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***  Phrb Pseudomonas fluorescens model 5   ***

LOGs for ID: 221006205537110470

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221006205537110470.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221006205537110470.atom to be opened. Openam> File opened: 221006205537110470.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 481 First residue number = 1 Last residue number = 481 Number of atoms found = 3831 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.681548 +/- 15.375139 From: -34.869000 To: 44.615000 = -0.026235 +/- 10.579322 From: -24.277000 To: 29.884000 = -1.584238 +/- 14.072911 From: -42.571000 To: 31.916000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.2137 % Filled. Pdbmat> 1462147 non-zero elements. Pdbmat> 159934 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.49 +/- 23.41 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 3.198680E+06 Pdbmat> Larger element = 501.304 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 481 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221006205537110470.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221006205537110470.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221006205537110470.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3831 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 481 residues. Blocpdb> 25 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 30 atoms in block 2 Block first atom: 26 Blocpdb> 25 atoms in block 3 Block first atom: 56 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 81 Blocpdb> 26 atoms in block 5 Block first atom: 107 Blocpdb> 20 atoms in block 6 Block first atom: 133 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 153 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 169 Blocpdb> 17 atoms in block 9 Block first atom: 192 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 209 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 228 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 256 Blocpdb> 31 atoms in block 13 Block first atom: 274 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 305 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 328 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 348 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 370 Blocpdb> 27 atoms in block 18 Block first atom: 403 Blocpdb> 27 atoms in block 19 Block first atom: 430 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 457 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 480 Blocpdb> 27 atoms in block 22 Block first atom: 500 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 527 Blocpdb> 27 atoms in block 24 Block first atom: 550 Blocpdb> 20 atoms in block 25 Block first atom: 577 Blocpdb> 32 atoms in block 26 Block first atom: 597 Blocpdb> 20 atoms in block 27 Block first atom: 629 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 649 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 675 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 692 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 715 Blocpdb> 21 atoms in block 32 Block first atom: 734 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 755 Blocpdb> 29 atoms in block 34 Block first atom: 778 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 807 Blocpdb> 27 atoms in block 36 Block first atom: 828 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 855 Blocpdb> 23 atoms in block 38 Block first atom: 879 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 902 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 924 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 945 Blocpdb> 32 atoms in block 42 Block first atom: 962 Blocpdb> 28 atoms in block 43 Block first atom: 994 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 1022 Blocpdb> 27 atoms in block 45 Block first atom: 1047 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 1074 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1091 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 1117 Blocpdb> 32 atoms in block 49 Block first atom: 1135 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 1167 Blocpdb> 31 atoms in block 51 Block first atom: 1191 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 1222 Blocpdb> 29 atoms in block 53 Block first atom: 1244 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 1273 Blocpdb> 21 atoms in block 55 Block first atom: 1295 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1316 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 1340 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1359 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 1384 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1403 Blocpdb> 20 atoms in block 61 Block first atom: 1423 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 1443 Blocpdb> 25 atoms in block 63 Block first atom: 1467 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1492 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1518 Blocpdb> 23 atoms in block 66 Block first atom: 1538 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 1561 Blocpdb> 26 atoms in block 68 Block first atom: 1585 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1611 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1629 Blocpdb> 30 atoms in block 71 Block first atom: 1652 Blocpdb> 28 atoms in block 72 Block first atom: 1682 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1710 Blocpdb> 25 atoms in block 74 Block first atom: 1730 Blocpdb> 33 atoms in block 75 Block first atom: 1755 Blocpdb> 28 atoms in block 76 Block first atom: 1788 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1816 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1839 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1860 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1877 Blocpdb> 27 atoms in block 81 Block first atom: 1900 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1927 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1941 Blocpdb> 27 atoms in block 84 Block first atom: 1963 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 1990 Blocpdb> 18 atoms in block 86 Block first atom: 2014 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 2032 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2055 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 2077 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 2103 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 2120 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2138 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 2167 Blocpdb> 33 atoms in block 94 Block first atom: 2192 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2225 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2257 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2284 Blocpdb> 30 atoms in block 98 Block first atom: 2303 Blocpdb> 24 atoms in block 99 Block first atom: 2333 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 101 Block first atom: 2383 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2412 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 2437 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 2455 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2490 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 2511 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2532 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2560 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 2585 Blocpdb> 23 atoms in block 110 Block first atom: 2604 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 2627 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 2645 Blocpdb> 25 atoms in block 113 Block first atom: 2673 Blocpdb> 25 atoms in block 114 Block first atom: 2698 Blocpdb> 26 atoms in block 115 Block first atom: 2723 Blocpdb> 30 atoms in block 116 Block first atom: 2749 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 2779 Blocpdb> 24 atoms in block 118 Block