CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  Q9SW76  ***

LOGs for ID: 22050623461512863

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22050623461512863.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22050623461512863.atom to be opened. Openam> File opened: 22050623461512863.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 599 First residue number = 1 Last residue number = 599 Number of atoms found = 9717 Mean number per residue = 16.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.406440 +/- 17.292926 From: -61.010000 To: 43.760000 = -2.304456 +/- 10.869032 From: -29.985000 To: 24.936000 = 3.977492 +/- 21.439438 From: -43.783000 To: 73.902000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6634 % Filled. Pdbmat> 7068030 non-zero elements. Pdbmat> 778987 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 160.33 +/- 55.83 Maximum number = 255 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.557974E+07 Pdbmat> Larger element = 897.671 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 599 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22050623461512863.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22050623461512863.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22050623461512863.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9717 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 599 residues. Blocpdb> 48 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 58 atoms in block 2 Block first atom: 49 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 107 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 144 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 192 Blocpdb> 52 atoms in block 6 Block first atom: 235 Blocpdb> 49 atoms in block 7 Block first atom: 287 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 336 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 386 Blocpdb> 44 atoms in block 10 Block first atom: 433 Blocpdb> 55 atoms in block 11 Block first atom: 477 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 532 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 573 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 612 Blocpdb> 54 atoms in block 15 Block first atom: 658 Blocpdb> 61 atoms in block 16 Block first atom: 712 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 773 Blocpdb> 47 atoms in block 18 Block first atom: 806 Blocpdb> 43 atoms in block 19 Block first atom: 853 Blocpdb> 59 atoms in block 20 Block first atom: 896 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 955 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 997 Blocpdb> 60 atoms in block 23 Block first atom: 1036 Blocpdb> 51 atoms in block 24 Block first atom: 1096 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 1147 Blocpdb> 47 atoms in block 26 Block first atom: 1194 Blocpdb> 48 atoms in block 27 Block first atom: 1241 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1289 Blocpdb> 46 atoms in block 29 Block first atom: 1338 Blocpdb> 45 atoms in block 30 Block first atom: 1384 Blocpdb> 50 atoms in block 31 Block first atom: 1429 Blocpdb> 49 atoms in block 32 Block first atom: 1479 Blocpdb> 54 atoms in block 33 Block first atom: 1528 Blocpdb> 56 atoms in block 34 Block first atom: 1582 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1638 Blocpdb> 60 atoms in block 36 Block first atom: 1679 Blocpdb> 51 atoms in block 37 Block first atom: 1739 Blocpdb> 50 atoms in block 38 Block first atom: 1790 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1840 Blocpdb> 48 atoms in block 40 Block first atom: 1888 Blocpdb> 42 atoms in block 41 Block first atom: 1936 Blocpdb> 54 atoms in block 42 Block first atom: 1978 Blocpdb> 49 atoms in block 43 Block first atom: 2032 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2081 Blocpdb> 41 atoms in block 45 Block first atom: 2137 Blocpdb> 59 atoms in block 46 Block first atom: 2178 Blocpdb> 46 atoms in block 47 Block first atom: 2237 Blocpdb> 64 atoms in block 48 Block first atom: 2283 Blocpdb> 48 atoms in block 49 Block first atom: 2347 Blocpdb> 51 atoms in block 50 Block first atom: 2395 Blocpdb> 51 atoms in block 51 Block first atom: 2446 Blocpdb> 51 atoms in block 52 Block first atom: 2497 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2548 Blocpdb> 54 atoms in block 54 Block first atom: 2592 Blocpdb> 62 atoms in block 55 Block