*** 4m8 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22092722260083457.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22092722260083457.atom to be opened.
Openam> File opened: 22092722260083457.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 742
First residue number = 554
Last residue number = 168
Number of atoms found = 5633
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -15.639604 +/- 19.775010 From: -56.169000 To: 35.288000
= 190.969924 +/- 13.287894 From: 161.134000 To: 227.070000
= -206.438745 +/- 14.842479 From: -243.323000 To: -171.524000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.4424 % Filled.
Pdbmat> 2059746 non-zero elements.
Pdbmat> 225142 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.94 +/- 22.18
Maximum number = 130
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 4.502840E+06
Pdbmat> Larger element = 493.248
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
742 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22092722260083457.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22092722260083457.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22092722260083457.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5633 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 742 residues.
Blocpdb> 20 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 21
Blocpdb> 34 atoms in block 3
Block first atom: 41
Blocpdb> 31 atoms in block 4
Block first atom: 75
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 106
Blocpdb> 36 atoms in block 6
Block first atom: 135
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 171
Blocpdb> 29 atoms in block 8
Block first atom: 201
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 230
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 257
Blocpdb> 24 atoms in block 11
Block first atom: 265
Blocpdb> 34 atoms in block 12
Block first atom: 289
Blocpdb> 42 atoms in block 13
Block first atom: 323
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 365
Blocpdb> 38 atoms in block 15
Block first atom: 395
Blocpdb> 24 atoms in block 16
Block first atom: 433
Blocpdb> 27 atoms in block 17
Block first atom: 457
Blocpdb> 13 atoms in block 18
Block first atom: 484
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 497
Blocpdb> 23 atoms in block 20
Block first atom: 519
Blocpdb> 30 atoms in block 21
Block first atom: 542
Blocpdb> 26 atoms in block 22
Block first atom: 572
Blocpdb> 26 atoms in block 23
Block first atom: 598
Blocpdb> 31 atoms in block 24
Block first atom: 624
Blocpdb> 31 atoms in block 25
Block first atom: 655
Blocpdb> 31 atoms in block 26
Block first atom: 686
Blocpdb> 34 atoms in block 27
Block first atom: 717
Blocpdb> 30 atoms in block 28
Block first atom: 751
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 781
Blocpdb> 29 atoms in block 30
Block first atom: 806
Blocpdb> 31 atoms in block 31
Block first atom: 835
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 866
Blocpdb> 36 atoms in block 33
Block first atom: 894
Blocpdb> 33 atoms in block 34
Block first atom: 930
Blocpdb> 31 atoms in block 35
Block first atom: 963
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 994
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 1023
Blocpdb> 32 atoms in block 38
Block first atom: 1047
Blocpdb> 38 atoms in block 39
Block first atom: 1079
Blocpdb> 30 atoms in block 40
Block first atom: 1117
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1147
Blocpdb> 37 atoms in block 42
Block first atom: 1180
Blocpdb> 28 atoms in block 43
Block first atom: 1217
Blocpdb> 35 atoms in block 44
Block first atom: 1245
Blocpdb> 30 atoms in block 45
Block first atom: 1280
Blocpdb> 27 atoms in block 46
Block first atom: 1310
Blocpdb> 35 atoms in block 47
Block first atom: 1337
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1372
Blocpdb> 33 atoms in block 49
Block first atom: 1398
