*** NM_MD2 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220203174926120771.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220203174926120771.atom to be opened.
Openam> File opened: 220203174926120771.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 203
First residue number = 989
Last residue number = 1191
Number of atoms found = 1568
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -34.996017 +/- 8.056359 From: -59.676000 To: -17.404000
= 10.901273 +/- 9.486721 From: -10.921000 To: 32.684000
= -21.963438 +/- 10.641942 From: -46.390000 To: 1.715000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.1675 % Filled.
Pdbmat> 571847 non-zero elements.
Pdbmat> 62501 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.72 +/- 23.10
Maximum number = 126
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 1.250020E+06
Pdbmat> Larger element = 480.851
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
203 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220203174926120771.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220203174926120771.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220203174926120771.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1568 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 203 residues.
Blocpdb> 11 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 12
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 49
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 69
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 83
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 96
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 109
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 132
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 145
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 159
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 172
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 183
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 195
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 212
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 228
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 244
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 257
Blocpdb> 13 atoms in block 19
Block first atom: 273
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 286
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 302
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 317
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 331
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 345
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 359
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 375
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 390
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 404
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 419
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 434
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 449
Blocpdb> 17 atoms in block 32
Block first atom: 463
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 480
Blocpdb> 11 atoms in block 34
Block first atom: 494
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 505
Blocpdb> 18 atoms in block 36
Block first atom: 522
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 540
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 557
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 572
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 583
Blocpdb> 12 atoms in block 41
Block first atom: 596
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 608
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 621
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 633
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 647
Blocpdb> 13 atoms in block 46
Block first atom: 664
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 677
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 697
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 713
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 727
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 750
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 765
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 782
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 794
Blocpdb> 25 atoms in block 55
Block first atom: 810
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 835
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 847
Blocpdb> 12 atoms in block 58
Block first atom: 860
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 872
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 889
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 905
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 922
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 938
Blocpdb> 14 atoms in block 64
Block first atom: 958
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 972
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 989
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 1005
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1019
Blocpdb> 15 atoms in block 69
Block first atom: 1033
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1048
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1061
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1079
Blocpdb> 11 atoms in block 73
Block first atom: 1092
Blocpdb> 12 atoms in block 74
Block first atom: 1103
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1115
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1127
Blocpdb> 17 atoms in block 77
Block first atom: 1145
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1162
Blocpdb> 14 atoms in block 79
Block first atom: 1181
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1195
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1211
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1225
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1241
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1261
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1278
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1293
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1310
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1327
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 1342
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1360
Blocpdb> 19 atoms in block 91
Block first atom: 1377
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1396
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1414
Blocpdb> 18 atoms in block 94
Block first atom: 1427
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1445
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1462
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1479
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1495
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1509
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1529
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1545
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 1560