first atom: 2646 Blocpdb> 39 atoms in block 56 Block first atom: 2708 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 2747 Blocpdb> 42 atoms in block 58 Block first atom: 2800 Blocpdb> 48 atoms in block 59 Block first atom: 2842 Blocpdb> 53 atoms in block 60 Block first atom: 2890 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2943 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2987 Blocpdb> 48 atoms in block 63 Block first atom: 3029 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 3077 Blocpdb> 50 atoms in block 65 Block first atom: 3119 Blocpdb> 45 atoms in block 66 Block first atom: 3169 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 3214 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 3271 Blocpdb> 58 atoms in block 69 Block first atom: 3307 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 3365 Blocpdb> 43 atoms in block 71 Block first atom: 3401 Blocpdb> 45 atoms in block 72 Block first atom: 3444 Blocpdb> 49 atoms in block 73 Block first atom: 3489 Blocpdb> 44 atoms in block 74 Block first atom: 3538 Blocpdb> 61 atoms in block 75 Block first atom: 3582 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 3643 Blocpdb> 45 atoms in block 77 Block first atom: 3697 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 3742 Blocpdb> 31 atoms in block 79 Block first atom: 3772 Blocpdb> 52 atoms in block 80 Block first atom: 3803 Blocpdb> 53 atoms in block 81 Block first atom: 3855 Blocpdb> 51 atoms in block 82 Block first atom: 3908 Blocpdb> 45 atoms in block 83 Block first atom: 3959 Blocpdb> 60 atoms in block 84 Block first atom: 4004 Blocpdb> 65 atoms in block 85 Block first atom: 4064 Blocpdb> 52 atoms in block 86 Block first atom: 4129 Blocpdb> 34 atoms in block 87 Block first atom: 4181 Blocpdb> 58 atoms in block 88 Block first atom: 4215 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 4273 Blocpdb> 60 atoms in block 90 Block first atom: 4342 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4402 Blocpdb> 46 atoms in block 92 Block first atom: 4445 Blocpdb> 53 atoms in block 93 Block first atom: 4491 Blocpdb> 48 atoms in block 94 Block first atom: 4544 Blocpdb> 45 atoms in block 95 Block first atom: 4592 Blocpdb> 52 atoms in block 96 Block first atom: 4637 Blocpdb> 47 atoms in block 97 Block first atom: 4689 Blocpdb> 47 atoms in block 98 Block first atom: 4736 Blocpdb> 56 atoms in block 99 Block first atom: 4783 Blocpdb> 55 atoms in block 100 Block first atom: 4839 Blocpdb> 72 atoms in block 101 Block first atom: 4894 Blocpdb> 35 atoms in block 102 Block first atom: 4966 Blocpdb> 51 atoms in block 103 Block first atom: 5001 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 5052 Blocpdb> 54 atoms in block 105 Block first atom: 5107 Blocpdb> 55 atoms in block 106 Block first atom: 5161 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 5216 Blocpdb> 65 atoms in block 108 Block first atom: 5258 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 5323 Blocpdb> 53 atoms in block 110 Block first atom: 5358 Blocpdb> 55 atoms in block 111 Block first atom: 5411 Blocpdb> 38 atoms in block 112 Block first atom: 5466 Blocpdb> 53 atoms in block 113 Block first atom: 5504 Blocpdb> 41 atoms in block 114 Block first atom: 5557 Blocpdb> 52 atoms in block 115 Block first atom: 5598 Blocpdb> 48 atoms in block 116 Block first atom: 5650 Blocpdb> 49 atoms in block 117 Block first atom: 5698 Blocpdb> 43 atoms in block 118 Block first atom: 5747 Blocpdb> 49 atoms in block 119 Block first atom: 5790 Blocpdb> 42 atoms in block 120 Block first atom: 5839 Blocpdb> 49 atoms in block 121 Block first atom: 5881 Blocpdb> 51 atoms in block 122 Block first atom: 5930 Blocpdb> 46 atoms in block 123 Block first atom: 5981 Blocpdb> 62 atoms in block 124 Block first atom: 6027 Blocpdb> 60 atoms in block 125 Block first atom: 6089 Blocpdb> 44 atoms in block 126 Block first atom: 6149 Blocpdb> 48 atoms in block 127 Block first atom: 6193 Blocpdb> 45 atoms in block 128 Block first atom: 6241 Blocpdb> 55 atoms in block 129 Block first atom: 6286 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 6341 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6391 Blocpdb> 48 atoms in block 132 Block first atom: 6439 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 6487 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 6527 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6573 