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LOGs for ID: 220616091311124970

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220616091311124970.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220616091311124970.atom to be opened. Openam> File opened: 220616091311124970.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 342 First residue number = 4 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2696 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 47.281156 +/- 12.619730 From: 13.701000 To: 76.347000 = 16.083418 +/- 9.714752 From: -7.052000 To: 41.148000 = 38.442355 +/- 11.168668 From: 12.878000 To: 63.828000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0497 % Filled. Pdbmat> 997608 non-zero elements. Pdbmat> 109068 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.91 +/- 22.25 Maximum number = 128 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 2.181360E+06 Pdbmat> Larger element = 475.508 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 342 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220616091311124970.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220616091311124970.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220616091311124970.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2696 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 342 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 52 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 67 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 79 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 94 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 110 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 126 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 137 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 151 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 168 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 187 Blocpdb> 21 atoms in block 14 Block first atom: 203 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 224 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 238 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 254 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 270 Blocpdb> 13 atoms in block 19 Block first atom: 287 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 300 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 317 Blocpdb> 18 atoms in block 22 Block first atom: 336 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 354 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 373 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 390 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 27 Block first atom: 423 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 443 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 459 Blocpdb> 9 atoms in block 30 Block first atom: 481 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 490 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 500 Blocpdb> 14 atoms in block 33 Block first atom: 516 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 530 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 547 Blocpdb> 23 atoms in block 36 Block first atom: 559 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 582 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 598 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 616 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 633 Blocpdb> 12 atoms in block 41 Block first atom: 647 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 659 Blocpdb> 10 atoms in block 43 Block first atom: 681 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 691 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 703 Blocpdb> 20 atoms in block 46 Block first atom: 719 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 739 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 752 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 768 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 788 Blocpdb> 14 atoms in block 51 Block first atom: 802 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 816 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 831 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 846 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 861 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 885 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 903 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 920 Blocpdb> 11 atoms in block 59 Block first atom: 936 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 947 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 960 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 970 Blocpdb> 11 atoms in block 63 Block first atom: 984 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 995 Blocpdb> 17 atoms in block 65 Block first atom: 1011 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1028 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 1044 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 1057 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 1070 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1080 Blocpdb> 21 atoms in block 71 Block first atom: 1094 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1115 Blocpdb> 19 atoms in block 73 Block first atom: 1133 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1152 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1168 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1185 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1202 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1224 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1239 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1257 Blocpdb> 13 atoms in block 81 Block first atom: 1273 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1286 Blocpdb> 9 atoms in block 83 Block first atom: 1306 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1315 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1337 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1352 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1365 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1381 Blocpdb> 17 atoms in block 89 Block first atom: 1394 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1411 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 1423 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 1443 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1454 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1471 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1490 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1509 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1524 Blocpdb> 11 atoms in block 98 Block first atom: 1540 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1551 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1569 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1583 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 1603 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1624 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1639 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1655 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1671 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 1686 Blocpdb> 16 atoms in block 108 Block first atom: 1705 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1721 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1740 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1752 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 1768 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 1782 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1794 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 1810 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1830 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 1843 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1863 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1879 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1895 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 1913 Blocpdb> 18 atoms in block 122 Block first atom: 1926 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1944 Blocpdb> 13 atoms in block 124 Block first atom: 