Blocpdb> 26 atoms in block 50
Block first atom: 1431
Blocpdb> 28 atoms in block 51
Block first atom: 1457
Blocpdb> 30 atoms in block 52
Block first atom: 1485
Blocpdb> 35 atoms in block 53
Block first atom: 1515
Blocpdb> 37 atoms in block 54
Block first atom: 1550
Blocpdb> 31 atoms in block 55
Block first atom: 1587
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1618
Blocpdb> 29 atoms in block 57
Block first atom: 1644
Blocpdb> 27 atoms in block 58
Block first atom: 1673
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 1700
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 1721
Blocpdb> 29 atoms in block 61
Block first atom: 1743
Blocpdb> 25 atoms in block 62
Block first atom: 1772
Blocpdb> 29 atoms in block 63
Block first atom: 1797
Blocpdb> 33 atoms in block 64
Block first atom: 1826
Blocpdb> 34 atoms in block 65
Block first atom: 1859
Blocpdb> 32 atoms in block 66
Block first atom: 1893
Blocpdb> 40 atoms in block 67
Block first atom: 1925
Blocpdb> 31 atoms in block 68
Block first atom: 1965
Blocpdb> 29 atoms in block 69
Block first atom: 1996
Blocpdb> 35 atoms in block 70
Block first atom: 2025
Blocpdb> 38 atoms in block 71
Block first atom: 2060
Blocpdb> 27 atoms in block 72
Block first atom: 2098
Blocpdb> 31 atoms in block 73
Block first atom: 2125
Blocpdb> 33 atoms in block 74
Block first atom: 2156
Blocpdb> 26 atoms in block 75
Block first atom: 2189
Blocpdb> 26 atoms in block 76
Block first atom: 2215
Blocpdb> 27 atoms in block 77
Block first atom: 2241
Blocpdb> 31 atoms in block 78
Block first atom: 2268
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 2299
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 2335
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 2358
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 2382
Blocpdb> 23 atoms in block 83
Block first atom: 2409
Blocpdb> 26 atoms in block 84
Block first atom: 2432
Blocpdb> 30 atoms in block 85
Block first atom: 2458
Blocpdb> 34 atoms in block 86
Block first atom: 2488
Blocpdb> 33 atoms in block 87
Block first atom: 2522
Blocpdb> 38 atoms in block 88
Block first atom: 2555
Blocpdb> 28 atoms in block 89
Block first atom: 2593
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 2621
Blocpdb> 27 atoms in block 91
Block first atom: 2641
Blocpdb> 34 atoms in block 92
Block first atom: 2668
Blocpdb> 33 atoms in block 93
Block first atom: 2702
Blocpdb> 30 atoms in block 94
Block first atom: 2735
Blocpdb> 29 atoms in block 95
Block first atom: 2765
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 2794
Blocpdb> 32 atoms in block 97
Block first atom: 2827
Blocpdb> 32 atoms in block 98
Block first atom: 2859
Blocpdb> 31 atoms in block 99
Block first atom: 2891
Blocpdb> 25 atoms in block 100
Block first atom: 2922
Blocpdb> 33 atoms in block 101
Block first atom: 2947
Blocpdb> 41 atoms in block 102
Block first atom: 2980
Blocpdb> 31 atoms in block 103
Block first atom: 3021
Blocpdb> 24 atoms in block 104
Block first atom: 3052
Blocpdb> 26 atoms in block 105
Block first atom: 3076
Blocpdb> 30 atoms in block 106
Block first atom: 3102
Blocpdb> 41 atoms in block 107
Block first atom: 3132
Blocpdb> 29 atoms in block 108
Block first atom: 3173
Blocpdb> 37 atoms in block 109
Block first atom: 3202
Blocpdb> 37 atoms in block 110
Block first atom: 3239
Blocpdb> 32 atoms in block 111
Block first atom: 3276
Blocpdb> 37 atoms in block 112
Block first atom: 3308
Blocpdb> 27 atoms in block 113
Block first atom: 3345
Blocpdb> 32 atoms in block 114
Block first atom: 3372
Blocpdb> 26 atoms in block 115
Block first atom: 3404
Blocpdb> 29 atoms in block 116
Block first atom: 3430
Blocpdb> 30 atoms in block 117
Block first atom: 3459
Blocpdb> 33 atoms in block 118
Block first atom: 3489
Blocpdb> 29 atoms in block 119
Block first atom: 3522
Blocpdb> 28 atoms in block 120
Block first atom: 3551
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 3579
