*** DARK TET ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22022320341990219.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22022320341990219.atom to be opened.
Openam> File opened: 22022320341990219.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -6.675623 +/- 15.433344 From: -42.435000 To: 33.926000
= -2.503884 +/- 13.647716 From: -41.838000 To: 30.385000
= 32.697066 +/- 19.188709 From: -9.662000 To: 80.210000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 4 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3710 % Filled.
Pdbmat> 2423999 non-zero elements.
Pdbmat> 265204 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.62 +/- 21.02
Maximum number = 131
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 5.304080E+06
Pdbmat> Larger element = 496.823
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
786 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22022320341990219.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22022320341990219.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22022320341990219.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6268 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 786 residues.
Blocpdb> 32 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 23 atoms in block 2
Block first atom: 33
Blocpdb> 30 atoms in block 3
Block first atom: 56
Blocpdb> 31 atoms in block 4
Block first atom: 86
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 117
Blocpdb> 33 atoms in block 6
Block first atom: 139
Blocpdb> 34 atoms in block 7
Block first atom: 172
Blocpdb> 40 atoms in block 8
Block first atom: 206
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 246
Blocpdb> 35 atoms in block 10
Block first atom: 273
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 308
Blocpdb> 35 atoms in block 12
Block first atom: 338
Blocpdb> 32 atoms in block 13
Block first atom: 373
Blocpdb> 34 atoms in block 14
Block first atom: 405
Blocpdb> 24 atoms in block 15
Block first atom: 439
Blocpdb> 36 atoms in block 16
Block first atom: 463
Blocpdb> 29 atoms in block 17
Block first atom: 499
Blocpdb> 35 atoms in block 18
Block first atom: 528
Blocpdb> 34 atoms in block 19
Block first atom: 563
Blocpdb> 29 atoms in block 20
Block first atom: 597
Blocpdb> 29 atoms in block 21
Block first atom: 626
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 655
Blocpdb> 29 atoms in block 23
Block first atom: 680
Blocpdb> 27 atoms in block 24
Block first atom: 709
Blocpdb> 38 atoms in block 25
Block first atom: 736
Blocpdb> 25 atoms in block 26
Block first atom: 774
Blocpdb> 32 atoms in block 27
Block first atom: 799
Blocpdb> 39 atoms in block 28
Block first atom: 831
Blocpdb> 23 atoms in block 29
Block first atom: 870
Blocpdb> 32 atoms in block 30
Block first atom: 893
Blocpdb> 29 atoms in block 31
Block first atom: 925
Blocpdb> 31 atoms in block 32
Block first atom: 954
Blocpdb> 29 atoms in block 33
Block first atom: 985
Blocpdb> 34 atoms in block 34
Block first atom: 1014
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 1048
Blocpdb> 26 atoms in block 36
Block first atom: 1069
Blocpdb> 30 atoms in block 37
Block first atom: 1095
Blocpdb> 31 atoms in block 38
Block first atom: 1125
Blocpdb> 27 atoms in block 39
Block first atom: 1156
Blocpdb> 30 atoms in block 40
Block first atom: 1183
Blocpdb> 31 atoms in block 41
Block first atom: 1213
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1244
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 1274
Blocpdb> 29 atoms in block 44
Block first atom: 1296
Blocpdb> 35 atoms in block 45
Block first atom: 1325
Blocpdb> 30 atoms in block 46
Block first atom: 1360
Blocpdb> 33 atoms in block 47
Block first atom: 1390
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1423
Blocpdb> 22 atoms in block 49
Block first atom: 1449
Blocpdb> 91 atoms in block 50
Block first atom: 1471
Blocpdb> 27 atoms in block 51
Block first atom: 1562
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 1589
Blocpdb> 32 atoms in block 53
Block first atom: 1618
Blocpdb> 25 atoms in block 54
Block first atom: 1650
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 1675
Blocpdb> 41 atoms in block 56
Block first atom: 1698
Blocpdb> 34 atoms in block 57
Block first atom: 1739
Blocpdb> 34 atoms in block 58
Block first atom: 1773
Blocpdb> 28 atoms in block 59
Block first atom: 1807
Blocpdb> 34 atoms in block 60
Block first atom: 1835
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1869
Blocpdb> 29 atoms in block 62
Block first atom: 1902
Blocpdb> 40 atoms in block 63
Block first atom: 1931
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1971
Blocpdb> 30 atoms in block 65
Block first atom: 1996
Blocpdb> 29 atoms in block 66
Block first atom: 2026
Blocpdb> 37 atoms in block 67
Block first atom: 2055
Blocpdb> 33 atoms in block 68
Block first atom: 2092
Blocpdb> 33 atoms in block 69
Block first atom: 2125
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2158
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 2186
Blocpdb> 29 atoms in block 72
Block first atom: 2211
Blocpdb> 28 atoms in block 73
Block first atom: 2240
Blocpdb> 34 atoms in block 74
Block first atom: 2268
Blocpdb> 26 atoms in block 75
Block first atom: 2302
Blocpdb> 26 atoms in block 76
Block first atom: 2328
Blocpdb> 41 atoms in block 77
Block first atom: 2354
Blocpdb> 31 atoms in block 78
Block first atom: 2395
Blocpdb> 32 atoms in block 79
Block first atom: 2426
Blocpdb> 27 atoms in block 80
Block first atom: 2458
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 2485
Blocpdb> 32 atoms in block 82
Block first atom: 2514
Blocpdb> 35 atoms in block 83
Block first atom: 2546
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 2581
Blocpdb> 27 atoms in block 85
Block first atom: 2602
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2629
Blocpdb> 30 atoms in block 87
Block first atom: 2655
Blocpdb> 31 atoms in block 88
Block first atom: 2685
Blocpdb> 25 atoms in block 89
Block first atom: 2716
Blocpdb> 30 atoms in block 90
Block first atom: 2741
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 2771
Blocpdb> 25 atoms in block 92
Block first atom: 2807
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 2832
