CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  LYASE/RNA 29-JUN-11 3SNP  ***

LOGs for ID: 22100319494474332

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22100319494474332.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22100319494474332.atom to be opened. Openam> File opened: 22100319494474332.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 850 First residue number = 2 Last residue number = 889 Number of atoms found = 6657 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 75.995688 +/- 21.224924 From: 30.793000 To: 129.614000 = 14.732307 +/- 16.893838 From: -21.239000 To: 63.738000 = -4.276373 +/- 17.183578 From: -37.578000 To: 37.545000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2801 % Filled. Pdbmat> 2552811 non-zero elements. Pdbmat> 279251 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.90 +/- 21.33 Maximum number = 131 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 5.585020E+06 Pdbmat> Larger element = 488.843 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 850 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22100319494474332.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22100319494474332.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22100319494474332.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6657 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 850 residues. Blocpdb> 37 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 38 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 79 Blocpdb> 40 atoms in block 4 Block first atom: 116 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 156 Blocpdb> 45 atoms in block 6 Block first atom: 200 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 245 Blocpdb> 43 atoms in block 8 Block first atom: 287 Blocpdb> 35 atoms in block 9 Block first atom: 330 Blocpdb> 40 atoms in block 10 Block first atom: 365 Blocpdb> 44 atoms in block 11 Block first atom: 405 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 449 Blocpdb> 46 atoms in block 13 Block first atom: 492 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 538 Blocpdb> 40 atoms in block 15 Block first atom: 579 Blocpdb> 39 atoms in block 16 Block first atom: 619 Blocpdb> 43 atoms in block 17 Block first atom: 658 Blocpdb> 37 atoms in block 18 Block first atom: 701 Blocpdb> 35 atoms in block 19 Block first atom: 738 Blocpdb> 40 atoms in block 20 Block first atom: 773 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 813 Blocpdb> 31 atoms in block 22 Block first atom: 851 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 882 Blocpdb> 36 atoms in block 24 Block first atom: 923 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 959 Blocpdb> 6 atoms in block 26 Block first atom: 1000 Blocpdb> 48 atoms in block 27 Block first atom: 1006 Blocpdb> 51 atoms in block 28 Block first atom: 1054 Blocpdb> 46 atoms in block 29 Block first atom: 1105 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1151 Blocpdb> 43 atoms in block 31 Block first atom: 1193 Blocpdb> 28 atoms in block 32 Block first atom: 1236 Blocpdb> 42 atoms in block 33 Block first atom: 1264 Blocpdb> 45 atoms in block 34 Block first atom: 1306 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1351 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1392 Blocpdb> 45 atoms in block 37 Block first atom: 1433 Blocpdb> 34 atoms in block 38 Block first atom: 1478 Blocpdb> 38 atoms in block 39 Block first atom: 1512 Blocpdb> 32 atoms in block 40 Block first atom: 1550 Blocpdb> 37 atoms in block 41 Block first atom: 1582 Blocpdb> 32 atoms in block 42 Block first atom: 1619 Blocpdb> 34 atoms in block 43 Block first atom: 1651 Blocpdb> 36 atoms in block 44 Block first atom: 1685 Blocpdb> 36 atoms in block 45 Block first atom: 1721 Blocpdb> 40 atoms in block 46 Block first atom: 1757 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 1797 Blocpdb> 39 atoms in block 48 Block first atom: 1837 Blocpdb> 36 atoms in block 49 Block first atom: 1876 Blocpdb> 37 atoms in block 50 Block first atom: 1912 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 1949 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 1996 Blocpdb> 47 atoms in block 53 Block first atom: 2025 Blocpdb> 33 atoms in block 54 Block first atom: 2072 Blocpdb> 36 atoms in block 55 Block first atom: 2105 Blocpdb> 36 atoms in block 56 Block first atom: 2141 Blocpdb> 35 atoms in block 57 Block first atom: 2177 Blocpdb> 37 atoms in block 58 Block first atom: 2212 Blocpdb> 41 atoms in block 59 Block first atom: 2249 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2290 Blocpdb> 43 atoms in block 