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LOGs for ID: 22040417491570403

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22040417491570403.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22040417491570403.atom to be opened. Openam> File opened: 22040417491570403.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 540 First residue number = 3 Last residue number = 544 Number of atoms found = 4130 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 8.191100 +/- 12.243700 From: -23.806000 To: 34.447000 = 86.845421 +/- 13.434276 From: 57.681000 To: 120.258000 = 45.406699 +/- 16.525591 From: 5.940000 To: 83.390000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0524 % Filled. Pdbmat> 1575470 non-zero elements. Pdbmat> 172330 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.45 +/- 22.75 Maximum number = 130 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.446600E+06 Pdbmat> Larger element = 489.980 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 540 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22040417491570403.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22040417491570403.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22040417491570403.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4130 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 540 residues. Blocpdb> 15 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 16 Blocpdb> 20 atoms in block 3 Block first atom: 41 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 61 Blocpdb> 27 atoms in block 5 Block first atom: 84 Blocpdb> 21 atoms in block 6 Block first atom: 111 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 132 Blocpdb> 26 atoms in block 8 Block first atom: 148 Blocpdb> 24 atoms in block 9 Block first atom: 174 Blocpdb> 28 atoms in block 10 Block first atom: 198 Blocpdb> 25 atoms in block 11 Block first atom: 226 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 251 Blocpdb> 20 atoms in block 13 Block first atom: 269 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 289 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 315 Blocpdb> 24 atoms in block 16 Block first atom: 338 Blocpdb> 27 atoms in block 17 Block first atom: 362 Blocpdb> 26 atoms in block 18 Block first atom: 389 Blocpdb> 28 atoms in block 19 Block first atom: 415 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 443 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 467 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 489 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 511 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 538 Blocpdb> 29 atoms in block 25 Block first atom: 561 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 590 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 612 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 633 Blocpdb> 31 atoms in block 29 Block first atom: 655 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 686 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 708 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 725 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 752 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 768 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 787 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 808 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 836 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 859 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 883 Blocpdb> 23 atoms in block 40 Block first atom: 905 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 928 Blocpdb> 25 atoms in block 42 Block first atom: 949 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 974 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 998 Blocpdb> 25 atoms in block 45 Block first atom: 1015 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1040 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1064 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1090 Blocpdb> 26 atoms in block 49 Block first atom: 1113 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 1139 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1163 Blocpdb> 27 atoms in block 52 Block first atom: 1186 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1213 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1237 Blocpdb> 30 atoms in block 55 Block first atom: 1260 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 1290 Blocpdb> 25 atoms in block 57 Block first atom: 1310 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1335 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1357 Blocpdb> 26 atoms in block 60 Block first atom: 1386 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1412 Blocpdb> 30 atoms in block 62 Block first atom: 1434 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1464 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1484 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1505 Blocpdb> 6 atoms in block 66 Block first atom: 1529 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1535 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1552 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1576 Blocpdb> 25 atoms in block 70 Block first atom: 1592 Blocpdb> 23 atoms in block 71 Block first atom: 1617 Blocpdb> 24 atoms in block 72 Block first atom: 1640 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 1664 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1691 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 1715 Blocpdb> 21 atoms in block 76 Block first atom: 1741 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1762 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1785 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1805 Blocpdb> 21 atoms in block 80 Block first atom: 1827 Blocpdb> 31 atoms in block 81 Block first atom: 1848 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1879 Blocpdb> 26 atoms in block 83 Block first atom: 1898 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1924 Blocpdb> 28 atoms in block 85 Block first atom: 1943 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 1971 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1992 Blocpdb> 28 atoms in block 88 Block first atom: 2017 Blocpdb> 31 atoms in block 89 Block first atom: 2045 Blocpdb> 26 atoms in block 90 Block first atom: 2076 Blocpdb> 30 atoms in block 91 Block first atom: 2102 Blocpdb> 23 atoms in block 92 Block first atom: 2132 Blocpdb> 29 atoms in block 93 Block first atom: 2155 Blocpdb> 23 atoms in block 94 Block first atom: 2184 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 2207 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2228 Blocpdb> 25 atoms in block 97 Block first atom: 2249 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2274 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2301 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 2323 Blocpdb> 29 atoms in block 101 Block first atom: 2347 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 2376 Blocpdb> 27 atoms in block 103 Block first atom: 2398 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 2425 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 2444 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 2457 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2478 Blocpdb> 18 atoms in block 108 Block first atom: 2503 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2521 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 2542 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 2574 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 2593 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 2621 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2641 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 2665 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 2685 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 2706 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2728 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 2749 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 2773 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 2789 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2809 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 2834 Blocpdb> 23 atoms in block 124 Block first atom: 2859 Blocpdb> 24 atoms in block 125 Block