Blocpdb> 34 atoms in block 94
Block first atom: 2852
Blocpdb> 28 atoms in block 95
Block first atom: 2886
Blocpdb> 38 atoms in block 96
Block first atom: 2914
Blocpdb> 29 atoms in block 97
Block first atom: 2952
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2981
Blocpdb> 37 atoms in block 99
Block first atom: 3008
Blocpdb> 11 atoms in block 100
Block first atom: 3045
Blocpdb> 91 atoms in block 101
Block first atom: 3056
Blocpdb> 35 atoms in block 102
Block first atom: 3147
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 3182
Blocpdb> 30 atoms in block 104
Block first atom: 3205
Blocpdb> 31 atoms in block 105
Block first atom: 3235
Blocpdb> 25 atoms in block 106
Block first atom: 3266
Blocpdb> 27 atoms in block 107
Block first atom: 3291
Blocpdb> 37 atoms in block 108
Block first atom: 3318
Blocpdb> 44 atoms in block 109
Block first atom: 3355
Blocpdb> 24 atoms in block 110
Block first atom: 3399
Blocpdb> 34 atoms in block 111
Block first atom: 3423
Blocpdb> 31 atoms in block 112
Block first atom: 3457
Blocpdb> 35 atoms in block 113
Block first atom: 3488
Blocpdb> 25 atoms in block 114
Block first atom: 3523
Blocpdb> 39 atoms in block 115
Block first atom: 3548
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 3587
Blocpdb> 33 atoms in block 117
Block first atom: 3615
Blocpdb> 26 atoms in block 118
Block first atom: 3648
Blocpdb> 35 atoms in block 119
Block first atom: 3674
Blocpdb> 37 atoms in block 120
Block first atom: 3709
Blocpdb> 32 atoms in block 121
Block first atom: 3746
Blocpdb> 27 atoms in block 122
Block first atom: 3778
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 3805
Blocpdb> 29 atoms in block 124
Block first atom: 3830
Blocpdb> 25 atoms in block 125
Block first atom: 3859
Blocpdb> 39 atoms in block 126
Block first atom: 3884
Blocpdb> 25 atoms in block 127
Block first atom: 3923
Blocpdb> 30 atoms in block 128
Block first atom: 3948
Blocpdb> 40 atoms in block 129
Block first atom: 3978
Blocpdb> 27 atoms in block 130
Block first atom: 4018
Blocpdb> 33 atoms in block 131
Block first atom: 4045
Blocpdb> 26 atoms in block 132
Block first atom: 4078
Blocpdb> 30 atoms in block 133
Block first atom: 4104
Blocpdb> 32 atoms in block 134
Block first atom: 4134
Blocpdb> 35 atoms in block 135
Block first atom: 4166
Blocpdb> 18 atoms in block 136
Block first atom: 4201
Blocpdb> 28 atoms in block 137
Block first atom: 4219
Blocpdb> 26 atoms in block 138
Block first atom: 4247
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 4273
Blocpdb> 28 atoms in block 140
Block first atom: 4308
Blocpdb> 26 atoms in block 141
Block first atom: 4336
Blocpdb> 28 atoms in block 142
Block first atom: 4362
Blocpdb> 37 atoms in block 143
Block first atom: 4390
Blocpdb> 21 atoms in block 144
Block first atom: 4427
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 4448
Blocpdb> 36 atoms in block 146
Block first atom: 4473
Blocpdb> 26 atoms in block 147
Block first atom: 4509
Blocpdb> 37 atoms in block 148
Block first atom: 4535
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 4572
Blocpdb> 27 atoms in block 150
Block first atom: 4601
Blocpdb> 91 atoms in block 151
Block first atom: 4628
Blocpdb> 27 atoms in block 152
Block first atom: 4719
Blocpdb> 29 atoms in block 153
Block first atom: 4746
Blocpdb> 32 atoms in block 154
Block first atom: 4775
Blocpdb> 25 atoms in block 155
Block first atom: 4807
Blocpdb> 23 atoms in block 156
Block first atom: 4832
Blocpdb> 41 atoms in block 157
Block first atom: 4855
Blocpdb> 34 atoms in block 158
Block first atom: 4896
Blocpdb> 34 atoms in block 159
Block first atom: 4930
Blocpdb> 28 atoms in block 160
Block first atom: 4964
Blocpdb> 34 atoms in block 161
Block first atom: 4992
Blocpdb> 33 atoms in block 162
Block first atom: 5026
Blocpdb> 29 atoms in block 163
Block first atom: 5059
Blocpdb> 40 atoms in block 164
Block first atom: 5088
Blocpdb> 25 atoms in block 165
Block first atom: 5128
Blocpdb> 30 atoms in block 166
Block first atom: 5153
Blocpdb> 29 atoms in block 167
Block first atom: 5183
Blocpdb> 37 atoms in block 168
Block first atom: 5212
Blocpdb> 33 atoms in block 169
Block first atom: 5249
Blocpdb> 33 atoms in block 170
Block first atom: 5282
Blocpdb> 28 atoms in block 171
Block first atom: 5315
Blocpdb> 25 atoms in block 172
Block first atom: 5343
Blocpdb> 29 atoms in block 173
Block first atom: 5368
Blocpdb> 28 atoms in block 174
Block first atom: 5397
Blocpdb> 34 atoms in block 175
Block first atom: 5425
Blocpdb> 26 atoms in block 176
Block first atom: 5459
Blocpdb> 26 atoms in block 177
Block first atom: 5485
Blocpdb> 41 atoms in block 178
Block first atom: 5511
Blocpdb> 31 atoms in block 179
Block first atom: 5552
Blocpdb> 32 atoms in block 180
Block first atom: 5583
Blocpdb> 27 atoms in block 181
Block first atom: 5615
Blocpdb> 29 atoms in block 182
Block first atom: 5642
Blocpdb> 32 atoms in block 183
Block first atom: 5671
Blocpdb> 35 atoms in block 184
Block first atom: 5703
Blocpdb> 21 atoms in block 185
Block first atom: 5738
Blocpdb> 27 atoms in block 186
Block first atom: 5759
Blocpdb> 26 atoms in block 187
Block first atom: 5786
Blocpdb> 30 atoms in block 188
Block first atom: 5812
Blocpdb> 31 atoms in block 189
Block first atom: 5842
Blocpdb> 25 atoms in block 190
Block first atom: 5873
Blocpdb> 30 atoms in block 191
Block first atom: 5898
Blocpdb> 36 atoms in block 192
Block first atom: 5928
Blocpdb> 25 atoms in block 193
Block first atom: 5964
Blocpdb> 20 atoms in block 194
Block first atom: 5989
Blocpdb> 34 atoms in block 195
Block first atom: 6009
Blocpdb> 28 atoms in block 196
Block first atom: 6043
Blocpdb> 38 atoms in block 197
Block first atom: 6071
Blocpdb> 29 atoms in block 198
Block first atom: 6109
Blocpdb> 27 atoms in block 199
Block first atom: 6138
Blocpdb> 13 atoms in block 200
Block first atom: 6165
Blocpdb> 91 atoms in block 201
Block first atom: 6177
Blocpdb> 201 blocks.
Blocpdb> At most, 91 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2424200 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 18804
Prepmat> Matrix trace = 5304080.0000
Prepmat> Last element read: 18804 18804 260.9509
Prepmat> 20302 lines saved.