61 Block first atom: 2328 Blocpdb> 38 atoms in block 62 Block first atom: 2371 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2409 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 2448 Blocpdb> 41 atoms in block 65 Block first atom: 2494 Blocpdb> 42 atoms in block 66 Block first atom: 2535 Blocpdb> 39 atoms in block 67 Block first atom: 2577 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 2616 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 2659 Blocpdb> 40 atoms in block 70 Block first atom: 2698 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2738 Blocpdb> 37 atoms in block 72 Block first atom: 2771 Blocpdb> 40 atoms in block 73 Block first atom: 2808 Blocpdb> 34 atoms in block 74 Block first atom: 2848 Blocpdb> 46 atoms in block 75 Block first atom: 2882 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 2928 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 2957 Blocpdb> 36 atoms in block 78 Block first atom: 2999 Blocpdb> 43 atoms in block 79 Block first atom: 3035 Blocpdb> 45 atoms in block 80 Block first atom: 3078 Blocpdb> 42 atoms in block 81 Block first atom: 3123 Blocpdb> 41 atoms in block 82 Block first atom: 3165 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 3206 Blocpdb> 33 atoms in block 84 Block first atom: 3240 Blocpdb> 34 atoms in block 85 Block first atom: 3273 Blocpdb> 34 atoms in block 86 Block first atom: 3307 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 3341 Blocpdb> 39 atoms in block 88 Block first atom: 3370 Blocpdb> 29 atoms in block 89 Block first atom: 3409 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 3438 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 3477 Blocpdb> 31 atoms in block 92 Block first atom: 3518 Blocpdb> 37 atoms in block 93 Block first atom: 3549 Blocpdb> 46 atoms in block 94 Block first atom: 3586 Blocpdb> 38 atoms in block 95 Block first atom: 3632 Blocpdb> 35 atoms in block 96 Block first atom: 3670 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 3705 Blocpdb> 38 atoms in block 98 Block first atom: 3738 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3776 Blocpdb> 36 atoms in block 100 Block first atom: 3812 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3848 Blocpdb> 37 atoms in block 102 Block first atom: 3878 Blocpdb> 43 atoms in block 103 Block first atom: 3915 Blocpdb> 39 atoms in block 104 Block first atom: 3958 Blocpdb> 44 atoms in block 105 Block first atom: 3997 Blocpdb> 33 atoms in block 106 Block first atom: 4041 Blocpdb> 37 atoms in block 107 Block first atom: 4074 Blocpdb> 32 atoms in block 108 Block first atom: 4111 Blocpdb> 47 atoms in block 109 Block first atom: 4143 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4190 Blocpdb> 33 atoms in block 111 Block first atom: 4227 Blocpdb> 44 atoms in block 112 Block first atom: 4260 Blocpdb> 48 atoms in block 113 Block first atom: 4304 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 4352 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 4396 Blocpdb> 43 atoms in block 116 Block first atom: 4437 Blocpdb> 39 atoms in block 117 Block first atom: 4480 Blocpdb> 45 atoms in block 118 Block first atom: 4519 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 4564 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 4600 Blocpdb> 51 atoms in block 121 Block first atom: 4620 Blocpdb> 37 atoms in block 122 Block first atom: 4671 Blocpdb> 42 atoms in block 123 Block first atom: 4708 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 4750 Blocpdb> 39 atoms in block 125 Block first atom: 4796 Blocpdb> 38 atoms in block 126 Block first atom: 4835 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 4873 Blocpdb> 39 atoms in block 128 Block first atom: 4913 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 4952 Blocpdb> 39 atoms in block 130 Block first atom: 4984 Blocpdb> 32 atoms in block 131 Block first atom: 5023 Blocpdb> 37 atoms in block 132 Block first atom: 5055 Blocpdb> 41 atoms in block 133 Block first atom: 5092 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 5133 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 5171 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 5216 Blocpdb> 42 atoms in block 137 Block first atom: 5252 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5294 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 5331 Blocpdb> 43 atoms in block 140 Block first atom: 5366 Blocpdb> 47 atoms in block 141 Block first atom: 5409 Blocpdb> 37 atoms in block 142 Block first atom: 5456 Blocpdb> 39 atoms in block 143 Block first atom: 5493 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 