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***  7RE6-AK  ***

LOGs for ID: 22100400203998843

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22100400203998843.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22100400203998843.atom to be opened. Openam> File opened: 22100400203998843.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 347 First residue number = 1 Last residue number = 356 Number of atoms found = 5514 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 8.822434 +/- 10.173393 From: -21.846000 To: 33.036000 = -8.060591 +/- 13.642661 From: -43.483000 To: 18.697000 = 12.898550 +/- 12.534707 From: -21.269000 To: 38.557000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0441 % Filled. Pdbmat> 4165149 non-zero elements. Pdbmat> 459202 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 166.56 +/- 48.10 Maximum number = 252 Minimum number = 27 Pdbmat> Matrix trace = 9.184040E+06 Pdbmat> Larger element = 930.085 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 347 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22100400203998843.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22100400203998843.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22100400203998843.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5514 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 347 residues. Blocpdb> 26 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 29 atoms in block 2 Block first atom: 27 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 56 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 80 Blocpdb> 41 atoms in block 5 Block first atom: 111 Blocpdb> 25 atoms in block 6 Block first atom: 152 Blocpdb> 27 atoms in block 7 Block first atom: 177 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 204 Blocpdb> 36 atoms in block 9 Block first atom: 248 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 284 Blocpdb> 34 atoms in block 11 Block first atom: 306 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 340 Blocpdb> 30 atoms in block 13 Block first atom: 373 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 403 Blocpdb> 43 atoms in block 15 Block first atom: 444 Blocpdb> 33 atoms in block 16 Block first atom: 487 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 520 Blocpdb> 39 atoms in block 18 Block first atom: 557 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 596 Blocpdb> 41 atoms in block 20 Block first atom: 632 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 673 Blocpdb> 36 atoms in block 22 Block first atom: 711 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 747 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 774 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 791 Blocpdb> 31 atoms in block 26 Block first atom: 824 Blocpdb> 35 atoms in block 27 Block first atom: 855 Blocpdb> 28 atoms in block 28 Block first atom: 890 Blocpdb> 23 atoms in block 29 Block first atom: 918 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 941 Blocpdb> 31 atoms in block 31 Block first atom: 970 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 1001 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 1019 Blocpdb> 37 atoms in block 34 Block first atom: 1042 Blocpdb> 24 atoms in block 35 Block first atom: 1079 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 1103 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 1125 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1151 Blocpdb> 36 atoms in block 39 Block first atom: 1186 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 1222 Blocpdb> 39 atoms in block 41 Block first atom: 1244 Blocpdb> 26 atoms in block 42 Block first atom: 1283 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1309 Blocpdb> 27 atoms in block 44 Block first atom: 1344 Blocpdb> 38 atoms in block 45 Block first atom: 1371 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 1409 Blocpdb> 42 atoms in block 47 Block first atom: 1423 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1465 Blocpdb> 34 atoms in block 49 Block first atom: 1493 Blocpdb> 31 atoms in block 50 Block first atom: 1527 Blocpdb> 28 atoms in block 51 Block first atom: 1558 Blocpdb> 32 atoms in block 52 Block first atom: 1586 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1618 Blocpdb> 31 atoms in block 54 Block first atom: 1637 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 1668 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 1701 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1731 