1960 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1973 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 1989 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 2005 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2020 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 2040 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 2059 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 2074 Blocpdb> 13 atoms in block 132 Block first atom: 2092 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2105 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2124 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 2139 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2155 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2167 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2182 Blocpdb> 12 atoms in block 139 Block first atom: 2198 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2210 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2226 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2241 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2258 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2275 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2293 Blocpdb> 15 atoms in block 146 Block first atom: 2309 Blocpdb> 12 atoms in block 147 Block first atom: 2324 Blocpdb> 9 atoms in block 148 Block first atom: 2336 Blocpdb> 13 atoms in block 149 Block first atom: 2345 Blocpdb> 18 atoms in block 150 Block first atom: 2358 Blocpdb> 8 atoms in block 151 Block first atom: 2376 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 2384 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2403 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2418 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 2433 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 2447 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2463 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 2478 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 2493 Blocpdb> 9 atoms in block 160 Block first atom: 2512 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 2521 Blocpdb> 10 atoms in block 162 Block first atom: 2543 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2553 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2567 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 2583 Blocpdb> 11 atoms in block 166 Block first atom: 2605 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2616 Blocpdb> 18 atoms in block 168 Block first atom: 2629 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2647 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2665 Blocpdb> 17 atoms in block 171 Block first atom: 2679 Blocpdb> 171 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 997779 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8088 Prepmat> Matrix trace = 2181360.0000 Prepmat> Last element read: 8088 8088 51.8136 Prepmat> 14707 lines saved. Prepmat> 12757 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2696 RTB> Total mass = 2696.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2696 RTB> Number of blocks = 171 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 237739.6081 RTB> 67599 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1026 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67599 Diagstd> Projected matrix trace = 237739.6081 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1026 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 237739.6081 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.8569434 3.5976887 4.6734920 6.3255874 7.7550083 8.7973710 9.3854818 10.5075184 10.7061889 11.1051688 13.6269464 13.8115820 14.4239791 15.3744765 15.6451815 17.1350438 17.5184906 18.7062025 19.1178337 19.7533864 20.6836193 21.9334339 22.1681917 24.1060049 24.3167605 25.3263977 25.5256423 25.9536652 26.8609463 27.5573017 28.4901201 28.9410082 29.7646904 30.6351781 30.9983851 31.5090646 32.2090479 32.3057301 32.5800123 33.4563276 33.6992878 34.1950178 34.7963036 35.2510496 35.4477502 36.4473396 37.1908250 37.5202898 38.8891748 39.2073279 40.4047700 40.6730995 41.3273137 41.7038258 42.4521954 43.0435580 43.2565547 43.5695852 44.5174414 44.6904733 46.1840564 46.4493395 46.8864961 47.0516822 47.4132555 48.0475160 48.4439066 49.4093589 49.4958816 50.1812500 50.6070512 51.3388857 52.4465501 53.6397769 53.9205789 54.3597542 54.7798621 55.5088608 55.9361953 56.6491237 57.1478632 57.5809275 58.0636635 59.1137434 60.1591774 60.4723196 60.6227705 62.2537307 62.6917434 62.9201909 63.1511946 63.8992088 64.4541317 65.2031363 65.5967494 66.1685722 66.8249078 67.5557642 67.9981009 68.4487987 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034329 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034347 183.5464978 205.9714708 234.7556396 273.1150990 302.4032214 322.0859147 332.6776051 352.0021861 355.3143362 361.8744014 400.8616904 403.5682511 412.4182002 425.7899915 429.5221674 449.5084806 454.5101880 469.6648901 474.8042742 482.6319398 493.8653397 508.5674907 511.2818950 533.1604193 535.4860217 546.4897136 548.6351387 553.2158689 562.8023922 570.0508873 579.6187420 584.1872965 592.4421716 601.0429188 604.5953669 609.5551926 616.2887274 617.2129942 619.8275879 628.1081295 630.3846675 635.0043455 640.5629805 644.7350886 646.5313949 655.5837750 662.2366106 665.1634424 677.1886088 679.9530133 690.2582400 692.5464619 698.0939413 701.2667200 707.5308122 712.4417502 714.2022980 716.7818384 724.5366826 725.9433936 737.9744360 740.0908786 743.5653941 744.8740730 747.7306247 752.7153113 755.8138732 763.3081325 763.9761701 769.2473658 772.5041057 778.0696932 786.4185395 795.3142459 797.3932468 800.6339874 803.7217985 809.0520030 812.1602726 817.3195331 820.9094942 824.0140338 827.4609305 834.9097086 842.2600948 844.4493275 845.4991403 856.7970679 859.8059654 861.3710987 862.9508593 868.0465609 871.8076215 876.8585139 879.5012070 883.3263016 887.6964118 892.5375285 895.4548065 898.4174848 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2696 Rtb_to_modes> Number of blocs = 171 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.385 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.45 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 48528 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220616091311124970.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220616091311124970.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220616091311124970.atom Openam> file on opening on unit 11: 220616091311124970.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 342 First residue number = 4 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2696 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.385 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.45 Bfactors> 106 vectors, 8088 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.857000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.565 for 342 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.020 +/- 0.02 Bfactors> = 13.893 +/- 5.26 Bfactors> Shiftng-fct= 13.873 Bfactors> Scaling-fct= 323.660 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220616091311124970.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220616091311124970.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1 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../../bin/get_modes.sh 220616091311124970 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220616091311124970 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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220616091311124970.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220616091311124970 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220616091311124970.eigenfacs 220616091311124970.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220616091311124970.eigenfacs 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220616091311124970.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220616091311124970.10.pdb 220616091311124970.11.pdb 220616091311124970.7.pdb 220616091311124970.8.pdb 220616091311124970.9.pdb STDERR: real 0m14.064s user 0m14.020s sys 0m0.036s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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