5532 Blocpdb> 36 atoms in block 145 Block first atom: 5568 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 5604 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 5654 Blocpdb> 32 atoms in block 148 Block first atom: 5692 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5724 Blocpdb> 35 atoms in block 150 Block first atom: 5764 Blocpdb> 37 atoms in block 151 Block first atom: 5799 Blocpdb> 38 atoms in block 152 Block first atom: 5836 Blocpdb> 37 atoms in block 153 Block first atom: 5874 Blocpdb> 41 atoms in block 154 Block first atom: 5911 Blocpdb> 46 atoms in block 155 Block first atom: 5952 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 5998 Blocpdb> 34 atoms in block 157 Block first atom: 6033 Blocpdb> 40 atoms in block 158 Block first atom: 6067 Blocpdb> 36 atoms in block 159 Block first atom: 6107 Blocpdb> 31 atoms in block 160 Block first atom: 6143 Blocpdb> 50 atoms in block 161 Block first atom: 6174 Blocpdb> 40 atoms in block 162 Block first atom: 6224 Blocpdb> 41 atoms in block 163 Block first atom: 6264 Blocpdb> 41 atoms in block 164 Block first atom: 6305 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 6346 Blocpdb> 41 atoms in block 166 Block first atom: 6382 Blocpdb> 45 atoms in block 167 Block first atom: 6423 Blocpdb> 39 atoms in block 168 Block first atom: 6468 Blocpdb> 48 atoms in block 169 Block first atom: 6507 Blocpdb> 32 atoms in block 170 Block first atom: 6555 Blocpdb> 48 atoms in block 171 Block first atom: 6587 Blocpdb> 23 atoms in block 172 Block first atom: 6634 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2552983 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 19971 Prepmat> Matrix trace = 5585020.0000 Prepmat> Last element read: 19971 19971 104.4272 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13309 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6657 RTB> Total mass = 6657.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6657 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 203109.3248 RTB> 53904 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53904 Diagstd> Projected matrix trace = 203109.3248 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 203109.3248 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2040708 0.5134141 0.8262097 1.2032858 1.7885553 2.1945503 3.4690001 4.3405052 4.9984253 5.1599726 5.8044826 6.7931163 7.6447135 7.9303788 8.6435532 9.0258279 9.7818963 10.3481626 11.5877315 12.5717912 13.1217476 14.6005225 14.6893136 15.1608974 15.6898193 16.3694312 17.2016385 17.5325906 17.6458243 18.6698733 19.4865047 20.3207871 20.6210641 20.9344004 21.1182295 21.5292510 22.0347079 22.2868733 22.8737293 23.4230554 23.6548900 24.3807234 25.0749906 25.6665582 26.2154000 26.7336540 27.7040476 28.0050327 28.6471699 28.9293120 29.2054134 29.7366472 30.4644115 30.7235174 30.9442101 31.7643828 32.3348655 32.6686538 32.8154058 33.5328734 33.8782892 34.5785700 34.9987769 35.3205429 36.1288264 36.6447448 37.0775716 38.2186263 38.4114161 38.6220001 39.4103005 39.6677941 39.9782260 40.3860384 41.1063339 41.4456369 41.7946002 42.0566365 42.6325505 43.1298586 43.4914175 44.0915542 44.5524508 44.7690372 45.0436729 45.8372115 45.9539076 46.5246250 46.9338575 47.2785924 47.7774356 48.3727234 48.7779800 49.2555368 49.5682154 49.9389391 50.2979018 50.7304341 51.2790675 51.4292191 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034303 0.0034335 0.0034340 0.0034342 0.0034343 0.0034351 49.0552785 77.8088853 98.7052884 119.1186261 145.2266978 160.8674017 202.2541472 226.2379300 242.7794275 246.6715017 261.6236721 283.0282633 300.2450714 305.8033562 319.2577407 326.2411982 339.6305963 349.3227753 369.6532189 385.0293712 393.3608371 414.9344362 416.1942070 422.8221545 430.1344741 439.3514605 450.3811326 454.6930606 456.1590083 469.2086017 479.3605099 489.5144804 493.1179557 496.8502852 499.0269879 503.8598357 509.7402520 512.6486910 519.3543443 525.5536457 528.1481306 536.1898318 543.7705329 550.1474417 555.9983779 561.4672665 571.5666658 574.6631146 581.2141009 584.0692373 586.8497977 592.1630169 599.3654110 601.9088757 604.0668194 612.0198260 617.4912527 620.6702078 622.0627123 628.8262528 632.0566658 638.5557128 642.4239362 645.3702858 652.7129169 657.3567563 661.2275211 671.3249947 673.0160783 674.8584040 681.7107668 683.9341757 686.6051234 690.0982197 696.2250626 699.0925743 702.0295097 704.2268005 709.0321659 713.1556011 716.1385647 721.0626233 724.8215216 726.5812020 728.8064008 735.1980984 736.1333672 740.6904085 743.9408479 746.6680171 750.5967819 755.2583752 758.4154749 762.1190345 764.5342079 767.3878811 770.1409473 773.4452373 777.6162717 778.7539195 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6657 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9786E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.203 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.645 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.43 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 119826 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100319494474332.