Prepmat> 18232 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6268
RTB> Total mass = 6268.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6268
RTB> Number of blocks = 201
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 254024.9955
RTB> 71469 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1206
Diagstd> Nb of non-zero elements: 71469
Diagstd> Projected matrix trace = 254024.9955
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1206 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 254024.9955
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0305982 1.1763548 1.8596385 3.6764941
3.9692044 4.9182509 4.9541763 5.4599455 6.9759695
7.8238932 7.8816922 8.6915966 9.2753072 10.9688819
11.6510491 11.8500147 12.4880869 12.8968567 13.3446396
13.4633122 14.0535605 15.1302248 15.2751447 15.9180857
16.1696043 16.6950616 17.5384429 18.2447561 19.0576324
19.3287947 19.9717826 20.4988747 20.8919842 21.5394344
21.9840916 22.6250566 23.5551368 24.0278952 24.2460322
24.5208341 24.6020657 25.4718472 25.8366261 26.2561017
26.6569991 26.8696545 27.1481849 27.6751747 27.7580735
28.3934933 28.7445260 29.1797959 29.4958347 30.1682793
31.1266660 31.3745207 31.9192937 32.2217167 32.7374431
33.9025585 34.5118236 35.1189774 35.4368416 35.7658884
35.9009037 37.0093214 37.1329004 37.7600179 37.9641542
38.1634612 38.9496820 39.3935909 39.7052404 40.3161586
40.4862254 40.6202416 41.4333823 41.7003223 41.8459125
42.6264323 42.7754216 43.0634112 43.5166328 43.9471944
44.3531458 44.8234790 45.4173416 45.9962304 46.1918737
46.7310393 47.3593384 47.4287768 47.9720189 48.3748170
48.8755459 48.9705131 49.3476113 49.7554690 49.9193780
50.0332717
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034340 0.0034341 0.0034343 0.0034344
0.0034353 110.2401932 117.7780709 148.0844789 208.2150980
216.3450759 240.8244734 241.7024268 253.7402906 286.8121643
303.7433215 304.8632074 320.1437742 330.7192166 359.6470152
370.6617711 373.8132793 383.7454482 389.9754049 396.6876724
398.4476219 407.0881537 422.3942244 424.4122858 433.2521231
436.6615741 443.6998609 454.7689413 463.8358487 474.0561153
477.4167668 485.2926292 491.6548078 496.3466840 503.9789856
509.1544484 516.5235389 527.0333481 532.2959286 534.7066918
537.7283073 538.6182537 548.0567117 551.9670851 556.4298283
560.6617252 562.8936141 565.8035654 571.2687471 572.1237030
578.6349934 582.2008777 586.5923637 589.7604239 596.4452035
605.8450767 608.2523983 613.5103829 616.4099174 621.3233262
632.2830174 637.9391189 643.5261674 646.4319063 649.4261750
650.6508037 660.6186671 661.7206941 667.2850206 669.0863106
670.8403215 677.7152192 681.5662319 684.2569155 689.5009245
690.9536648 692.0963063 698.9892137 701.2372634 702.4603272
708.9812876 710.2192343 712.6060327 716.3461348 719.8812428
723.1984631 727.0228504 731.8231360 736.4722723 738.0368891
742.3316886 747.3053539 747.8530042 752.1237076 755.2747189
759.1735885 759.9107833 762.8310254 765.9769350 767.2375733
768.1123211
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6268
Rtb_to_modes> Number of blocs = 201
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.031
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.176
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.860
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.676
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.969
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.954
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.976
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.824
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.882
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.275
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 112824 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22022320341990219.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022320341990219.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22022320341990219.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22022320341990219.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.031
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.176
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.860
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.676
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.969
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.954
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.976
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.824
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.882
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.692
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03
Bfactors> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.031000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.337 for 782 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.017 +/- 0.01
Bfactors> = 28.990 +/- 5.86
Bfactors> Shiftng-fct= 28.972
Bfactors> Scaling-fct= 460.661
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22022320341990219.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022320341990219.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1
Chkmod> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6268 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7286
0.0034 0.7405
0.0034 0.8024
0.0034 0.9235
0.0034 0.9783
0.0034 0.7675
110.2569 0.6869
117.7553 0.7191
148.0925 0.7482
208.1922 0.5057
216.3302 0.5940
240.8080 0.6575
241.6877 0.6234
253.7307 0.6468
286.8005 0.5586
303.7324 0.5094
304.8561 0.4356
320.1375 0.4721
330.6995 0.0176
359.6499 0.3329
370.6292 0.5137
373.7970 0.5794
383.7584 0.4889
390.0062 0.5619
396.6017 0.4177
398.3815 0.5676
407.0191 0.3354
422.3730 0.3438
424.4615 0.5791
433.2596 0.5143
436.6482 0.5718
443.7464 0.1090
454.7696 0.6570
463.7555 0.5622
474.0652 0.5029
477.4112 0.5106
485.2501 0.3922
491.6472 0.5317
496.3018 0.4410
503.9640 0.5545
509.0852 0.4753
516.5578 0.3708
527.0651 0.2966
532.2964 0.2508
534.7275 0.4823
537.6961 0.3476
538.5725 0.5388
548.0133 0.3768
551.9794 0.5339
556.4472 0.2758
560.6692 0.3947
562.8731 0.3452
565.7982 0.4551
571.2940 0.4140
572.1190 0.4343
578.5746 0.4167
582.1301 0.2360
586.5692 0.4096
589.7767 0.4065
596.4366 0.4151
605.8515 0.4292
608.1825 0.3720
613.4908 0.2187
616.3670 0.4257
621.3209 0.3972
632.2320 0.4730
637.8949 0.5324
643.5079 0.5612
646.4330 0.5234
649.4356 0.3902
650.6147 0.4898
660.5964 0.3594
661.6664 0.3693
667.2562 0.3429
669.0210 0.2636
670.7811 0.3850
677.6889 0.3683
681.5059 0.4205
684.2686 0.4297
689.5042 0.3577
690.9562 0.5120
692.0645 0.4409
698.9307 0.4507
701.2045 0.4924
702.4645 0.3327
708.9805 0.4137
710.2268 0.4906
712.5472 0.3558
716.3431 0.4143
719.8733 0.4958
723.1418 0.3673
726.9634 0.4339
731.8131 0.4259
736.4708 0.4672
737.9902 0.4120
742.2916 0.5029
747.2785 0.4598
747.8305 0.5204
752.0756 0.4519
755.2047 0.3518
759.1756 0.4178
759.8742 0.2153
762.8167 0.4495
765.9789 0.3501
767.2094 0.4675
768.0542 0.3622
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 22022320341990219.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022320341990219.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 22022320341990219.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22022320341990219.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 22022320341990219.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
22022320341990219.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1
Projmod> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Atom 6173 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6174 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6175 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6176 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> ...