Blocpdb> 32 atoms in block 122
Block first atom: 3607
Blocpdb> 33 atoms in block 123
Block first atom: 3639
Blocpdb> 32 atoms in block 124
Block first atom: 3672
Blocpdb> 35 atoms in block 125
Block first atom: 3704
Blocpdb> 34 atoms in block 126
Block first atom: 3739
Blocpdb> 36 atoms in block 127
Block first atom: 3773
Blocpdb> 30 atoms in block 128
Block first atom: 3809
Blocpdb> 25 atoms in block 129
Block first atom: 3839
Blocpdb> 27 atoms in block 130
Block first atom: 3864
Blocpdb> 31 atoms in block 131
Block first atom: 3891
Blocpdb> 21 atoms in block 132
Block first atom: 3922
Blocpdb> 36 atoms in block 133
Block first atom: 3943
Blocpdb> 37 atoms in block 134
Block first atom: 3979
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 4016
Blocpdb> 40 atoms in block 136
Block first atom: 4039
Blocpdb> 38 atoms in block 137
Block first atom: 4079
Blocpdb> 39 atoms in block 138
Block first atom: 4117
Blocpdb> 37 atoms in block 139
Block first atom: 4156
Blocpdb> 23 atoms in block 140
Block first atom: 4193
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 4216
Blocpdb> 27 atoms in block 142
Block first atom: 4238
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 4265
Blocpdb> 32 atoms in block 144
Block first atom: 4296
Blocpdb> 29 atoms in block 145
Block first atom: 4328
Blocpdb> 27 atoms in block 146
Block first atom: 4357
Blocpdb> 31 atoms in block 147
Block first atom: 4384
Blocpdb> 22 atoms in block 148
Block first atom: 4415
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 4437
Blocpdb> 26 atoms in block 150
Block first atom: 4461
Blocpdb> 34 atoms in block 151
Block first atom: 4487
Blocpdb> 32 atoms in block 152
Block first atom: 4521
Blocpdb> 33 atoms in block 153
Block first atom: 4553
Blocpdb> 30 atoms in block 154
Block first atom: 4586
Blocpdb> 35 atoms in block 155
Block first atom: 4616
Blocpdb> 28 atoms in block 156
Block first atom: 4651
Blocpdb> 29 atoms in block 157
Block first atom: 4679
Blocpdb> 28 atoms in block 158
Block first atom: 4708
Blocpdb> 33 atoms in block 159
Block first atom: 4736
Blocpdb> 24 atoms in block 160
Block first atom: 4769
Blocpdb> 36 atoms in block 161
Block first atom: 4793
Blocpdb> 31 atoms in block 162
Block first atom: 4829
Blocpdb> 36 atoms in block 163
Block first atom: 4860
Blocpdb> 30 atoms in block 164
Block first atom: 4896
Blocpdb> 28 atoms in block 165
Block first atom: 4926
Blocpdb> 33 atoms in block 166
Block first atom: 4954
Blocpdb> 27 atoms in block 167
Block first atom: 4987
Blocpdb> 34 atoms in block 168
Block first atom: 5014
Blocpdb> 33 atoms in block 169
Block first atom: 5048
Blocpdb> 33 atoms in block 170
Block first atom: 5081
Blocpdb> 29 atoms in block 171
Block first atom: 5114
Blocpdb> 25 atoms in block 172
Block first atom: 5143
Blocpdb> 30 atoms in block 173
Block first atom: 5168
Blocpdb> 27 atoms in block 174
Block first atom: 5198
Blocpdb> 31 atoms in block 175
Block first atom: 5225
Blocpdb> 37 atoms in block 176
Block first atom: 5256
Blocpdb> 23 atoms in block 177
Block first atom: 5293
Blocpdb> 31 atoms in block 178
Block first atom: 5316
Blocpdb> 32 atoms in block 179
Block first atom: 5347
Blocpdb> 36 atoms in block 180
Block first atom: 5379
Blocpdb> 30 atoms in block 181
Block first atom: 5415
Blocpdb> 26 atoms in block 182
Block first atom: 5445
Blocpdb> 32 atoms in block 183
Block first atom: 5471
Blocpdb> 32 atoms in block 184
Block first atom: 5503
Blocpdb> 39 atoms in block 185
Block first atom: 5535
Blocpdb> 35 atoms in block 186
Block first atom: 5574
Blocpdb> 25 atoms in block 187
Block first atom: 5608
Blocpdb> 187 blocks.
Blocpdb> At most, 42 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2059933 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 16899
Prepmat> Matrix trace = 4502840.0000
Prepmat> Last element read: 16899 16899 41.5337
Prepmat> 17579 lines saved.
