CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 22050814041994329

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22050814041994329.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22050814041994329.atom to be opened. Openam> File opened: 22050814041994329.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 298 First residue number = 1 Last residue number = 298 Number of atoms found = 2248 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 17.257687 +/- 15.551650 From: -16.749000 To: 51.750000 = 5.800086 +/- 10.083700 From: -18.626000 To: 31.256000 = 9.299002 +/- 10.101932 From: -13.460000 To: 31.132000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.7043 % Filled. Pdbmat> 842506 non-zero elements. Pdbmat> 92132 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.97 +/- 22.62 Maximum number = 133 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.842640E+06 Pdbmat> Larger element = 493.087 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 298 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22050814041994329.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22050814041994329.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22050814041994329.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2248 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 298 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 11 atoms in block 3 Block first atom: 33 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 44 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 59 Blocpdb> 11 atoms in block 6 Block first atom: 68 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 79 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 95 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 109 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 121 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 141 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 156 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 168 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 187 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 200 Blocpdb> 10 atoms in block 16 Block first atom: 210 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 220 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 231 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 251 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 269 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 280 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 295 Blocpdb> 17 atoms in block 23 Block first atom: 311 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 328 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 344 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 362 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 374 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 391 Blocpdb> 13 atoms in block 29 Block first atom: 401 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 414 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 428 Blocpdb> 11 atoms in block 32 Block first atom: 443 Blocpdb> 12 atoms in block 33 Block first atom: 454 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 466 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 478 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 490 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 504 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 524 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 546 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 563 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 581 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 596 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 607 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 623 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 635 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 651 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 667 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 686 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 698 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 713 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 726 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 742 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 758 Blocpdb> 16 atoms in block 54 Block first atom: 770 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 786 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 797 Blocpdb> 13 atoms in block 57 Block first atom: 811 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 824 Blocpdb> 10 atoms in block 59 Block first atom: 835 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 845 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 859 