*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220926155553133140.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220926155553133140.atom to be opened.
Openam> File opened: 220926155553133140.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 349
First residue number = 1
Last residue number = 349
Number of atoms found = 2841
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -22.361907 +/- 8.065464 From: -44.432000 To: -0.907000
= -29.848533 +/- 12.953451 From: -63.229000 To: -2.023000
= 26.200781 +/- 14.661563 From: -5.717000 To: 63.368000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.9040 % Filled.
Pdbmat> 1054866 non-zero elements.
Pdbmat> 115330 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.19 +/- 22.77
Maximum number = 130
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 2.306600E+06
Pdbmat> Larger element = 493.159
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
349 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220926155553133140.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220926155553133140.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220926155553133140.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2841 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 349 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 66
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 85
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 101
Blocpdb> 17 atoms in block 8
Block first atom: 121
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 138
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 156
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 172
Blocpdb> 13 atoms in block 12
Block first atom: 187
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 200
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 222
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 238
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 268
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 284
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 299
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 316
Blocpdb> 18 atoms in block 21
Block first atom: 335
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 353
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 370
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 390
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 401
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 414
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 428
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 446
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 461
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 10 atoms in block 31
Block first atom: 488
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 521
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 554
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 569
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 583
Blocpdb> 15 atoms in block 39
Block first atom: 596
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 629
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 644
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 661
Blocpdb> 20 atoms in block 44
Block first atom: 674
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 694
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 711
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 730
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 752
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 765
Blocpdb> 18 atoms in block 50
Block first atom: 784
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 802
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 821
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 841
Blocpdb> 11 atoms in block 54
Block first atom: 858
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 869
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 889
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 907
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 927
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 943
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 961
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 977
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 992
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1010
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1030
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 1045
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1060
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1074
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1092
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1106
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1119
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1136
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1154
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1170
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1190
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1205
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1220
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1236
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1249
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 1261
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1284
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1298
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1314
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1330
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1345
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1362
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1381
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1398
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1415
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1430
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1445
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 1460
Blocpdb> 13 atoms in block 92
Block first atom: 1478
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1491
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1508
Blocpdb> 18 atoms in block 95
Block first atom: 1521
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1539
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 1556
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 1584
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 1603
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1622
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1641
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1655
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1672
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1687
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1703
Blocpdb> 16 atoms in block 106
Block first atom: 1722
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 1738
Blocpdb> 21 atoms in block 108
Block first atom: 1762
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1783
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1796
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1814
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1831
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1843
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1860
Blocpdb> 21 atoms in block 115
Block first atom: 1874
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1895
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1908
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1925
Blocpdb> 19 atoms in block 119
Block first atom: 1940
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1959
Blocpdb> 18 atoms in block 121
Block first atom: 1978
Blocpdb> 10 atoms in block 122
Block first atom: 1996
Blocpdb> 20 atoms in block 123
Block first atom: 2006
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 2026
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 2041
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 2058
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 2070
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 2083
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2103
Blocpdb> 17 atoms in block 130
Block first atom: 2117
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2134
Blocpdb> 17 atoms in block 132
Block first atom: 2149
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2166
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 2185
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2202
Blocpdb> 25 atoms in block 136
Block first atom: 2216
Blocpdb> 14 atoms in block 137
Block first atom: 2241
Blocpdb> 24 atoms in block 138
Block first atom: 2255
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2279
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2298
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2313
Blocpdb> 11 atoms in block 142
Block first atom: 2327
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2338
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2355
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2371
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2389
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2406
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 2422
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2440
Blocpdb> 16 atoms in block 150
Block first atom: 2455
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2471
Blocpdb> 15 atoms in block 152
Block first atom: 2483
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 2498
Blocpdb> 15 atoms in block 154
Block first atom: 2509
Blocpdb> 8 atoms in block 155
Block first atom: 2524
Blocpdb> 12 atoms in block 156
Block first atom: 2532
Blocpdb> 17 atoms in block 157
Block first atom: 2544
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2561
Blocpdb> 20 atoms in block 159
Block first atom: 2581
Blocpdb> 13 atoms in block 160
Block first atom: 2601
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 2614
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2632
Blocpdb> 21 atoms in block 163
Block first atom: 2648
Blocpdb> 12 atoms in block 164
Block first atom: 2669
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 2681
Blocpdb> 12 atoms in block 166
Block first atom: 2700
Blocpdb> 17 atoms in block 167
Block first atom: 2712
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2729
Blocpdb> 10 atoms in block 169
Block first atom: 2745
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2755
Blocpdb> 9 atoms in block 171
Block first atom: 2770
Blocpdb> 21 atoms in block 172
Block first atom: 2779
Blocpdb> 16 atoms in block 173
Block first atom: 2800
Blocpdb> 18 atoms in block 174
Block first atom: 2816
Blocpdb> 8 atoms in block 175
Block first atom: 2833
Blocpdb> 175 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1055041 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8523
Prepmat> Matrix trace = 2306600.0000
Prepmat> Last element read: 8523 8523 75.0455
Prepmat> 15401 lines saved.
