64 Block first atom: 6826 Blocpdb> 120 atoms in block 65 Block first atom: 6940 Blocpdb> 114 atoms in block 66 Block first atom: 7060 Blocpdb> 127 atoms in block 67 Block first atom: 7174 Blocpdb> 125 atoms in block 68 Block first atom: 7301 Blocpdb> 109 atoms in block 69 Block first atom: 7426 Blocpdb> 70 atoms in block 70 Block first atom: 7535 Blocpdb> 126 atoms in block 71 Block first atom: 7605 Blocpdb> 123 atoms in block 72 Block first atom: 7731 Blocpdb> 115 atoms in block 73 Block first atom: 7854 Blocpdb> 117 atoms in block 74 Block first atom: 7969 Blocpdb> 121 atoms in block 75 Block first atom: 8086 Blocpdb> 112 atoms in block 76 Block first atom: 8207 Blocpdb> 121 atoms in block 77 Block first atom: 8319 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 8440 Blocpdb> 66 atoms in block 79 Block first atom: 8470 Blocpdb> 134 atoms in block 80 Block first atom: 8536 Blocpdb> 129 atoms in block 81 Block first atom: 8670 Blocpdb> 112 atoms in block 82 Block first atom: 8799 Blocpdb> 120 atoms in block 83 Block first atom: 8911 Blocpdb> 126 atoms in block 84 Block first atom: 9031 Blocpdb> 111 atoms in block 85 Block first atom: 9157 Blocpdb> 116 atoms in block 86 Block first atom: 9268 Blocpdb> 124 atoms in block 87 Block first atom: 9384 Blocpdb> 118 atoms in block 88 Block first atom: 9508 Blocpdb> 119 atoms in block 89 Block first atom: 9626 Blocpdb> 126 atoms in block 90 Block first atom: 9745 Blocpdb> 118 atoms in block 91 Block first atom: 9871 Blocpdb> 117 atoms in block 92 Block first atom: 9989 Blocpdb> 119 atoms in block 93 Block first atom: 10106 Blocpdb> 118 atoms in block 94 Block first atom: 10225 Blocpdb> 116 atoms in block 95 Block first atom: 10343 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 10459 Blocpdb> 75 atoms in block 97 Block first atom: 10474 Blocpdb> 63 atoms in block 98 Block first atom: 10549 Blocpdb> 111 atoms in block 99 Block first atom: 10612 Blocpdb> 125 atoms in block 100 Block first atom: 10723 Blocpdb> 105 atoms in block 101 Block first atom: 10848 Blocpdb> 119 atoms in block 102 Block first atom: 10953 Blocpdb> 115 atoms in block 103 Block first atom: 11072 Blocpdb> 118 atoms in block 104 Block first atom: 11187 Blocpdb> 117 atoms in block 105 Block first atom: 11305 Blocpdb> 99 atoms in block 106 Block first atom: 11422 Blocpdb> 100 atoms in block 107 Block first atom: 11521 Blocpdb> 112 atoms in block 108 Block first atom: 11621 Blocpdb> 108 atoms in block 109 Block first atom: 11733 Blocpdb> 45 atoms in block 110 Block first atom: 11841 Blocpdb> 109 atoms in block 111 Block first atom: 11886 Blocpdb> 112 atoms in block 112 Block first atom: 11995 Blocpdb> 111 atoms in block 113 Block first atom: 12107 Blocpdb> 109 atoms in block 114 Block first atom: 12218 Blocpdb> 116 atoms in block 115 Block first atom: 12327 Blocpdb> 113 atoms in block 116 Block first atom: 12443 Blocpdb> 125 atoms in block 117 Block first atom: 12556 Blocpdb> 120 atoms in block 118 Block first atom: 12681 Blocpdb> 124 atoms in block 119 Block first atom: 12801 Blocpdb> 31 atoms in block 120 Block first atom: 12925 Blocpdb> 116 atoms in block 121 Block first atom: 12956 Blocpdb> 107 atoms in block 122 Block first atom: 13072 Blocpdb> 108 atoms in block 123 Block first atom: 13179 Blocpdb> 116 atoms in block 124 Block first atom: 13287 Blocpdb> 127 atoms in block 125 Block first atom: 13403 Blocpdb> 101 atoms in block 126 Block first atom: 13530 Blocpdb> 109 atoms in block 127 Block first atom: 13631 Blocpdb> 112 atoms in block 128 Block first atom: 13740 Blocpdb> 115 atoms in block 129 Block first atom: 13852 Blocpdb> 118 atoms in block 130 Block first atom: 13967 Blocpdb> 122 atoms in block 131 Block first atom: 14085 Blocpdb> 105 atoms in block 132 Block first atom: 14207 Blocpdb> 