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 872 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 892 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 905 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 925 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 944 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 955 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 970 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 988 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1004 Blocpdb> 12 atoms in block 71 Block first atom: 1018 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1030 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1041 Blocpdb> 11 atoms in block 74 Block first atom: 1067 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1078 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1098 Blocpdb> 20 atoms in block 77 Block first atom: 1111 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1131 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1146 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1163 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1179 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1191 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1208 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1224 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1240 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1260 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1276 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1293 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1308 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1323 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1340 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1356 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1373 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1388 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1408 Blocpdb> 12 atoms in block 96 Block first atom: 1427 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1439 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1454 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1470 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1485 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1496 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1509 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1523 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1538 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1552 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 1565 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1578 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1593 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1605 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1621 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 1637 Blocpdb> 9 atoms in block 112 Block first atom: 1655 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1664 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1681 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1694 Blocpdb> 12 atoms in block 116 Block first atom: 1709 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 1721 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1741 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1757 Blocpdb> 11 atoms in block 120 Block first atom: 1774 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 1785 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1802 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 1821 Blocpdb> 8 atoms in block 124 Block first atom: 1838 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 1846 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1865 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1882 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 1898 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1920 Blocpdb> 18 atoms in block 130 Block first atom: 1940 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 1958 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 1978 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 1995 Blocpdb> 12 atoms in block 134 Block first atom: 2013 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2025 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 2039 Blocpdb> 13 atoms in block 137 Block first atom: 2055 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2068 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2085 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 2101 Blocpdb> 12 atoms in block 141 Block first atom: 2113 Blocpdb> 16 atoms in block 142 Block first atom: 2125 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2141 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2158 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 2176 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2187 Blocpdb> 17 atoms in block 147 Block first atom: 2201 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2218 Blocpdb> 14 atoms in block 149 Block first atom: 2234 Blocpdb> 149 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 842655 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6744 Prepmat> Matrix trace = 1842640.0000 Prepmat> Last element read: 6744 6744 109.1270 Prepmat> 11176 lines saved. Prepmat> 9539 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2248 RTB> Total mass = 2248.