%Projmod-Wn> 5 atoms belong to different residues in the two pdb files.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 6268 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.91
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.001 Sum= 0.000 q= 0.1837
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.018 Sum= 0.000 q= 2.7149
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.015 Sum= 0.001 q= -2.3218
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.015 Sum= 0.001 q= -2.2266
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.013 Sum= 0.001 q= -1.9906
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.018 Sum= 0.001 q= -2.6857
Vector: 7 F= 110.26 Cos= 0.040 Sum= 0.003 q= 6.1100
Vector: 8 F= 117.76 Cos= 0.149 Sum= 0.025 q= 22.5419
Vector: 9 F= 148.09 Cos= 0.225 Sum= 0.076 q= 34.0645
Vector: 10 F= 208.19 Cos= -0.024 Sum= 0.076 q= -3.5782
Vector: 11 F= 216.33 Cos= 0.182 Sum= 0.110 q= 27.5381
Vector: 12 F= 240.81 Cos= 0.099 Sum= 0.119 q= 14.9543
Vector: 13 F= 241.69 Cos= 0.024 Sum= 0.120 q= 3.6616
Vector: 14 F= 253.73 Cos= 0.042 Sum= 0.122 q= 6.2933
Vector: 15 F= 286.80 Cos= -0.059 Sum= 0.125 q= -8.8810
Vector: 16 F= 303.73 Cos= -0.095 Sum= 0.134 q= -14.4400
Vector: 17 F= 304.86 Cos= 0.011 Sum= 0.134 q= 1.6506
Vector: 18 F= 320.14 Cos= 0.034 Sum= 0.136 q= 5.0852
%Projmod-Wn> Eigenvector 19 Norm= 1.0001
Vector: 19 F= 330.70 Cos= -0.018 Sum= 0.136 q= -2.7172
Vector: 20 F= 359.65 Cos= 0.101 Sum= 0.146 q= 15.2845
Vector: 21 F= 370.63 Cos= -0.015 Sum= 0.146 q= -2.2442
Vector: 22 F= 373.80 Cos= -0.007 Sum= 0.146 q= -1.0727
Vector: 23 F= 383.76 Cos= 0.004 Sum= 0.146 q= 0.5537
Vector: 24 F= 390.01 Cos= 0.008 Sum= 0.146 q= 1.2203
Vector: 25 F= 396.60 Cos= 0.048 Sum= 0.149 q= 7.2755
Vector: 26 F= 398.38 Cos= -0.122 Sum= 0.164 q= -18.4815
Vector: 27 F= 407.02 Cos= -0.035 Sum= 0.165 q= -5.2673
Vector: 28 F= 422.37 Cos= 0.066 Sum= 0.169 q= 9.9718
Vector: 29 F= 424.46 Cos= -0.016 Sum= 0.169 q= -2.4301
Vector: 30 F= 433.26 Cos= 0.050 Sum= 0.172 q= 7.5031
Vector: 31 F= 436.65 Cos= -0.053 Sum= 0.175 q= -7.9401
Vector: 32 F= 443.75 Cos= 0.031 Sum= 0.176 q= 4.6432
Vector: 33 F= 454.77 Cos= -0.005 Sum= 0.176 q= -0.7238
Vector: 34 F= 463.76 Cos= 0.043 Sum= 0.178 q= 6.5277
Vector: 35 F= 474.07 Cos= 0.030 Sum= 0.178 q= 4.4742
Vector: 36 F= 477.41 Cos= 0.041 Sum= 0.180 q= 6.2561
Vector: 37 F= 485.25 Cos= -0.042 Sum= 0.182 q= -6.4234
Vector: 38 F= 491.65 Cos= -0.004 Sum= 0.182 q= -0.5362
Vector: 39 F= 496.30 Cos= -0.080 Sum= 0.188 q= -12.0897
Vector: 40 F= 503.96 Cos= 0.076 Sum= 0.194 q= 11.5143
Vector: 41 F= 509.09 Cos= -0.033 Sum= 0.195 q= -4.9756
Vector: 42 F= 516.56 Cos= -0.072 Sum= 0.200 q= -10.8337
Vector: 43 F= 527.07 Cos= -0.004 Sum= 0.200 q= -0.5515
Vector: 44 F= 532.30 Cos= -0.044 Sum= 0.202 q= -6.6335
Vector: 45 F= 534.73 Cos= -0.014 Sum= 0.202 q= -2.1155
Vector: 46 F= 537.70 Cos= -0.029 Sum= 0.203 q= -4.3962
Vector: 47 F= 538.57 Cos= -0.020 Sum= 0.204 q= -3.0940
Vector: 48 F= 548.01 Cos= 0.052 Sum= 0.206 q= 7.8797
Vector: 49 F= 551.98 Cos= 0.020 Sum= 0.207 q= 3.0316
Vector: 50 F= 556.45 Cos= -0.039 Sum= 0.208 q= -5.9032
Vector: 51 F= 560.67 Cos= -0.060 Sum= 0.212 q= -9.0474
Vector: 52 F= 562.87 Cos= 0.018 Sum= 0.212 q= 2.7396
Vector: 53 F= 565.80 Cos= 0.024 Sum= 0.213 q= 3.6314
Vector: 54 F= 571.29 Cos= -0.003 Sum= 0.213 q= -0.4286
Vector: 55 F= 572.12 Cos= -0.015 Sum= 0.213 q= -2.1927
Vector: 56 F= 578.57 Cos= 0.020 Sum= 0.213 q= 2.9518
Vector: 57 F= 582.13 Cos= 0.039 Sum= 0.215 q= 5.8222
Vector: 58 F= 586.57 Cos= 0.005 Sum= 0.215 q= 0.6982
Vector: 59 F= 589.78 Cos= -0.019 Sum= 0.215 q= -2.8669
Vector: 60 F= 596.44 Cos= 0.075 Sum= 0.221 q= 11.3946
Vector: 61 F= 605.85 Cos= 0.016 Sum= 0.221 q= 2.4070
Vector: 62 F= 608.18 Cos= -0.025 Sum= 0.222 q= -3.8205
Vector: 63 F= 613.49 Cos= 0.010 Sum= 0.222 q= 1.4708
Vector: 64 F= 616.37 Cos= 0.000 Sum= 0.222 q= 0.0559
Vector: 65 F= 621.32 Cos= 0.002 Sum= 0.222 q= 0.2728
Vector: 66 F= 632.23 Cos= -0.046 Sum= 0.224 q= -6.9670
Vector: 67 F= 637.89 Cos= -0.022 Sum= 0.225 q= -3.2850
Vector: 68 F= 643.51 Cos= -0.003 Sum= 0.225 q= -0.4380
Vector: 69 F= 646.43 Cos= 0.014 Sum= 0.225 q= 2.1006
Vector: 70 F= 649.44 Cos= 0.015 Sum= 0.225 q= 2.2979
Vector: 71 F= 650.61 Cos= -0.007 Sum= 0.225 q= -1.1039
Vector: 72 F= 660.60 Cos= 0.055 Sum= 0.228 q= 8.2445
Vector: 73 F= 661.67 Cos= 0.019 Sum= 0.228 q= 2.8345
Vector: 74 F= 667.26 Cos= -0.008 Sum= 0.228 q= -1.2835
Vector: 75 F= 669.02 Cos= -0.003 Sum= 0.228 q= -0.5060
Vector: 76 F= 670.78 Cos= 0.022 Sum= 0.229 q= 3.3088
Vector: 77 F= 677.69 Cos= -0.007 Sum= 0.229 q= -1.0207
Vector: 78 F= 681.51 Cos= 0.039 Sum= 0.231 q= 5.9265
Vector: 79 F= 684.27 Cos= -0.054 Sum= 0.233 q= -8.2332
Vector: 80 F= 689.50 Cos= -0.052 Sum= 0.236 q= -7.7974
Vector: 81 F= 690.96 Cos= -0.034 Sum= 0.237 q= -5.1923
Vector: 82 F= 692.06 Cos= 0.042 Sum= 0.239 q= 6.2776
Vector: 83 F= 698.93 Cos= -0.062 Sum= 0.243 q= -9.4132
Vector: 84 F= 701.20 Cos= -0.018 Sum= 0.243 q= -2.7569
Vector: 85 F= 702.46 Cos= -0.050 Sum= 0.246 q= -7.5241
Vector: 86 F= 708.98 Cos= 0.005 Sum= 0.246 q= 0.7109
Vector: 87 F= 710.23 Cos= 0.014 Sum= 0.246 q= 2.0542
Vector: 88 F= 712.55 Cos= 0.019 Sum= 0.246 q= 2.8710
Vector: 89 F= 716.34 Cos= 0.010 Sum= 0.246 q= 1.5838
Vector: 90 F= 719.87 Cos= 0.003 Sum= 0.246 q= 0.5240
Vector: 91 F= 723.14 Cos= -0.029 Sum= 0.247 q= -4.3743
Vector: 92 F= 726.96 Cos= -0.015 Sum= 0.247 q= -2.2527
Vector: 93 F= 731.81 Cos= 0.012 Sum= 0.248 q= 1.7565
Vector: 94 F= 736.47 Cos= 0.031 Sum= 0.249 q= 4.6201