Blocpdb> 59 atoms in block 136 Block first atom: 6618 Blocpdb> 37 atoms in block 137 Block first atom: 6677 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 6714 Blocpdb> 64 atoms in block 139 Block first atom: 6763 Blocpdb> 52 atoms in block 140 Block first atom: 6827 Blocpdb> 47 atoms in block 141 Block first atom: 6879 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6926 Blocpdb> 54 atoms in block 143 Block first atom: 6970 Blocpdb> 49 atoms in block 144 Block first atom: 7024 Blocpdb> 65 atoms in block 145 Block first atom: 7073 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 7138 Blocpdb> 47 atoms in block 147 Block first atom: 7169 Blocpdb> 49 atoms in block 148 Block first atom: 7216 Blocpdb> 55 atoms in block 149 Block first atom: 7265 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 7320 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 7369 Blocpdb> 32 atoms in block 152 Block first atom: 7416 Blocpdb> 47 atoms in block 153 Block first atom: 7448 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 7495 Blocpdb> 64 atoms in block 155 Block first atom: 7545 Blocpdb> 42 atoms in block 156 Block first atom: 7609 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 7651 Blocpdb> 51 atoms in block 158 Block first atom: 7696 Blocpdb> 39 atoms in block 159 Block first atom: 7747 Blocpdb> 62 atoms in block 160 Block first atom: 7786 Blocpdb> 50 atoms in block 161 Block first atom: 7848 Blocpdb> 59 atoms in block 162 Block first atom: 7898 Blocpdb> 46 atoms in block 163 Block first atom: 7957 Blocpdb> 55 atoms in block 164 Block first atom: 8003 Blocpdb> 53 atoms in block 165 Block first atom: 8058 Blocpdb> 43 atoms in block 166 Block first atom: 8111 Blocpdb> 32 atoms in block 167 Block first atom: 8154 Blocpdb> 46 atoms in block 168 Block first atom: 8186 Blocpdb> 51 atoms in block 169 Block first atom: 8232 Blocpdb> 35 atoms in block 170 Block first atom: 8283 Blocpdb> 47 atoms in block 171 Block first atom: 8318 Blocpdb> 47 atoms in block 172 Block first atom: 8365 Blocpdb> 49 atoms in block 173 Block first atom: 8412 Blocpdb> 47 atoms in block 174 Block first atom: 8461 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 8508 Blocpdb> 35 atoms in block 176 Block first atom: 8544 Blocpdb> 63 atoms in block 177 Block first atom: 8579 Blocpdb> 62 atoms in block 178 Block first atom: 8642 Blocpdb> 48 atoms in block 179 Block first atom: 8704 Blocpdb> 55 atoms in block 180 Block first atom: 8752 Blocpdb> 61 atoms in block 181 Block first atom: 8807 Blocpdb> 39 atoms in block 182 Block first atom: 8868 Blocpdb> 51 atoms in block 183 Block first atom: 8907 Blocpdb> 45 atoms in block 184 Block first atom: 8958 Blocpdb> 41 atoms in block 185 Block first atom: 9003 Blocpdb> 54 atoms in block 186 Block first atom: 9044 Blocpdb> 37 atoms in block 187 Block first atom: 9098 Blocpdb> 32 atoms in block 188 Block first atom: 9135 Blocpdb> 50 atoms in block 189 Block first atom: 9167 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 9217 Blocpdb> 57 atoms in block 191 Block first atom: 9261 Blocpdb> 38 atoms in block 192 Block first atom: 9318 Blocpdb> 36 atoms in block 193 Block first atom: 9356 Blocpdb> 38 atoms in block 194 Block first atom: 9392 Blocpdb> 50 atoms in block 195 Block first atom: 9430 Blocpdb> 53 atoms in block 196 Block first atom: 9480 Blocpdb> 48 atoms in block 197 Block first atom: 9533 Blocpdb> 57 atoms in block 198 Block first atom: 9581 Blocpdb> 49 atoms in block 199 Block first atom: 9638 Blocpdb> 31 atoms in block 200 Block first atom: 9686 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 72 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7068230 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 29151 Prepmat> Matrix trace = 15579740.0000 Prepmat> Last element read: 29151 29151 244.0092 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17785 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9717 RTB> Total mass = 9717.