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***  TRANSFERASE/RNA 05-DEC-14 4RWN  ***

LOGs for ID: 221128153433140407

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221128153433140407.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221128153433140407.atom to be opened. Openam> File opened: 221128153433140407.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 387 First residue number = 1 Last residue number = 19 Number of atoms found = 3641 Mean number per residue = 9.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.875277 +/- 11.391337 From: -44.432000 To: 10.372000 = -31.854302 +/- 12.349354 From: -63.229000 To: -2.023000 = 26.819099 +/- 14.762596 From: -5.717000 To: 63.368000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 38 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.3182 % Filled. Pdbmat> 1383063 non-zero elements. Pdbmat> 151268 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.09 +/- 22.86 Maximum number = 132 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 3.025360E+06 Pdbmat> Larger element = 493.159 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 387 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221128153433140407.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221128153433140407.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221128153433140407.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3641 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 387 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 85 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 101 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 121 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 138 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 156 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 172 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 187 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 200 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 222 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 238 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 254 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 268 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 284 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 299 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 316 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 335 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 353 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 370 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 390 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 401 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 414 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 428 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 446 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 461 Blocpdb> 13 atoms in block 30 Block first atom: 475 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 488 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 498 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 508 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 521 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 535 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 554 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 569 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 583 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 596 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 611 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 629 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 644 Blocpdb> 13 atoms in block 43 Block first atom: 661 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 694 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 730 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 752 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 765 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 784 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 802 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 821 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 869 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 889 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 907 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 927 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 943 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 961 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 977 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 992 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1010 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 1030 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1045 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1061 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1075 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1093 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1107 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1120 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1137 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1155 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1171 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1191 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1206 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1221 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1237 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1250 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1262 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1285 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1299 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1315 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1331 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1346 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1363 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1382 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1399 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1416 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1431 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1446 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1461 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1479 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1492 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1509 Blocpdb> 18 atoms in block 95 Block first atom: 1522 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1540 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 1557 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1585 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1604 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1623 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1642 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1656 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1673 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1688 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 1704 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1723 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1739 Blocpdb> 21 atoms in block 108 Block first atom: 1763 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1784 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1797 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 1815 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1832 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1844 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1861 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 1875 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1896 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1909 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1926 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1941 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1960 Blocpdb> 18 atoms in block 121 Block first atom: 1979 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1997 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 2007 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 2027 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 2042 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 2059 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 2071 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2084 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2104 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2118 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2135 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 2150 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2167 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 2186 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2203 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 2217 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2242 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 2256 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 2280 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2299 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2314 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2328 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2339 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2356 