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LOGs for ID: 221128051311117986

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221128051311117986.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221128051311117986.atom to be opened. Openam> File opened: 221128051311117986.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.001277 +/- 16.735934 From: -36.983000 To: 34.444000 = 1.435315 +/- 11.689866 From: -23.616000 To: 26.330000 = -0.000690 +/- 16.712318 From: -34.222000 To: 35.443000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3180 % Filled. Pdbmat> 10525108 non-zero elements. Pdbmat> 1160803 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 174.28 +/- 44.97 Maximum number = 259 Minimum number = 23 Pdbmat> Matrix trace = 2.321606E+07 Pdbmat> Larger element = 893.778 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 908 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221128051311117986.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221128051311117986.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221128051311117986.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13321 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 908 residues. Blocpdb> 98 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 99 Blocpdb> 84 atoms in block 3 Block first atom: 170 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 254 Blocpdb> 63 atoms in block 5 Block first atom: 314 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 377 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 441 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 500 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 571 Blocpdb> 80 atoms in block 10 Block first atom: 646 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 726 Blocpdb> 65 atoms in block 12 Block first atom: 788 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 853 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 927 Blocpdb> 70 atoms in block 15 Block first atom: 996 Blocpdb> 83 atoms in block 16 Block first atom: 1066 Blocpdb> 83 atoms in block 17 Block first atom: 1149 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1232 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1310 Blocpdb> 79 atoms in block 20 Block first atom: 1369 Blocpdb> 63 atoms in block 21 Block first atom: 1448 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1511 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1589 Blocpdb> 63 atoms in block 24 Block first atom: 1655 Blocpdb> 64 atoms in block 25 Block first atom: 1718 Blocpdb> 65 atoms in block 26 Block first atom: 1782 Blocpdb> 63 atoms in block 27 Block first atom: 1847 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 1910 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 1988 Blocpdb> 83 atoms in block 30 Block first atom: 2065 Blocpdb> 74 atoms in block 31 Block first atom: 2148 Blocpdb> 72 atoms in block 32 Block first atom: 2222 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2294 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2366 Blocpdb> 93 atoms in block 35 Block first atom: 2435 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2528 Blocpdb> 69 atoms in block 37 Block first atom: 2602 Blocpdb> 73 atoms in block 38 Block first atom: 2671 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2744 Blocpdb> 64 atoms in block 40 Block first atom: 2813 Blocpdb> 96 atoms in block 41 Block first atom: 2877 Blocpdb> 90 atoms in block 42 Block first atom: 2973 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 3063 Blocpdb> 65 atoms in block 44 Block first atom: 3132 Blocpdb> 104 atoms in block 45 Block first atom: 3197 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 3301 Blocpdb> 98 atoms in block 47 Block first atom: 3331 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 3429 Blocpdb> 84 atoms in block 49 Block first atom: 3500 Blocpdb> 60 atoms in block 50 Block first atom: 3584 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3644 Blocpdb> 64 atoms in block 52 Block first atom: 3707 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 3771 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3830 Blocpdb> 75 atoms in block 55 Block first atom: 3901 Blocpdb> 80 atoms in block 56 Block first atom: 3976 Blocpdb> 62 atoms in block 57 Block first atom: 4056 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 4118 Blocpdb> 74 atoms in block 59 Block first atom: 4183 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 4257 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 4326 Blocpdb> 83 atoms in block 62 Block first atom: 4396 Blocpdb> 83 atoms in block 63 Block first atom: 4479 Blocpdb> 78 atoms in block 64 Block first atom: 4562 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4640 Blocpdb> 79 atoms in block 66 Block first atom: 4699 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4778 Blocpdb> 78 atoms in block 68 Block first atom: 4841 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4919 Blocpdb> 63 atoms in block 70 Block first atom: 4985 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 5048 Blocpdb> 65 atoms in block 72 Block first atom: 5112 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 5177 Blocpdb> 78 atoms in block 74 Block first atom: 5240 Blocpdb> 77 atoms in block 75 Block first atom: 5318 Blocpdb> 83 atoms in block 76 Block first atom: 5395 Blocpdb> 74 atoms in block 77 Block first atom: 5478 