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9717 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 501643.2687 RTB> 80340 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80340 Diagstd> Projected matrix trace = 501643.2687 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 501643.2687 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0001196 0.0002071 0.0022000 0.0023887 0.0093734 0.0159068 0.0331734 0.0467554 0.0747747 0.1710610 0.2120750 0.3676973 0.4939883 0.5640892 0.7768541 0.8351965 1.0503993 1.3263519 1.4478285 1.9203877 2.4849889 2.5766532 2.9096250 3.0381146 3.4140428 4.1951110 4.6818364 4.7316757 5.0689368 5.4224494 6.1607994 6.3665942 6.6123952 7.5410678 8.1341001 8.3349354 9.7371737 10.2185410 11.3664345 12.1730624 12.7402316 13.5416680 13.5941767 13.8972384 14.0654883 15.2194156 15.5285893 16.1399749 16.4875760 17.2583487 17.8540340 18.0652034 19.3155793 20.6813254 20.8234769 21.3353857 21.7503422 22.7414687 22.7538333 24.2307307 24.3818592 25.0712143 25.6377037 26.9784055 27.6565349 28.4968066 29.0997953 29.3140914 30.1889069 30.3333365 31.6276651 32.2693164 32.7580001 33.5105306 34.2686631 34.8540388 35.0927605 35.7275946 36.5020475 36.9592451 37.1182086 38.3156765 39.1081096 40.0489231 41.1688270 41.8983796 42.5691477 44.9165254 46.0070139 46.9726525 48.2850595 48.3254176 49.0700515 51.0190322 51.9638824 52.4574486 54.6058984 55.4745633 55.9081298 56.2468960 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034304 0.0034315 0.0034330 0.0034337 0.0034339 0.0034346 1.1877551 1.5628073 5.0934215 5.3072935 10.5134165 13.6957914 19.7783541 23.4807119 29.6942624 44.9128693 50.0080564 65.8476868 76.3226798 81.5584882 95.7116940 99.2406550 111.2941915 125.0617972 130.6633664 150.4837947 171.1817670 174.3103857 185.2310515 189.2767860 200.6456567 222.4165040 234.9651189 236.2124389 244.4858452 252.8675120 269.5341596 273.9989295 279.2381040 298.2027908 309.7062974 313.5063923 338.8533158 347.1280642 366.1064722 378.8743505 387.6001543 399.6054122 400.3794106 404.8177389 407.2608729 423.6373750 427.9187161 436.2613185 440.9340993 451.1229277 458.8423121 461.5478243 477.2535301 493.8379535 495.5322258 501.5861428 506.4403815 517.8506607 517.9914202 534.5379396 536.2023217 543.7295856 549.8381151 564.0315785 571.0763346 579.6867553 585.7876989 587.9406650 596.6490784 598.0746180 610.7013026 616.8650468 621.5183714 628.6167264 635.6877777 641.0941814 643.2859212 649.0784180 656.0756108 660.1715832 661.5897748 672.1768164 679.0921216 687.2119475 696.7540900 702.9005677 708.5047362 727.7770510 736.5585975 744.2482513 754.5737030 754.8889844 760.6826965 775.6421265 782.7914545 786.5002445 802.4445995 808.8020184 811.9564999 814.4127436 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9717 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9790E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1964E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0712E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2000E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3887E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3734E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5907E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3173E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6755E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4775E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1711 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.038 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.25 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 0.99995 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 1.00002 1.00004 1.00001 1.00005 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99995 1.00001 1.00002 1.00000 0.99994 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00005 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00006 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 174906 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 0.99995 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 1.00002 1.00004 1.00001 1.00005 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99995 1.00001 1.00002 1.00000 0.99994 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00005 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00006 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050623461512863.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050623461512863.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22050623461512863.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050623461512863.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 599 First residue number = 1 Last residue number = 599 Number of atoms found = 9717 Mean number per residue = 16.