Prepmat> 13499 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2841
RTB> Total mass = 2841.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2841
RTB> Number of blocks = 175
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 238573.7324
RTB> 65811 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1050
Diagstd> Nb of non-zero elements: 65811
Diagstd> Projected matrix trace = 238573.7324
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1050 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 238573.7324
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.1736702 1.7166689 3.4160680 4.1032172
4.8342978 5.3549519 6.4565476 6.7784907 7.5949856
8.7134775 9.2714564 9.9304291 10.4873446 10.9048220
12.2146286 12.7747913 13.3455658 15.2209566 15.3629972
15.7402667 15.8673206 16.3900007 17.5364401 17.7234416
18.4473870 19.4964600 20.5572882 20.6264677 21.5726028
22.3069846 22.5137859 23.4105911 23.8438339 24.1136264
25.3083666 25.6094561 26.7260802 27.1811712 27.8664468
28.4088129 29.1477823 30.5932597 30.9463590 31.5318937
31.6547057 31.9562059 32.5077343 33.0959167 33.9819396
34.6997737 35.0167418 36.5445506 37.0068562 37.9131964
38.0476225 38.4582650 38.6707995 39.3931788 40.0234539
40.8068230 41.3661525 41.6855245 42.9295402 43.2896460
43.5290200 44.0193078 44.0887345 45.2592286 45.3772737
46.2944699 46.6369509 47.0533355 47.9718002 48.1551899
48.9913233 49.9028277 50.4395893 50.6763144 51.2508557
52.0579170 52.8201211 53.3590931 54.3936206 54.7630387
54.7960779 55.1382295 55.4156906 56.4238179 57.2818601
57.8792620 58.7556638 59.6158423 60.3836323 60.7991947
60.9607404 61.0872950 62.3272209 62.7787250 64.4253843
64.5312398
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034329 0.0034332 0.0034351 0.0034354
0.0034355 117.6436045 142.2782627 200.7051576 219.9670011
238.7602253 251.2887631 275.9278014 282.7234189 299.2669500
320.5464987 330.6505582 342.1994344 351.6641121 358.5952815
379.5206525 388.1255085 396.7014387 423.6588213 425.6310047
430.8254233 432.5607192 439.6274139 454.7429740 457.1611432
466.4044756 479.4829424 492.3548184 493.1825608 504.3668721
512.8799414 515.2518337 525.4137935 530.2532315 533.2446963
546.2951421 549.5351267 561.3877270 566.1471997 573.2394601
578.7910724 586.2704962 600.6315718 604.0877928 609.7759719
610.9623109 613.8650187 619.1396691 624.7157964 633.0228135
639.6738561 642.5887936 656.4574674 660.5966642 668.6371157
669.8214367 673.4263790 675.2846157 681.5626670 686.9933966
693.6839915 698.4218932 701.1128313 711.4975331 714.4754286
716.4480834 720.4716305 721.0395665 730.5481644 731.5002519
738.8560572 741.5840062 744.8871595 752.1219933 753.5582525
760.0722301 767.1103772 771.2249144 773.0325683 777.4023346
783.4994096 789.2143558 793.2306742 800.8833486 803.5983739
803.8407478 806.3464693 808.3727312 815.6925857 821.8713406
826.1459394 832.3771481 838.4479796 843.8298754 846.7285307
847.8526791 848.7322948 857.3026406 860.4022273 871.6131810
872.3289480
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2841
Rtb_to_modes> Number of blocs = 175
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.174
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.717
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.416
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.834
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.355
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.778
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.595
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.713
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.930
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.53
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997
1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 51138 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997
1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220926155553133140.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220926155553133140.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220926155553133140.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220926155553133140.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 349