Blocpdb> 102 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 571949 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4704
Prepmat> Matrix trace = 1250020.0000
Prepmat> Last element read: 4704 4704 157.5340
Prepmat> 5254 lines saved.
Prepmat> 4174 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1568
RTB> Total mass = 1568.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1568
RTB> Number of blocks = 102
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 135954.9605
RTB> 37314 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 612
Diagstd> Nb of non-zero elements: 37314
Diagstd> Projected matrix trace = 135954.9605
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 612 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 135954.9605
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.0701554 5.0966413 6.9501665 8.1419714
9.4235881 10.8873802 12.9767284 13.6027653 13.8937509
14.7790167 16.0889538 17.1715543 18.0061360 19.0097888
19.8317087 22.5045555 23.0569276 23.3620703 24.3556058
25.0306089 26.0522787 27.8050253 30.0582352 30.6005124
32.3219890 32.7103034 34.1781207 35.5994933 37.5089422
37.7241242 38.5064103 39.2260853 40.1238856 40.6303944
41.2155346 44.0107906 45.9789717 46.8264470 47.2911720
47.9826774 48.9344476 51.1426644 52.5703428 52.8674869
53.4805269 54.3639174 55.2322920 55.6768577 56.6507222
57.7130049 58.7468758 59.8890996 60.1144990 60.6890001
61.2883834 62.7773909 63.3325394 64.3978543 65.3006421
66.7960532 67.0974631 67.8582671 68.2521561 69.2398264
69.9155025 70.7030694 71.2409236 71.8381749 72.6168741
73.6016592 74.4904698 75.1229625 75.8151793 77.8170910
78.6496453 79.4580843 80.4976613 80.7115939 81.2995969
82.4185837 83.2816578 83.6186981 83.9594405 85.0277216
85.2878485 87.0479548 87.5535755 88.3719893 88.6604956
89.2157260 90.2988669 90.4298290 91.0391982 91.9093878
92.2984239 93.2301483 94.0875281 95.4252058 96.3002647
96.8021705
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034334 0.0034337 0.0034338 0.0034347
0.0034355 219.0790139 245.1530578 286.2812364 309.8561115
333.3522784 358.3083877 391.1811216 400.5058679 404.7669412
417.4630586 435.5712266 449.9871204 460.7926495 473.4606893
483.5878129 515.1461994 521.4299806 524.8690243 535.9135628
543.2890947 554.2658711 572.6073625 595.3563903 600.7027631
617.3682904 621.0657313 634.8474357 647.9137382 665.0628494
666.9677938 673.8477733 680.1156437 687.8548000 692.1827934
697.1492250 720.4019263 736.3340901 743.0890874 746.7673449
752.2072567 759.6309053 776.5813479 787.3461073 789.5681356
794.1327725 800.6646459 807.0339656 810.2753712 817.3310644
824.9585419 832.3148975 840.3673525 841.9472764 845.9608625
850.1280842 860.3930853 864.1889948 871.4269340 877.5139034
887.5047401 889.5048707 894.5336101 897.1260512 903.5938479
907.9919997 913.0917407 916.5582075 920.3921912 925.3671013
931.6205993 937.2288247 941.1993822 945.5257558 957.9277979
963.0385330 967.9754110 974.2870088 975.5807948 979.1280141
985.8432199 990.9915720 992.9948153 995.0159630 1001.3261342
1002.8566523 1013.1519066 1016.0901082 1020.8280520 1022.4930333
1025.6896831 1031.8971917 1032.6452104 1036.1186534 1041.0586979
1043.2596796 1048.5121509 1053.3223747 1060.7836884 1065.6363361
1068.4097136
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1568
Rtb_to_modes> Number of blocs = 102
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.097
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.950
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.142
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.424
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.80
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 612 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
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0.99996 1.00005 1.00000 0.99999 1.00001
1.00004 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996
0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
1.00002 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00004
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997
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0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 28224 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99996 1.00005 1.00000 0.99999 1.00001
1.00004 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996
0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
1.00002 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00004
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997
1.00003 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220203174926120771.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220203174926120771.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220203174926120771.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220203174926120771.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 203
First residue number = 989
Last residue number = 1191
Number of atoms found = 1568
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.950
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.142
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.424
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.80
Bfactors> 106 vectors, 4704 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.070000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.656 for 203 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.026 +/- 0.03
Bfactors> = 16.524 +/- 4.93
Bfactors> Shiftng-fct= 16.498
Bfactors> Scaling-fct= 164.020
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220203174926120771.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220203174926120771.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Chkmod> 106 vectors, 4704 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1568 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7329
0.0034 0.8962
0.0034 0.8079
0.0034 0.7350
0.0034 0.8014
0.0034 0.7169
219.0654 0.2860
245.1512 0.3987
286.2655 0.4157
309.8434 0.5197
333.3453 0.2302
358.3361 0.5209
391.2136 0.2752
400.4480 0.2367
404.6949 0.5597
417.4590 0.3896
435.5667 0.2804
449.9474 0.3485
460.8223 0.1945
473.4430 0.2651
483.5462 0.4728
515.0719 0.3956
521.4423 0.4449
524.8232 0.4701
535.9389 0.5346
543.2592 0.2673
554.2178 0.2065
572.6340 0.6224
595.3483 0.4640
600.6719 0.5203
617.3228 0.3405
621.0362 0.4509
634.8376 0.3499
647.8905 0.4688
665.0437 0.3461
666.9027 0.4696
673.8503 0.3557
680.1204 0.4972
687.7920 0.2883
692.1497 0.4764
697.1571 0.1420
720.3645 0.3819
736.3107 0.4230
743.0854 0.3727
746.7260 0.3564
752.1540 0.5098
759.5638 0.5442
776.5278 0.3467
787.3097 0.4448
789.5530 0.4870
794.0948 0.4799
800.6014 0.3498
806.9826 0.3228
810.2635 0.4954
817.2908 0.2522
824.9017 0.3891
832.3013 0.4546
840.3376 0.4841
841.8796 0.3612
845.9315 0.4340
850.1028 0.3827
860.3740 0.5297
864.1346 0.3828
871.4040 0.3070
877.4719 0.4369
887.4929 0.4352
889.4835 0.4222
894.5066 0.3253
897.0734 0.3730
903.5562 0.4283
907.9822 0.4500
913.0327 0.4254
916.5129 0.4423