Vector: 95 F= 737.99 Cos= 0.036 Sum= 0.250 q= 5.4454
Vector: 96 F= 742.29 Cos= -0.023 Sum= 0.250 q= -3.4115
Vector: 97 F= 747.28 Cos= 0.020 Sum= 0.251 q= 2.9783
Vector: 98 F= 747.83 Cos= 0.014 Sum= 0.251 q= 2.1464
Vector: 99 F= 752.08 Cos= 0.005 Sum= 0.251 q= 0.7273
Vector: 100 F= 755.20 Cos= 0.027 Sum= 0.252 q= 4.1185
Vector: 101 F= 759.18 Cos= 0.010 Sum= 0.252 q= 1.4453
Vector: 102 F= 759.87 Cos= 0.076 Sum= 0.258 q= 11.5115
Vector: 103 F= 762.82 Cos= -0.026 Sum= 0.258 q= -3.8826
Vector: 104 F= 765.98 Cos= 0.059 Sum= 0.262 q= 8.9082
Vector: 105 F= 767.21 Cos= -0.019 Sum= 0.262 q= -2.8161
Vector: 106 F= 768.05 Cos= -0.018 Sum= 0.262 q= -2.7210
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 110.256949
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.23 for mode 9 with F= 148.09 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.051 0.106 0.141 0.162 0.179 0.262
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 7 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-95
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
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calculating perturbed structure for DQ=50
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=75
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=95
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 195 0.524 195 0.524
MODEL 2 MODE=7 DQ=-95 195 0.516 195 0.516
MODEL 3 MODE=7 DQ=-90 195 0.508 195 0.508
MODEL 4 MODE=7 DQ=-85 195 0.501 195 0.501
MODEL 5 MODE=7 DQ=-80 195 0.493 195 0.493
MODEL 6 MODE=7 DQ=-75 195 0.486 195 0.486
MODEL 7 MODE=7 DQ=-70 195 0.478 195 0.478
MODEL 8 MODE=7 DQ=-65 195 0.471 195 0.471
MODEL 9 MODE=7 DQ=-60 195 0.464 195 0.464
MODEL 10 MODE=7 DQ=-55 195 0.457 195 0.457
MODEL 11 MODE=7 DQ=-50 195 0.451 195 0.451
MODEL 12 MODE=7 DQ=-45 195 0.444 195 0.444
MODEL 13 MODE=7 DQ=-40 195 0.438 195 0.438
MODEL 14 MODE=7 DQ=-35 195 0.432 195 0.432
MODEL 15 MODE=7 DQ=-30 195 0.426 195 0.426
MODEL 16 MODE=7 DQ=-25 195 0.420 195 0.420
MODEL 17 MODE=7 DQ=-20 195 0.414 195 0.414
MODEL 18 MODE=7 DQ=-15 195 0.409 195 0.409
MODEL 19 MODE=7 DQ=-10 195 0.404 195 0.404
MODEL 20 MODE=7 DQ=-5 195 0.399 195 0.399
MODEL 21 MODE=7 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=7 DQ=5 195 0.391 195 0.391
MODEL 23 MODE=7 DQ=10 195 0.387 195 0.387
MODEL 24 MODE=7 DQ=15 195 0.383 195 0.383
MODEL 25 MODE=7 DQ=20 195 0.380 195 0.380
MODEL 26 MODE=7 DQ=25 195 0.377 195 0.377
MODEL 27 MODE=7 DQ=30 195 0.374 195 0.374
MODEL 28 MODE=7 DQ=35 195 0.372 195 0.372
MODEL 29 MODE=7 DQ=40 195 0.370 195 0.370
MODEL 30 MODE=7 DQ=45 195 0.368 195 0.368
MODEL 31 MODE=7 DQ=50 195 0.367 195 0.367
MODEL 32 MODE=7 DQ=55 195 0.366 195 0.366
MODEL 33 MODE=7 DQ=60 195 0.365 195 0.365
MODEL 34 MODE=7 DQ=65 195 0.365 195 0.365
MODEL 35 MODE=7 DQ=70 195 0.365 195 0.365
MODEL 36 MODE=7 DQ=75 195 0.366 195 0.366
MODEL 37 MODE=7 DQ=80 195 0.367 195 0.367
MODEL 38 MODE=7 DQ=85 195 0.368 195 0.368
MODEL 39 MODE=7 DQ=90 195 0.370 195 0.370
MODEL 40 MODE=7 DQ=95 195 0.372 195 0.372
MODEL 41 MODE=7 DQ=100 195 0.374 195 0.374
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 8 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-15
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calculating perturbed structure for DQ=-10
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calculating perturbed structure for DQ=-5
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=5
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=45
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calculating perturbed structure for DQ=50
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calculating perturbed structure for DQ=55
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=65
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calculating perturbed structure for DQ=85
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calculating perturbed structure for DQ=90
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calculating perturbed structure for DQ=95
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calculating perturbed structure for DQ=100
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compute RMSD to second conformer
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MODEL 4 MODE=8 DQ=-85 195 0.583 195 0.583
MODEL 5 MODE=8 DQ=-80 195 0.570 195 0.570
MODEL 6 MODE=8 DQ=-75 195 0.557 195 0.557
MODEL 7 MODE=8 DQ=-70 195 0.544 195 0.544
MODEL 8 MODE=8 DQ=-65 195 0.532 195 0.532
MODEL 9 MODE=8 DQ=-60 195 0.520 195 0.520
MODEL 10 MODE=8 DQ=-55 195 0.508 195 0.508
MODEL 11 MODE=8 DQ=-50 195 0.496 195 0.496
MODEL 12 MODE=8 DQ=-45 195 0.484 195 0.484
MODEL 13 MODE=8 DQ=-40 195 0.473 195 0.473
MODEL 14 MODE=8 DQ=-35 195 0.462 195 0.462
MODEL 15 MODE=8 DQ=-30 195 0.451 195 0.451
MODEL 16 MODE=8 DQ=-25 195 0.441 195 0.441
MODEL 17 MODE=8 DQ=-20 195 0.431 195 0.431
MODEL 18 MODE=8 DQ=-15 195 0.421 195 0.421
MODEL 19 MODE=8 DQ=-10 195 0.412 195 0.412
MODEL 20 MODE=8 DQ=-5 195 0.403 195 0.403
MODEL 21 MODE=8 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=8 DQ=5 195 0.387 195 0.387
MODEL 23 MODE=8 DQ=10 195 0.380 195 0.380
MODEL 24 MODE=8 DQ=15 195 0.373 195 0.373
MODEL 25 MODE=8 DQ=20 195 0.367 195 0.367
MODEL 26 MODE=8 DQ=25 195 0.362 195 0.362
MODEL 27 MODE=8 DQ=30 195 0.357 195 0.357
MODEL 28 MODE=8 DQ=35 195 0.353 195 0.353
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MODEL 41 MODE=8 DQ=100 195 0.376 195 0.376