118 atoms in block 133 Block first atom: 14312 Blocpdb> 114 atoms in block 134 Block first atom: 14430 Blocpdb> 120 atoms in block 135 Block first atom: 14544 Blocpdb> 114 atoms in block 136 Block first atom: 14664 Blocpdb> 127 atoms in block 137 Block first atom: 14778 Blocpdb> 125 atoms in block 138 Block first atom: 14905 Blocpdb> 109 atoms in block 139 Block first atom: 15030 Blocpdb> 70 atoms in block 140 Block first atom: 15139 Blocpdb> 126 atoms in block 141 Block first atom: 15209 Blocpdb> 123 atoms in block 142 Block first atom: 15335 Blocpdb> 115 atoms in block 143 Block first atom: 15458 Blocpdb> 117 atoms in block 144 Block first atom: 15573 Blocpdb> 121 atoms in block 145 Block first atom: 15690 Blocpdb> 112 atoms in block 146 Block first atom: 15811 Blocpdb> 121 atoms in block 147 Block first atom: 15923 Blocpdb> 30 atoms in block 148 Block first atom: 16044 Blocpdb> 66 atoms in block 149 Block first atom: 16074 Blocpdb> 134 atoms in block 150 Block first atom: 16140 Blocpdb> 129 atoms in block 151 Block first atom: 16274 Blocpdb> 112 atoms in block 152 Block first atom: 16403 Blocpdb> 120 atoms in block 153 Block first atom: 16515 Blocpdb> 126 atoms in block 154 Block first atom: 16635 Blocpdb> 111 atoms in block 155 Block first atom: 16761 Blocpdb> 116 atoms in block 156 Block first atom: 16872 Blocpdb> 124 atoms in block 157 Block first atom: 16988 Blocpdb> 118 atoms in block 158 Block first atom: 17112 Blocpdb> 119 atoms in block 159 Block first atom: 17230 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17349 Blocpdb> 118 atoms in block 161 Block first atom: 17475 Blocpdb> 117 atoms in block 162 Block first atom: 17593 Blocpdb> 119 atoms in block 163 Block first atom: 17710 Blocpdb> 118 atoms in block 164 Block first atom: 17829 Blocpdb> 116 atoms in block 165 Block first atom: 17947 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 18063 Blocpdb> 75 atoms in block 167 Block first atom: 18078 Blocpdb> 63 atoms in block 168 Block first atom: 18153 Blocpdb> 111 atoms in block 169 Block first atom: 18216 Blocpdb> 125 atoms in block 170 Block first atom: 18327 Blocpdb> 105 atoms in block 171 Block first atom: 18452 Blocpdb> 119 atoms in block 172 Block first atom: 18557 Blocpdb> 115 atoms in block 173 Block first atom: 18676 Blocpdb> 118 atoms in block 174 Block first atom: 18791 Blocpdb> 117 atoms in block 175 Block first atom: 18909 Blocpdb> 99 atoms in block 176 Block first atom: 19026 Blocpdb> 100 atoms in block 177 Block first atom: 19125 Blocpdb> 112 atoms in block 178 Block first atom: 19225 Blocpdb> 108 atoms in block 179 Block first atom: 19337 Blocpdb> 45 atoms in block 180 Block first atom: 19445 Blocpdb> 109 atoms in block 181 Block first atom: 19490 Blocpdb> 112 atoms in block 182 Block first atom: 19599 Blocpdb> 111 atoms in block 183 Block first atom: 19711 Blocpdb> 109 atoms in block 184 Block first atom: 19822 Blocpdb> 116 atoms in block 185 Block first atom: 19931 Blocpdb> 113 atoms in block 186 Block first atom: 20047 Blocpdb> 125 atoms in block 187 Block first atom: 20160 Blocpdb> 120 atoms in block 188 Block first atom: 20285 Blocpdb> 124 atoms in block 189 Block first atom: 20405 Blocpdb> 31 atoms in block 190 Block first atom: 20529 Blocpdb> 116 atoms in block 191 Block first atom: 20560 Blocpdb> 107 atoms in block 192 Block first atom: 20676 Blocpdb> 108 atoms in block 193 Block first atom: 20783 Blocpdb> 116 atoms in block 194 Block first atom: 20891 Blocpdb> 127 atoms in block 195 Block first atom: 21007 Blocpdb> 101 atoms in block 196 Block first atom: 21134 Blocpdb> 109 atoms in block 197 Block first atom: 21235 Blocpdb> 112 atoms in block 198 Block first atom: 21344 Blocpdb> 115 atoms in block 199 Block first atom: 21456 Blocpdb> 118 atoms in block 200 Block