*** Phrb Pseudomonas fluorescens model 5 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 221006205537110470.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 221006205537110470.atom to be opened.
Openam> File opened: 221006205537110470.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 481
First residue number = 1
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3831
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.681548 +/- 15.375139 From: -34.869000 To: 44.615000
= -0.026235 +/- 10.579322 From: -24.277000 To: 29.884000
= -1.584238 +/- 14.072911 From: -42.571000 To: 31.916000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2137 % Filled.
Pdbmat> 1462147 non-zero elements.
Pdbmat> 159934 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.49 +/- 23.41
Maximum number = 131
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 3.198680E+06
Pdbmat> Larger element = 501.304
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
481 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 221006205537110470.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 221006205537110470.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
221006205537110470.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3831 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 481 residues.
Blocpdb> 25 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 30 atoms in block 2
Block first atom: 26
Blocpdb> 25 atoms in block 3
Block first atom: 56
Blocpdb> 26 atoms in block 4
Block first atom: 81
Blocpdb> 26 atoms in block 5
Block first atom: 107
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 133
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 153
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 169
Blocpdb> 17 atoms in block 9
Block first atom: 192
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 209
Blocpdb> 28 atoms in block 11
Block first atom: 228
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 256
Blocpdb> 31 atoms in block 13
Block first atom: 274
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 305
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 328
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 348
Blocpdb> 33 atoms in block 17
Block first atom: 370
Blocpdb> 27 atoms in block 18
Block first atom: 403
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 430
Blocpdb> 23 atoms in block 20
Block first atom: 457
Blocpdb> 20 atoms in block 21
Block first atom: 480
Blocpdb> 27 atoms in block 22
Block first atom: 500
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 527
Blocpdb> 27 atoms in block 24
Block first atom: 550
Blocpdb> 20 atoms in block 25
Block first atom: 577
Blocpdb> 32 atoms in block 26
Block first atom: 597
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 629
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 649
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 675
Blocpdb> 23 atoms in block 30
Block first atom: 692
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 715
Blocpdb> 21 atoms in block 32
Block first atom: 734
Blocpdb> 23 atoms in block 33
Block first atom: 755
Blocpdb> 29 atoms in block 34
Block first atom: 778
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 807
Blocpdb> 27 atoms in block 36
Block first atom: 828
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 855
Blocpdb> 23 atoms in block 38
Block first atom: 879
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 902
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 924
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 945
Blocpdb> 32 atoms in block 42
Block first atom: 962
Blocpdb> 28 atoms in block 43
Block first atom: 994
Blocpdb> 25 atoms in block 44
Block first atom: 1022
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1047
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 1074
Blocpdb> 26 atoms in block 47
Block first atom: 1091
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 1117
Blocpdb> 32 atoms in block 49
Block first atom: 1135
Blocpdb> 24 atoms in block 50
Block first atom: 1167
Blocpdb> 31 atoms in block 51
Block first atom: 1191
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1222
Blocpdb> 29 atoms in block 53
Block first atom: 1244
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1273
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 1295
Blocpdb> 24 atoms in block 56
Block first atom: 1316
Blocpdb> 19 atoms in block 57
Block first atom: 1340
Blocpdb> 25 atoms in block 58
Block first atom: 1359
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 1384
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1403
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1423
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1443
Blocpdb> 25 atoms in block 63
Block first atom: 1467
Blocpdb> 26 atoms in block 64
Block first atom: 1492
Blocpdb> 20 atoms in block 65
Block first atom: 1518
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1538
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1561
Blocpdb> 26 atoms in block 68
Block first atom: 1585
Blocpdb> 18 atoms in block 69
Block first atom: 1611
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1629
Blocpdb> 30 atoms in block 71
Block first atom: 1652
Blocpdb> 28 atoms in block 72