Blocpdb> 29 atoms in block 58 Block first atom: 1759 Blocpdb> 36 atoms in block 59 Block first atom: 1788 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 1824 Blocpdb> 27 atoms in block 61 Block first atom: 1861 Blocpdb> 38 atoms in block 62 Block first atom: 1888 Blocpdb> 40 atoms in block 63 Block first atom: 1926 Blocpdb> 18 atoms in block 64 Block first atom: 1966 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 1984 Blocpdb> 36 atoms in block 66 Block first atom: 2019 Blocpdb> 28 atoms in block 67 Block first atom: 2055 Blocpdb> 34 atoms in block 68 Block first atom: 2083 Blocpdb> 28 atoms in block 69 Block first atom: 2117 Blocpdb> 30 atoms in block 70 Block first atom: 2145 Blocpdb> 29 atoms in block 71 Block first atom: 2175 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 2204 Blocpdb> 43 atoms in block 73 Block first atom: 2231 Blocpdb> 32 atoms in block 74 Block first atom: 2274 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 2306 Blocpdb> 38 atoms in block 76 Block first atom: 2333 Blocpdb> 33 atoms in block 77 Block first atom: 2371 Blocpdb> 37 atoms in block 78 Block first atom: 2404 Blocpdb> 29 atoms in block 79 Block first atom: 2441 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 2470 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 2501 Blocpdb> 41 atoms in block 82 Block first atom: 2520 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 2561 Blocpdb> 42 atoms in block 84 Block first atom: 2582 Blocpdb> 33 atoms in block 85 Block first atom: 2624 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 2657 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 2678 Blocpdb> 44 atoms in block 88 Block first atom: 2707 Blocpdb> 31 atoms in block 89 Block first atom: 2751 Blocpdb> 34 atoms in block 90 Block first atom: 2782 Blocpdb> 38 atoms in block 91 Block first atom: 2816 Blocpdb> 24 atoms in block 92 Block first atom: 2854 Blocpdb> 37 atoms in block 93 Block first atom: 2878 Blocpdb> 39 atoms in block 94 Block first atom: 2915 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 2954 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 2991 Blocpdb> 44 atoms in block 97 Block first atom: 3010 Blocpdb> 36 atoms in block 98 Block first atom: 3054 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 3090 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 3110 Blocpdb> 35 atoms in block 101 Block first atom: 3134 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 3169 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 3214 Blocpdb> 31 atoms in block 104 Block first atom: 3242 Blocpdb> 26 atoms in block 105 Block first atom: 3273 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 3299 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 3337 Blocpdb> 32 atoms in block 108 Block first atom: 3363 Blocpdb> 34 atoms in block 109 Block first atom: 3395 Blocpdb> 35 atoms in block 110 Block first atom: 3429 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 3464 Blocpdb> 29 atoms in block 112 Block first atom: 3504 Blocpdb> 27 atoms in block 113 Block first atom: 3533 Blocpdb> 36 atoms in block 114 Block first atom: 3560 Blocpdb> 43 atoms in block 115 Block first atom: 3596 Blocpdb> 30 atoms in block 116 Block first atom: 3639 Blocpdb> 34 atoms in block 117 Block first atom: 3669 Blocpdb> 24 atoms in block 118 Block first atom: 3703 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 3727 Blocpdb> 41 atoms in block 120 Block first atom: 3746 Blocpdb> 33 atoms in block 121 Block first atom: 3787 Blocpdb> 32 atoms in block 122 Block first atom: 3820 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 3852 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3893 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 3920 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 3943 Blocpdb> 34 atoms in block 127 Block first atom: 3980 Blocpdb> 44 atoms in block 128 Block first atom: 4014 Blocpdb> 33 atoms in block 129 Block first atom: 4058 Blocpdb> 31 atoms in block 130 Block first atom: 4091 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 4122 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 4158 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 4194 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 4220 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4259 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 4293 Blocpdb> 28 atoms in block 137 Block first atom: 4318 