First residue number = 1
Last residue number = 349
Number of atoms found = 2841
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.717
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.416
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.834
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.355
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.778
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.595
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.930
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.53
Bfactors> 106 vectors, 8523 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.174000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.787 for 350 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.028 +/- 0.03
Bfactors> = 35.373 +/- 14.92
Bfactors> Shiftng-fct= 35.345
Bfactors> Scaling-fct= 458.148
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220926155553133140.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220926155553133140.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.3
Chkmod> 106 vectors, 8523 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2841 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7182
0.0034 0.8171
0.0034 0.9725
0.0034 0.8722
0.0034 0.7705
0.0034 0.9873
117.6551 0.5738
142.2859 0.6111
200.6945 0.0815
219.9517 0.5832
238.7426 0.0141
251.2791 0.4374
275.9256 0.5331
282.7010 0.5886
299.2544 0.5337
320.5240 0.1719
330.6282 0.1768
342.1774 0.2781
351.6935 0.5389
358.5006 0.5153
379.4324 0.2614
388.0361 0.4417
396.7503 0.3445
423.6273 0.1000
425.5712 0.2153
430.8033 0.4832
432.5787 0.3452
439.6085 0.4703
454.7696 0.2170
457.0971 0.4479
466.4175 0.2851
479.5059 0.4064
492.3662 0.3331
493.2036 0.1157
504.3148 0.2265
512.8926 0.4047
515.1864 0.3612
525.3846 0.3370
530.1878 0.4121
533.1817 0.4779
546.2893 0.5723
549.5174 0.3416
561.4048 0.5251
566.1107 0.5019
573.2514 0.4043
578.7783 0.4094
586.2676 0.3843
600.5738 0.5124
604.0974 0.0197
609.7315 0.4293
610.8907 0.3641
613.8751 0.3646
619.1347 0.3486
624.7275 0.4229
632.9776 0.5438
639.6485 0.2406
642.5911 0.3853
656.3884 0.4802
660.5964 0.2948
668.5802 0.5655
669.8136 0.4162
673.4127 0.5176
675.2486 0.4476
681.5059 0.3274
686.9343 0.3901
693.6812 0.3873
698.4244 0.3900
701.1204 0.4037
711.4708 0.4439
714.4477 0.4770
716.4254 0.3249
720.4464 0.3285
721.0190 0.3227
730.5230 0.3249
731.4908 0.4126
738.7887 0.2904
741.5764 0.4095
744.8288 0.3489
752.0756 0.4563
753.5635 0.4195
760.0293 0.3355
767.0557 0.5019
771.1949 0.4662
773.0275 0.4221
777.3625 0.4201
783.4815 0.3963
789.1796 0.3800
793.2034 0.4236
800.8223 0.4167
803.5416 0.4074
803.8350 0.4517
806.3248 0.3219
808.3695 0.4225
815.6300 0.1897
821.8227 0.5546
826.1157 0.5102
832.3721 0.4262
838.4412 0.5037
843.7683 0.4644
846.6978 0.2168
847.8111 0.4890
848.7147 0.3415
857.2850 0.4084
860.3740 0.4594
871.6070 0.1912
872.2831 0.4773
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
making animated gifs
11 models are in 220926155553133140.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
making animated gifs
11 models are in 220926155553133140.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
making animated gifs
11 models are in 220926155553133140.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
making animated gifs
11 models are in 220926155553133140.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220926155553133140 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220926155553133140.eigenfacs
220926155553133140.atom
making animated gifs
11 models are in 220926155553133140.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220926155553133140.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
220926155553133140.10.pdb
220926155553133140.11.pdb
220926155553133140.7.pdb
220926155553133140.8.pdb
220926155553133140.9.pdb
STDERR:
real 0m16.400s
user 0m16.328s
sys 0m0.040s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