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 9 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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calculating perturbed structure for DQ=-35
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calculating perturbed structure for DQ=-30
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calculating perturbed structure for DQ=-25
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-5
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calculating perturbed structure for DQ=5
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calculating perturbed structure for DQ=10
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calculating perturbed structure for DQ=35
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calculating perturbed structure for DQ=75
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calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=90
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calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 195 0.371 195 0.371
MODEL 2 MODE=9 DQ=-95 195 0.365 195 0.365
MODEL 3 MODE=9 DQ=-90 195 0.359 195 0.359
MODEL 4 MODE=9 DQ=-85 195 0.354 195 0.354
MODEL 5 MODE=9 DQ=-80 195 0.349 195 0.349
MODEL 6 MODE=9 DQ=-75 195 0.346 195 0.346
MODEL 7 MODE=9 DQ=-70 195 0.344 195 0.344
MODEL 8 MODE=9 DQ=-65 195 0.342 195 0.342
MODEL 9 MODE=9 DQ=-60 195 0.341 195 0.341
MODEL 10 MODE=9 DQ=-55 195 0.341 195 0.341
MODEL 11 MODE=9 DQ=-50 195 0.342 195 0.342
MODEL 12 MODE=9 DQ=-45 195 0.344 195 0.344
MODEL 13 MODE=9 DQ=-40 195 0.347 195 0.347
MODEL 14 MODE=9 DQ=-35 195 0.351 195 0.351
MODEL 15 MODE=9 DQ=-30 195 0.355 195 0.355
MODEL 16 MODE=9 DQ=-25 195 0.360 195 0.360
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MODEL 21 MODE=9 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=9 DQ=5 195 0.403 195 0.403
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MODEL 26 MODE=9 DQ=25 195 0.442 195 0.442
MODEL 27 MODE=9 DQ=30 195 0.453 195 0.453
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MODEL 29 MODE=9 DQ=40 195 0.475 195 0.475
MODEL 30 MODE=9 DQ=45 195 0.486 195 0.486
MODEL 31 MODE=9 DQ=50 195 0.497 195 0.497
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MODEL 36 MODE=9 DQ=75 195 0.558 195 0.558
MODEL 37 MODE=9 DQ=80 195 0.571 195 0.571
MODEL 38 MODE=9 DQ=85 195 0.583 195 0.583
MODEL 39 MODE=9 DQ=90 195 0.596 195 0.596
MODEL 40 MODE=9 DQ=95 195 0.609 195 0.609
MODEL 41 MODE=9 DQ=100 195 0.622 195 0.622
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 10 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-95
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calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 195 0.870 195 0.870
MODEL 2 MODE=10 DQ=-95 195 0.842 195 0.842
MODEL 3 MODE=10 DQ=-90 195 0.814 195 0.814
MODEL 4 MODE=10 DQ=-85 195 0.787 195 0.787
MODEL 5 MODE=10 DQ=-80 195 0.760 195 0.760
MODEL 6 MODE=10 DQ=-75 195 0.733 195 0.733
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MODEL 9 MODE=10 DQ=-60 195 0.654 195 0.654
MODEL 10 MODE=10 DQ=-55 195 0.628 195 0.628
MODEL 11 MODE=10 DQ=-50 195 0.603 195 0.603
MODEL 12 MODE=10 DQ=-45 195 0.578 195 0.578
MODEL 13 MODE=10 DQ=-40 195 0.554 195 0.554
MODEL 14 MODE=10 DQ=-35 195 0.530 195 0.530
MODEL 15 MODE=10 DQ=-30 195 0.508 195 0.508
MODEL 16 MODE=10 DQ=-25 195 0.486 195 0.486
MODEL 17 MODE=10 DQ=-20 195 0.465 195 0.465
MODEL 18 MODE=10 DQ=-15 195 0.445 195 0.445
MODEL 19 MODE=10 DQ=-10 195 0.427 195 0.427
MODEL 20 MODE=10 DQ=-5 195 0.410 195 0.410
MODEL 21 MODE=10 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=10 DQ=5 195 0.382 195 0.382
MODEL 23 MODE=10 DQ=10 195 0.371 195 0.371
MODEL 24 MODE=10 DQ=15 195 0.362 195 0.362
MODEL 25 MODE=10 DQ=20 195 0.356 195 0.356
MODEL 26 MODE=10 DQ=25 195 0.352 195 0.352
MODEL 27 MODE=10 DQ=30 195 0.352 195 0.352
MODEL 28 MODE=10 DQ=35 195 0.354 195 0.354
MODEL 29 MODE=10 DQ=40 195 0.359 195 0.359
MODEL 30 MODE=10 DQ=45 195 0.366 195 0.366
MODEL 31 MODE=10 DQ=50 195 0.377 195 0.377
MODEL 32 MODE=10 DQ=55 195 0.389 195 0.389
MODEL 33 MODE=10 DQ=60 195 0.404 195 0.404
MODEL 34 MODE=10 DQ=65 195 0.420 195 0.420
MODEL 35 MODE=10 DQ=70 195 0.439 195 0.439
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MODEL 41 MODE=10 DQ=100 195 0.576 195 0.576
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 11 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-95
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calculating perturbed structure for DQ=-90
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calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-75
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calculating perturbed structure for DQ=-70
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calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-50
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calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
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22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 195 0.454 195 0.454
MODEL 2 MODE=11 DQ=-95 195 0.442 195 0.442
MODEL 3 MODE=11 DQ=-90 195 0.431 195 0.431
MODEL 4 MODE=11 DQ=-85 195 0.420 195 0.420
MODEL 5 MODE=11 DQ=-80 195 0.411 195 0.411
MODEL 6 MODE=11 DQ=-75 195 0.402 195 0.402
MODEL 7 MODE=11 DQ=-70 195 0.394 195 0.394
MODEL 8 MODE=11 DQ=-65 195 0.387 195 0.387
MODEL 9 MODE=11 DQ=-60 195 0.381 195 0.381
MODEL 10 MODE=11 DQ=-55 195 0.376 195 0.376
MODEL 11 MODE=11 DQ=-50 195 0.372 195 0.372
MODEL 12 MODE=11 DQ=-45 195 0.369 195 0.369