first atom: 2882 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 2906 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 2922 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 2941 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2965 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 2989 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3010 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3032 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 3056 Blocpdb> 23 atoms in block 134 Block first atom: 3078 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 3101 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 3118 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3138 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 3162 Blocpdb> 32 atoms in block 139 Block first atom: 3179 Blocpdb> 18 atoms in block 140 Block first atom: 3211 Blocpdb> 25 atoms in block 141 Block first atom: 3229 Blocpdb> 27 atoms in block 142 Block first atom: 3254 Blocpdb> 27 atoms in block 143 Block first atom: 3281 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 3308 Blocpdb> 26 atoms in block 145 Block first atom: 3338 Blocpdb> 23 atoms in block 146 Block first atom: 3364 Blocpdb> 21 atoms in block 147 Block first atom: 3387 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 3408 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3433 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 3454 Blocpdb> 26 atoms in block 151 Block first atom: 3471 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3497 Blocpdb> 27 atoms in block 153 Block first atom: 3519 Blocpdb> 23 atoms in block 154 Block first atom: 3546 Blocpdb> 24 atoms in block 155 Block first atom: 3569 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 3593 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 3609 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 3628 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 3646 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3664 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 3684 Blocpdb> 24 atoms in block 162 Block first atom: 3703 Blocpdb> 23 atoms in block 163 Block first atom: 3727 Blocpdb> 20 atoms in block 164 Block first atom: 3750 Blocpdb> 27 atoms in block 165 Block first atom: 3770 Blocpdb> 23 atoms in block 166 Block first atom: 3797 Blocpdb> 24 atoms in block 167 Block first atom: 3820 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 3844 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 3866 Blocpdb> 26 atoms in block 170 Block first atom: 3883 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 3909 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 3928 Blocpdb> 24 atoms in block 173 Block first atom: 3953 Blocpdb> 23 atoms in block 174 Block first atom: 3977 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 4000 Blocpdb> 17 atoms in block 176 Block first atom: 4019 Blocpdb> 18 atoms in block 177 Block first atom: 4036 Blocpdb> 24 atoms in block 178 Block first atom: 4054 Blocpdb> 21 atoms in block 179 Block first atom: 4078 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 4099 Blocpdb> 14 atoms in block 181 Block first atom: 4116 Blocpdb> 181 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1575651 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12390 Prepmat> Matrix trace = 3446600.0000 Prepmat> Last element read: 12390 12390 59.1966 Prepmat> 16472 lines saved. Prepmat> 14611 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4130 RTB> Total mass = 4130.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4130 RTB> Number of blocks = 181 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 240409.3358 RTB> 64245 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1086 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64245 Diagstd> Projected matrix trace = 240409.3358 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1086 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 240409.3358 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1886856 0.4274958 0.9339121 2.5951156 3.1755259 3.3735359 4.2064255 4.7504538 4.9653748 6.3970948 7.8267604 8.7187796 10.1088883 10.7761783 10.9422868 12.5402674 13.3536749 13.8666542 14.4622482 14.7136021 15.1258059 15.8298491 16.4828533 16.9104323 17.3903484 17.9906775 19.7150095 20.2950107 21.8774009 22.3989959 23.1381130 23.3611997 23.9578556 24.7759334 25.3054354 25.9325977 26.3701772 26.9324466 27.2483606 27.8545353 28.5716546 29.5615164 30.9881789 31.1715809 31.6124996 32.0121067 32.4519788 32.5522964 34.0434560 34.4352336 34.7502769 35.4588931 35.7756222 36.2347693 36.7560525 37.3294542 38.3958273 39.1202304 39.6219802 40.0427062 40.2465165 41.2193502 41.6220793 41.9282389 42.4116116 43.0644332 44.1840666 44.4701321 45.2340552 45.7913609 46.0786140 46.5717853 47.2624575 47.6908072 48.0307163 48.4782037 49.1227414 49.4819205 49.6526533 50.1419500 50.9915872 51.8073287 52.3521151 52.8842916 52.9255196 53.1359592 54.3767103 54.6936803 54.8091486 55.5674860 55.6715039 56.4316970 56.6824836 57.1656850 57.6156467 57.7653818 58.2612317 58.6860805 58.8723914 59.3668720 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034322 0.0034327 0.0034337 0.0034344 0.0034348 47.1698678 71.0004663 104.9417427 174.9337603 193.5098653 199.4517941 222.7162384 236.6806920 241.9754449 274.6544712 303.7989709 320.6440087 345.2605662 356.4738407 359.2107512 384.5463368 396.8219433 404.3720437 412.9649425 416.5381500 422.3325379 432.0496606 440.8709431 446.5526131 452.8448378 460.5948098 482.1628830 489.2039132 507.9174608 513.9366094 522.3471731 524.8592443 531.5195611 540.5181637 546.2635055 552.9912909 557.6372855 563.5509469 566.8464998 573.1169321 580.4475418 590.4167017 604.4958272 606.2820280 610.5548685 614.4016996 618.6084847 619.5638875 633.5955251 637.2308560 640.1391885 646.6330042 649.5145404 653.6692128 658.3543540 663.4697099 672.8794966 679.1973488 683.5391103 687.1586073 688.9051453 697.1814942 700.5790829 703.1509873 707.1925353 712.6144885 721.8186896 724.1515921 730.3449694 734.8302999 737.1315230 741.0657189 746.5405982 749.9159952 752.5837071 756.0813747 761.0909854 763.8684167 765.1851109 768.9460846 775.4334749 781.6113909 785.7102095 789.6936140 790.0013716 791.5703943 800.7588462 803.0893268 803.9366135 809.4791271 810.2364131 815.7495359 817.5601523 821.0374859 824.2624221 825.3327989 828.8675002 831.8841176 833.2035639 836.6953663 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4130 Rtb_to_modes> Number of blocs = 181 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.965 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.397 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.827 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.37 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1086 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 74340 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040417491570403.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040417491570403.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22040417491570403.atom Openam> file on opening on unit 11: 22040417491570403.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 540 First residue number = 3 Last residue number = 544 Number of atoms found = 4130 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.965 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.397 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.827 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.37 Bfactors> 106 vectors, 12390 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.188700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.534 for 540 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.051 +/- 0.06 Bfactors> = 34.272 +/- 14.98 Bfactors> Shiftng-fct= 34.221 Bfactors> Scaling-fct= 236.848 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040417491570403.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040417491570403.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 4130 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040417491570403.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040417491570403.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22040417491570403 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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