Block first atom: 1682
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1710
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 1730
Blocpdb> 33 atoms in block 75
Block first atom: 1755
Blocpdb> 28 atoms in block 76
Block first atom: 1788
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 1816
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 1839
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1860
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1877
Blocpdb> 27 atoms in block 81
Block first atom: 1900
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1927
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1941
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 1963
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 1990
Blocpdb> 18 atoms in block 86
Block first atom: 2014
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 2032
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 2055
Blocpdb> 26 atoms in block 89
Block first atom: 2077
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 2103
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 2120
Blocpdb> 29 atoms in block 92
Block first atom: 2138
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2167
Blocpdb> 33 atoms in block 94
Block first atom: 2192
Blocpdb> 32 atoms in block 95
Block first atom: 2225
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2257
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 2284
Blocpdb> 30 atoms in block 98
Block first atom: 2303
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 2333
Blocpdb> 26 atoms in block 100
Block first atom: 2357
Blocpdb> 29 atoms in block 101
Block first atom: 2383
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2412
Blocpdb> 18 atoms in block 103
Block first atom: 2437
Blocpdb> 35 atoms in block 104
Block first atom: 2455
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 2490
Blocpdb> 21 atoms in block 106
Block first atom: 2511
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 2532
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2560
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 2585
Blocpdb> 23 atoms in block 110
Block first atom: 2604
Blocpdb> 18 atoms in block 111
Block first atom: 2627
Blocpdb> 28 atoms in block 112
Block first atom: 2645
Blocpdb> 25 atoms in block 113
Block first atom: 2673
Blocpdb> 25 atoms in block 114
Block first atom: 2698
Blocpdb> 26 atoms in block 115
Block first atom: 2723
Blocpdb> 30 atoms in block 116
Block first atom: 2749
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 2779
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 2801
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 2825
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2849
Blocpdb> 30 atoms in block 121
Block first atom: 2873
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 2903
Blocpdb> 31 atoms in block 123
Block first atom: 2927
Blocpdb> 30 atoms in block 124
Block first atom: 2958
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2988
Blocpdb> 20 atoms in block 126
Block first atom: 3014
Blocpdb> 18 atoms in block 127
Block first atom: 3034
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 3052
Blocpdb> 27 atoms in block 129
Block first atom: 3072
Blocpdb> 26 atoms in block 130
Block first atom: 3099
Blocpdb> 17 atoms in block 131
Block first atom: 3125
Blocpdb> 21 atoms in block 132
Block first atom: 3142
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3163
Blocpdb> 30 atoms in block 134
Block first atom: 3187
Blocpdb> 26 atoms in block 135
Block first atom: 3217
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 3243
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 3266
Blocpdb> 25 atoms in block 138
Block first atom: 3290
Blocpdb> 21 atoms in block 139
Block first atom: 3315
Blocpdb> 28 atoms in block 140
Block first atom: 3336
Blocpdb> 32 atoms in block 141
Block first atom: 3364
Blocpdb> 24 atoms in block 142
Block first atom: 3396
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 3420
Blocpdb> 26 atoms in block 144
Block first atom: 3437
Blocpdb> 26 atoms in block 145
Block first atom: 3463
Blocpdb> 20 atoms in block 146
Block first atom: 3489
Blocpdb> 20 atoms in block 147
Block first atom: 3509
Blocpdb> 23 atoms in block 148
Block first atom: 3529
Blocpdb> 16 atoms in block 149
Block first atom: 3552
Blocpdb> 27 atoms in block 150
Block first atom: 3568
Blocpdb> 23 atoms in block 151
Block first atom: 3595
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 3618
Blocpdb> 19 atoms in block 153
Block first atom: 3641
Blocpdb> 31 atoms in block 154
Block first atom: 3660
Blocpdb> 18 atoms in block 155
Block first atom: 3691
Blocpdb> 25 atoms in block 156
Block first atom: 3709
Blocpdb> 23 atoms in block 157
Block first atom: 3734
Blocpdb> 26 atoms in block 158
Block first atom: 3757
Blocpdb> 18 atoms in block 159
Block first atom: 3783
Blocpdb> 23 atoms in block 160
Block first atom: 3801
Blocpdb> 8 atoms in block 161
Block first atom: 3823
Blocpdb> 161 blocks.
Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1462308 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11493
Prepmat> Matrix trace = 3198680.0000
Prepmat> Last element read: 11493 11493 12.1780
Prepmat> 13042 lines saved.