920.3644 0.5127
925.3473 0.4012
931.5701 0.3836
937.1856 0.5115
941.1404 0.4148
945.5152 0.4022
957.9046 0.4238
962.9994 0.4307
967.9455 0.4653
974.2593 0.4029
975.5293 0.4095
979.0884 0.2526
985.8094 0.2728
990.9392 0.3449
992.9599 0.4692
994.9766 0.4113
1001.2966 0.4986
1002.8263 0.3069
1013.1203 0.4404
1016.0257 0.4106
1020.7727 0.3533
1022.4463 0.3301
1025.6702 0.4777
1031.8594 0.3730
1032.6019 0.4529
1036.0787 0.4407
1041.0175 0.4179
1043.2238 0.4047
1048.4663 0.4849
1053.2910 0.3572
1060.7648 0.4219
1065.5891 0.4765
1068.3519 0.4369
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 220203174926120771.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220203174926120771.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 220203174926120771.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220203174926120771.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 220203174926120771.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
220203174926120771.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Projmod> 106 vectors, 4704 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 203
First residue number = 989
Last residue number = 1191
Number of atoms found = 1568
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 189
First residue number = 1002
Last residue number = 1190
Number of atoms found = 1500
Mean number per residue = 7.9
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220203174926120771 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220203174926120771.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 220203174926120771.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 189 2.697 163 1.329
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 189 2.521 171 1.238
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 189 2.388 175 1.084
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 189 2.307 175 0.899
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 189 2.283 174 0.760
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 189 2.317 174 0.751
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 189 2.408 174 0.845
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 189 2.548 173 0.988
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 189 2.731 171 1.146
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 189 2.949 171 1.372
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 189 3.195 164 1.500
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220203174926120771 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
220203174926120771.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 220203174926120771.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 189 2.044 174 1.255
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 189 1.975 175 1.085
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 189 1.970 174 0.876
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 189 2.030 174 0.742
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 189 2.149 174 0.700
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 189 2.317 174 0.751
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 189 2.525 174 0.893
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 189 2.764 173 1.074
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 189 3.026 169 1.173
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 189 3.306 165 1.287
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 189 3.600 162 1.370
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220203174926120771 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
making animated gifs
11 models are in 220203174926120771.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 189 3.444 150 1.658
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 189 3.122 162 1.556
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 189 2.836 169 1.375
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 189 2.597 171 1.118
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 189 2.419 173 0.910
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 189 2.317 174 0.751
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 189 2.300 174 0.753
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 189 2.371 175 1.004
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 189 2.521 171 1.232
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 189 2.738 166 1.461
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 189 3.008 155 1.574
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220203174926120771 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
making animated gifs
11 models are in 220203174926120771.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 189 3.096 147 1.638
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 189 2.829 165 1.553
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 189 2.606 170 1.304
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 189 2.439 172 1.045
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 189 2.339 174 0.851
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 189 2.317 174 0.751
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 189 2.374 175 0.868
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 189 2.504 176 1.104
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 189 2.698 173 1.342
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 189 2.942 165 1.540
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 189 3.225 152 1.682
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220203174926120771 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220203174926120771.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
220203174926120771.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220203174926120771.eigenfacs
220203174926120771.atom
making animated gifs
11 models are in 220203174926120771.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220203174926120771.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 189 3.175 164 1.011
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 189 2.868 166 0.930
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 189 2.613 167 0.901
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 189 2.425 171 0.893
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 189 2.323 174 0.844
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 189 2.317 174 0.751
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 189 2.408 175 0.857
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 189 2.585 174 0.989
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 189 2.833 173 1.105
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 189 3.134 170 1.174
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 189 3.476 168 1.247
220203174926120771.10.pdb
220203174926120771.11.pdb
220203174926120771.7.pdb
220203174926120771.8.pdb
220203174926120771.9.pdb
STDERR:
real 0m3.483s
user 0m3.456s
sys 0m0.024s
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elNémo
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