Prepmat> 15861 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5633
RTB> Total mass = 5633.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5633
RTB> Number of blocks = 187
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 215465.9758
RTB> 59007 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1122
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59007
Diagstd> Projected matrix trace = 215465.9758
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1122 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 215465.9758
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2545747 0.3852649 0.5016294 0.8297133
0.9590132 1.6709192 2.1123364 2.2539620 2.6937738
3.2652957 3.6964544 3.7066205 4.5410593 4.7959232
5.4910383 5.7281594 6.0582202 6.6261081 7.3450193
8.5156088 9.0983476 9.4047417 9.7510204 9.9828745
10.7755469 11.0907939 11.4059076 11.7228565 12.0459994
12.3878462 12.7232344 13.3844708 13.7054179 14.0192610
14.7183333 15.2644024 15.6509979 15.9230157 16.5254121
16.8286564 16.9729541 17.5983672 18.1800198 18.6156474
18.7801441 19.8524954 20.0306646 20.3098983 20.7564988
21.5715445 21.9056381 22.4404695 22.6846704 23.0030697
23.4146586 23.6417063 24.1423708 24.9973608 25.3348209
25.4534909 25.9582521 26.1226608 26.5620409 26.7366247
27.3069513 27.7156629 28.1549713 28.4786028 28.7095847
29.7089659 29.9417201 30.0408717 30.3227241 30.5928164
30.9245028 32.0516148 32.2547928 32.9364071 33.1766760
33.5956951 33.9704607 34.2294476 34.5401605 35.1069691
35.4380138 35.5849923 35.9352231 36.2074947 36.2516368
37.1029547 37.8432781 38.2266570 38.6427046 38.9679481
39.1740940 39.4792472 39.9966452 40.1566849 40.5325426
40.7370610
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034317 0.0034323 0.0034337 0.0034340 0.0034343
0.0034359 54.7901990 67.4023419 76.9107022 98.9143535
106.3426718 140.3695823 157.8253731 163.0303931 178.2279619
196.2259938 208.7795484 209.0664482 231.4056000 237.8106998
254.4617543 259.8979341 267.2808277 279.5274994 294.3010083
316.8860575 327.5491989 333.0187730 339.0941615 343.1018712
356.4633958 361.6401144 366.7416245 371.8022424 376.8918089
382.2022001 387.3415129 397.2792495 402.0142259 406.5910747
416.6051141 424.2630239 429.6020025 433.3192093 441.4397420
445.4715795 447.3773556 455.5451930 463.0122237 468.5267076
470.5922167 483.8411840 486.0074876 489.3833103 494.7346518
504.3545006 508.2451405 514.4121879 517.2035740 520.8206292
525.4594362 528.0009315 533.5624258 542.9281498 546.5805834
547.8591975 553.2647533 555.0140609 559.6622327 561.4984610
567.4556022 571.6864720 576.1994305 579.5015733 581.8469139
591.8873364 594.2013758 595.1844080 597.9699881 600.6272205
603.8744338 614.7807177 616.7262137 623.2085330 625.4775347
629.4150109 632.9158892 635.3239474 638.2009642 643.4161364
646.4425980 647.7817644 650.9617233 653.4231522 653.8213390
661.4538195 668.0202919 671.3955214 675.0392691 677.8741131
679.6647731 682.3068188 686.7632754 688.1358857 691.3487853
693.0907883
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5633
Rtb_to_modes> Number of blocs = 187
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9871E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999
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0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
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0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
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1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
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1.00003 1.00001 1.00003 1.00003 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
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1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 101394 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999
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0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
1.00003 1.00000 0.99997 0.99999 1.00004
0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999
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1.00003 1.00001 1.00003 1.00003 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22092722260083457.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22092722260083457.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22092722260083457.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22092722260083457.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 742
First residue number = 554
Last residue number = 168
Number of atoms found = 5633
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9871E-10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5016
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.751
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74
Bfactors> 106 vectors, 16899 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.254600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.296 for 742 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.058 +/- 0.19
Bfactors> = 135.027 +/- 30.08
Bfactors> Shiftng-fct= 134.969
Bfactors> Scaling-fct= 160.409
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22092722260083457.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22092722260083457.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Chkmod> 106 vectors, 16899 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5633 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7083
0.0034 0.9253
0.0034 0.7799
0.0034 0.8762
0.0034 0.9390
0.0034 0.8550
54.7906 0.0316
67.4025 0.4654
76.9051 0.4545
98.9093 0.1225
106.3374 0.2720
140.3669 0.1388
157.8060 0.4139
163.0248 0.3365
178.2278 0.2769
196.2087 0.4312
208.7578 0.3260
209.0682 0.5845
231.3942 0.5473
237.8024 0.0753
254.4499 0.3484
259.8832 0.3600
267.2645 0.5395
279.5132 0.1095
294.2880 0.5541
316.8797 0.4954
327.5289 0.2246
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 11
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normal mode computation
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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