Prepmat> 11391 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3831
RTB> Total mass = 3831.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3831
RTB> Number of blocks = 161
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 210428.4151
RTB> 56985 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 966
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56985
Diagstd> Projected matrix trace = 210428.4151
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 966 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 210428.4151
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6909545 1.5013480 2.2931926 2.4491882
2.9271797 3.3131400 3.8652358 5.5058128 6.0279977
7.0839140 7.5380053 8.2177845 8.6263947 9.4275109
9.5320120 10.7246194 11.1798177 11.8361385 12.8091457
13.0892492 13.3055903 15.0229801 15.2740950 15.8461862
16.2278345 17.1805213 17.9346710 18.2657774 19.5737241
20.7598496 20.9999398 21.2889929 22.0437139 22.8755579
23.0143137 23.7125542 24.0382365 25.3314088 26.1138527
26.2714504 26.7016759 28.3424198 28.6986173 29.0823761
29.6488124 30.5024610 30.8675756 32.4796360 33.3533921
33.8733038 33.9798515 34.6265626 35.3200830 35.4875940
36.4299310 37.0416980 37.3034638 38.2589624 38.4706011
38.7693162 39.5799646 40.0802114 40.6986600 40.8997827
41.6486116 42.1897881 42.6779981 43.1894848 44.5784552
44.8830773 45.6343417 45.9886203 46.7725590 46.9937699
48.0399531 48.5454613 49.1120868 49.4809408 49.8640417
50.2872834 50.7571027 51.3881771 52.0416037 52.3054507
52.8516909 53.4914140 53.8856841 54.2347364 54.6677616
55.5137159 55.6680375 55.9744594 56.2584145 56.9347123
57.0311557 57.3612629 57.9721049 58.5762294 58.8699421
59.2219289
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034334 0.0034335 0.0034338 0.0034344
0.0034356 90.2651282 133.0564599 164.4430571 169.9442059
185.7889907 197.6583536 213.4928208 254.8038586 266.6133053
289.0226769 298.1422336 311.2953653 318.9407001 333.4216535
335.2645002 355.6200383 363.0886234 373.5943506 388.6470387
392.8734211 396.1068513 420.8945731 424.3977023 432.2725499
437.4471235 450.1045973 459.8773149 464.1029837 480.4320938
494.7745835 497.6274232 501.0405078 509.8444115 519.3751039
520.9479034 528.7914794 532.4104637 546.5437745 554.9204828
556.5924427 561.1313593 578.1143420 581.7357679 585.6123453
591.2878173 599.7395928 603.3183586 618.8720328 627.1411312
632.0101589 633.0033644 638.9986944 645.3660841 646.8946483
655.4271907 660.9075656 663.2387015 671.6791606 673.5343764
676.1442369 683.1765971 687.4803383 692.7640390 694.4736635
700.8023416 705.3407126 709.4099900 713.6483927 725.0330230
727.5060226 733.5693463 736.4113451 742.6613896 744.4155276
752.6560688 756.6056788 761.0084414 763.8608546 766.8122090
770.0596502 773.6485082 778.4431227 783.3766383 785.3599575
789.4501716 794.2135995 797.1351877 799.7127997 802.8990168
809.0873841 810.2111881 812.4380110 814.4961285 819.3771440
820.0708338 822.4407726 826.8082759 831.1051746 833.1862314
835.6733535
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3831
Rtb_to_modes> Number of blocs = 161
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6910
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.293
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.449
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.313
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.865
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.028
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.218
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.626
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.428
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.22
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001
0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002
1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 68958 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001
0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002
1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221006205537110470.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221006205537110470.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 221006205537110470.atom
Openam> file on opening on unit 11:
221006205537110470.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 481
First residue number = 1
Last residue number = 481
Number of atoms found = 3831
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6910
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.293
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.449
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.313
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.865
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.218
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.626
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.428
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.22
Bfactors> 106 vectors, 11493 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.691000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.847 for 481 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.030 +/- 0.09
Bfactors> = 95.574 +/- 9.69
Bfactors> Shiftng-fct= 95.544
Bfactors> Scaling-fct= 108.367
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221006205537110470.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221006205537110470.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6
Chkmod> 106 vectors, 11493 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3831 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7882
0.0034 0.8522
0.0034 0.7333
0.0034 0.7823
0.0034 0.9204
0.0034 0.9358
90.2642 0.0282
133.0353 0.0284
164.4291 0.1823
169.9304 0.2242
185.7753 0.0722
197.6457 0.2460
213.4771 0.4006
254.7973 0.4407
266.6019 0.3184
289.0120 0.5237
298.1293 0.0338
311.2861 0.3098
318.9197 0.3954
333.4160 0.5337
335.2499 0.3966
355.5282 0.2216
363.0760 0.1534
373.6392 0.0579
388.6433 0.3403
392.8678 0.4370
396.1555 0.2861
420.8348 0.2160
424.3226 0.4562
432.3060 0.4040
437.4575 0.5269
450.0784 0.4238
459.7977 0.3697
464.1367 0.4170
480.3658 0.4424
494.7551 0.4387
497.6068 0.2884
501.0308 0.3533
509.7796 0.2942
519.4032 0.3048
520.8767 0.3311
528.7403 0.4405
532.4071 0.4005
546.5051 0.5887
554.8557 0.5014
556.5532 0.3370
561.0897 0.5865
578.0648 0.0851
581.7248 0.5552
585.5633 0.2944
591.2743 0.2394
599.6897 0.4047
603.3162 0.4846
618.8489 0.5346
627.0823 0.3630
631.9522 0.3706
632.9776 0.2020
639.0030 0.4423
645.3376 0.4974
646.8888 0.1375
655.3997 0.4183
660.8640 0.4194
663.1794 0.4160
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MODEL 1 will be plotted
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getting mode 9
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getting mode 10
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getting mode 11
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 12
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 221006205537110470 13 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 221006205537110470.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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11 models are in 221006205537110470.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 14
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 221006205537110470 15 -100 100 20 on 0
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 221006205537110470 16 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
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making animated gifs
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221006205537110470.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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elNémo
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by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
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