first atom: 21571 Blocpdb> 122 atoms in block 201 Block first atom: 21689 Blocpdb> 105 atoms in block 202 Block first atom: 21811 Blocpdb> 118 atoms in block 203 Block first atom: 21916 Blocpdb> 114 atoms in block 204 Block first atom: 22034 Blocpdb> 120 atoms in block 205 Block first atom: 22148 Blocpdb> 114 atoms in block 206 Block first atom: 22268 Blocpdb> 127 atoms in block 207 Block first atom: 22382 Blocpdb> 125 atoms in block 208 Block first atom: 22509 Blocpdb> 109 atoms in block 209 Block first atom: 22634 Blocpdb> 70 atoms in block 210 Block first atom: 22742 Blocpdb> 210 blocks. Blocpdb> At most, 134 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8703388 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 68436 Prepmat> Matrix trace = 19040380.0001 Prepmat> Last element read: 68436 68436 91.7857 Prepmat> 22156 lines saved. Prepmat> 20502 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 22812 RTB> Total mass = 22812.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 22812 RTB> Number of blocks = 210 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195916.3030 RTB> 56358 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1260 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56358 Diagstd> Projected matrix trace = 195916.3030 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1260 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195916.3030 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4991741 0.4993390 0.6603587 0.7948934 0.7952452 1.0540536 1.2454244 1.4512561 1.4513299 1.9510021 2.2116201 2.2119868 2.3787312 2.3794734 2.7170284 2.7952603 2.7954509 3.1709902 3.1712208 3.2549832 3.5109455 3.6326054 3.6337381 3.9103604 4.5315695 4.5318804 5.0162988 5.1721696 5.1727386 5.4850626 5.4854441 5.5398028 6.0239990 6.0247551 6.3171204 6.6516423 6.6522875 7.2875022 7.8618907 7.9111660 7.9112524 8.2117586 8.2118703 8.8827601 9.2809410 9.2815247 9.6349614 9.7649852 9.7653518 10.1611248 10.8779651 11.1533690 11.1548619 11.3160346 11.9583800 12.2562707 12.2574084 12.9899549 12.9918839 13.3790266 13.6658290 13.6665876 14.4176069 14.5337173 14.5359526 14.9419748 15.3623941 15.3632183 15.7133560 15.7145596 16.0248224 16.7947023 17.9821174 17.9829536 18.2800288 19.2105300 19.2109992 19.2475972 19.4056202 19.6212861 19.6217256 20.1627669 20.1631518 20.8833812 20.8853557 21.1249167 22.0668921 22.0674166 22.8309947 22.8316911 23.3038067 23.5380462 23.5385732 23.6443388 24.3478909 24.3489178 24.5360695 24.8972345 25.1772686 25.1782602 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034333 0.0034334 0.0034336 0.0034338 0.0034351 76.7222472 76.7349129 88.2440088 96.8165752 96.8380020 111.4876138 121.1864208 130.8179399 130.8212659 151.6785444 161.4918253 161.5052151 167.4819320 167.5080597 178.9956065 181.5542440 181.5604347 193.3716182 193.3786490 195.9158879 203.4732497 206.9685678 207.0008309 214.7354149 231.1636816 231.1716122 243.2131079 246.9628678 246.9764518 254.3232551 254.3321001 255.5891605 266.5248613 266.5415865 272.9322513 280.0655720 280.0791547 293.1464442 304.4800063 305.4326988 305.4343667 311.1812108 311.1833284 323.6452575 330.8196410 330.8300442 337.0701302 339.3368900 339.3432592 346.1514645 358.1534267 362.6588796 362.6831503 365.2938944 375.5186017 380.1670321 380.1846766 391.3804259 391.4094852 397.1984441 401.4331844 401.4443268 412.3270919 413.9840744 414.0159089 419.7582888 425.6226501 425.6340667 430.4569809 430.4734659 434.7022553 445.0219529 460.4852195 460.4959258 464.2840002 475.9539705 475.9597827 476.4129317 478.3646116 481.0154382 481.0208258 487.6074638 487.6121179 496.2444792 496.2679382 499.1059914 510.1123831 510.1184452 518.8689675 518.8768806 524.2141199 526.8421168 526.8480146 528.0303271 535.8286779 535.8399773 537.8953338 541.8397158 