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2372 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2390 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2407 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 2423 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2441 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2456 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2472 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2484 Blocpdb> 11 atoms in block 153 Block first atom: 2499 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2510 Blocpdb> 8 atoms in block 155 Block first atom: 2525 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 2533 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2545 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 2562 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2582 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2602 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2615 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2633 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 2649 Blocpdb> 12 atoms in block 164 Block first atom: 2670 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2682 Blocpdb> 12 atoms in block 166 Block first atom: 2701 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2713 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2730 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2746 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2756 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 2771 Blocpdb> 21 atoms in block 172 Block first atom: 2780 Blocpdb> 16 atoms in block 173 Block first atom: 2801 Blocpdb> 18 atoms in block 174 Block first atom: 2817 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 2835 Blocpdb> 43 atoms in block 176 Block first atom: 2843 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 2886 Blocpdb> 40 atoms in block 178 Block first atom: 2926 Blocpdb> 43 atoms in block 179 Block first atom: 2966 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 3009 Blocpdb> 40 atoms in block 181 Block first atom: 3051 Blocpdb> 40 atoms in block 182 Block first atom: 3091 Blocpdb> 42 atoms in block 183 Block first atom: 3131 Blocpdb> 45 atoms in block 184 Block first atom: 3173 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 3218 Blocpdb> 37 atoms in block 186 Block first atom: 3240 Blocpdb> 42 atoms in block 187 Block first atom: 3277 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 3319 Blocpdb> 44 atoms in block 189 Block first atom: 3361 Blocpdb> 46 atoms in block 190 Block first atom: 3405 Blocpdb> 40 atoms in block 191 Block first atom: 3451 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 3491 Blocpdb> 44 atoms in block 193 Block first atom: 3535 Blocpdb> 43 atoms in block 194 Block first atom: 3579 Blocpdb> 20 atoms in block 195 Block first atom: 3621 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1383258 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10923 Prepmat> Matrix trace = 3025360.0000 Prepmat> Last element read: 10923 10923 264.7514 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 16996 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3641 RTB> Total mass = 3641.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3641 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 267501.8952 RTB> 73179 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73179 Diagstd> Projected matrix trace = 267501.8952 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 267501.8952 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.5627822 1.8610749 2.8568720 3.2914190 3.6284689 3.9362170 4.7525609 4.8728765 5.3340887 6.5185195 6.5775233 7.4369474 7.8387005 8.3464419 9.3180321 9.5750750 10.0989607 10.5693247 11.2220623 11.3838801 12.1386519 12.4734153 13.0584110 14.3197605 14.3691048 14.7858782 14.9526851 15.6127873 16.5077544 17.5062306 18.1508657 18.3597977 19.3201296 19.7526215 19.8910574 21.1259107 21.6427888 22.2671147 22.4185146 22.9271967 23.4068163 24.2812899 24.6980094 25.4444829 25.7111442 26.3165245 26.6826383 27.4527713 28.4812131 28.8513682 29.2681126 30.0720733 30.5691968 30.8960889 31.3362716 31.8774740 32.1571435 32.7921338 32.9731720 33.0572653 33.9085683 34.2019458 34.8894569 35.6792528 35.8699269 36.4082775 36.8535373 38.1467533 38.5908445 38.9719352 39.5045163 40.0349724 40.3384765 40.5221697 41.5753040 42.1706686 42.3175060 42.7151596 43.1863901 43.8560763 43.9550012 44.3235534 44.8399609 45.4750240 45.8997091 46.4467520 46.7284786 47.1381027 47.7059860 48.2083793 49.0049018 49.5252920 49.9222061 50.2981213 51.0964614 51.8615439 52.5124713 52.6415405 53.6766238 54.4798236 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034330 0.0034332 0.0034334 0.0034336 0.0034338 135.7514616 148.1416591 183.5442019 197.0093619 206.8506939 215.4441959 236.7331762 239.7110096 250.7987660 277.2488578 278.5008207 296.1369749 304.0306133 313.7227179 331.4800389 336.0209636 345.0909910 353.0359234 363.7739692 366.3873210 378.3384754 383.5199594 392.4103438 410.9255611 411.6329552 417.5599560 419.9087006 429.0772635 441.2038355 454.3511198 462.6408226 465.2959009 477.3097408 482.6225963 484.3108683 499.1177327 505.1866793 512.4213940 514.1604860 519.9609865 525.3714319 535.0953260 539.6674889 547.7622448 550.6250721 557.0697133 560.9312882 568.9687010 579.5281308 583.2818829 587.4793953 595.4934183 600.3953140 603.5969453 607.8815213 613.1083488 615.7919573 621.8420964 623.5562610 624.3508995 632.3390564 635.0686692 641.4198341 648.6391469 650.3700394 655.2323730 659.2268227 670.6934586 674.5861522 677.9087912 682.5251426 687.0922449 689.6917420 691.2603160 700.1853134 705.1808719 706.4075179 709.7187794 713.6228246 719.1345712 719.9451802 722.9571634 727.1565039 732.2877156 735.6991376 740.0702647 742.3113498 745.5578194 750.0353252 753.9743059 760.1775539 764.2031136 767.2593058 770.1426270 776.2304814 782.0202533 786.9126172 787.8790911 795.5873624 801.5177168 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3641 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.861 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.839 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.318 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.575 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 65538 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128153433140407.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128153433140407.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221128153433140407.atom Openam> file on opening on unit 11: 221128153433140407.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 387 First residue number = 1 Last residue number = 19 Number of atoms found = 3641 Mean number per residue = 9.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.861 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.839 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.575 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.48 Bfactors> 106 vectors, 10923 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.563000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.768 for 350 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.03 Bfactors> = 35.373 +/- 14.92 Bfactors> Shiftng-fct= 35.350 Bfactors> Scaling-fct= 492.128 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128153433140407.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128153433140407.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.0 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vecteur en lecture: 687.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5 Chkmod> 106 vectors, 10923 coordinates in file. Chkmod> That is: 3641 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7898 0.0034 0.9582 0.0034 0.7424 0.0034 0.9355 0.0034 0.8266 0.0034 0.8464 135.7551 0.5391 148.1323 0.5292 183.5404 0.1882 196.9884 0.1830 206.8284 0.2538 215.4290 0.4421 236.7339 0.1125 239.7038 0.0094 250.7859 0.3666 277.2472 0.2556 278.4990 0.4776 296.1253 0.6031 304.0234 0.3127 313.7009 0.2184 331.4652 0.5761 336.0052 0.3454 345.0939 0.4141 353.0320 0.4842 363.7249 0.3192 366.3092 0.3403 378.3432 0.1163 383.4510 0.4513 392.4174 0.2347 410.9114 0.3030 411.6281 0.4162 417.6002 0.4330 419.8530 0.3707 429.0205 0.0834 441.2149 0.1279 454.3805 0.6057 462.6099 0.4456 465.2785 0.4678 477.2877 0.4176 482.5699 0.1940 484.2772 0.2526 499.1446 0.1608 505.1324 0.3661 512.4326 0.4862 514.1554 0.3476 519.9705 0.3767 525.3846 0.4319 535.0581 0.4120 539.6661 0.3822 547.6905 0.3306 550.5892 0.2733 557.0826 0.4874 560.8795 0.4946 568.9156 0.5831 579.4909 0.4772 583.2430 0.3875 587.4731 0.4802 595.4473 0.2659 600.3774 0.4145 603.6092 0.3788 607.8916 0.2004 613.1063 0.1535 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128153433140407.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128153433140407.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 221128153433140407 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=60 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=80 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 221128153433140407 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom calculating perturbed structure for DQ=60 221128153433140407.eigenfacs 221128153433140407.atom 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