MODEL 13 MODE=11 DQ=-40 195 0.367 195 0.367
MODEL 14 MODE=11 DQ=-35 195 0.367 195 0.367
MODEL 15 MODE=11 DQ=-30 195 0.367 195 0.367
MODEL 16 MODE=11 DQ=-25 195 0.369 195 0.369
MODEL 17 MODE=11 DQ=-20 195 0.372 195 0.372
MODEL 18 MODE=11 DQ=-15 195 0.376 195 0.376
MODEL 19 MODE=11 DQ=-10 195 0.381 195 0.381
MODEL 20 MODE=11 DQ=-5 195 0.388 195 0.388
MODEL 21 MODE=11 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=11 DQ=5 195 0.403 195 0.403
MODEL 23 MODE=11 DQ=10 195 0.412 195 0.412
MODEL 24 MODE=11 DQ=15 195 0.422 195 0.422
MODEL 25 MODE=11 DQ=20 195 0.433 195 0.433
MODEL 26 MODE=11 DQ=25 195 0.444 195 0.444
MODEL 27 MODE=11 DQ=30 195 0.456 195 0.456
MODEL 28 MODE=11 DQ=35 195 0.469 195 0.469
MODEL 29 MODE=11 DQ=40 195 0.482 195 0.482
MODEL 30 MODE=11 DQ=45 195 0.496 195 0.496
MODEL 31 MODE=11 DQ=50 195 0.510 195 0.510
MODEL 32 MODE=11 DQ=55 195 0.525 195 0.525
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MODEL 34 MODE=11 DQ=65 195 0.556 195 0.556
MODEL 35 MODE=11 DQ=70 195 0.572 195 0.572
MODEL 36 MODE=11 DQ=75 195 0.588 195 0.588
MODEL 37 MODE=11 DQ=80 195 0.604 195 0.604
MODEL 38 MODE=11 DQ=85 195 0.621 195 0.621
MODEL 39 MODE=11 DQ=90 195 0.638 195 0.638
MODEL 40 MODE=11 DQ=95 195 0.655 195 0.655
MODEL 41 MODE=11 DQ=100 195 0.673 195 0.673
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 12 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-100 195 0.833 195 0.833
MODEL 2 MODE=12 DQ=-95 195 0.806 195 0.806
MODEL 3 MODE=12 DQ=-90 195 0.779 195 0.779
MODEL 4 MODE=12 DQ=-85 195 0.752 195 0.752
MODEL 5 MODE=12 DQ=-80 195 0.725 195 0.725
MODEL 6 MODE=12 DQ=-75 195 0.699 195 0.699
MODEL 7 MODE=12 DQ=-70 195 0.673 195 0.673
MODEL 8 MODE=12 DQ=-65 195 0.648 195 0.648
MODEL 9 MODE=12 DQ=-60 195 0.623 195 0.623
MODEL 10 MODE=12 DQ=-55 195 0.599 195 0.599
MODEL 11 MODE=12 DQ=-50 195 0.575 195 0.575
MODEL 12 MODE=12 DQ=-45 195 0.552 195 0.552
MODEL 13 MODE=12 DQ=-40 195 0.530 195 0.530
MODEL 14 MODE=12 DQ=-35 195 0.508 195 0.508
MODEL 15 MODE=12 DQ=-30 195 0.488 195 0.488
MODEL 16 MODE=12 DQ=-25 195 0.469 195 0.469
MODEL 17 MODE=12 DQ=-20 195 0.451 195 0.451
MODEL 18 MODE=12 DQ=-15 195 0.434 195 0.434
MODEL 19 MODE=12 DQ=-10 195 0.419 195 0.419
MODEL 20 MODE=12 DQ=-5 195 0.406 195 0.406
MODEL 21 MODE=12 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=12 DQ=5 195 0.386 195 0.386
MODEL 23 MODE=12 DQ=10 195 0.379 195 0.379
MODEL 24 MODE=12 DQ=15 195 0.374 195 0.374
MODEL 25 MODE=12 DQ=20 195 0.372 195 0.372
MODEL 26 MODE=12 DQ=25 195 0.373 195 0.373
MODEL 27 MODE=12 DQ=30 195 0.376 195 0.376
MODEL 28 MODE=12 DQ=35 195 0.382 195 0.382
MODEL 29 MODE=12 DQ=40 195 0.389 195 0.389
MODEL 30 MODE=12 DQ=45 195 0.399 195 0.399
MODEL 31 MODE=12 DQ=50 195 0.412 195 0.412
MODEL 32 MODE=12 DQ=55 195 0.426 195 0.426
MODEL 33 MODE=12 DQ=60 195 0.441 195 0.441
MODEL 34 MODE=12 DQ=65 195 0.458 195 0.458
MODEL 35 MODE=12 DQ=70 195 0.477 195 0.477
MODEL 36 MODE=12 DQ=75 195 0.497 195 0.497
MODEL 37 MODE=12 DQ=80 195 0.518 195 0.518
MODEL 38 MODE=12 DQ=85 195 0.539 195 0.539
MODEL 39 MODE=12 DQ=90 195 0.562 195 0.562
MODEL 40 MODE=12 DQ=95 195 0.585 195 0.585
MODEL 41 MODE=12 DQ=100 195 0.609 195 0.609
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 13 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-100 195 1.008 195 1.008
MODEL 2 MODE=13 DQ=-95 195 0.972 195 0.972
MODEL 3 MODE=13 DQ=-90 195 0.936 195 0.936
MODEL 4 MODE=13 DQ=-85 195 0.901 195 0.901
MODEL 5 MODE=13 DQ=-80 195 0.865 195 0.865
MODEL 6 MODE=13 DQ=-75 195 0.830 195 0.830
MODEL 7 MODE=13 DQ=-70 195 0.795 195 0.795
MODEL 8 MODE=13 DQ=-65 195 0.760 195 0.760
MODEL 9 MODE=13 DQ=-60 195 0.726 195 0.726
MODEL 10 MODE=13 DQ=-55 195 0.692 195 0.692
MODEL 11 MODE=13 DQ=-50 195 0.659 195 0.659
MODEL 12 MODE=13 DQ=-45 195 0.627 195 0.627
MODEL 13 MODE=13 DQ=-40 195 0.595 195 0.595
MODEL 14 MODE=13 DQ=-35 195 0.565 195 0.565
MODEL 15 MODE=13 DQ=-30 195 0.535 195 0.535
MODEL 16 MODE=13 DQ=-25 195 0.507 195 0.507
MODEL 17 MODE=13 DQ=-20 195 0.480 195 0.480
MODEL 18 MODE=13 DQ=-15 195 0.455 195 0.455
MODEL 19 MODE=13 DQ=-10 195 0.433 195 0.433
MODEL 20 MODE=13 DQ=-5 195 0.412 195 0.412
MODEL 21 MODE=13 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=13 DQ=5 195 0.381 195 0.381
MODEL 23 MODE=13 DQ=10 195 0.370 195 0.370
MODEL 24 MODE=13 DQ=15 195 0.364 195 0.364
MODEL 25 MODE=13 DQ=20 195 0.362 195 0.362
MODEL 26 MODE=13 DQ=25 195 0.364 195 0.364
MODEL 27 MODE=13 DQ=30 195 0.370 195 0.370
MODEL 28 MODE=13 DQ=35 195 0.381 195 0.381
MODEL 29 MODE=13 DQ=40 195 0.395 195 0.395
MODEL 30 MODE=13 DQ=45 195 0.412 195 0.412
MODEL 31 MODE=13 DQ=50 195 0.433 195 0.433
MODEL 32 MODE=13 DQ=55 195 0.456 195 0.456
MODEL 33 MODE=13 DQ=60 195 0.481 195 0.481
MODEL 34 MODE=13 DQ=65 195 0.508 195 0.508
MODEL 35 MODE=13 DQ=70 195 0.537 195 0.537
MODEL 36 MODE=13 DQ=75 195 0.567 195 0.567
MODEL 37 MODE=13 DQ=80 195 0.599 195 0.599
MODEL 38 MODE=13 DQ=85 195 0.631 195 0.631
MODEL 39 MODE=13 DQ=90 195 0.664 195 0.664
MODEL 40 MODE=13 DQ=95 195 0.698 195 0.698
MODEL 41 MODE=13 DQ=100 195 0.733 195 0.733
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 14 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
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22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=5
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=15
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=25
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=35
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=45