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2248 RTB> Number of blocks = 149 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 210800.0915 RTB> 56661 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 894 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56661 Diagstd> Projected matrix trace = 210800.0915 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 894 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 210800.0915 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5488805 0.8071992 1.4150128 2.9340551 4.3627877 5.4760499 6.6168719 9.0660936 9.9393636 10.6800908 11.4201846 11.7517070 13.3816868 15.2105889 16.1195264 16.7160974 17.8767759 19.1776993 20.2261446 21.0666985 22.9982349 24.4552068 25.0455816 25.7779180 26.8820822 27.1799859 27.8639052 28.6234447 30.1479892 30.3034189 31.0057627 32.0215310 33.9745593 34.5110660 35.2085007 36.1339045 37.1517965 37.9659766 39.1924204 39.7236309 40.5421385 41.1778525 42.9044068 43.9288511 44.1480714 45.0493195 45.3469505 46.6422518 47.3718006 47.9607767 48.5646038 49.3865152 50.6920677 51.4981053 51.9038049 52.1370444 53.7402123 54.3018323 55.0938315 55.4536786 56.1604172 56.7044545 58.1993475 58.3079829 59.6486775 59.8533638 60.5739961 60.8746530 62.2666327 62.9609090 63.3919653 64.1670701 64.5042641 65.5488564 66.6105437 66.9027931 67.2485118 67.7301842 68.3349694 68.9561666 70.0475516 70.9351754 71.9970659 72.2902155 73.1387134 73.6055651 74.3935736 74.6935347 75.4923227 76.4491499 76.7810578 77.8679639 78.4479701 78.9615203 80.0649189 80.4844775 81.9698227 82.7324826 83.5341635 83.8328565 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034337 0.0034343 0.0034345 0.0034351 0.0034351 80.4515037 97.5631087 129.1741059 186.0070536 226.8178977 254.1142268 279.3326121 326.9680974 342.3533395 354.8810035 366.9710821 372.2594730 397.2379309 423.5145098 435.9848705 443.9793052 459.1344485 475.5470944 488.3732119 498.4177731 520.7658933 537.0082403 543.4515617 551.3396154 563.0237727 566.1348555 573.2133176 580.9733741 596.2445962 597.7796070 604.6673097 614.4921323 632.9540693 637.9321166 644.3458655 652.7587867 661.8890402 669.1023698 679.8237340 684.4153625 691.4306172 696.8304607 711.2892276 719.7309898 721.5246093 728.8520808 731.2557998 741.6261501 747.4036706 752.0355727 756.7548368 763.1316600 773.1527113 779.2752906 782.3388154 784.0946385 796.0584731 800.2073246 806.0217636 808.6497576 813.7864288 817.7185858 828.4271774 829.1999920 838.6788476 840.1165916 845.1589463 847.2538081 856.8858485 861.6497674 864.5943405 869.8640549 872.1466015 879.1800804 886.2714705 888.2135718 890.5055270 893.6889924 897.6701466 901.7410395 908.8490551 914.5892740 921.4094867 923.2834272 928.6860850 931.6453185 936.6190590 938.5054226 943.5103619 949.4707944 951.5296504 958.2408690 961.8030182 964.9460460 971.6646755 974.2072222 983.1556472 987.7187741 992.4927531 994.2655971 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2248 Rtb_to_modes> Number of blocs = 149 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.363 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.617 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.066 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.939 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.83 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 894 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 40464 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050814041994329.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050814041994329.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22050814041994329.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050814041994329.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 298 First residue number = 1 Last residue number = 298 Number of atoms found = 2248 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.363 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.617 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.066 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.939 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.83 Bfactors> 106 vectors, 6744 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.548900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.697 for 298 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.044 +/- 0.03 Bfactors> = 16.422 +/- 5.99 Bfactors> Shiftng-fct= 16.378 Bfactors> Scaling-fct= 194.811 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050814041994329.