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 4346 Blocpdb> 28 atoms in block 139 Block first atom: 4372 Blocpdb> 43 atoms in block 140 Block first atom: 4400 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 4443 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4464 Blocpdb> 41 atoms in block 143 Block first atom: 4497 Blocpdb> 33 atoms in block 144 Block first atom: 4538 Blocpdb> 41 atoms in block 145 Block first atom: 4571 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 4612 Blocpdb> 34 atoms in block 147 Block first atom: 4632 Blocpdb> 32 atoms in block 148 Block first atom: 4666 Blocpdb> 31 atoms in block 149 Block first atom: 4698 Blocpdb> 30 atoms in block 150 Block first atom: 4729 Blocpdb> 20 atoms in block 151 Block first atom: 4759 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 4779 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 4822 Blocpdb> 33 atoms in block 154 Block first atom: 4855 Blocpdb> 31 atoms in block 155 Block first atom: 4888 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 4919 Blocpdb> 25 atoms in block 157 Block first atom: 4933 Blocpdb> 33 atoms in block 158 Block first atom: 4958 Blocpdb> 30 atoms in block 159 Block first atom: 4991 Blocpdb> 36 atoms in block 160 Block first atom: 5021 Blocpdb> 48 atoms in block 161 Block first atom: 5057 Blocpdb> 24 atoms in block 162 Block first atom: 5105 Blocpdb> 33 atoms in block 163 Block first atom: 5129 Blocpdb> 36 atoms in block 164 Block first atom: 5162 Blocpdb> 27 atoms in block 165 Block first atom: 5198 Blocpdb> 40 atoms in block 166 Block first atom: 5225 Blocpdb> 32 atoms in block 167 Block first atom: 5265 Blocpdb> 29 atoms in block 168 Block first atom: 5297 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 5326 Blocpdb> 32 atoms in block 170 Block first atom: 5352 Blocpdb> 38 atoms in block 171 Block first atom: 5384 Blocpdb> 41 atoms in block 172 Block first atom: 5422 Blocpdb> 32 atoms in block 173 Block first atom: 5463 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 5494 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4165323 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16542 Prepmat> Matrix trace = 9184040.0000 Prepmat> Last element read: 16542 16542 438.4630 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 13004 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5514 RTB> Total mass = 5514.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5514 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 492408.9774 RTB> 77346 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 77346 Diagstd> Projected matrix trace = 492408.9774 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 492408.9774 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.2989529 3.2933258 6.6226376 7.5670243 9.1162922 11.4657028 16.5052847 17.7061799 19.7725125 20.9424000 22.5057943 27.8968631 29.5787186 31.1374954 31.5932439 34.2804785 36.6508446 38.6591438 39.5121304 41.6254104 43.6954043 46.6971651 48.3051765 52.2851915 53.3323223 56.0825570 56.3498440 59.5969444 60.7064853 63.0504424 64.2882323 66.2251157 69.8653608 71.2725923 72.4953900 73.2751055 74.2295349 74.9859475 76.2681572 79.1972535 80.1668258 81.2674612 84.1994300 85.1462492 86.1208788 87.8115288 89.1131814 90.0543101 92.4941463 93.9290343 95.2016639 96.2899860 96.5615103 97.5845323 98.9098166 100.5974756 100.8705237 103.3756122 104.7012226 105.8479652 107.9459646 109.9960343 110.0933105 111.3076524 113.6539369 115.8842288 117.1814283 119.0505347 119.7918162 122.0895986 123.8636843 124.3101396 125.6774969 126.9504029 127.8009992 128.7440601 130.2740144 131.8352806 132.4878787 135.3350730 136.2786908 138.0562696 138.4073987 138.7828851 140.7150541 141.4723776 142.3429754 144.3275474 145.0391407 148.1253728 148.5833273 151.1758043 151.7036622 151.9384280 154.0268214 154.5087138 155.0600456 156.2914137 157.6057396 158.8345308 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034285 0.0034307 0.0034317 0.0034323 0.0034341 0.0034358 164.6494628 197.0664207 279.4542858 298.7155590 327.8720511 367.7016850 441.1708314 456.9384628 482.8655368 496.9452057 515.1603777 573.5522211 590.5884620 605.9504587 610.3688904 635.7973569 657.4114651 675.1828394 682.5909144 700.6071164 717.8160442 742.0625907 754.7308751 785.2078482 793.0316634 813.2221208 815.1577074 838.3150771 846.0827194 862.2622030 870.6849192 883.7036388 907.6663461 916.7619039 924.5927328 929.5516079 935.5858611 940.3406748 948.3461967 966.3853568 972.2828479 