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LOGs for ID: 220926155553133140

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220926155553133140.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220926155553133140.atom to be opened. Openam> File opened: 220926155553133140.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 1 Last residue number = 349 Number of atoms found = 2841 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -22.361907 +/- 8.065464 From: -44.432000 To: -0.907000 = -29.848533 +/- 12.953451 From: -63.229000 To: -2.023000 = 26.200781 +/- 14.661563 From: -5.717000 To: 63.368000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9040 % Filled. Pdbmat> 1054866 non-zero elements. Pdbmat> 115330 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.19 +/- 22.77 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.306600E+06 Pdbmat> Larger element = 493.159 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 349 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220926155553133140.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220926155553133140.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220926155553133140.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2841 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 349 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 85 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 101 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 121 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 138 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 156 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 172 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 187 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 200 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 222 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 238 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 254 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 268 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 284 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 299 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 316 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 335 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 353 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 370 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 390 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 401 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 414 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 428 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 446 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 461 Blocpdb> 13 atoms in block 30 Block first atom: 475 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 488 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 498 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 508 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 521 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 535 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 554 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 569 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 583 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 596 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 611 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 629 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 644 Blocpdb> 13 atoms in block 43 Block first atom: 661 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 694 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 730 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 752 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 765 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 784 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 802 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 821 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 869 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 889 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 907 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 927 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 943 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 961 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 977 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 992 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1010 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 1030 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1045 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1060 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1074 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1092 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1106 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1119 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1136 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1154 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1170 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1190 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1205 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1220 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1236 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1249 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1261 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1284 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1298 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1314 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1330 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1345 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1362 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1381 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1398 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1415 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1430 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1445 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1460 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1478 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1491 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1508 Blocpdb> 18 atoms in block 95 Block first atom: 1521 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1539 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 1556 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1584 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1603 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1622 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1641 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1655 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1672 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1687 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 1703 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1722 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1738 Blocpdb> 21 atoms in block 108 Block first atom: 1762 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1783 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1796 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 1814 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1831 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1843 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1860 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 1874 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1895 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1908 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1925 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1940 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1959 Blocpdb> 18 atoms in block 121 Block first atom: 1978 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1996 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 2006 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 2026 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 2041 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 2058 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 2070 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2083 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2103 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2117 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2134 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 2149 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2166 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 2185 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2202 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 2216 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2241 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 2255 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 2279 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2298 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2313 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2327 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2338 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2355 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2371 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2389 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2406 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 2422 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2440 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2455 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2471 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2483 Blocpdb> 11 atoms in block 153 Block first atom: 2498 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2509 Blocpdb> 8 atoms in block 155 Block first atom: 2524 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 2532 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2544 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 2561 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2581 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2601 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2614 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2632 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 2648 Blocpdb> 12 atoms in block 164 Block first atom: 2669 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2681 Blocpdb> 12 atoms in block 166 Block first atom: 2700 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2712 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2729 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2745 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2755 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 2770 Blocpdb> 21 atoms in block 172 Block first atom: 2779 Blocpdb> 16 atoms in block 173 Block first atom: 2800 Blocpdb> 18 atoms in block 174 Block first atom: 2816 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 2833 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1055041 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8523 Prepmat> Matrix trace = 2306600.0000 Prepmat> Last element read: 8523 8523 75.0455 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13499 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2841 RTB> Total mass = 2841.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2841 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 238573.7324 RTB> 65811 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65811 Diagstd> Projected matrix trace = 238573.7324 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 238573.7324 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1736702 1.7166689 3.4160680 4.1032172 4.8342978 5.3549519 6.4565476 6.7784907 7.5949856 8.7134775 9.2714564 9.9304291 10.4873446 10.9048220 12.2146286 12.7747913 13.3455658 15.2209566 15.3629972 15.7402667 15.8673206 16.3900007 17.5364401 17.7234416 18.4473870 19.4964600 20.5572882 20.6264677 21.5726028 22.3069846 22.5137859 23.4105911 23.8438339 24.1136264 25.3083666 25.6094561 26.7260802 27.1811712 27.8664468 28.4088129 29.1477823 30.5932597 30.9463590 31.5318937 31.6547057 31.9562059 32.5077343 33.0959167 33.9819396 34.6997737 35.0167418 36.5445506 37.0068562 37.9131964 38.0476225 38.4582650 38.6707995 39.3931788 40.0234539 40.8068230 41.3661525 41.6855245 42.9295402 43.2896460 43.5290200 44.0193078 44.0887345 45.2592286 45.3772737 46.2944699 46.6369509 47.0533355 47.9718002 48.1551899 48.9913233 49.9028277 50.4395893 50.6763144 51.2508557 52.0579170 52.8201211 53.3590931 54.3936206 54.7630387 54.7960779 55.1382295 55.4156906 56.4238179 57.2818601 57.8792620 58.7556638 59.6158423 60.3836323 60.7991947 60.9607404 61.0872950 62.3272209 62.7787250 64.4253843 64.5312398 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034329 0.0034332 0.0034351 0.0034354 0.0034355 117.6436045 142.2782627 200.7051576 219.9670011 238.7602253 251.2887631 275.9278014 282.7234189 299.2669500 320.5464987 330.6505582 342.1994344 351.6641121 358.5952815 379.5206525 388.1255085 396.7014387 423.6588213 425.6310047 430.8254233 432.5607192 439.6274139 454.7429740 457.1611432 466.4044756 479.4829424 492.3548184 493.1825608 504.3668721 512.8799414 515.2518337 525.4137935 530.2532315 533.2446963 546.2951421 549.5351267 561.3877270 566.1471997 573.2394601 578.7910724 586.2704962 600.6315718 604.0877928 609.7759719 610.9623109 613.8650187 619.1396691 624.7157964 633.0228135 639.6738561 642.5887936 656.4574674 660.5966642 668.6371157 669.8214367 673.4263790 675.2846157 681.5626670 686.9933966 693.6839915 698.4218932 701.1128313 711.4975331 714.4754286 716.4480834 720.4716305 721.0395665 730.5481644 731.5002519 738.8560572 741.5840062 744.8871595 752.1219933 753.5582525 760.0722301 767.1103772 771.2249144 773.0325683 777.4023346 783.4994096 789.2143558 793.2306742 800.8833486 803.5983739 803.8407478 806.3464693 808.3727312 815.6925857 821.8713406 826.1459394 832.3771481 838.4479796 843.8298754 846.7285307 847.8526791 848.7322948 857.3026406 860.4022273 871.6131810 872.3289480 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2841 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.53 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51138 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220926155553133140.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220926155553133140.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220926155553133140.atom Openam> file on opening on unit 11: 220926155553133140.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 1 Last residue number = 349 Number of atoms found = 2841 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.53 Bfactors> 106 vectors, 8523 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.174000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.787 for 350 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.03 Bfactors> = 35.373 +/- 14.92 Bfactors> Shiftng-fct= 35.345 Bfactors> Scaling-fct= 458.148 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220926155553133140.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220926155553133140.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 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../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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220926155553133140.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220926155553133140.eigenfacs 220926155553133140.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220926155553133140.eigenfacs 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220926155553133140.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220926155553133140.10.pdb 220926155553133140.11.pdb 220926155553133140.7.pdb 220926155553133140.8.pdb 220926155553133140.9.pdb STDERR: real 0m16.400s user 0m16.328s sys 0m0.040s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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