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100319494474332.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22100319494474332.atom Openam> file on opening on unit 11: 22100319494474332.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 850 First residue number = 2 Last residue number = 889 Number of atoms found = 6657 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9786E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.203 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.645 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43 Bfactors> 106 vectors, 19971 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.204100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.709 for 850 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.03 Bfactors> = 52.639 +/- 18.06 Bfactors> Shiftng-fct= 52.606 Bfactors> Scaling-fct= 678.994 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100319494474332.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100319494474332.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7 Chkmod> 106 vectors, 19971 coordinates in file. Chkmod> That is: 6657 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6840 0.0034 0.9529 0.0034 0.9757 0.0034 0.8122 0.0034 0.8373 0.0034 0.8877 49.0567 0.5550 77.8045 0.5562 98.7005 0.5994 119.0994 0.5981 145.2385 0.6516 160.8770 0.7053 202.2455 0.6490 226.2411 0.6977 242.7587 0.4785 246.6616 0.6923 261.6016 0.6636 283.0137 0.6483 300.2378 0.4471 305.7829 0.5983 319.2523 0.4394 326.2303 0.0974 339.6178 0.2337 349.3388 0.4495 369.6735 0.4222 384.9854 0.4584 393.3178 0.5618 414.9092 0.2590 416.1861 0.2832 422.7915 0.4320 430.1185 0.4754 439.3402 0.4753 450.3403 0.4642 454.6399 0.5192 456.1934 0.5573 469.1901 0.4382 479.3829 0.5560 489.4840 0.2785 493.0841 0.3331 496.7767 0.2343 499.0265 0.5144 503.8470 0.3028 509.6639 0.3316 512.6626 0.1708 519.2897 0.5424 525.4968 0.4796 528.0709 0.4230 536.1589 0.5746 543.6931 0.4339 550.1607 0.4118 556.0233 0.5076 561.4048 0.4629 571.5004 0.3818 574.6894 0.4654 581.2179 0.4157 584.0511 0.4800 586.8707 0.5612 592.1710 0.6269 599.2963 0.4201 601.8486 0.4596 603.9998 0.5372 611.9513 0.5117 617.4183 0.4846 620.6564 0.4797 622.0796 0.5268 628.7723 0.5713 632.0455 0.5229 638.5415 0.4905 642.4076 0.5406 645.3376 0.4579 652.6955 0.5787 657.2860 0.4574 661.2208 0.4275 671.3082 0.5199 672.9748 0.4898 674.8120 0.4788 681.6789 0.5459 683.9238 0.5005 686.5909 0.5356 690.1024 0.4882 696.2262 0.5090 699.0994 0.5454 701.9607 0.4861 704.2247 0.5093 708.9805 0.5076 713.1262 0.4618 716.0962 0.5709 721.0190 0.4917 724.7705 0.3217 726.5578 0.3904 728.7454 0.2698 735.1889 0.4606 736.0705 0.3306 740.6218 0.4091 743.8783 0.4270 746.6471 0.5335 750.5847 0.1874 755.2047 0.3457 758.3986 0.4246 762.1208 0.5114 764.5152 0.5521 767.3631 0.3788 770.1239 0.4789 773.4087 0.3639 777.5900 0.4112 778.7264 0.4720 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22100319494474332 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom making animated gifs 11 models are in 22100319494474332.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22100319494474332 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom making animated gifs 11 models are in 22100319494474332.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22100319494474332 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom making animated gifs 11 models are in 22100319494474332.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22100319494474332 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom making animated gifs 11 models are in 22100319494474332.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22100319494474332 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100319494474332.eigenfacs 22100319494474332.atom making animated gifs 11 models are in 22100319494474332.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100319494474332.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22100319494474332.10.pdb 22100319494474332.11.pdb 22100319494474332.7.pdb 22100319494474332.8.pdb 22100319494474332.9.pdb STDERR: real 0m23.430s user 0m23.340s sys 0m0.080s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.