978.9344824 996.4370239 1002.0238091 1007.7423424 1017.5858267 1025.1000494 1030.4988985 1044.3652300 1052.4348216 1059.5404705 1065.5794639 1067.0807989 1072.7185056 1079.9781737 1089.1528235 1090.6299456 1104.0896215 1111.1460754 1117.2144319 1128.2321883 1138.8952830 1139.3987689 1145.6653858 1157.6773125 1168.9809871 1175.5055227 1184.8434049 1188.5264607 1199.8711557 1208.5573870 1210.7334951 1217.3740540 1223.5235195 1227.6156178 1232.1366641 1239.4362056 1246.8410845 1249.9232704 1263.2824451 1267.6788849 1275.9197131 1277.5412549 1279.2730067 1288.1473998 1291.6091306 1295.5772105 1304.5775364 1307.7896300 1321.6303657 1323.6718103 1335.1695653 1337.4985279 1338.5330369 1347.7007088 1349.8072885 1352.2133955 1357.5718998 1363.2681706 1368.5722904 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5514 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9680E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9810E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.8 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 99252 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100400203998843.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100400203998843.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22100400203998843.atom Openam> file on opening on unit 11: 22100400203998843.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 347 First residue number = 1 Last residue number = 356 Number of atoms found = 5514 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9680E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9810E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.8 Bfactors> 106 vectors, 16542 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.299000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.737 for 348 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.006 +/- 0.01 Bfactors> = 19.062 +/- 6.09 Bfactors> Shiftng-fct= 19.055 Bfactors> Scaling-fct= 1081.602 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100400203998843.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100400203998843.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4283E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139. 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8907 0.0034 0.7996 0.0034 0.7234 0.0034 0.9731 0.0034 0.7874 0.0034 0.9041 164.6441 0.4757 197.0482 0.5518 279.4499 0.5117 298.7023 0.3377 327.8527 0.5681 367.7548 0.6145 441.2149 0.4948 456.9681 0.6288 482.8141 0.6255 496.8954 0.5145 515.1864 0.3811 573.5598 0.2863 590.5759 0.3521 605.9488 0.3635 610.3114 0.4925 635.7656 0.2259 657.3757 0.2767 675.1613 0.4919 682.5432 0.4508 700.6157 0.3905 717.8230 0.4536 742.0533 0.1915 754.7362 0.4939 785.2102 0.4742 792.9804 0.4163 813.1687 0.5131 815.1238 0.3738 838.3006 0.4775 846.0709 0.3477 862.2222 0.5161 870.6595 0.3723 883.6983 0.3522 907.6575 0.2036 916.7059 0.3115 924.5824 0.3913 929.5427 0.3981 935.5486 0.2699 940.3257 0.3475 948.3169 0.3900 966.3606 0.3816 972.2604 0.3938 978.9077 0.4635 996.3976 0.4462 1002.0029 0.3416 1007.6939 0.4478 1017.5333 0.5019 1025.0377 0.2979 1030.4300 0.3814 1044.2970 0.1598 1052.3951 0.4858 1059.4857 0.3183 1065.5338 0.3060 1067.0266 0.3496 1072.6475 0.3679 1079.9328 0.3182 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22100400203998843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22100400203998843 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom making animated gifs 11 models are in 22100400203998843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22100400203998843 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom making animated gifs 11 models are in 22100400203998843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22100400203998843 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom 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will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22100400203998843 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100400203998843.eigenfacs 22100400203998843.atom making animated gifs 11 models are in 22100400203998843.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100400203998843.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22100400203998843.10.pdb 22100400203998843.11.pdb 22100400203998843.7.pdb 22100400203998843.8.pdb 22100400203998843.9.pdb STDERR: real 0m23.161s user 0m23.036s sys 0m0.116s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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