544.8783940 544.8891234 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 22812 Rtb_to_modes> Number of blocs = 210 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.054 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.795 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.795 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.633 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.172 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.862 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.635 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.18 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1260 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 410616 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221129135925108001.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221129135925108001.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221129135925108001.atom Openam> file on opening on unit 11: 221129135925108001.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2916 First residue number = 27 Last residue number = 1147 Number of atoms found = 22812 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.054 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.795 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.795 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.633 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.172 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.862 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.635 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.18 Bfactors> 106 vectors, 68436 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.499200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.402 for 2916 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.01 Bfactors> = 28.253 +/- 19.45 Bfactors> Shiftng-fct= 28.238 Bfactors> Scaling-fct= 1455.017 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221129135925108001.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221129135925108001.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 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Chkmod> That is: 22812 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6953 0.0034 0.8113 0.0034 0.9889 0.0034 0.9454 0.0034 0.8875 0.0034 0.9311 76.7209 0.4214 76.7286 0.4070 88.2430 0.5226 96.8128 0.3946 96.8311 0.3709 111.4800 0.6265 121.1606 0.4221 130.8008 0.4787 130.8008 0.4862 151.6720 0.3399 161.4988 0.6756 161.4988 0.6819 167.4842 0.3983 167.4842 0.3947 178.9870 0.7640 181.5380 0.5855 181.5380 0.5882 193.3636 0.2818 193.3636 0.3022 195.9080 0.4545 203.4661 0.3383 206.9709 0.3501 206.9994 0.3538 214.7163 0.2049 231.1647 0.4623 231.1647 0.4474 243.1954 0.3964 246.9482 0.5334 246.9721 0.5331 254.3109 0.3680 254.3109 0.3706 255.5827 0.0472 266.5134 0.6318 266.5356 0.6373 272.9179 0.5707 280.0611 0.4518 280.0611 0.4459 293.1439 0.4618 304.4691 0.3553 305.4164 0.4697 305.4164 0.4663 311.1724 0.3520 311.1724 0.3542 323.6357 0.5165 330.8065 0.5562 330.8243 0.5610 337.0563 0.6130 339.3226 0.4101 339.3226 0.3969 346.1174 0.2853 358.1715 0.3123 362.5885 0.5380 362.5885 0.5496 365.3422 0.5809 375.5279 0.4716 380.2085 0.5412 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221129135925108001.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221129135925108001.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 221129135925108001 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=60 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=80 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 221129135925108001 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom calculating perturbed structure for DQ=60 221129135925108001.eigenfacs 221129135925108001.atom 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