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050814041994329.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.2 Chkmod> 106 vectors, 6744 coordinates in file. Chkmod> That is: 2248 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9042 0.0034 0.7407 0.0034 0.7291 0.0034 0.9832 0.0034 0.9044 0.0034 0.7972 80.4495 0.6270 97.5590 0.5911 129.1680 0.5418 185.9973 0.6879 226.8137 0.6292 254.1022 0.7303 279.3233 0.6186 326.9524 0.5474 342.3324 0.3970 354.8643 0.3330 366.9524 0.5615 372.2165 0.4229 397.1958 0.5521 423.4881 0.5894 435.9726 0.5556 444.0121 0.6035 459.1561 0.4561 475.5552 0.1664 488.3988 0.3149 498.4354 0.3268 520.7635 0.4473 537.0378 0.2835 543.4762 0.1924 551.3382 0.3971 562.9778 0.2819 566.1107 0.3066 573.1485 0.3651 580.9135 0.4948 596.2389 0.1678 597.7202 0.3628 604.6827 0.3817 614.4511 0.4616 632.8844 0.3478 637.8949 0.3724 644.3319 0.2531 652.6955 0.4681 661.8446 0.4811 669.1091 0.4312 679.7736 0.4004 684.3547 0.4430 691.3827 0.4324 696.8187 0.5285 711.2222 0.3585 719.7095 0.4444 721.5094 0.3785 728.8263 0.3516 731.2490 0.4130 741.5764 0.3531 747.3574 0.3683 751.9972 0.5275 756.6865 0.3676 763.1258 0.3136 773.1038 0.4614 779.2562 0.5022 782.2766 0.5322 784.0832 0.4739 796.0227 0.5309 800.1595 0.4104 805.9591 0.3514 808.5882 0.5447 813.7485 0.3259 817.6514 0.4524 828.3963 0.4427 829.1787 0.5211 838.6521 0.4309 840.0569 0.3411 845.0948 0.4009 847.1851 0.5419 856.8722 0.4659 861.6066 0.4262 864.5438 0.5606 869.8466 0.4869 872.0803 0.5225 879.1500 0.3590 886.2298 0.4851 888.1569 0.5789 890.4772 0.3878 893.6494 0.5988 897.5990 0.3655 901.7274 0.4872 908.8259 0.4311 914.5811 0.5180 921.3887 0.4284 923.2424 0.4574 928.6544 0.4191 931.6334 0.4041 936.5564 0.2638 938.4429 0.5153 943.4553 0.4264 949.4353 0.4214 951.4822 0.3965 958.2123 0.4183 961.7742 0.3288 964.8953 0.5381 971.5931 0.4415 974.1383 0.4474 983.1145 0.4481 987.6616 0.4183 992.4254 0.3583 994.2060 0.2537 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 22050814041994329.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050814041994329.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 22050814041994329.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050814041994329.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 22050814041994329.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 22050814041994329.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.2 Projmod> 106 vectors, 6744 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 298 First residue number = 1 Last residue number = 298 Number of atoms found = 2248 Mean number per residue = 7.5 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 299 First residue number = 1 Last residue number = 299 Number of atoms found = 2257 Mean number per residue = 7.5 %Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer. %Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer. Projmod> All atoms of first conformer were found in second one. Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 2248 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 3.15 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.008 Sum= 0.000 q= -1.1504 Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.006 Sum= 0.000 q= -0.9260 Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.038 Sum= 0.002 q= -5.7102 Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.030 Sum= 0.002 q= 4.4730 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.018 Sum= 0.003 q= 2.7298 Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.018 Sum= 0.003 q= 2.6542 Vector: 7 F= 80.45 Cos= 0.778 Sum= 0.609 q= 116.0873 Vector: 8 F= 97.56 Cos= 0.293 Sum= 0.695 q= 43.6287 Vector: 9 F= 129.17 Cos= -0.147 Sum= 0.716 q= -21.9690 Vector: 10 F= 186.00 Cos= -0.318 Sum= 0.817 q= -47.4397 Vector: 11 F= 226.81 Cos= -0.065 Sum= 0.822 q= -9.6916 Vector: 12 F= 254.10 Cos= 0.018 Sum= 0.822 q= 2.7323 Vector: 13 F= 279.32 Cos= -0.020 Sum= 0.822 q= -3.0191 Vector: 14 F= 326.95 Cos= 0.017 Sum= 0.823 q= 2.5792 Vector: 15 F= 342.33 Cos= -0.036 Sum= 0.824 q= -5.3029 Vector: 16 F= 354.86 Cos= -0.099 Sum= 0.834 q= -14.7933 Vector: 17 F= 366.95 Cos= 0.061 Sum= 0.837 q= 9.1138 Vector: 18 F= 372.22 Cos= 0.043 Sum= 0.839 q= 6.4719 Vector: 19 F= 397.20 Cos= 0.084 Sum= 0.847 q= 12.5960 Vector: 20 F= 423.49 Cos= 0.015 Sum= 0.847 q= 2.2326 Vector: 21 F= 435.97 Cos= -0.047 Sum= 0.849 q= -6.9763 Vector: 