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5552 Blocpdb> 72 atoms in block 79 Block first atom: 5624 Blocpdb> 69 atoms in block 80 Block first atom: 5696 Blocpdb> 93 atoms in block 81 Block first atom: 5765 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 5858 Blocpdb> 69 atoms in block 83 Block first atom: 5932 Blocpdb> 73 atoms in block 84 Block first atom: 6001 Blocpdb> 69 atoms in block 85 Block first atom: 6074 Blocpdb> 64 atoms in block 86 Block first atom: 6143 Blocpdb> 96 atoms in block 87 Block first atom: 6207 Blocpdb> 90 atoms in block 88 Block first atom: 6303 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 6393 Blocpdb> 65 atoms in block 90 Block first atom: 6462 Blocpdb> 104 atoms in block 91 Block first atom: 6527 Blocpdb> 30 atoms in block 92 Block first atom: 6631 Blocpdb> 98 atoms in block 93 Block first atom: 6661 Blocpdb> 71 atoms in block 94 Block first atom: 6759 Blocpdb> 84 atoms in block 95 Block first atom: 6830 Blocpdb> 60 atoms in block 96 Block first atom: 6914 Blocpdb> 63 atoms in block 97 Block first atom: 6974 Blocpdb> 64 atoms in block 98 Block first atom: 7037 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 7101 Blocpdb> 71 atoms in block 100 Block first atom: 7160 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 7231 Blocpdb> 80 atoms in block 102 Block first atom: 7306 Blocpdb> 62 atoms in block 103 Block first atom: 7386 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 7448 Blocpdb> 74 atoms in block 105 Block first atom: 7513 Blocpdb> 69 atoms in block 106 Block first atom: 7587 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7656 Blocpdb> 83 atoms in block 108 Block first atom: 7726 Blocpdb> 83 atoms in block 109 Block first atom: 7809 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 7892 Blocpdb> 59 atoms in block 111 Block first atom: 7970 Blocpdb> 79 atoms in block 112 Block first atom: 8029 Blocpdb> 63 atoms in block 113 Block first atom: 8108 Blocpdb> 78 atoms in block 114 Block first atom: 8171 Blocpdb> 66 atoms in block 115 Block first atom: 8249 Blocpdb> 63 atoms in block 116 Block first atom: 8315 Blocpdb> 64 atoms in block 117 Block first atom: 8378 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 8442 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 8507 Blocpdb> 78 atoms in block 120 Block first atom: 8570 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 8648 Blocpdb> 83 atoms in block 122 Block first atom: 8725 Blocpdb> 74 atoms in block 123 Block first atom: 8808 Blocpdb> 72 atoms in block 124 Block first atom: 8882 Blocpdb> 72 atoms in block 125 Block first atom: 8954 Blocpdb> 69 atoms in block 126 Block first atom: 9026 Blocpdb> 93 atoms in block 127 Block first atom: 9095 Blocpdb> 74 atoms in block 128 Block first atom: 9188 Blocpdb> 69 atoms in block 129 Block first atom: 9262 Blocpdb> 73 atoms in block 130 Block first atom: 9331 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9404 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 9473 Blocpdb> 96 atoms in block 133 Block first atom: 9537 Blocpdb> 90 atoms in block 134 Block first atom: 9633 Blocpdb> 69 atoms in block 135 Block first atom: 9723 Blocpdb> 65 atoms in block 136 Block first atom: 9792 Blocpdb> 104 atoms in block 137 Block first atom: 9857 Blocpdb> 30 atoms in block 138 Block first atom: 9961 Blocpdb> 98 atoms in block 139 Block first atom: 9991 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 10089 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 10160 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 10244 Blocpdb> 63 atoms in block 143 Block first atom: 10304 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 10367 Blocpdb> 59 atoms in block 145 Block first atom: 10431 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 10490 Blocpdb> 75 atoms in block 147 Block first atom: 10561 Blocpdb> 80 atoms in block 148 Block first atom: 10636 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 10716 Blocpdb> 65 atoms in block 150 Block first atom: 10778 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 10843 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 10917 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 10986 Blocpdb> 83 atoms in block 154 Block first atom: 11056 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 11139 Blocpdb> 78 atoms in block 156 Block first atom: 11222 Blocpdb> 59 atoms in block 157 Block first atom: 11300 Blocpdb> 79 atoms in block 158 Block first atom: 11359 Blocpdb> 63 atoms in block 159 Block first atom: 11438 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 11501 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 11579 Blocpdb> 63 atoms in block 162 Block first atom: 11645 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 11708 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 11773 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 11838 Blocpdb> 78 atoms in block 166 Block first atom: 11901 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 11979 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 12056 Blocpdb> 74 atoms in block 169 Block first atom: 12139 Blocpdb> 72 atoms in block 170 Block first atom: 12213 Blocpdb> 72 atoms in block 171 Block first atom: 12285 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 12357 Blocpdb> 93 atoms in block 173 Block first atom: 12426 Blocpdb> 74 atoms in block 174 Block first atom: 12519 Blocpdb> 69 atoms in block 175 Block first