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=55
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=65
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=75
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=85
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=95
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022320341990219.eigenfacs
22022320341990219.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-100 195 0.784 195 0.784
MODEL 2 MODE=14 DQ=-95 195 0.759 195 0.759
MODEL 3 MODE=14 DQ=-90 195 0.735 195 0.735
MODEL 4 MODE=14 DQ=-85 195 0.710 195 0.710
MODEL 5 MODE=14 DQ=-80 195 0.686 195 0.686
MODEL 6 MODE=14 DQ=-75 195 0.663 195 0.663
MODEL 7 MODE=14 DQ=-70 195 0.640 195 0.640
MODEL 8 MODE=14 DQ=-65 195 0.617 195 0.617
MODEL 9 MODE=14 DQ=-60 195 0.595 195 0.595
MODEL 10 MODE=14 DQ=-55 195 0.573 195 0.573
MODEL 11 MODE=14 DQ=-50 195 0.552 195 0.552
MODEL 12 MODE=14 DQ=-45 195 0.532 195 0.532
MODEL 13 MODE=14 DQ=-40 195 0.512 195 0.512
MODEL 14 MODE=14 DQ=-35 195 0.493 195 0.493
MODEL 15 MODE=14 DQ=-30 195 0.476 195 0.476
MODEL 16 MODE=14 DQ=-25 195 0.459 195 0.459
MODEL 17 MODE=14 DQ=-20 195 0.443 195 0.443
MODEL 18 MODE=14 DQ=-15 195 0.429 195 0.429
MODEL 19 MODE=14 DQ=-10 195 0.416 195 0.416
MODEL 20 MODE=14 DQ=-5 195 0.405 195 0.405
MODEL 21 MODE=14 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=14 DQ=5 195 0.387 195 0.387
MODEL 23 MODE=14 DQ=10 195 0.381 195 0.381
MODEL 24 MODE=14 DQ=15 195 0.377 195 0.377
MODEL 25 MODE=14 DQ=20 195 0.375 195 0.375
MODEL 26 MODE=14 DQ=25 195 0.376 195 0.376
MODEL 27 MODE=14 DQ=30 195 0.378 195 0.378
MODEL 28 MODE=14 DQ=35 195 0.382 195 0.382
MODEL 29 MODE=14 DQ=40 195 0.389 195 0.389
MODEL 30 MODE=14 DQ=45 195 0.397 195 0.397
MODEL 31 MODE=14 DQ=50 195 0.407 195 0.407
MODEL 32 MODE=14 DQ=55 195 0.419 195 0.419
MODEL 33 MODE=14 DQ=60 195 0.432 195 0.432
MODEL 34 MODE=14 DQ=65 195 0.446 195 0.446
MODEL 35 MODE=14 DQ=70 195 0.462 195 0.462
MODEL 36 MODE=14 DQ=75 195 0.479 195 0.479
MODEL 37 MODE=14 DQ=80 195 0.497 195 0.497
MODEL 38 MODE=14 DQ=85 195 0.516 195 0.516
MODEL 39 MODE=14 DQ=90 195 0.536 195 0.536
MODEL 40 MODE=14 DQ=95 195 0.556 195 0.556
MODEL 41 MODE=14 DQ=100 195 0.577 195 0.577
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 15 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
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calculating perturbed structure for DQ=-75
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=10
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calculating perturbed structure for DQ=100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-100 195 0.823 195 0.823
MODEL 2 MODE=15 DQ=-95 195 0.788 195 0.788
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MODEL 9 MODE=15 DQ=-60 195 0.565 195 0.565
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MODEL 16 MODE=15 DQ=-25 195 0.412 195 0.412
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MODEL 18 MODE=15 DQ=-15 195 0.393 195 0.393
MODEL 19 MODE=15 DQ=-10 195 0.390 195 0.390
MODEL 20 MODE=15 DQ=-5 195 0.390 195 0.390
MODEL 21 MODE=15 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=15 DQ=5 195 0.403 195 0.403
MODEL 23 MODE=15 DQ=10 195 0.415 195 0.415
MODEL 24 MODE=15 DQ=15 195 0.430 195 0.430
MODEL 25 MODE=15 DQ=20 195 0.448 195 0.448
MODEL 26 MODE=15 DQ=25 195 0.469 195 0.469
MODEL 27 MODE=15 DQ=30 195 0.492 195 0.492
MODEL 28 MODE=15 DQ=35 195 0.517 195 0.517
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MODEL 40 MODE=15 DQ=95 195 0.904 195 0.904
MODEL 41 MODE=15 DQ=100 195 0.940 195 0.940
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 22022320341990219 16 -100 100 5 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
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calculating perturbed structure for DQ=10
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calculating perturbed structure for DQ=100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-100 195 0.800 195 0.800
MODEL 2 MODE=16 DQ=-95 195 0.772 195 0.772
MODEL 3 MODE=16 DQ=-90 195 0.745 195 0.745
MODEL 4 MODE=16 DQ=-85 195 0.718 195 0.718
MODEL 5 MODE=16 DQ=-80 195 0.691 195 0.691
MODEL 6 MODE=16 DQ=-75 195 0.665 195 0.665
MODEL 7 MODE=16 DQ=-70 195 0.639 195 0.639
MODEL 8 MODE=16 DQ=-65 195 0.614 195 0.614
MODEL 9 MODE=16 DQ=-60 195 0.589 195 0.589
MODEL 10 MODE=16 DQ=-55 195 0.566 195 0.566
MODEL 11 MODE=16 DQ=-50 195 0.543 195 0.543
MODEL 12 MODE=16 DQ=-45 195 0.521 195 0.521
MODEL 13 MODE=16 DQ=-40 195 0.500 195 0.500
MODEL 14 MODE=16 DQ=-35 195 0.481 195 0.481
MODEL 15 MODE=16 DQ=-30 195 0.463 195 0.463
MODEL 16 MODE=16 DQ=-25 195 0.447 195 0.447
MODEL 17 MODE=16 DQ=-20 195 0.432 195 0.432
MODEL 18 MODE=16 DQ=-15 195 0.419 195 0.419
MODEL 19 MODE=16 DQ=-10 195 0.409 195 0.409
MODEL 20 MODE=16 DQ=-5 195 0.401 195 0.401
MODEL 21 MODE=16 DQ=0 195 0.395 195 0.395
MODEL 22 MODE=16 DQ=5 195 0.392 195 0.392
MODEL 23 MODE=16 DQ=10 195 0.391 195 0.391
MODEL 24 MODE=16 DQ=15 195 0.394 195 0.394
MODEL 25 MODE=16 DQ=20 195 0.399 195 0.399
MODEL 26 MODE=16 DQ=25 195 0.406 195 0.406
MODEL 27 MODE=16 DQ=30 195 0.416 195 0.416
MODEL 28 MODE=16 DQ=35 195 0.428 195 0.428
MODEL 29 MODE=16 DQ=40 195 0.442 195 0.442
MODEL 30 MODE=16 DQ=45 195 0.458 195 0.458
MODEL 31 MODE=16 DQ=50 195 0.476 195 0.476
MODEL 32 MODE=16 DQ=55 195 0.496 195 0.496
MODEL 33 MODE=16 DQ=60 195 0.516 195 0.516
MODEL 34 MODE=16 DQ=65 195 0.538 195 0.538
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