22 F= 444.01 Cos= -0.032 Sum= 0.850 q= -4.8075 Vector: 23 F= 459.16 Cos= -0.004 Sum= 0.850 q= -0.5898 Vector: 24 F= 475.56 Cos= 0.056 Sum= 0.853 q= 8.3845 Vector: 25 F= 488.40 Cos= 0.013 Sum= 0.853 q= 1.9329 Vector: 26 F= 498.44 Cos= 0.028 Sum= 0.854 q= 4.1998 Vector: 27 F= 520.76 Cos= 0.027 Sum= 0.855 q= 4.0130 Vector: 28 F= 537.04 Cos= -0.024 Sum= 0.855 q= -3.6072 Vector: 29 F= 543.48 Cos= 0.025 Sum= 0.856 q= 3.6802 Vector: 30 F= 551.34 Cos= -0.027 Sum= 0.857 q= -4.0566 Vector: 31 F= 562.98 Cos= 0.008 Sum= 0.857 q= 1.2493 Vector: 32 F= 566.11 Cos= -0.020 Sum= 0.857 q= -3.0194 Vector: 33 F= 573.15 Cos= 0.011 Sum= 0.857 q= 1.6005 Vector: 34 F= 580.91 Cos= -0.038 Sum= 0.859 q= -5.7138 Vector: 35 F= 596.24 Cos= -0.000 Sum= 0.859 q= -0.0152 Vector: 36 F= 597.72 Cos= -0.036 Sum= 0.860 q= -5.4097 Vector: 37 F= 604.68 Cos= -0.004 Sum= 0.860 q= -0.6288 Vector: 38 F= 614.45 Cos= 0.008 Sum= 0.860 q= 1.1704 Vector: 39 F= 632.88 Cos= -0.022 Sum= 0.861 q= -3.3288 Vector: 40 F= 637.89 Cos= 0.006 Sum= 0.861 q= 0.9413 Vector: 41 F= 644.33 Cos= -0.000 Sum= 0.861 q= -0.0516 Vector: 42 F= 652.70 Cos= -0.024 Sum= 0.861 q= -3.5305 Vector: 43 F= 661.84 Cos= -0.012 Sum= 0.861 q= -1.8411 Vector: 44 F= 669.11 Cos= -0.003 Sum= 0.861 q= -0.4800 Vector: 45 F= 679.77 Cos= 0.032 Sum= 0.863 q= 4.8192 Vector: 46 F= 684.35 Cos= 0.000 Sum= 0.863 q= 0.0161 Vector: 47 F= 691.38 Cos= 0.017 Sum= 0.863 q= 2.4829 Vector: 48 F= 696.82 Cos= -0.026 Sum= 0.863 q= -3.9230 Vector: 49 F= 711.22 Cos= 0.026 Sum= 0.864 q= 3.8456 Vector: 50 F= 719.71 Cos= 0.016 Sum= 0.864 q= 2.3769 Vector: 51 F= 721.51 Cos= 0.020 Sum= 0.865 q= 3.0360 Vector: 52 F= 728.83 Cos= -0.020 Sum= 0.865 q= -2.9779 Vector: 53 F= 731.25 Cos= 0.001 Sum= 0.865 q= 0.0788 Vector: 54 F= 741.58 Cos= -0.027 Sum= 0.866 q= -4.0516 Vector: 55 F= 747.36 Cos= -0.020 Sum= 0.866 q= -2.9876 Vector: 56 F= 752.00 Cos= -0.059 Sum= 0.870 q= -8.8621 Vector: 57 F= 756.69 Cos= 0.018 Sum= 0.870 q= 2.6418 Vector: 58 F= 763.13 Cos= -0.010 Sum= 0.870 q= -1.5185 Vector: 59 F= 773.10 Cos= -0.005 Sum= 0.870 q= -0.6831 Vector: 60 F= 779.26 Cos= 0.007 Sum= 0.870 q= 1.1040 Vector: 61 F= 782.28 Cos= 0.028 Sum= 0.871 q= 4.2125 Vector: 62 F= 784.08 Cos= -0.009 Sum= 0.871 q= -1.4026 Vector: 63 F= 796.02 Cos= 0.007 Sum= 0.871 q= 1.0612 Vector: 64 F= 800.16 Cos= 0.012 Sum= 0.871 q= 1.8347 Vector: 65 F= 805.96 Cos= 0.019 Sum= 0.872 q= 2.7593 Vector: 66 F= 808.59 Cos= 0.002 Sum= 0.872 q= 0.3410 Vector: 67 F= 813.75 Cos= 0.029 Sum= 0.873 q= 4.3685 Vector: 68 F= 817.65 Cos= 0.021 Sum= 0.873 q= 3.1451 Vector: 69 F= 828.40 Cos= 0.006 Sum= 0.873 q= 0.8934 Vector: 70 F= 829.18 Cos= 0.009 Sum= 0.873 q= 1.3000 Vector: 71 F= 838.65 Cos= 0.027 Sum= 0.874 q= 3.9586 Vector: 72 F= 840.06 Cos= 0.000 Sum= 0.874 q= 0.0184 Vector: 73 F= 845.09 Cos= -0.033 Sum= 0.875 q= -4.8874 Vector: 74 F= 847.19 Cos= -0.005 Sum= 0.875 q= -0.7794 Vector: 75 F= 856.87 Cos= 0.023 Sum= 0.876 q= 3.4610 Vector: 76 F= 861.61 Cos= 0.015 Sum= 0.876 q= 2.2136 Vector: 77 F= 864.54 Cos= -0.003 Sum= 0.876 q= -0.3975 Vector: 78 F= 869.85 Cos= -0.004 Sum= 0.876 q= -0.6300 Vector: 79 F= 872.08 Cos= 0.016 Sum= 0.876 q= 2.3797 Vector: 80 F= 879.15 Cos= 0.007 Sum= 0.876 q= 1.0553 Vector: 81 F= 886.23 Cos= -0.020 Sum= 0.877 q= -2.9691 Vector: 82 F= 888.16 Cos= 0.030 Sum= 0.877 q= 4.4928 Vector: 83 F= 890.48 Cos= 0.012 Sum= 0.878 q= 1.8372 Vector: 84 F= 893.65 Cos= 0.001 Sum= 0.878 q= 0.0803 Vector: 85 F= 897.60 Cos= -0.014 Sum= 0.878 q= -2.1034 Vector: 86 F= 901.73 Cos= 0.011 Sum= 0.878 q= 1.5717 Vector: 87 F= 908.83 Cos= 0.008 Sum= 0.878 q= 1.2431 Vector: 88 F= 914.58 Cos= 0.018 Sum= 0.878 q= 2.6676 Vector: 89 F= 921.39 Cos= 0.017 Sum= 0.879 q= 2.5226 Vector: 90 F= 923.24 Cos= -0.009 Sum= 0.879 q= -1.3250 Vector: 91 F= 928.65 Cos= -0.007 Sum= 0.879 q= -1.0571 Vector: 92 F= 931.63 Cos= 0.031 Sum= 0.880 q= 4.5993 Vector: 93 F= 936.56 Cos= 0.002 Sum= 0.880 q= 0.3162 Vector: 94 F= 938.44 Cos= 0.003 Sum= 0.880 q= 0.5148 Vector: 95 F= 943.46 Cos= 0.015 Sum= 0.880 q= 2.1865 Vector: 96 F= 949.44 Cos= 0.020 Sum= 0.880 q= 2.9829 Vector: 97 F= 951.48 Cos= -0.027 Sum= 0.881 q= -3.9870 Vector: 98 F= 958.21 Cos= 0.033 Sum= 0.882 q= 4.9219 Vector: 99 F= 961.77 Cos= 0.004 Sum= 0.882 q= 0.6566 Vector: 100 F= 964.90 Cos= -0.014 Sum= 0.882 q= -2.1108 Vector: 101 F= 971.59 Cos= -0.030 Sum= 0.883 q= -4.4096 Vector: 102 F= 974.14 Cos= -0.007 Sum= 0.883 q= -1.1176 Vector: 103 F= 983.11 Cos= -0.002 Sum= 0.883 q= -0.3462 Vector: 104 F= 987.66 Cos= -0.003 Sum= 0.883 q= -0.4562 Vector: 105 F= 992.43 Cos= 0.030 Sum= 0.884 q= 4.5478 Vector: 106 F= 994.21 Cos= -0.016 Sum= 0.884 q= -2.3606 Projmod> Best zero-frequency found : 0.003434 Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435 Projmod> Lowest non-zero frequency : 80.449482 Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.78 for mode 7 with F= 80.45 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.606 0.793 0.831 0.843 0.850 0.884 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22050814041994329 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom making animated gifs 11 models are in 22050814041994329.