first atom: 2801 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 2825 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 2849 Blocpdb> 30 atoms in block 121 Block first atom: 2873 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2903 Blocpdb> 31 atoms in block 123 Block first atom: 2927 Blocpdb> 30 atoms in block 124 Block first atom: 2958 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 2988 Blocpdb> 20 atoms in block 126 Block first atom: 3014 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 3034 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 3052 Blocpdb> 27 atoms in block 129 Block first atom: 3072 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3099 Blocpdb> 17 atoms in block 131 Block first atom: 3125 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 3142 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 3163 Blocpdb> 30 atoms in block 134 Block first atom: 3187 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 3217 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 3243 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3266 Blocpdb> 25 atoms in block 138 Block first atom: 3290 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 3315 Blocpdb> 28 atoms in block 140 Block first atom: 3336 Blocpdb> 32 atoms in block 141 Block first atom: 3364 Blocpdb> 24 atoms in block 142 Block first atom: 3396 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 3420 Blocpdb> 26 atoms in block 144 Block first atom: 3437 Blocpdb> 26 atoms in block 145 Block first atom: 3463 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3489 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 3509 Blocpdb> 23 atoms in block 148 Block first atom: 3529 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 3552 Blocpdb> 27 atoms in block 150 Block first atom: 3568 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3595 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3618 Blocpdb> 19 atoms in block 153 Block first atom: 3641 Blocpdb> 31 atoms in block 154 Block first atom: 3660 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 3691 Blocpdb> 25 atoms in block 156 Block first atom: 3709 Blocpdb> 23 atoms in block 157 Block first atom: 3734 Blocpdb> 26 atoms in block 158 Block first atom: 3757 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 3783 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 3801 Blocpdb> 8 atoms in block 161 Block first atom: 3823 Blocpdb> 161 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1462308 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11493 Prepmat> Matrix trace = 3198680.0000 Prepmat> Last element read: 11493 11493 12.1780 Prepmat> 13042 lines saved. Prepmat> 11391 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3831 RTB> Total mass = 3831.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3831 RTB> Number of blocks = 161 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 210428.4151 RTB> 56985 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 966 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56985 Diagstd> Projected matrix trace = 210428.4151 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 966 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 210428.4151 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6909545 1.5013480 2.2931926 2.4491882 2.9271797 3.3131400 3.8652358 5.5058128 6.0279977 7.0839140 7.5380053 8.2177845 8.6263947 9.4275109 9.5320120 10.7246194 11.1798177 11.8361385 12.8091457 13.0892492 13.3055903 15.0229801 15.2740950 15.8461862 16.2278345 17.1805213 17.9346710 18.2657774 19.5737241 20.7598496 20.9999398 21.2889929 22.0437139 22.8755579 23.0143137 23.7125542 24.0382365 25.3314088 26.1138527 26.2714504 26.7016759 28.3424198 28.6986173 29.0823761 29.6488124 30.5024610 30.8675756 32.4796360 33.3533921 33.8733038 33.9798515 34.6265626 35.3200830 35.4875940 36.4299310 37.0416980 37.3034638 38.2589624 38.4706011 38.7693162 39.5799646 40.0802114 40.6986600 40.8997827 41.6486116 42.1897881 42.6779981 43.1894848 44.5784552 44.8830773 45.6343417 45.9886203 46.7725590 46.9937699 48.0399531 48.5454613 49.1120868 49.4809408 49.8640417 50.2872834 50.7571027 51.3881771 52.0416037 52.3054507 52.8516909 53.4914140 53.8856841 54.2347364 54.6677616 55.5137159 55.6680375 55.9744594 56.2584145 56.9347123 57.0311557 57.3612629 57.9721049 58.5762294 58.8699421 59.2219289 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034334 0.0034335 0.0034338 0.0034344 0.0034356 90.2651282 133.0564599 164.4430571 169.9442059 185.7889907 197.6583536 213.4928208 254.8038586 266.6133053 289.0226769 298.1422336 311.2953653 318.9407001 333.4216535 335.2645002 355.6200383 363.0886234 373.5943506 388.6470387 392.8734211 396.1068513 420.8945731 424.3977023 432.2725499 437.4471235 450.1045973 459.8773149 464.1029837 480.4320938 494.7745835 497.6274232 501.0405078 509.8444115 519.3751039 520.9479034 528.7914794 532.4104637 546.5437745 554.9204828 556.5924427 561.1313593 578.1143420 581.7357679 585.6123453 591.2878173 599.7395928 603.3183586 618.8720328 627.1411312 632.0101589 633.0033644 638.9986944 645.3660841 646.8946483 655.4271907 660.9075656 663.2387015 671.6791606 673.5343764 676.1442369 683.1765971 687.4803383 692.7640390 694.4736635 700.8023416 705.3407126 709.4099900 713.6483927 725.0330230 727.5060226 733.5693463 736.4113451 742.6613896 744.4155276 752.6560688 756.6056788 761.0084414 763.8608546 766.8122090 770.0596502 773.6485082 778.4431227 783.3766383 785.3599575 789.4501716 794.2135995 797.1351877 799.7127997 802.8990168 809.0873841 810.2111881 812.4380110 814.4961285 819.3771440 820.0708338 822.4407726 826.8082759 831.1051746 833.1862314 835.6733535 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3831 Rtb_to_modes> Number of blocs = 161 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.501 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.865 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.218 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.22 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 68958 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221006205537110470.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221006205537110470.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221006205537110470.atom Openam> file on opening on unit 11: 221006205537110470.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 481 First residue number = 1 Last residue number = 481 Number of atoms found = 3831 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.865 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.218 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.58 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.22 Bfactors> 106 vectors, 11493 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.691000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.847 for 481 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.09 Bfactors> = 95.574 +/- 9.69 Bfactors> Shiftng-fct= 95.544 Bfactors> Scaling-fct= 108.367 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221006205537110470.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221006205537110470.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 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vecteur en lecture: 509.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4 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vecteur en lecture: 736.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6 Chkmod> 106 vectors, 11493 coordinates in file. Chkmod> That is: 3831 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221006205537110470.13.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221006205537110470.13.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 221006205537110470 14 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 221006205537110470.eigenfacs 221006205537110470.atom calculating perturbed structure 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