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9790E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1964E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0712E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2000E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3887E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3734E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5907E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3173E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6755E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4775E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1711 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.038 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.25 Bfactors> 106 vectors, 29151 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000120 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.572 for 599 C-alpha atoms. Bfactors> = 22.782 +/- 108.61 Bfactors> = 89.928 +/- 19.41 Bfactors> Shiftng-fct= 67.147 Bfactors> Scaling-fct= 0.179 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050623461512863.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050623461512863.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.4 Chkmod> 106 vectors, 29151 coordinates in file. Chkmod> That is: 9717 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 92 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6863 0.0034 0.5970 0.0034 0.9205 0.0034 0.5497 0.0034 0.8456 0.0034 0.8420 1.1877 0.0646 1.5627 0.0919 5.0932 0.2368 5.3071 0.1651 10.5130 0.1715 13.6953 0.0957 19.7774 0.0487 23.4796 0.0841 29.6931 0.0711 44.9161 0.0632 50.0089 0.0697 65.8451 0.0716 76.3203 0.0436 81.5558 0.0649 95.7104 0.0431 99.2366 0.0680 111.2683 0.0542 125.0398 0.0719 130.6655 0.0734 150.4621 0.0412 171.1748 0.0668 174.3146 0.0723 185.2350 0.0726 189.2651 0.0800 200.6358 0.0776 222.4040 0.4170 234.9591 0.5882 236.2104 0.0504 244.4769 0.1476 252.8462 0.1255 269.5270 0.0626 273.9959 0.0416 279.2178 0.0500 298.1886 0.4926 309.6911 0.0565 313.4941 0.0421 338.8357 0.0596 347.1379 0.0627 366.1482 0.0461 378.8104 0.3767 387.5800 0.0499 399.5636 0.4197 400.3007 0.0796 404.8406 0.3669 407.3087 0.0417 423.6273 0.0449 427.9198 0.0796 436.2429 0.3596 440.9476 0.0198 451.1251 0.0615 458.7708 0.5782 461.5893 0.4321 477.2877 0.0531 493.8009 0.0642 495.4696 0.1956 501.6188 0.2363 506.4147 0.1738 517.8117 0.1167 517.9256 0.1375 534.5069 0.3711 536.1589 0.4099 543.6931 0.0458 549.8391 0.0450 564.0240 0.4023 571.0876 0.0563 579.6943 0.1269 585.7646 0.3632 587.8744 0.1888 596.6343 0.2011 598.0161 0.0634 610.6976 0.1528 616.8451 0.0579 621.5107 0.1702 628.5848 0.1977 635.6729 0.3671 641.0295 0.3274 643.2330 0.0638 649.0724 0.0383 656.0290 0.2231 660.1500 0.2267 661.5773 0.2950 672.1859 0.4102 679.0794 0.1324 687.1917 0.3807 696.7341 0.6255 702.8840 0.1255 708.4814 0.2450 727.7740 0.3230 736.5509 0.4643 744.1953 0.3081 754.5799 0.2812 754.8924 0.2647 760.6496 0.3484 775.6162 0.5196 782.7286 0.4163 786.4856 0.0602 802.4403 0.4666 808.7340 0.3541 811.9352 0.1493 814.4003 0.5103 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22050623461512863 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom making animated gifs 11 models are in 22050623461512863.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22050623461512863 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom making animated gifs 11 models are in 22050623461512863.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22050623461512863 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom making animated gifs 11 models are in 22050623461512863.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22050623461512863 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom making animated gifs 11 models are in 22050623461512863.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22050623461512863 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050623461512863.eigenfacs 22050623461512863.atom making animated gifs 11 models are in 22050623461512863.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050623461512863.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22050623461512863.10.pdb 22050623461512863.11.pdb 22050623461512863.7.pdb 22050623461512863.8.pdb 22050623461512863.9.pdb STDERR: real 0m43.518s user 0m43.296s sys 0m0.204s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.