atom: 12593 Blocpdb> 73 atoms in block 176 Block first atom: 12662 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 12735 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12804 Blocpdb> 96 atoms in block 179 Block first atom: 12868 Blocpdb> 90 atoms in block 180 Block first atom: 12964 Blocpdb> 69 atoms in block 181 Block first atom: 13054 Blocpdb> 65 atoms in block 182 Block first atom: 13123 Blocpdb> 104 atoms in block 183 Block first atom: 13188 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 13291 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10525292 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39963 Prepmat> Matrix trace = 23216060.0000 Prepmat> Last element read: 39963 39963 96.5021 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15049 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13321 RTB> Total mass = 13321.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13321 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 465396.5005 RTB> 68196 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68196 Diagstd> Projected matrix trace = 465396.5005 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 465396.5005 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.7696548 8.3410055 14.1145610 15.0544815 16.1468831 18.4983128 18.9091427 19.5314432 20.7162551 20.7365363 25.0735552 25.4640155 26.7728643 29.6522001 30.7826420 31.6010681 32.1546638 32.6494496 34.1528303 34.7095781 36.1157859 36.5467069 37.2835946 37.9794060 39.1972043 40.0292874 42.1672218 44.2897700 45.2876750 45.9803555 46.8344131 49.4533650 50.4366655 51.4013071 53.2305967 54.2251097 55.4788275 56.8932392 57.9098952 59.8975766 61.5362189 61.7975619 62.6038549 63.3024431 64.6642074 65.3873373 65.4523629 65.8433941 67.6464316 69.1007776 69.5843428 70.1305731 71.0965335 72.1005109 73.0629365 73.2911101 73.7782081 75.4881671 77.6106713 78.1050338 79.5563490 80.5250104 81.2090872 82.7777209 83.5188865 84.7109483 85.6737603 86.5637696 87.2441179 88.6396330 89.1110907 89.3219450 90.1353332 91.4720084 93.0098135 93.7361634 94.7565723 96.3780042 97.1759228 97.8582414 98.3556550 99.5779077 101.1517410 101.4877330 103.2258375 104.2424349 104.9255032 105.4918509 107.2906109 107.5800004 108.8253643 109.0736511 109.2688813 109.6805188 111.1596623 112.0278028 113.5017786 114.9409077 115.8874725 117.6277295 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034325 0.0034329 0.0034341 0.0034359 0.0034383 260.8375988 313.6205303 407.9706948 421.3356251 436.3546728 467.0478092 472.2056727 479.9129269 494.2548108 494.4966900 543.7549693 547.9724509 561.8788673 591.3215976 602.4877564 610.4444667 615.7682142 620.4877512 634.6125121 639.7642198 652.5951100 656.4768346 663.0620448 669.2206975 679.8652234 687.0434598 705.1520524 722.6815923 730.7777112 736.3451703 743.1522917 763.6479747 771.2025618 778.5425655 792.2749916 799.6418217 808.8331033 819.0786594 826.3645342 840.4268252 851.8452067 853.6521747 859.2030664 863.9836344 873.2272092 878.0962175 878.5327282 881.1531236 893.1362698 902.6860843 905.8390631 909.3874873 915.6289029 922.0711871 928.2048681 929.6531176 932.7372730 943.4843929 956.6564417 959.6984486 968.5737669 974.4525021 978.5828373 987.9887804 992.4019937 999.4591585 1005.1229623 1010.3302597 1014.2928363 1022.3727253 1025.0880248 1026.3000875 1030.9623716 1038.5786430 1047.2724213 1051.3537480 1057.0607599 1066.0663729 1070.4702866 1074.2218549 1076.9485301 1083.6194177 1092.1491730 1093.9615454 1103.2895074 1108.7089510 1112.3355326 1115.3334732 1124.8021538 1126.3180682 1132.8185322 1134.1100675 1135.1245817 1137.2606913 1144.9035174 1149.3655860 1156.9021117 1164.2133942 1168.9973478 1177.7419307 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13321 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0026E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 239778 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128051311117986.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128051311117986.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221128051311117986.atom Openam> file on opening on unit 11: 221128051311117986.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0026E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.6 Bfactors> 106 vectors, 39963 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.770000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.544 for 908 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.002 +/- 0.00 Bfactors> = 13.618 +/- 19.69 Bfactors> Shiftng-fct= 13.616 Bfactors> Scaling-fct= 11254.966 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128051311117986.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128051311117986.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4383E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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calculating perturbed structure for DQ=100 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom making animated gifs 11 models are in 221128051311117986.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128051311117986.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128051311117986.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 221128051311117986 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221128051311117986.eigenfacs 221128051311117986.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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