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 298 4.859 187 1.026 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 298 4.470 190 0.994 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 298 4.087 192 0.932 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 298 3.710 199 1.116 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 298 3.343 202 1.529 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 298 2.989 215 1.502 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 298 2.653 221 1.805 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 298 2.342 242 1.726 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 298 2.069 258 1.689 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 298 1.850 277 1.671 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 298 1.705 288 1.604 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22050814041994329 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom making animated gifs 11 models are in 22050814041994329.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 298 4.095 189 1.278 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 298 3.814 193 1.355 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 298 3.557 194 1.262 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 298 3.330 198 1.211 MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 298 3.138 209 1.507 MODEL 6 MODE=8 DQ=0 298 2.989 215 1.502 MODEL 7 MODE=8 DQ=20 298 2.889 213 1.267 MODEL 8 MODE=8 DQ=40 298 2.843 214 1.201 MODEL 9 MODE=8 DQ=60 298 2.855 215 1.217 MODEL 10 MODE=8 DQ=80 298 2.922 213 1.263 MODEL 11 MODE=8 DQ=100 298 3.042 206 1.252 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22050814041994329 9 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom making animated gifs 11 models are in 22050814041994329.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 298 3.337 181 1.755 MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 298 3.168 186 1.850 MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 298 3.045 193 1.602 MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 298 2.971 209 1.513 MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 298 2.953 215 1.481 MODEL 6 MODE=9 DQ=0 298 2.989 215 1.502 MODEL 7 MODE=9 DQ=20 298 3.079 205 1.183 MODEL 8 MODE=9 DQ=40 298 3.218 198 1.172 MODEL 9 MODE=9 DQ=60 298 3.399 188 1.207 MODEL 10 MODE=9 DQ=80 298 3.617 181 1.333 MODEL 11 MODE=9 DQ=100 298 3.865 160 1.629 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22050814041994329 10 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom making animated gifs 11 models are in 22050814041994329.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 298 2.930 225 1.585 MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 298 2.829 227 1.647 MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 298 2.784 199 1.847 MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 298 2.796 195 1.860 MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 298 2.866 206 1.586 MODEL 6 MODE=10 DQ=0 298 2.989 215 1.502 MODEL 7 MODE=10 DQ=20 298 3.159 207 1.408 MODEL 8 MODE=10 DQ=40 298 3.369 201 1.331 MODEL 9 MODE=10 DQ=60 298 3.612 187 1.657 MODEL 10 MODE=10 DQ=80 298 3.882 175 1.797 MODEL 11 MODE=10 DQ=100 298 4.174 163 2.012 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22050814041994329 11 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050814041994329.eigenfacs 22050814041994329.atom making animated gifs 11 models are in 22050814041994329.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050814041994329.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 298 3.461 171 1.800 MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 298 3.274 173 1.849 MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 298 3.129 167 1.864 MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 298 3.030 193 1.421 MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 298 2.983 210 1.556 MODEL 6 MODE=11 DQ=0 298 2.989 215 1.502 MODEL 7 MODE=11 DQ=20 298 3.049 211 1.426 MODEL 8 MODE=11 DQ=40 298 3.160 207 1.479 MODEL 9 MODE=11 DQ=60 298 3.316 204 1.436 MODEL 10 MODE=11 DQ=80 298 3.511 190 1.534 MODEL 11 MODE=11 DQ=100 298 3.740 179 1.611 22050814041994329.10.pdb 22050814041994329.11.pdb 22050814041994329.7.pdb 22050814041994329.8.pdb 22050814041994329.9.pdb STDERR: real 0m9.161s user 0m9.124s sys 0m0.032s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.